Trachymyrmex septentrionalis: 108745528
Help
Entry
108745528 CDS
T11226
Name
(RefSeq) DENN domain-containing protein 4C isoform X1
KO
K20163
DENN domain-containing protein 4
Organism
tsep Trachymyrmex septentrionalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsep00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tsep04131
]
108745528
Membrane trafficking [BR:
tsep04131
]
Protein recycling
Rab GTPases and associated proteins
Other Rab GTPase associated proteins
108745528
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DENN
dDENN
uDENN
DUF2464
PPR_2
PPR_long
PPR
PPR_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108745528
NCBI-ProteinID:
XP_018337210
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1600 aa
AA seq
DB search
MDDRRVADYFVIAGLPGQDDELSEDNETNDKLEAWCQEGTHLKDMHMPPPITDLAVIFPA
LGEHCPEGYTLLEYTVSGFPADLNHGSLRTNECYLCYRRGRDKPPLVDIGVIYDGKERIM
QDAEMVLETPKGHVANVNNSTSKIFVTYRRASRKMPCNSLVVTDICVILTNKGESPPHAF
CVINKNLNKGMLGSDVFLCYKKSMNRANLVSFKPAILYKYPMVDYNSFVFPNSVAMFCLP
MGATIECWPKVACKPKPVFSTFVLTVADAAQKIYGSAITFYEEVQMELDTSNCKNSQEIM
DTVENNKNSDNMEITKDKPQVKMKMFKRFGILKKLSILELERLQYTDPASQSLNISKSIC
ILSHWPFFDTFEKFLVFLHRMVNDKPQSVPIEKYISYFLCDIPFPSPQRPRILVQLSSQD
RLILTQPEDLALPRSGASFRQLLINLGPDNCLLILLLILTEQKILVHSLRPDVLTSVSEA
IAMILFPFKWQCPYIPLCPLGLAEVLHAPLPFLIGVDSRFFDLYDPPSDVNCVNLDTNNI
AICDDKKYLNVKLLPKKAARQLRNWLELLSSKIISWGKTSCSQKDRGDEDFSVDREFQQK
RKEQALELEIQDAFLRFMATILKGYRSYLLPITKAPTVGTTDPTSLFNIQAFLRSRDKAH
AKFYTMLVRTQMFIRFIEERSFVSDMDMAGLAFFDECTERVEEENVTLLELDESQHSERT
VFIPPPEAGTNQTPIIYKSFKLDPELMRPQKNFCLKNPSLSAFGMVPGSPMARRTKHEIK
VAQRMARKQAAMPDRWGRCLLGTCHSLWFLHLPAMLQVSSQPAAVLHQAYEILVKMQKLR
LDPMEEVCYRAMMQLCGVYGQPVLAVKLLFHMKRSGVQPNALTYGFYNKAVLEATWPSDM
TNSSQLMWNKLRNVIVGAALFKKAGKKSARRRLSSNVDFLTTDKTECMEHALSRSSLDSS
HSQDTEAAHSDSTKGSSVSDLPGFGAFELKAKLLRQNSIVKDQTTLSILQSDELEQTPSN
PRLTRSVESPLKSPIRTPVTENDPLGALINDETPIVSPSEENDSNCSTSTLTVLNNTTEE
RPGGPLLFRSNILPRSATFHQAVDESGMTVGGHLQRSETMPHSVAQQGEQEREKERLEIS
SLWSQNKDSVTSSLSSLGSSLKLSFGRYSTGGLAFAKNKDLISSNQLIESLSLSSYISPS
SLTGKKSNEIILGGLNSLKSAATTVVKKFDEIKEAISATSTPVKNKEREQKIAYGVSHES
LDSLTDSIQDRNETRASGDGNLDLCPLYELAECLYPKGTRELEERLAIELVLSSASRCHH
CAAILYDEEIMAGWQPEDSNLNTVCQYCDKATVPLLTATILDYRSEVSEKNSDPLMGALV
ELLDQPKESLEPITVPYLNPLVLRKELESVLSQEGDACLTKHKFIQEHPIVYWNLIWYFE
RINLTSHLPDLWLANDKNSELQRTIGLVGVRTIWDNERLHMDRLPMYLQWKSNSTEDRTL
MQTVITYVRCNDLAEPILRVALERSKHQTDDHPFSIYRDILFLAFTVLGRTNIDQGVFDR
EYSLSLEKFSENDEKLLHKIDAPPTMMSVYCRYYFKQLNV
NT seq
4803 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgacagaagggtagcagattattttgttattgccggtctacctggtcaggatgat
gagcttagcgaagataatgagactaacgacaagctggaggcttggtgtcaggaaggcact
catctcaaagatatgcacatgccgcctcctatcacagatcttgccgtaatatttcctgca
ctgggggaacattgtccggagggatatacactcttagaatatacggtatccggttttcca
gcagacttaaatcatgggagtttacgaacaaacgagtgttatttgtgctatagaagaggg
cgggataaacctcccttggttgacattggtgtaatatatgatggaaaagaacgtataatg
caagatgccgaaatggtattagagacccctaaaggccatgtggcgaatgtgaataattct
acgtcaaaaatttttgtaacatacagacgagcgagtcggaagatgccttgcaattccctt
gtggttacagatatttgtgttatcttgacaaataaaggagagagtccgccacacgctttc
tgtgttattaataagaatttgaacaaaggaatgctgggcagcgacgtatttttgtgctac
aagaaatctatgaatcgcgctaatttagtatcatttaaaccagcgatactctacaaatat
cccatggtagattacaacagtttcgtctttcctaattctgtcgccatgttttgtctaccg
atgggtgcgactatagaatgttggcctaaagtagcgtgtaaacctaagccggtattctcg
acgtttgtcttaacggttgccgatgctgctcaaaaaatatatggttcagcaataacattt
tacgaggaagttcaaatggagctcgatacttcaaactgcaaaaatagtcaggagatcatg
gacacagttgaaaataataaaaacagtgataatatggagataactaaagataagccacaa
gtgaaaatgaagatgtttaagagatttggcatactcaagaagcttagtatattggaactg
gaaaggttgcagtacacagatcctgcgagccaatcgctgaatattagtaaatccatatgt
atactatctcactggccgttttttgacacgttcgagaaatttttggttttcctacaccgc
atggtgaacgataagccgcagagtgtcccgatcgagaaatatatctcgtactttttatgc
gacataccgtttccaagtccgcaacgtccacgaatcttagtacagctcagtagtcaggat
agattaatcttgactcaaccggaggatttagctctgcctagatcaggcgcaagtttcaga
caactactgataaacttgggacctgataattgtttattaatactattattaatattgacc
gagcagaaaatattggttcactccttacgtccggatgtactaacttccgtcagcgaggcc
attgccatgattctgtttccttttaagtggcaatgtccttacataccattgtgtcctcta
ggattagcagaggtgttgcatgcaccattgccattcctgatcggcgtggattcaaggttc
tttgatttatatgatcctccttctgacgtcaattgtgtaaatttggacacgaataacatt
gcaatatgtgacgataaaaaatatttaaatgttaaattactgcctaaaaaggcagctaga
cagctcagaaattggttagagcttttgtcctccaagataatttcgtggggaaaaactagc
tgttcccaaaaagatagaggagatgaagacttcagcgtggatagggaatttcaacaaaaa
cgaaaggagcaagctttagaacttgaaatacaggatgctttcttaagattcatggcgacg
attctcaaaggatatcgaagttatctgttaccgattacaaaagcgcctactgtaggaaca
acggatccgacaagtttatttaatatccaagcgtttttgagaagtcgcgataaagcccat
gctaaattttacaccatgcttgtcagaacgcaaatgtttatcaggttcatagaagagaga
agtttcgtatctgatatggatatggctgggttagcgtttttcgatgaatgcacagaacga
gttgaggaggaaaatgtaacgcttttggaactggatgaatctcaacatagtgaacgtaca
gtatttatacctccacctgaagcaggaacaaatcaaacaccaataatatacaagtcgttc
aagttggacccggaactaatgaggcctcagaagaatttctgtttaaagaatccctctcta
agtgccttcggtatggtacctggaagtcctatggctcgtagaacgaagcatgaaatcaaa
gttgctcaaaggatggctcgaaaacaagctgcaatgcccgacaggtggggtagatgcctg
cttggtacatgtcacagtctttggtttctgcatttaccggccatgttacaagtttccagc
caacctgctgcagttttgcatcaggcctatgaaatattggttaaaatgcagaagttacgt
cttgatcctatggaagaggtatgctacagagctatgatgcaactttgtggggtatacggg
caaccagttttagctgtaaagttattattccatatgaaacgcagtggtgttcaacctaac
gctttaacatacggattttacaataaggctgttctcgaggcaacttggccttcggatatg
acaaactcaagtcagttaatgtggaacaaattacgaaatgttatcgtcggtgcagcttta
tttaaaaaagctggaaaaaagagcgctagaagacgattgagctctaatgtagacttctta
accaccgataagactgaatgtatggaacatgcgctctctcggtctagtctcgacagttcc
cattctcaggataccgaagctgcgcacagtgattccactaaaggcagttctgtgtcagat
ttacccgggttcggagcattcgaattaaaagctaagctccttcgacagaatagcatagtg
aaagatcaaacaacattaagtatcttacaatcggatgaattggaacaaacaccgagtaat
ccaaggctaacgcgcagtgtcgaatcgcctttaaaaagtcccatacgcacaccagttacg
gaaaatgacccattgggtgctctcattaatgacgaaacaccgattgtgtcgccttccgag
gagaatgattcaaattgctcaacaagtactttaaccgttttaaataatacgactgaagag
agaccaggagggccgctcttatttagaagcaacatcctcccacgtagtgcgacgtttcat
caagcggtagatgaaagtggcatgacggtgggtgggcatttgcagaggagtgagacgatg
cctcactccgtggcgcaacaaggggaacaggagagagaaaaggagagactggaaataagc
agtctttggtctcaaaataaggatagtgtaacgtccagcctctctagcttaggatctagt
cttaaacttagtttcggacgatactccacgggtggattggcatttgctaaaaataaggat
ttaatatcatcgaatcaacttattgaatctcttagtctctccagctatatcagtccgtcg
agtttaacaggaaaaaagtcgaacgaaataatacttggtggtttgaatagcttaaagtcc
gctgcaacgactgtggtaaaaaaatttgatgaaatcaaagaagccatttcagcgacaagt
acgccagtgaaaaataaggaacgtgaacaaaaaatagcttatggagtatcgcatgaatct
ctagattctctcactgattccatacaagatcgaaacgaaacaagagcatctggtgatgga
aatttagatttgtgtccactgtacgagctcgcggagtgtctgtatccaaaaggcactaga
gagttagaggaacgtcttgctattgagcttgtgctttccagtgccagtaggtgtcatcat
tgcgctgccatcctgtatgatgaggagataatggctggttggcagccggaagattccaac
ttgaatacagtctgtcaatattgcgacaaagctactgtacccctcctcacagctacgata
ttagattacagatccgaagtaagcgagaagaatagtgaccctttaatgggagcactggta
gaattattggatcaaccgaaagaatcgttggaaccgataaccgtaccatacctaaatcca
ttagttttgagaaaagaattagaaagtgtattgagtcaagagggggatgcgtgtctcact
aagcataagttcattcaagagcacccgatagtatattggaatttgatatggtactttgaa
aggattaatttaacgagtcatttacctgatctgtggttggctaacgataagaactcagaa
cttcaaagaactataggattggtaggtgttagaaccatatgggataacgaacgactccac
atggaccgtttgcctatgtatctccaatggaagtcaaattccacagaagacagaacattg
atgcagacagtgataacatatgtccgttgcaacgacttagcggaacctatactaagagtg
gccttagaaagaagtaaacatcaaacagacgatcatccgttttctatatacagggatatt
ttgtttctggcatttactgtattaggaagaacgaatattgaccaaggcgtcttcgatagg
gaatacagtttatcgctggagaaattttccgagaatgatgagaagttattacacaaaatt
gatgcgccgccgacaatgatgtcagtgtactgcagatattacttcaaacaattaaacgtg
tga
DBGET
integrated database retrieval system
