Tenacibaculum retecalamus: PG912_07400
Help
Entry
PG912_07400 CDS
T08858
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
trt
Tenacibaculum retecalamus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
trt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
trt02000
]
PG912_07400
Transporters [BR:
trt02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PG912_07400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
OMP_b-brl_3
Xol-1_GHMP-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX70120
LinkDB
All DBs
Position
complement(1547134..1549011)
Genome browser
AA seq
625 aa
AA seq
DB search
MNKQLLIVGAIATLFASTKIIAQEQEKIEELDEVIVTATKTKMSKKNVGKIVYKLTTKEI
EERQGKSLTQLLNEIPGIEINGSQSNRGQNLGVYIRGGRNKQTAVLIDGINVNDPSSIAG
DFDLRQLDLNQIESIEVLKGASSVLYGSGAAAGVINIILKKESKKEFEGTFTTSLGSNRS
AEHTTFAGDELQANFNFKGKVDKVTYLLGLNSNSSSGLSAIESLNSKANKEDKFYRQNAL
LKIGYKINNKVKVGIQGSFNEFNNEFDSSYPPEDADYVSGGKQNRAVFSTDFKYAKGELK
ARAFYTEIDRESNSSSKSVYQGEVKGFDVFNSYRLSNQFSFLTGITAQYQDMLQETSYSN
IAKGTAKQHFYDPYVSLNYNSDFGFNVNGGVRMNIHNEYGNHFVYNINPSYNFEILEDKN
LKLFASYGTAFITPTLTEIFNRADNIDELTPEKDFTIEGGFEFDVLDNLTLNATYFYREE
TDKVAYSAGRYLNNIGTFNLKGIEAGVIYKPLKKLSILADYTYVNFKGGVSIINLPKQKF
GASVNYQLASKTFVNAAYRYTGERETFGGILDSYSIIDFFINHKVIKDKVTFFGSVTNLL
NENFQDVNAYTARGRNYNLGLKVRF
NT seq
1878 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaacaattattaattgttggtgctattgcaacattatttgcaagcacaaaaatt
attgctcaagagcaggagaaaatcgaagaattagatgaagttattgtaactgcaactaaa
acaaagatgagtaaaaaaaatgttggtaaaatagtttacaaactaacaacaaaagagatt
gaagaaagacaaggaaaatcgttaacacaattgttaaatgaaattcctggtattgaaatt
aatggatctcaaagtaatagaggacaaaatttaggtgtttatattagaggcggtagaaat
aaacaaactgcggttttaatagacggtattaatgttaatgatccatcatctattgctgga
gactttgatttaagacaattagatttaaaccaaatagaatctattgaagtattaaaagga
gcatcttcagttttatatggttctggtgcagcagcaggagtaattaatattattttaaag
aaagagtctaaaaaagagttcgaagggacatttacaacatcattaggtagtaatagatca
gcagaacacacaacatttgcaggagatgaattacaagctaactttaattttaaaggtaaa
gtagataaggtaacttatttattaggtttaaattcaaatagctcatctggtttatctgca
attgaaagcttaaacagtaaagcaaataaggaagataaattttaccgtcaaaatgcttta
ttaaaaattggctataaaattaataataaagttaaagtaggtattcaaggaagttttaat
gaatttaataacgaatttgattcttcttatccacctgaagatgctgattatgtttctgga
ggtaaacagaatagagctgtttttagtaccgattttaaatatgcaaaaggagagttaaaa
gcaagagctttttatactgaaatagatagagagtctaactcgtcttcgaaaagtgtttat
caaggagaagtaaaaggatttgatgtgtttaatagttatagactttctaatcagttttct
tttttaacaggaattacggcacagtatcaagatatgttacaagaaacatcttatagtaat
atagctaaaggtacagcaaagcaacatttttatgacccttacgtatcattaaactataat
tctgattttggatttaatgtaaatggtggtgttcgtatgaatattcataatgaatatgga
aatcattttgtttataatattaacccatcttataattttgaaattttagaggataaaaat
ttaaaattatttgcttcttacggtaccgcatttataacaccaactttaactgagattttt
aatagagcggataatatagacgaattaacaccagaaaaagattttactattgaaggtggt
tttgaatttgatgttttagataatttaactttaaacgctacttatttttatagagaggaa
acagacaaagttgcatatagtgcaggaaggtatttaaataatattggaacatttaattta
aaaggtattgaagcaggagttatttataaacctttaaaaaaactatcaattttagctgat
tatacttacgttaattttaaaggaggagtaagtataattaatttaccaaaacaaaaattt
ggagcaagtgttaattatcaattggcttcaaagacttttgtaaatgcagcatacaggtat
acaggtgagagagaaacttttggaggaattttagattcttatagtattattgactttttc
ataaaccacaaagtaataaaagataaagtaacattctttggaagtgtgactaatttactg
aatgaaaactttcaagatgtaaatgcttatacagctagaggtagaaattataatttagga
ttaaaagttaggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
