Thiosulfatimonas sediminis: THMIRHAS_04680
Help
Entry
THMIRHAS_04680 CDS
T06859
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
tse
Thiosulfatimonas sediminis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4214
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBP45095
UniProt:
A0A6F8PSK0
LinkDB
All DBs
Position
516830..522640
Genome browser
AA seq
1936 aa
AA seq
DB search
MALTTQQQAELISVYIAAFDRAPDADGLDFWAKSITDGVNPTVTDVSNAIFNDQTIPEVN
ANYSDALTNEQFVTKVYQNVFNREPDAEGLAFWAGAMNDGINSRGETVVEMFKSLSNPGS
EADKALFDNKVAVGTYFAIDVGSNDVALAIQALDNVTADPASIDAAKAVIDGVDAIGQTF
TLTEGADDFTPTSQQENSQTTVGDDQFYAGSVQGGGAHTLGSTDSIDGGDGTDTIRVVED
RDATATTLFPKMQNVENVELQALEDLTIDFTNTTGVEEAMNYQSVGNIVIQSLVDDADFK
FFNTASDMSVGYFNNNDADNEADVMFDQANGSSITFTTATEADAIDTLNIELDNDTYTID
NAANTGFFGLNGTNNLDTINMMGNADVTVADLTGSLTQDITTFDASMLEGTLETNLLGNN
LGINYDGAMGANTLVIGQGDNDITMQEAGDLVVLSSTGFDANDMMDGAGGTDRLEIHFND
TDAATDLDGNGLDTDVLDAINNTVNTEELVIDVWSQNTDDTAIAGENITLDRGLITSDFS
TFIFDDTRTDGLGATNNVQDTDISGTVTVTNATAADDYQIAVDQVTTMSFTAAAGETTLN
VTHNDADLVADMIGSFDSDVFTTTNLTVNAADENYMLGASQVDAGATLNLLGDADQMTAN
FGAEGDGATLDASTLVTTTDRNDGINNDFNVFTVTNGFDTTVKGTDQDDNIIGNAGVDTL
HGNAGDDIIVGGAGDDTIEGGDGNDMIFAGDGTDAAQLEGVDKLYGNAGDDTFYFTYNAD
ATLEGITSADMIDGGADNDTVQMLTAGAVLSDEIFNGFTSVEELTLAAGDNVVTINEIAD
SKVDFGTINAEGNGNDDINIGEGFDRELTINLGGGNDIVAADLSSANITVNIDAGNLDAN
DNLDFGDDAGDVLNIITENGIADTAGVTNLETLNIVDENGTNDLGQTTLVRIGDELFDNN
TTPVDAFTVNAETVADDLVIDATDISGANIITINTGAGDDMIFGSANNDIINAGGNQTGG
VNTIYGGAGADQIDASEGDNDITYGYVADSNGTRTEIDTVTGFVSGSDRIVLDTDMLAGN
VLVAGSSMNAANFADAQSAVNNVPAGEIAYVFQTDDQILWVDINRDGTLNNDDLRINLDG
VSAIEAGDVVNGDVYYDVDAAGNLLHVTAAAVPRAFEMNNDILGATIFVDGVDSGVTTFA
AISPVPSAIDTLTVGGTTDISGAGVATFSSAAFEGGSNVTMTSAQHTAYVTPANASLFGV
QTINITDAVTMTGDAAVENYALLSTAADNFTVASTTQNVDISAGGNDTVSISGTFSGTIT
GEAAGDIINLADGTNIAANATIASGNGETINVNGDATMTDAQYDAVVITDTVVTTNNLTI
TTAATNLAVDADIEEYTLNAGGVIAIANNLDVDINGAAGAAVTVVVGGATVASGAEYDLA
NGADIITVTDGADITNINDGAATTAESITVADNATVTMTAAQHTEITQAAGVETIIFDDR
GGVDAVTADADVENYEIDGLGTDSSFVFTLSATGQNITSEGSTNTTVVFDGALGAFTSDL
NDEIAETGDVIRVTNSGVGTTVDISGVLNSDDSDVALDLNNEFLTVTLTQEQHEAYSSVI
NTANGQTLDVDTAGAVTARVGVEAYIIDDEANSITVNAGQTDVNIDSDDASADTIIIGGN
TVTGEYVIDATDTIEATDGANITGVSDGGAAGNATGGLLDLTGGITMTVAQLNDFTTNGI
TAAGAADAVTLTDAGTITSADAAIETFTLADGTNSITFDAADADRDLQTVNLGIGANTVI
ITNNATVDDGDDSAVTITNFGSDDVLTTGSSDGLFYNNFAGGATAVADGSIIEVDATQFQ
NGVLSNTANVLAWLNAETVTGAAGNALITVVAYTGNGSAGIYQLEETGGVAGAFDTIELI
GVVNATDNVFVGANFA
NT seq
5811 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttaacgacacaacaacaagcagaactaatcagcgtctatattgccgcgtttgac
cgcgcgccggatgcagacggtttagacttctgggcgaaatcaattactgatggtgttaac
ccaacggtaacggatgtttcaaacgcgatttttaatgaccaaactatccctgaagtgaat
gcgaattactcagacgcattaactaacgaacagttcgtaaccaaagtttaccaaaacgta
tttaaccgtgaaccagatgctgaaggactggcattctgggcaggtgcgatgaatgatggc
atcaactcacgtggtgaaaccgttgttgagatgtttaaatctctatctaacccaggttca
gaagcagataaagcgctgtttgataacaaagttgcagtagggacttacttcgcaattgac
gtaggttcaaatgacgttgcgcttgcaatccaggcgctagacaacgtaactgcagatcca
gcgtctattgacgctgcgaaagcagtgattgatggtgtagatgctatcggacaaactttt
acgttgactgaaggtgcggatgacttcactccaacttcacagcaagaaaactcacaaaca
actgttggtgatgatcagttctatgcaggttctgttcaaggcggtggtgctcacactcta
ggttctacggattctatcgacggtggtgacggtacggacacaatccgtgttgttgaagac
cgtgatgctacagctacaacccttttcccgaaaatgcaaaacgttgaaaacgttgagctt
caagcactagaagatctaaccattgacttcactaacacaacgggtgttgaagaagcaatg
aactaccaatctgttggtaatattgtgattcagagccttgttgacgatgcagatttcaaa
ttcttcaacactgcatctgacatgtctgttggttacttcaacaacaacgatgctgacaac
gaagcagatgtaatgtttgaccaagcaaatggttcaagcatcactttcacaacagcaaca
gaagctgatgcaatcgatacgctaaacatcgaactagacaacgatacctacacaatcgac
aacgcagcgaacactggtttcttcggtctaaacggtacaaacaacctagacaccatcaac
atgatgggtaatgcagatgtaactgtagcggatctaacgggttctttgactcaagacatc
acaacatttgatgcatcaatgttagagggaactctagaaactaaccttcttggcaacaac
ctaggtattaactacgatggtgcaatgggtgcaaacacattagttatcggtcaaggtgac
aacgacatcaccatgcaagaggcaggtgacctagtggttctatcttcaactggttttgat
gcaaatgacatgatggatggtgccggtggtactgaccgtctagaaatccacttcaacgac
actgatgcagccactgatctagatggcaacggtttagatactgacgttcttgatgcaatc
aacaacacagtgaatactgaagagttggtaatcgatgtatggtcacaaaatactgacgat
acagctattgctggtgagaacatcactctagatcgtggtctgatcacgtctgacttctca
acgttcatcttcgacgatacgcgtacagatggtctaggtgctacaaacaacgttcaagat
actgacatctctggtacggtgactgttaccaatgcaacagcagcggatgactaccaaatc
gcagttgaccaagttacaacgatgtctttcactgccgccgctggtgaaaccacgctaaac
gtgacgcacaacgatgcggatcttgttgcagatatgattggttcgtttgattctgatgtc
tttacaacaactaacctaacggttaatgctgcagatgaaaactacatgctaggcgcgtca
caagttgatgcgggtgcgactttgaacctactaggtgatgcagatcaaatgactgcaaac
ttcggtgcagaaggtgatggtgcaaccttagacgcttcaactctagtaacaacgactgat
cgtaatgatggcatcaataatgacttcaacgtattcacagtcacaaacggtttcgatacc
acggttaaagggactgaccaagacgataacatcatcggtaacgcaggtgttgacacactt
cacggtaatgccggtgacgacataatcgtaggtggtgcaggtgacgataccatcgaaggt
ggtgacggcaacgacatgatctttgcgggtgatggaacagatgcggctcaactagaaggt
gttgataagctttacggtaatgccggtgatgatacgttctacttcacatacaacgcggac
gcaacacttgaaggtatcacttctgcagacatgattgatggtggtgcggacaacgatacg
gttcaaatgctaacggctggtgcagtactaagtgatgaaatctttaacggcttcacgtca
gttgaagaactaacactggctgcaggtgacaacgtcgttacaatcaacgaaatcgcagat
tcaaaagttgacttcggcacaatcaatgcagaaggtaatggtaacgatgacatcaacatc
ggtgaagggtttgatcgtgaactaaccatcaatctaggtggtggtaacgatatcgttgca
gcagatctatcttcagcaaacattactgtaaacatcgatgcaggtaacctagatgcgaat
gataacctagacttcggtgacgatgcaggtgacgtattaaacatcattacagagaatggt
attgcagacactgctggggtaactaatctagaaacgctaaacatcgttgatgaaaacgga
acaaacgatcttggacagacgacactagttcgtattggtgacgagttgtttgataacaac
acaacgccagttgatgcgttcactgtgaatgcagaaacggtagcggatgatttagttatc
gatgcaacagatatttctggtgcaaacatcattaccatcaacactggtgcgggtgatgac
atgatcttcggttctgcgaacaatgacatcattaacgcaggtggtaaccaaacaggtggt
gtgaacactatctatggtggcgcaggtgcagaccaaatcgacgcgtctgaaggcgacaac
gacatcacttacggttatgtagcagactctaacggtacgcgaacagaaatcgatactgtg
actggatttgtatcaggcagcgatcgtatcgttctagatacagacatgctagcaggtaat
gtattggtagcaggttcaagcatgaatgctgcgaactttgcagatgctcagtctgcggta
aacaatgtaccggccggtgaaatcgcttacgttttccaaacagatgatcaaatcctatgg
gttgacatcaaccgtgatggtactttgaataacgacgatctacgtatcaaccttgatggt
gtttctgcaatcgaagcaggtgacgttgtaaacggtgatgtttattatgatgttgatgct
gctggaaaccttctccacgtgactgcagcagccgttccacgtgcatttgaaatgaacaac
gacatccttggtgcgaccatctttgttgatggcgtagattcaggtgttacgacttttgct
gcaatctctccagttccttctgcgattgatacactgactgttggtggtacgactgatatc
tctggtgcaggcgttgcaacattcagttcagctgctttcgaaggtggttcaaacgtaact
atgacaagtgctcaacacactgcctatgttacacctgcaaatgcatcactgtttggtgtg
caaaccatcaacattactgatgctgttaccatgacaggtgatgcagcagttgaaaactat
gcattgctaagcactgctgcagacaactttactgttgcctcaacaacgcaaaatgttgac
atctctgctggcggtaacgatacagtttctatttctggtactttctctggaacaattact
ggtgaagctgctggcgacatcattaaccttgctgatggaacaaatattgctgcaaatgca
acaattgcatcaggtaatggtgaaaccatcaatgttaacggtgatgcaaccatgacagat
gctcagtatgatgctgttgtcattactgacacagttgttacgactaacaacctgacaatc
actactgcggcaacgaatttagctgtagacgcagatattgaagagtatacgttgaatgca
ggcggagtgattgcaatcgctaacaacctagatgtagacatcaacggtgctgcaggtgct
gcggtaacagtagttgtaggtggcgcaactgtagcttctggtgctgaatacgatctagca
aatggtgcagatatcatcactgtaacagacggtgcagacatcactaatattaacgatggt
gcagctactacggctgagtctattactgttgctgataatgcaactgtaacaatgactgca
gcacagcatactgaaatcacacaagctgcaggtgttgagacgattatctttgatgatcgt
ggtggtgttgatgcagtgactgcagatgctgatgttgaaaattatgaaatcgacggtctt
ggtactgattctagtttcgtatttacactttcagcaacgggtcaaaatatcacttcagaa
ggtagtacaaatactacagtagtatttgacggtgcccttggtgcatttacatcagacctt
aatgatgaaattgctgaaactggtgatgtgattcgtgttacaaacagtggtgttggaact
acggtagatatttctggtgtactaaactctgatgattcagatgtggctcttgacttgaat
aacgagttcttgactgtgacgctaacacaagagcaacatgaagcttactcaagtgttatt
aatacagcaaatggccaaacattagatgttgacactgctggtgcagtaaccgcccgtgtt
ggtgttgaggcatatattattgatgatgaagccaacagcattacagttaatgctggacaa
actgatgtaaacattgattctgatgatgcttccgcagatacaattatcattggtggtaac
acagtaactggtgaatatgttattgatgcaactgatactattgaagcaaccgatggtgcg
aatatcacaggtgtaagtgacggtggtgcggcaggaaatgcaactggaggtctattagat
cttactggtggtatcacaatgaccgttgctcagttgaatgacttcactacaaacggtatt
actgctgctggtgctgctgatgcagtgactctgactgatgcaggtacgattacttcggca
gacgctgcaattgaaaccttcacattagctgatggtacaaacagcatcacatttgacgct
gctgatgccgatcgtgatcttcaaactgtgaatctaggtataggtgcaaacactgtaatt
atcactaacaacgcaactgttgatgacggtgatgattcagcggtcactatcacgaacttc
ggttcggatgacgtattgactactggtagctctgatggattgttctacaacaacttcgca
ggtggtgcgacagcggttgcagacggttcaatcattgaagtcgatgcaactcagttccaa
aacggtgttctttctaacactgcgaacgtactagcttggttgaatgctgagacagtaacc
ggtgcagctggtaatgcgttaatcactgttgtggcttacactggtaacggatcggctggt
atctatcagcttgaagaaactggtggtgtagctggtgcattcgatacaatcgagttgatc
ggtgttgtgaatgcaactgacaatgtatttgttggtgcaaacttcgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
