Thiothrix subterranea: HMY34_07375
Help
Entry
HMY34_07375 CDS
T07831
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
tsb
Thiothrix subterranea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Big_9
Cadherin_CELSR2_9th
DUF11
Ribosomal_L27A
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQZ28588
LinkDB
All DBs
Position
complement(1499135..1503421)
Genome browser
AA seq
1428 aa
AA seq
DB search
MKYNRLTSLGILLMLFYGTLTQAAPAYNPNATPTDMTSLLDGPGLSVNNLSIPRGVSQQY
GVFSNGGDVWGVKSGVFLNTGNLGSIQAPNNGAAYSHNTKVQYLDLDLGKISANAKYDPA
IIEFDITPQGDRLNFVFAFGSEEYPEYVCSSFNDAFGLFVSGPGLTGTKNAAFLPDTGEA
IAVNNVNAGKPGANQNGAACNLNNVAYFVDNGNGSGSTSTQLDGYTRPITASLDGLTPGQ
SYHVKLALADAGDPAYDSGAFFKWLTSTKSTPVDLSLQAAVNTPNPAWNSEVELSYTLKN
ATAIATSLVQVELEWPVGLTWVSDDSGGRYNPNTGVWDADVVPASGSKILKIRARVGTAS
NYRVDGEITFAFNEDPDSTPFNRTSKSSEDDTASITVYPVDKPANQPPVISSDGGNASAV
LSVPEGQTAVTTVKATDPDGSALSYSLSGVDAVRFALNTATGALSFIAPPDYEYPIDADK
NNKYDVVVTASDGSLTDTQALTVQVLDASENAAPQITSNGGGTSATLSLDENVTAVTKVT
ATDSDGDYVTFDITGGADAALFKITTSTGRLSFISAPDYEKPQDANRDNIYEIDVRGSDG
VLNDTQFIRVQILNVQEGKPPVITSNGGSATATINVPENQQAVTTVTATDADGDTVTYRL
STGADDGLFQINTNSGQLAFIKAPDYETPKDANQDNIYILTVIATDGVFETTQLLFVTVT
KVVENAAPQITSNGGGNTASVSLEENLTAVTTVTATDPNGDPLTLSIKAGADANLFKITA
STGKLSFLNAPDYEKPQDINHDNYYEVEVMVSDGVLMDTQLIRVQILNVQEGKPPVITSN
GGNATANISVPENQQAVTTVTATDADGDTVTYSLSTGADDGLFQINTNSGKLAFIKAPDY
ETPKDANQDNIYILTVIATDGVFETTQLLFVTVTDGVENAAPKIISDGGGVSATLSVEEN
QKIATIVTATDTDGDAITYSISGGADAALFQISSGGTLSFAVAPDYEKPQDSNKDNIYVV
TVTASDGAQQVTQTLNLVVMDVLENLPPVMTSHAGAATVTLDVEENKTLVMVATANDPNG
EALTYSISGGADAALFKINASTGLLEFIAAPDYELPKDADKNNTYAVVVSATDAGGLSAT
QSITAKVTNIDDVPFVNVSLRAWLQGAYKSTDKMMRGDLHRLGLMPQLQPYGELKTAFGY
ATSSDMVSPFDYKGTETASAAVLAATGGDAPVDWVLVELRNVFDPGKRVAVAAGLLQRDG
DIVDAATGSKVLPITNADDGLYYIAIRHRNHLAVMTKEPVSVSRGIPAAVDFTALATKVY
NSVGARLESSGVALMWAGDANNSNTIIASGPGSDNSVLLGAILVAPENTNVNAAFRLPGY
YSTDFNLDGTTLYTGPNNDINLMLGNILMHPGNASFSGNYIIRGEAPL
NT seq
4287 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatacaatcgactaacgtcattgggcatcctgttgatgcttttttatggcacattg
acacaggcagcccctgcctataatcctaatgccactcccaccgatatgacgagtttgcta
gatggccccggcttatcggtaaacaatctttctattccacggggtgtctcccaacaatac
ggcgttttcagcaacggcggtgacgtttggggcgtgaaaagtggggtttttctgaatacc
gggaatctgggtagtattcaagcaccgaataatggcgcggcgtattcgcacaataccaag
gtgcaataccttgaccttgatcttggcaaaattagcgcgaacgccaaatacgaccccgcg
atcattgagtttgacattaccccgcaaggggataggcttaactttgtgtttgcgtttggt
tcagaggaataccctgaatacgtgtgtagcagttttaacgatgccttcggtttgttcgtc
tctggccccggattgacgggaacaaagaatgcggcatttttaccggataccggcgaagca
atagccgtcaataatgtcaatgcaggcaagcccggtgctaatcagaacggggcggcttgt
aatctgaataatgtagcttactttgtagacaatggtaatggcagcggtagcacctcgacg
caattggatggttatacgcgcccgattaccgcgtctttggacggtttgacaccggggcaa
tcttaccatgtcaagctggcgttggcggatgcgggcgacccggcttatgattctggcgca
ttttttaagtggctaacgagtaccaaatccacgccagtcgacttgtccttgcaggccgca
gtgaataccccgaatccggcatggaacagcgaggtggagctgagttatacgctcaaaaat
gccacggctattgcgaccagtttggtgcaggtggagttggaatggccggttggtttgacg
tgggtcagcgatgattctggcgggcgttacaaccccaatactggcgtgtgggatgcggat
gtggttccggcgagtggttctaaaatcctgaaaattcgggcgcgggtgggaacggcgagc
aattatcgcgttgacggggaaattacttttgcgttcaatgaagatcccgactcgacgcct
tttaaccgcaccagtaagtcgagtgaagacgataccgctagtattacggtgtatccggtg
gataaacccgcgaatcagccgcctgttattagcagtgatggtgggaatgcgagtgccgtt
ctgtctgttcctgaggggcaaacagcggtcacaaccgtgaaagcgactgacccggacggg
agtgcgcttagctacagcctcagtggtgtggatgcggtgcgctttgcactgaatacggcg
acgggtgcgctgtcttttatcgcaccgcccgattatgaataccccattgatgcggataaa
aacaacaagtacgacgtggtggtgactgctagtgatggcagtttaaccgatacccaagcg
ttaacggtgcaagtgctggatgcgagcgaaaatgctgcgccacaaattaccagcaatggc
ggcggtacgagcgcgacgctgagcttggatgaaaatgtaacagcggtaactaaagtaacc
gcgactgattcagatggcgattatgtaacctttgacatcaccggtggcgcggatgcggca
ctattcaaaattaccaccagtaccggcagattaagttttattagcgccccggattacgaa
aagccgcaagatgctaaccgtgacaatatttatgaaatagacgtcaggggcagtgacggt
gtgttaaatgatacacaatttattcgcgtgcaaattctcaatgtgcaagaaggcaagccg
ccggtcattaccagcaatgggggcagcgcaaccgccacgattaatgtgcctgaaaatcag
caagcggtaacaaccgtgaccgccacggatgccgatggcgataccgttacctaccgttta
tcgacgggcgcggatgatgggctgtttcaaattaataccaatagcggccaattagccttt
atcaaagcgccggattatgaaacgcctaaagatgccaatcaggataatatttacatatta
acggtgattgcaacggatggcgtgtttgaaaccacacaattgttattcgtcacggtaacg
aaagtggtggaaaatgctgcccctcagattaccagtaatggtggaggcaataccgccagc
gtcagtttagaagaaaacctcacggctgttaccaccgtcactgcgactgatcccaatggc
gacccgctaacgctgagcattaaagccggtgcagatgccaatttatttaaaatcaccgcg
agtacgggcaaattaagtttcctgaatgcacccgattacgaaaagccgcaagatattaat
catgataactactacgaagtggaagtcatggtgagtgacggtgtgttaatggatacacaa
cttatccgcgtgcaaattctcaatgtgcaagaaggcaagccgccggtcattaccagcaac
ggtggtaatgccactgcaaacatcagcgtacctgaaaatcagcaagcggtgacgactgtg
accgccacggatgctgatggcgacaccgttacctacagtttgtctaccggcgcggatgat
gggctgtttcaaattaataccaatagtggcaaattagctttcattaaagcgcccgattat
gaaacgcctaaagatgccaatcaggataatatctatattttaacggtgattgcgacggat
ggcgtgtttgaaaccacacaattgttattcgtcaccgtaacggatggcgtggaaaacgct
gcacccaaaattattagtgatggtggtggcgtgagtgctaccttgagtgtggaggaaaat
caaaaaatagcgacgattgtgacggctaccgatacagacggcgatgcgattacctacagc
attagcggtggcgcggatgcggcgctattccagatcagcagtggcggcacgctcagtttt
gcggtcgcgcccgattatgagaaaccgcaagacagcaataaagataatatctacgtagtc
acagtgaccgccagtgatggcgcacagcaggtgacacaaacccttaatttagtggtgatg
gatgttttggaaaatttgccgccggtgatgaccagtcatgcaggggcagccactgttacc
ttagacgtcgaagaaaataaaaccttggtcatggtggcgacagcaaacgaccccaatggc
gaagccttgacctatagcatcagcggcggtgcggatgcggcgttatttaagatcaatgcg
tcgactgggctgttggaatttattgctgcccccgattatgaacttcccaaggatgcagac
aaaaacaatacgtatgcggtggtggtcagtgcgacagatgcaggtggtttgagtgcgacg
caaagcataactgccaaagtgaccaatattgatgatgtacctttcgtcaatgtgagtctg
cgggcgtggttgcaaggggcttacaaatccactgataaaatgatgcgcggggatttgcac
cgtttggggttaatgccgcaattacaaccttatggggagttgaagacggcgtttggctat
gcaacttcttccgatatggtgtcaccctttgattacaagggtacggaaaccgcatcggcg
gcagtgttggcggcaacgggaggcgatgcgccggtggattgggtattggtggaattgcgc
aatgtcttcgaccctggtaagcgggtagcggtagcggcgggcttgctgcaacgtgatggc
gatattgtggatgccgccactggctccaaagtgttgccaattaccaatgcagacgacggc
ctgtattacatcgccatacgtcaccgtaatcatttggcggtaatgaccaaagagcctgtc
agtgttagccgtgggataccggcggcggtagattttacggcacttgctaccaaggtgtat
aacagtgttggggcacgtttggaaagttcgggcgttgcattgatgtgggcgggagatgcc
aataatagcaatacgattatcgcgagtgggccgggtagcgataacagtgtgttattggga
gctattttggtcgcgccggaaaataccaatgtgaatgcggcgtttcgattgccgggttat
tattccaccgatttcaatctggatggcactacactttataccggcccgaacaatgacatc
aatttgatgttgggcaatattttgatgcatcccggcaatgccagctttagcggcaattac
attattcgcggcgaagcaccgctctga
DBGET
integrated database retrieval system