Tenacibaculum retecalamus: PG912_10185
Help
Entry
PG912_10185 CDS
T08858
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
trt
Tenacibaculum retecalamus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sortilin-Vps10
BNR
BICDL2_C
PAC11
RnlA_toxin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX70618
LinkDB
All DBs
Position
2152040..2155243
Genome browser
AA seq
1067 aa
AA seq
DB search
MKRIFSIVFLLITPLLFSQEFSMDLVKKMKPRNIDPGGMSGRVTSIDVVESNPEIMYVGT
ASGGIWKSTSGGIKWKPIFEKELTASIGAVAIQQSNPSVIWAGTGEGNPRNSLNGGFGIY
KSLDAGKTWKAMGLEKTRHIHRVIIHPTNPDIVYVGAIGSPWGEHKERGVYKTTDGGKTW
KQILFNNIKTGAADLIMDPSNPNKLIAAMWEHKRDPWFFKSGGKGSGMYITHDGGENWKK
ITDKEGFPKGELGRIGVAIAPNNPDVIYALVEAKKNALYKSEDGGFKWKKINDKPGIGNR
PFYYSEIYVDPQNENRLYTVFTYINVSQDGGKSFKQLMPAYGVDNGVHPDHHAWWIHPKN
GKFMIDGNDGGLNITKDGGKSWRFIGNLPVAQFYHINVDNEFPYNVYGGMQDNGSWRGPA
YVWKAQGIRNSYWQEISFGDGFDVVPDKDDARYGWTMSQQGSVSRYDYKTGNNYNVKPTH
KDPNVKLRFNWNSAINIDPFDNSTLYFGSQFVHKSVDKGLTWEVISPDLSTNNPEKLKQA
ESGGLTMDATGAENHCTVLVIEPSLLQKDVLWAATDDGQVHITKNGGAIWTNVANNIKDL
PKNSWVTQIKASNKNKGEALLVANDYRRFNYEPYAYRTKDYGKTWQRIVGKNDVESYALS
IIEDPENANLLFLGTDDGLYISLTAGEKWTKWTNGFPTVPVKDLVIHPRENDLVIGTFGR
AAWVLDDIRPLRAMAKNNVTNQKLTLFAPPTAYQAASQQPTGSRFGADAMYQGENRRRGA
LISYYINKPIQKKQESKSKKQDKKDVRSSAVENKIKHDSIKLEIFDGTRKIRTLKFKTPK
ENGLHKTTWYLREKGVARASRSIRKQRREPGGVTVKPGTYKLKMTFGDAVSEQNINVEFD
PRLQISDEAINQKYNASKELETYQEKIATVVKQLVESKNTATSLKSKFTKEDKKKYKVEI
KASKEIIKKIDTLIAMYLGTIDKRQGITRNPEVTINNRFSTARWYVGSRFGKQTATEKQL
INQFKTSYTKGIEKTNIFFSEDWKKYKSTVEKIEISPFKKTSTFSIN
NT seq
3204 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaatattttcaatcgtatttttactgataacgccactcctattttcacaagaa
ttttcgatggatttagttaaaaaaatgaaacctagaaacatcgatccaggtggaatgagc
ggacgcgtaacttctatagatgttgtagaatctaatcccgaaataatgtatgttggtaca
gcatcaggtggaatttggaaatctacttctggaggtataaaatggaaacctattttcgaa
aaagaattaaccgcatctattggtgctgttgctattcaacaatcaaacccaagtgtaatt
tgggcaggaactggtgaaggaaatcctagaaacagtttaaatggcggattcgggatttac
aaatcgttagatgccggtaaaacatggaaagccatgggattagaaaaaacacgtcatatt
caccgtgtaataattcacccaacaaatcctgatattgtgtatgttggtgctattggttcg
ccttggggtgagcataaagaacgtggtgtttacaaaactactgatggtggaaaaacttgg
aaacaaattttattcaacaatataaaaacaggtgcggctgatttaattatggatccgtca
aatcctaataaattaatcgctgccatgtgggaacacaagcgcgatccttggttttttaaa
tcaggtgggaaaggaagcggaatgtacattacacacgatggtggagaaaattggaaaaaa
attaccgataaagaaggttttccgaaaggagaactaggtagaattggtgttgccattgcc
cctaacaatcctgatgtaatttatgctttggtagaagccaaaaagaatgcactttataaa
agtgaagatggcggatttaaatggaaaaaaataaacgacaaaccaggtattggaaatcgt
cctttttattattctgaaatttatgtagatcctcaaaatgaaaatagattatatactgtt
tttacctacatcaacgtttcgcaagatggcggaaaatcttttaaacaattaatgcctgct
tatggtgttgataatggagtgcatccagatcatcacgcatggtggattcatccgaagaat
ggaaaatttatgattgatggaaacgatggtggattaaatattaccaaagatggtggtaaa
tcttggcgatttatcggaaatcttcctgtagcgcaattttatcatattaatgttgataat
gagtttccgtataatgtttatggaggaatgcaagacaacggttcttggcgcggacctgct
tatgtttggaaagcacaaggaattagaaatagttactggcaagaaattagttttggagac
ggatttgatgtagttcctgataaagatgatgctcgttatggatggacaatgagtcagcaa
ggatcagtttctcgttacgattataaaacaggtaataattacaacgtaaaaccaacacat
aaagacccgaatgtaaaattacgtttcaactggaattcagctattaatattgatcctttt
gataattcgacgctttacttcggaagtcagtttgtgcataaatcggtagataaaggatta
acttgggaggtgatttcgcctgatttatcaaccaataatccagaaaaattaaaacaagcc
gaaagtggtggtttaactatggatgctactggtgctgaaaatcactgtaccgttttagtt
attgagccttctcttttacaaaaagatgttttatgggctgctactgatgacggacaagtt
cacatcacaaaaaatggtggcgcaatttggacaaatgttgctaacaacattaaagactta
cctaaaaactcttgggttacacaaattaaagcttcaaacaaaaataaaggtgaagcgctt
ttagttgccaacgattacagacgttttaactacgagccgtatgcatacagaactaaagat
tacggaaaaacttggcaacgtattgttggtaaaaatgatgttgaaagctatgctttatca
attattgaagatccagaaaatgcaaacttattatttttaggtactgatgatggattgtat
atttctttaaccgcaggagaaaaatggacaaaatggacaaatggtttcccaactgttcct
gttaaagatttagtaattcatcctcgtgaaaacgacttggtaattggtacttttggtaga
gctgcttgggttttagatgatattcgcccactacgtgctatggcaaaaaataatgttacc
aatcaaaaattaaccttgtttgcaccaccaactgcttatcaggcagctagccaacaacca
acaggaagtaggtttggtgccgatgcaatgtatcaaggtgaaaacagaaggcgtggtgct
ttaatttcatactacatcaataaaccaattcaaaagaaacaagaatcaaaaagcaagaaa
caggataaaaaagatgttcgttcgagcgcagtcgagaataaaatcaaacacgattctatt
aaattagaaatttttgacggaactcgaaaaataagaaccctaaaatttaaaactcctaaa
gaaaacggattacacaaaactacttggtatttaagagaaaaaggtgtcgctagagcttct
agaagtatcagaaaacaacgtagagaaccaggtggtgttactgtaaaaccagggacttat
aaattaaaaatgacttttggggatgctgtttctgaacaaaatattaacgttgaatttgat
cctagattacaaatatcagatgaagctatcaatcagaaatacaatgctagcaaagagttg
gaaacctatcaagagaaaattgctactgttgtaaaacaattggttgaaagtaaaaacaca
gcaacttctttaaaatctaaatttaccaaagaagataaaaagaagtacaaggtagaaata
aaagcatcaaaagaaattatcaaaaaaattgatactttaatcgcaatgtatttaggtaca
attgataaaagacaaggaattactcgcaatcctgaagttacaataaacaatcgttttagt
acagctcgttggtatgttggcagtagatttgggaaacaaacagcaactgaaaaacaatta
ataaatcagtttaaaacatcttacactaaaggaatagaaaaaacaaatattttcttttct
gaagattggaaaaagtataaatcgactgttgaaaaaattgaaatttctcctttcaaaaaa
actagtactttttctataaattaa
DBGET
integrated database retrieval system