Tenacibaculum retecalamus: PG912_10645
Help
Entry
PG912_10645 CDS
T08858
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
KO
K18890
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
trt
Tenacibaculum retecalamus
Pathway
trt02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
trt00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
PG912_10645
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
trt02000
]
PG912_10645
Transporters [BR:
trt02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
PG912_10645
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_21
RsgA_GTPase
AAA_29
AAA_22
AAA_16
Zeta_toxin
AAA_30
AAA_23
MMR_HSR1
FtsK_SpoIIIE
DUF87
Cytochrom_B_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX70695
LinkDB
All DBs
Position
2250938..2252644
Genome browser
AA seq
568 aa
AA seq
DB search
MSFAKLYRVRFIIAATSTILLAVFAVISPVILMTAIDDFVAHKDLTRLLYYTIAMLAVLL
VQVVFQFSFIYNANWVGQHIIRDIRTKTFRKILAFKMSYFNNSSVGKLVTRVVSDIETIA
NFFTQGVFMIISDVLKMIIVIIVMLYTNWKLAIIALATLPVLIYATKIFQIAIKSTFQDV
RNQVANLNGFVQERVTGMKIVQLFNREKIEYQNFVGINEKHKKAHVKTVWYYSIFFPIAE
ILSSIAIGLIVWFGGLQVVEDNAVTVGAIIGFIKMSQMLFRPLRQIADKFNQLQMGIVAG
ERVFNVIDTESSITKSGTITTDSLQGNINFKEVRFSYIKGEEVLKGISFNVKKGETIAIV
GATGAGKSTIINLINRFYEIDSGAIYLDDVLVEDYEINSLREKVAVVLQDVFLFSDTIFN
NISLKHQNISLEEVKQAAKQIGIHDFIMTLPNNYAYNVKERGAMLSSGQRQLIAFLRAYV
SKPSILILDEATSSVDSHSEQMIQHATDEITKKRTSIIIAHRLATIKKADTIIVMDKGII
VEQGNHNQLLQKENGHYKNLYDKQFRKD
NT seq
1707 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttttgcaaaactgtaccgtgtacgatttattatagcagcaacatcaacaatacta
ttggctgtctttgccgtaattagtcctgttattttaatgacagctatcgatgattttgta
gcgcataaagacttaacaagactattatattatacgatagcaatgttagctgttttacta
gtgcaagtagtctttcaatttagttttatatacaacgctaattgggttgggcagcatatt
attagagacattagaactaaaacatttcgaaagattttagcttttaaaatgagttatttt
aataattcatctgtaggtaaattagttaccagagttgtttcagacatcgaaacaattgct
aacttttttacgcaaggtgtttttatgattataagtgatgttttaaaaatgatcatcgtt
ataattgtaatgctttacaccaattggaagttagccattatcgcattggcaaccttacca
gttttaatttatgctacaaaaatttttcaaatagctataaaatctacttttcaagatgtt
cgtaaccaagtagcaaaccttaacggatttgttcaagaaagagttacgggaatgaaaatt
gtgcaactttttaatcgtgaaaaaattgaatatcaaaattttgttggtatcaacgaaaaa
cataaaaaagcacatgtaaaaacagtttggtattattcgatattttttccaattgctgaa
atattatcatctattgccatcggattaattgtatggtttggaggtcttcaagttgttgag
gacaatgcagtaactgttggtgctattattggttttataaaaatgtctcaaatgttattt
agaccacttcgtcaaatagcagataaatttaaccaattacaaatgggaattgtagctggt
gaacgtgtatttaacgtaattgacacagaaagctctattactaaaagcggtacaataact
acagattctttgcaaggaaacatcaattttaaagaggttcgttttagttatattaaagga
gaagaggttttaaaaggcattagttttaatgttaaaaaaggtgaaacaattgctattgtt
ggagctacaggtgcaggaaaatcgactattataaatttaataaatcgtttttatgaaata
gatagcggtgctatttatcttgatgatgttcttgttgaagattatgaaatcaactctttg
cgtgaaaaagttgctgtcgtattacaagatgtatttttattttctgatactatttttaat
aacatttcattaaaacatcaaaatatttcattagaagaagttaaacaagccgctaaacaa
attggaattcatgattttataatgaccctgcctaataattatgcttataacgttaaagaa
cgtggagcaatgctttcttctggccaacgacaattaatcgcttttttacgtgcatatgta
agtaaacctagtattttaattttagatgaagctacctcttctgttgattctcattcagaa
caaatgattcaacacgctacggatgaaattacaaaaaaaagaacctctataataattgcg
catcgattagcgactataaaaaaagcggatactatcattgttatggataaaggaataatc
gttgaacaaggaaatcataaccagttgcttcaaaaggaaaatgggcactataaaaacctc
tacgataagcaatttcggaaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system