Tenacibaculum retecalamus: PG912_06710
Help
Entry
PG912_06710 CDS
T08858
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
trt
Tenacibaculum retecalamus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Flg_new_2
Big_12
fn3
Chlam_PMP
Flg_new
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX72418
LinkDB
All DBs
Position
1404306..1411691
Genome browser
AA seq
2461 aa
AA seq
DB search
MKVKLLYLFFLFAFSMSYAQTFPINDIQGYYKFDSGAVLVDQVGVANLTQNGALATGATD
RFNSSNGDAIQLNGDDFSRANIPTTRSVTHAFWVKTSTNNNNNETIIGDSDRPGAGFNST
TYGYDIHLRNGGIILYTRIKEERNNGAFNDIARALTSSVIADDTWHHVAVVFYTNGTIDR
YLNTKIYIDGVLDASDTYDTTRAVRTFPFNSGTLAIGNNRVGNLSSVNKYKDYFDDYFVY
SRVLDASEILTLATQDGYCLVPQNNIISATGITENSATINVSLNSNTYDIAYGLKSESLA
NATILSNVNSTVNIASLQASTDYNVYIREQCASGLTSNWSNPISFRTLGPIYVDDTATGL
NDGSSWQNAFTSLMSALDIDSDGQEIWVAGGTYKTQSSGINVRFNIDKPNVSLYGGFAGT
ETLLSQRVLGANESIISGDTNGDDAAGVLYDIDATRSDNTRGLIDLTTISDGFTIDGFTI
TAGMATYSKDGGGINNVGANNVMVSNCKFFRNGGHRNGGAIFNLGDMTIESCVFEENFSL
SGGAVYQYLAGGNPGTVTISKSTFLNNKATSTGGAVSSLLFSSTGTSLNIDASEFVGNNS
RSGGGIYVGVPANSTFNVSITNTLFNGNIVEDNASSVGNSGSAAWLRTTGTNSTLTTSIV
NNTFVNNIDTGTATGLNNFTRATLALTKNNAAATHNASVSNNIFYNNRGASSSTVSKSIT
GLTETMATVTVENSIDENSFSSIAAGSKTNTSNADPLFTSSSDFTLSAASSPAANTGNNS
AVTTILDLLGNHRIFNTTVDMGAYEFGSSAPIYRTLTINATNGTVATDPNPTNGTYTDGQ
VVELTATPDTGYQFDNWSGDASGVLNPLNITMDANKTVTANFSLIPAPTPTFITPPTSIS
GAFTATIQFDIAVTGFDVSDIQVTGASLSNFTAVSGTEYTVLVTPTSICASSVTLKVPEN
VAQNSSNVNNVASSLITIASVDNVAPIVITQDITVQLDANGNAAFTPSQIDNGSSDNCAI
ASRNLDVSNFTCSNIGTNTVRLTVEDTTGNSANNTATVTVVDNIAPIVVTQNVTITLDVN
GNTSITAAAINNGSSDNCSISTYTLSKTAFTCSDLGANNVVLTVTDVNGNSDTATAVVTV
SQNPNQTFTARAQNITVQLDASGNVTITPQQVDNGSGSGCNNNPTLSLDKTAFTCADLGN
NAVTLTATDGSTTDTAQAIVTVEDNVVPVVLTQNVTIQLDANGNASITTADINNGSSDNC
GIKGISLDKSNFTCSDIGANNVTLTVVDSSANSADNTATVTVVDNIAPIVVTQNVTITLD
VNGNASTTAAAINNGSTDNCGIASMSLDTAAFTCSDLGANNVVLTVTDVNGNSETATAVV
TVSQSPNQTFTARAQNITVQLDVSGNVTITPQQVDNGSGSGCNNNPTLSLDKTDFTCADL
GNNAVTLTATDGSTTDTAQATVTVEDNVVPVVLTQNVTIQLDANGNASILPTQVNNGSTD
NCGIEGISLDKSNFTCSDIGANIVTLTVVDSSANSADNTATVTVVDNVAPTVVTQNVTIQ
LDVNGNASTTAAAINNGSTDNCGIASMSLDTTTFTCSDLGANNVVLTVTDVNGNSDTATA
VVTVDPNPNQTFTARTQNITVQLDANGNVTITPQQVDNGSGSGCNNNPTLSLDKTAFTCA
DLGNNAVTLTATDGSTTDTVQAIVTVEDNVAPVVLTQNVTIQLDANGNASITTADINNGS
SDNCGIEGISLDKSNFTCSDIGVNTVTLTVVDSSANSAGNTAIVTVEDNVAPVVLTQNVT
IQLDVNGNASTTAAAINNGSSDNCSISTYTLSKTVFTCSDLGANNVVLTVTDVNGNSDTA
TAVVTVSQNPNQTFTARTQNITVQLDASGNVTITPQQVDNGSGSGCNNNPTLSLDKTAFT
CADLGNNAVTLTATDGSTTDTAQAIVTVEDNVVPVVLTQNITIQLDANGNASITTADINN
GSSDNCGIEGISLDKSNFTCSDIGVNTVTLTVVDSSANSADNTATVTVVDNVAPTVVTQN
VTITLDVNGNASTTAAAINNGSTDNCGIASMSLDTTAFTCSDLGANNVVLTVTDVNGNSD
TATAVVTVDPNPNQTLTVIAQNITVQLDASGNVTITPQQVDNGSGSGCNSNPTLSLDVTD
FTCANIGTNTVTLTATEGQTTDTAQATVTVEDNVAPVVLTQNVTIQLDANGNASIVVADI
DNGSSDNCGIDSRSLDITDFTCSDIGANNVTLTVEDVNGNISTNTAIVTVSESVAPTVVT
QDITVALDANGSVSITTGDIDNGSSDGCSGIASMSLDQSTFDCPTLGDVTVTLTVTDTSG
NSATGTAIVTITGPDEDNDGISDACDSKEIVFNKGFSPNGDNQNDTWVIENIDNYPKNTV
EIFNRWGERVYKASDYKNDFDGKANQRGGSSDKLPVGSYLYIINLNEPGFTPIKGWLYIN
Y
NT seq
7386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtaaaattactttatctcttctttttatttgcgtttagcatgtcctatgcgcaa
acattccctatcaatgatattcaggggtattataaatttgactctggtgctgttttagtc
gatcaggtaggtgtagcaaacttaacccaaaacggagctttagctacaggcgctacagat
aggtttaatagtagcaatggtgatgctattcagcttaatggtgatgatttttctagggcg
aacattcctactacaagatctgtaacgcacgctttttgggttaaaacaagtactaataat
aataataatgaaactataattggagattcagatagaccaggagctggttttaatagtaca
acttatggttatgatatccatctaagaaatggaggaattatactttatactaggattaaa
gaagaaagaaataatggtgcttttaatgatatagctcgcgctttaacatctagtgtaata
gctgatgatacatggcatcatgtagctgttgtgttttatactaatggtactattgatagg
tatcttaacactaaaatatatatagatggtgttttagatgcttctgatacatatgatact
acaagagcagtacgtacatttccttttaattcaggaacgcttgctataggtaataatagg
gttggaaacctaagtagtgttaataaatataaagattattttgatgattattttgtttat
tctagagttttagatgctagtgaaatactaacgcttgcaacacaagatggttattgttta
gtaccgcaaaacaatattatttcggcaaccggaataacagaaaattcagcaacaataaat
gtatctcttaattcaaatacttacgatatagcctatggcttaaaatcagaaagtcttgca
aatgcaactattttaagcaatgtaaattcaactgttaacatagctagtttacaagcttca
acagattataatgtttatatacgtgagcaatgcgcttcgggtttaacgtcaaattggtca
aacccaattagttttagaacattaggtccaatttatgtggatgatactgctacaggactt
aatgacgggtcttcatggcaaaatgcatttactagtttaatgagtgcattagatatagat
agtgacggacaagaaatttgggttgctggaggtacttacaaaacacaaagttcaggtatc
aacgtacgttttaatatagataaacctaatgttagcctttatggtggtttcgcaggtaca
gaaacattattatctcaaagagttttaggtgccaacgaatctattatttcaggtgatact
aatggtgatgatgctgctggtgttctttatgatatagatgctacaagatcagataataca
agaggacttatagatttaactactattagcgatggttttactatagatggctttacaatt
accgcaggaatggcaacatattctaaagatggaggtggaattaataatgttggagcaaat
aatgtgatggtttcaaattgtaaatttttcagaaatggaggtcatagaaatgggggagct
atttttaacttaggagatatgacaatagaatcatgtgtttttgaggaaaatttctcacta
agtggaggtgcagtatatcagtatttagcaggtggaaatccaggtacagttactataagt
aaatcaacttttttaaataataaagcaacgagtactggaggagctgtatcttctttgctt
tttagtagtacaggtactagccttaacatagatgcgagtgagtttgtaggtaataattct
agatctggtggaggtatttatgttggtgttccagctaattctacatttaatgtatctatt
acaaacactttatttaatggaaatattgttgaggataatgcaagtagcgtaggtaattct
ggtagtgcagcttggttaagaactacaggaacaaattcaactcttactacttctattgta
aataatacatttgtaaataatatagatacaggtacagctactgggttaaataattttaca
agagcaactttagctttaactaaaaataatgcagctgcaacccataatgctagcgttagt
aataatattttttataataatagaggtgcaagtagtagtactgtttcaaaatctataaca
ggtttaacagaaacaatggctactgtaactgttgaaaatagtatagatgaaaatagtttt
tcttcaatcgctgcagggtctaaaacaaatacaagtaatgcagatccactatttacatca
agtagtgactttacattatcagcagctagttcaccagccgctaatacaggaaataacagt
gctgtaacaacaattttagatttattaggtaaccatcgtatttttaatactacggtagat
atgggtgcttatgaatttggttcttcagcaccaatttatagaacattaacaataaacgct
acaaacggaacagtagcaacagatccaaatccaacaaatggaacttataccgatggacaa
gttgttgagttaacagcaacgccagatacaggttatcaatttgataattggagtggagat
gctagtggagttttaaatccattaaatattacaatggatgccaataaaacggtaacagct
aattttagtttaataccggcaccaacaccaacgtttataacaccgcctactagtatttca
ggtgcttttacagctacgattcagttcgatatagcagtaacaggttttgatgttagtgat
attcaagtaacaggggctagtttaagtaactttacagcagttagtggtacagaatataca
gtattagtaacaccaacaagtatttgtgctagctctgtaacattaaaagtacctgagaat
gtagcacaaaattcaagtaatgtgaataatgtagcatcaagtttaattacaattgcttca
gtagataatgtagcaccaatagttataacacaggatataacagtacaattagatgccaat
ggaaatgctgcatttaccccatcacaaatagataacggaagtagtgataattgtgcgata
gcttcaagaaatttagatgtatcaaactttacttgttcaaatattggaacaaacactgta
agattaactgttgaagataccacaggaaacagtgctaataatacagcaacagtaaccgtt
gtagataatattgcaccaatcgttgtaacacaaaatgttacaattacgttagatgtaaat
ggaaatacatcaataacagctgctgcaattaacaatggatcatcagacaattgttcaatt
tctacctatacattaagtaaaacagcttttacttgttcagatttaggagcaaacaatgta
gtgttaacagtaacagatgtaaatggaaatagcgatacagctacagcagtagtaacggta
tcacaaaatccaaatcaaacatttacagcacgtgctcaaaatattacggtacaattagat
gctagtggaaatgtaaccattacaccacaacaggtagataatggatcaggaagtggatgt
aataataatccaaccttaagcttagataaaacagcttttacctgtgcagatttaggaaac
aatgcagttaccttaacagcaacagacggatcaacaacagataccgcgcaagcaatagta
acggttgaagataatgtagtaccagtagttttaacacagaatgttacaattcagttagat
gccaatggaaatgcttcaataacaacagcagatataaacaatggaagtagtgataattgt
ggtattaaaggaataagtttagataaatcaaactttacatgttcagatatcggagcaaac
aacgtaacattaacagttgtagattcatcagcaaacagtgcagataatacagcaacagta
accgttgtagataatattgcaccaatcgttgtaacacaaaatgttacaattacgttagat
gtaaatggaaatgcatcaacaacagctgctgcaattaacaatggaagtacagacaattgt
ggtattgcatcaatgagtttagatacagctgcttttacctgttcagatttaggcgcaaac
aatgtagtgttaacagtaacagatgtaaatggaaatagtgaaacagctacagcagtagta
acggtatcacaaagtccaaatcaaacatttacagcacgtgctcaaaatattacggtacaa
ttagatgttagtggaaatgtaaccattacaccacaacaggtagataatggatcaggaagt
ggatgtaataataatccaaccttaagcttagataaaactgattttacttgtgcagattta
ggaaacaatgcagttactttaacagccacagacggatcaacaacagatacagcgcaagca
acagtaacggttgaagataatgtagtaccagtagttttaacacagaatgttacaattcag
ttagatgccaatggaaatgcttcaatattaccaacacaagttaacaacgggagtactgat
aattgtggtattgaaggaataagtttagataaatcaaactttacatgttcagatatcgga
gcaaacatcgtaacattaacagttgtagattcatcagcaaacagtgcagataatacagca
acagtaacggttgtagataatgtagcaccaacagttgtaacacaaaatgttacaattcag
ttagatgtaaatggaaatgcttcaacaacagctgctgcaattaacaatggaagtacagat
aattgtggtattgcatcaatgagtttagatacaactacatttacttgttcagatttaggc
gcaaacaatgtagtgttaacagtaacagatgtaaatggaaatagtgatacagcaacagca
gtagtaacggtagatccaaatccaaatcaaacatttacagcacgtactcaaaatattacg
gtacaattagatgctaatggaaatgtaaccattacaccacaacaggtagataatggatca
ggaagtggatgtaataataatccaaccttaagcttagataaaacagcttttacttgtgca
gatttaggaaacaatgcagttactttaacagccacagacggatcaacaacagataccgtg
caagcaatagtaacggttgaagataatgtagcaccagtagttttaacacagaatgttaca
attcagttagatgccaatggaaatgcttcaataacaacagcagatataaacaatggaagt
agtgataattgtggtattgaaggaataagtttagataaatcaaactttacttgttcagat
atcggagtgaacactgtaacattaacagttgtagattcatcagcaaacagtgcaggtaat
acagcaatagtaacggttgaagataatgtagcaccagtagttttaacacaaaatgttaca
attcagttagatgtaaacggaaatgcatcaacaacagctgctgcaattaacaatggatca
tcagacaattgttcaatttctacttatacattaagtaaaacagtttttacatgttcagat
ttaggcgcaaacaatgtagtgttaacagtaacagatgtaaatggaaatagcgatacagct
acagcagtagtaacagtatcacaaaatccaaatcaaacatttacagcacgtactcaaaat
attacggtacaattagatgctagtggaaatgtaaccattacaccacaacaggtagataat
ggatcaggaagtggatgtaataataatccaaccttaagtttagataaaacagcttttact
tgtgcagatttaggaaacaatgcagttactttaacagcaacagacggatcaacaacagat
accgcgcaagcaatagtaacggttgaagataatgtagtaccagtagttttaacacagaat
attacaattcagttagatgccaatggaaatgcctcaataacaacagcagatataaacaat
ggaagtagtgataattgtggtattgaaggaataagtttagataaatcaaactttacttgt
tcagatatcggagtgaacaccgtaacattaacagttgtagattcatcagcaaacagtgca
gataatacagcaacagtaaccgttgtagataatgtagcaccaacagttgtaacacaaaat
gttacaattacgttagatgtaaatggaaatgcttcaacaacagctgctgcaattaacaat
ggaagtacagataattgtggtattgcatcaatgagtttagatacaactgcatttacatgt
tcagatttaggcgcaaacaatgtagtgttaacagtaacagatgtaaatggaaatagcgat
acagctacagcagtagtaacagtagatccaaatccaaaccagacgttaacagtaattgct
caaaatattacggtacaattagatgctagtggaaatgtaactattacaccacaacaggta
gataatggatcaggaagtggatgtaacagtaatccgaccttaagtttagatgtaacagac
tttacatgtgctaatatcggaacaaatacagttacattaacagccacagaagggcaaaca
acagatacagcgcaagcaacagtaacggttgaagataatgtagcaccagtagttttaaca
cagaatgttacaattcagttagatgccaatggaaacgcttcaatagtagtagctgatata
gacaatggaagtagtgacaattgtggtatcgactcaagaagtttagatataacagatttt
acatgttcagatatcggagcaaacaacgtaacattaactgtagaagatgtaaatggaaac
atttcaacaaatacagcaattgtaacagtttcagaatcggtagcacccacagttgtaaca
caagatattacagtagcattagatgctaatggaagtgtatcaattacaacaggagatatt
gataatggaagtagtgatggttgtagtggaatagcttcaatgagtttagatcaaagtact
tttgattgtccaacattaggagatgtaacagtaacattaacagttacagatactagcggt
aattcagctacaggtacagcaattgtaacaattacaggaccagatgaagataatgacggt
atttcggatgcatgtgatagtaaagaaattgtttttaataaaggattttcaccaaacgga
gataaccaaaatgatacttgggtaatagagaatatagataattatcctaaaaacactgta
gagatctttaatcgttggggagaaagagtttataaagcaagtgattataagaatgatttt
gatggtaaagctaaccaaagaggaggtagtagcgacaaattaccagtaggttcttactta
tatattatcaatttaaatgaaccaggatttacgcctattaaaggttggttatatatcaat
tactaa
DBGET
integrated database retrieval system