Thiothrix subterranea: HMY34_14880
Help
Entry
HMY34_14880 CDS
T07831
Name
(GenBank) tandem-95 repeat protein
Organism
tsb
Thiothrix subterranea
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
LRR_8
LRR_LRWD1
Cadherin_3
LRR_14
LRR_9
LRR_EndoS
GspH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQZ29940
LinkDB
All DBs
Position
3013744..3016851
Genome browser
AA seq
1035 aa
AA seq
DB search
MNPKLIACMVLIMALLPFTAQANVTPIATPQAVIVDEDTAIPISLIASDTDTDEKLLTYK
ITLQPSTGVVSQLKSGSKQLIYTPSANFSGTDSFYFQVSDGRLISKTAKVSITVNPVNDA
PVVPSVTTLSTEEDAAKSMTFSGTDIERDTLSYVIHTKAAHGQAIIQGGKVTYTPEPNFF
GTDSFTYTAFDGKNYSAPGHINVTVIPVNDAPIGQPQTVTLPASQPSIITLQATDPDNDK
LSYQLANSPNPKGSLGTMNGSQVIYTPKAGLSVDSFGFTAHDGIVASLPALVTINIQSAL
TTVTDPSLLQCLKNIAPTAADQQTLVTFSCNDLDLSNADLTQLTYLPNLRNLDLSNTKLT
SINGLSDLKQLTKLNLGSNYIENISALSDMQQLQILNLGFNEISDITPLSNMNSLQELYL
DANKLSNLSALSNKKSLLKLYLDDNQVNSIAELSALTNLTHLGLSYNQINSISALSKLKR
LQSLALEANDLSNISALAEFVNLQSLYLSGNLLTDISPLTYLVNMKTLELSFNQITNVIF
LQNMVSLINLTLDFNNLTEVTGLTNLMSLQHIDLENNALNTISGLQNLSAVNGLLQLSHN
QLLDEDIILLASMRNSYSLRLEDNCLVNISLPETIQVYGKSWQFPGSKCGGIAPVAIGKT
VEVYPNTATIITLDAYDPNDKTMIFQLDSIAVNGGVLSASIGKLASNQIIFFPNPDHLKS
AGNFTFSVTNSDGEKSQKVTVQLRVIPPILETCFGKNIPSDEDLLKLQSLSCENKGNNVT
DISALPMFLPNLTHLSLGGNAISDYSTLLDFPELIGLSLKGNVLDATALQIIAQLSKLSI
LSLEKSQLNDLDINFLAGLTNLTQLYLGGNKITNINPLSQLKRLDVLTLDNNFIGDLTPL
ASLTSIRTLSLNNNGLSKNQALNLAVLSKLQALIYFEIDNNGLTSINGLENLTNLSVLTV
RYNRLATVNNLKVFPQAMTLHLQGNCLSDSDLFGWPSNISLIGSNSSNQRSLFNNQCPVY
PQYISAIAGVWDKSH
NT seq
3108 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccccaagttgatcgcatgtatggtattaatcatggccttgttaccattcactgca
caagcaaatgttacaccaatagcgacaccacaagccgttatagtggatgaagatacagca
atccccattagcttgatagcttctgatacagatacagatgaaaaactattaacgtataag
atcacgcttcagcctagcacgggtgtcgtgtcacaactaaaatcaggtagtaaacaatta
atttatacgccatccgcaaatttttcaggaaccgacagtttttactttcaagtcagtgat
ggcagattaatttctaagacagcaaaagtatccatcactgtgaaccctgtgaacgatgct
cctgttgtacctagtgtgactacattgagtacagaggaggatgcggctaagtcaatgacg
ttcagcggaacagatattgagcgtgataccttaagttatgttattcacactaaagccgcg
catgggcaagctattattcagggggggaaagttacttacacgccagaacccaattttttc
ggtacagacagttttacttacacggcttttgatggcaaaaattattctgcaccgggacac
attaacgtgacggtaatccccgtgaatgatgcaccaattggacaaccacaaaccgtaacg
cttccggctagtcaacctagtattattactttgcaggcaacagatccagacaatgataag
ttaagttatcaattagcaaattcacccaatccaaaaggcagtttgggaactatgaatggc
agccaagttatctacacgcctaaagccggtcttagtgtggacagttttggatttactgca
cacgatggaatagttgcatcgctgccagcactggtaacgataaacatacaatcggcattg
actactgttacagatcctagcttattacaatgtttgaaaaatattgcaccaaccgcagcc
gatcaacaaacattggtaacatttagctgcaatgatttagatctttctaatgctgattta
acacagctaacatatcttcctaatctgcgtaaccttgatttgtcgaacactaaattgacg
agtattaacggtctatctgacttaaagcaactaaccaaattaaatctaggctctaattat
attgaaaatattagtgcattgtcagatatgcagcaattgcaaatcttgaatttgggtttc
aatgaaattagtgacattactcctttgtcaaatatgaacagtctacaagagctttacttg
gatgctaataagttaagtaatttgagtgcactatcaaataaaaaatcactactaaagctt
tatttggatgataatcaagttaattctattgctgagttatcagccttgacaaatttgaca
cacttaggtttgagctataaccaaattaattctattagtgctttatctaaattgaaacga
cttcagtcattagcattagaagctaatgatttatcaaatatttctgcactagcagaattt
gtgaatttacaatcactttatttaagtggaaacttgctaacggatattagtccgttaact
tatcttgtaaacatgaagacgttggaattgagctttaatcaaatcaccaatgttattttt
ttgcaaaatatggtcagcctgattaacttgacgctagattttaataatcttactgaagtt
actggtttgacaaatttgatgagtttacaacatattgatttggagaataatgcgttaaat
accattagtggtttgcaaaatctaagtgcagtgaatggtttattgcaattaagtcataac
cagttgttagatgaagatattatattgcttgcgtccatgcgtaatagctatagcctacgt
ttagaagataactgtttagtgaatatttcattacctgaaactattcaggtttatggtaag
tcttggcagtttccaggctcaaagtgtgggggcattgcgcctgtggctattggtaaaaca
gtagaggtttatcctaacactgcaacaataattaccttggatgcttatgatcctaatgat
aaaaccatgatttttcaattggatagtattgcggttaatggtggagtgctaagtgcttct
attggaaaattagcaagcaatcagataatatttttccctaatcccgatcacttgaagagt
gcgggtaatttcaccttctcagttacaaatagtgatggtgaaaagtcacaaaaagttacc
gtgcaattgcgtgtaattcctccgattctggagacttgctttggtaaaaatattcctagt
gatgaggatttgttaaaattacaatctttgagctgtgagaataaaggtaacaatgttacg
gatattagtgcattgcctatgtttttgcctaacttgacgcatctatcgttaggaggcaat
gctattagtgactattcaacgttgttagattttcctgaattgataggtttgtctttaaaa
ggtaatgtgttagatgctacagcattacaaattatcgctcagttatcaaaacttagtatt
ctcagtttagagaaaagtcagttgaatgacttagatattaattttttggctgggttgacc
aatctaactcaattgtatttgggtggtaataaaattactaatattaatccgttaagtcaa
ttaaaacgtttggatgtcttgacattggataataattttattggtgatttaacgcctttg
gcgtcgttaacgagtattcgtactttgagtttgaataataatggattaagtaaaaatcaa
gcgcttaatttggctgttttgtcaaaattgcaagcgttaatttattttgagattgacaat
aacggattgacgagtattaatggtttggaaaatctaacaaacttgagtgtactaacggtt
cgttataatcgcttagcgacagtcaataacttgaaggtatttccgcaggctatgactttg
catctgcaaggaaattgtctcagtgattcagatttattcggttggccaagtaatatcagt
cttattggtagcaatagtagtaatcaacgcagtttgtttaataatcagtgtcctgtttat
ccgcaatatatatcagcaattgcaggcgtttgggataagtctcactag
DBGET
integrated database retrieval system