Trachymyrmex septentrionalis: 108754337
Help
Entry
108754337 CDS
T11226
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC108754337 isoform X1
KO
K19027
zinc finger FYVE domain-containing protein 26
Organism
tsep Trachymyrmex septentrionalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsep00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
tsep03400
]
108754337
DNA repair and recombination proteins [BR:
tsep03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
Other HR factors
108754337
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF547
FYVE
Cript
MIT_C
TPR_2
V-set_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108754337
NCBI-ProteinID:
XP_018352070
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2391 aa
AA seq
DB search
MICPTLSKSYIKNIKLTLYSKKNDKLLSEWLLLWNKTHMCFESTATLLTVYKICESVFEL
TENSEILLCKQELLKRTSARKLHWLNGILDICYILIMKGRYNEVELLLSCNLLKRLYPVL
LFKVLNDCPQEIMNTRESYDNGISICECINFFLEKCYSDLYNDDCLNKLYALLKNHIRIV
LYILQWKKQYFIDMKLSTKESKNSQSDMIEQTVSIKQILSLLQKHNVLFVLKLITDIHDR
DYSDIQDLVKEVSLNQSMSFQAYCCIISVLKAIFLCEFYNVEHKQITKYFSDMMSHLSSL
FPLSLRIETMENIFSLLFLRYEDFNVINASSKDDCNIRKSIEHEKSGFIANKYAVRDMLY
YLWKSTLITTEEIDKLQVLESHKEMQQLHENVSTFTSTLIDTRWRLKFHMGLYFFENVGT
PQDESDNPSGVNKLESIISQTPSFPHRITEDTFFYKGDSTSDEIKVKSDSSSESGLLSRN
KRRKCSRIAVEKTDHLTTKDKLSLINLMLASKESLIVHCLWKGNFQKAQEVVEMFHMENT
QLDGEIRFSEALHTFKQNLYKHIRTLNTIDSFKESSKTSTLENIKFAAQEGVQSSKYINQ
LQTFLASQQVHLLILDTNILRSNEILTLSALDLSLTMGQTYQISSNLCDVAMKYLKLCET
FDSTGHASFFSKIYQLFYENKNNVSVNVILCDARISLHVKEWRENDAIWNEFQNNYHILY
DFKRIEIMRTQSCSNNYILGLKTIEKISDIFDSEKYLYNIYLYLQLISTIIPDDTNIQTI
SDLLKTPLHHYFGYQIFDLNTEPDKLEKVASNLQVNLIYSILVNVYPNISCYDKKKCNSI
KDSEYIILNKNQELGVKNVIKRPNQYISEILAELLQILCNISSGRSHLDNSYLRSISNHT
DIRMILNKTSNLANLDLGELSGGDETLTFFLNVWNVMFLHASLDIWSNDPPLESLRHTIS
LTSIGYIIGDLGLVTLAALRSKLLGKLANDIKFFTQVEELNELAWQDLDLVQNPRIIFAM
ANEFYGTPEIRVYEAQTLNDALNEATNDYIAYYSLVSPDESVNEPKQKISLLNLVRQYQN
TFSQDTDGETNANRSLPSIADFEKLNEDINLEYMTSNYTYEVILKYSKYNISNVTTTNLI
QTSLWQSRILRTSLLQYLERHCWLVSYLVQRMHNENPTILENNYDNVKRIVCLENLMNSP
WMNKLKLLFNNNQILAAIHDSVPEHELWHYFELRKDHNWQDSLEMLNALTDIMIKYSAEL
QRFKDLILSHMLSNLGVLSVTSMLQYLYQIKDIHILTQTILHNVNKWPMILCEHALCHAL
QHEHNHKLPVHCKHRMNDILCRITIFHKMIPYCMNKSNITWYDIVYCTGKIDPFKIIKSL
IDADQFELCLEWLECQAFSLEMQTTVSQDFLIGLLKNEQQDFKQALKFLQALPLSQPMKI
CKGVLKKLESISALQFITNYLLDYCKVAEQPKYRKTLIGLQILKLLEDKDRSLYIHLIKE
PLLMLEQLLMNCKFENIQNILNSLQENLQHPDIGISNFYEIIKFYAKKSLDFRVSFRRDG
TKNKTKNMSQPNIEAENNEFVMPVNVPTKEEWVPNDRARECSCCKAVIFSMFNRRHHCRR
CGRVICAMCSRHRMQVAGYPSSVLVRVCDDCNHQTILQIRAAQGVPSTSSNELFDYWRLT
KDEKHNRTIREEFSFEYAPNISLCLAILNLYCDSKIYTSFLLDRCDEMKRLLQPVSGDRI
NPEIDHAVIIKMIRSLLTAAKMKCAKFGFNTGLAHCDRFLSQVDLIATLVQSDCVTLISM
DDLDEHTLRKLRDLLTEKERWTLALDVSTKAGLDTQGVWAAWGKACLKVGHLEQAKEKFQ
HCLDKIIHEDLDDWVMLFYPKELIESPKKELTVKMTQSTQEGNEISDEEKQACKTSYLRR
NEYFKCRPLKDPPLLTEILQILDTLSIHRSRTQHSSPQSKSDTAQEILQTLNSLKAVSQN
QFNVKYVIPANQTVYYQESLYYLLTYGSYTSILQFFLRHKEFDKCLVYILDNNIERDLFL
NGVYLYCLKNGQIEKLHNAMRTKDPTLVTWRKYLISVCHFMERKQYWHILYQIQLFMRDY
VRASMTCIRFYTNEANTYSDLHNRAHLLQDAQKHLELELQTESLTKRRKNINSDHSGQNT
LVMEPSEIDRHINTICRQTEIVKFLANCEKEERPLTEFFNLFPDIDSNNFQTLQLPTLFG
NQQQKIHLAVLAILCGRDIEEGFGIAFRIMQDYNLPQQKVYSLAGHVLALKNNVAAIEQL
IKCCRSSGAPNAHIISDHVLAHCVKLLLTYSYTEQIPTLKHHIDILIRLIIDTELRINAY
IENKQLKAAYLLAVKYSRAQDIRRILKESDRLGQSAIKAICLKWLQQNPKK
NT seq
7176 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttgtcctacgctttcaaaatcgtatattaaaaatattaaacttactttatattca
aagaaaaatgataagttgttaagtgaatggctcttactttggaataaaacacacatgtgt
tttgaaagcactgctactttactcacagtatataaaatatgtgaaagtgtatttgaatta
acagagaactctgaaattcttttgtgcaaacaagaattacttaaaagaacaagtgcaaga
aaattacattggttgaacggtattttggatatatgttatatcttgattatgaaaggaaga
tataatgaagttgaattgttgctatcatgtaatttgttaaaaagattatatccagtgtta
ttatttaaagtattaaatgattgtccacaggaaataatgaatactcgtgaaagctatgac
aatggtatttctatttgtgagtgcatcaacttcttcttggagaaatgttactctgatcta
tacaatgatgattgtttgaacaaattatatgcgcttttaaaaaatcatattagaattgtg
ttatacattttacagtggaagaaacaatattttatagatatgaaattaagtaccaaagaa
tcaaaaaattcgcaatctgatatgattgagcaaacagtatctataaaacaaattttgtct
cttttgcaaaaacacaatgtactttttgtcttgaaactaataacagatatacatgatcga
gattatagtgacattcaagatttagtgaaagaggtgtctttaaatcaatctatgagtttt
caagcatattgttgcataataagcgtcttaaaagccatttttttatgtgaattttataac
gtggaacataaacaaattactaaatacttctctgatatgatgtcacacttatcttctttg
tttcctctgtcattaagaatagagacaatggagaatatattttccttattatttttacgt
tatgaagatttcaacgttataaatgctagttccaaagatgattgcaatattcgtaaatca
atagaacatgagaagtctggctttatagctaataaatatgctgtaagagacatgctgtac
tatttatggaagagtactttgattacaacagaagaaattgataaattacaagtactcgaa
tcgcataaagaaatgcaacaacttcacgaaaatgtatccacttttacatcaacattgata
gatactcgttggagattgaaatttcatatgggactttatttttttgaaaatgttggtacg
ccacaagacgagtctgataatccctctggtgtaaataaattagaatctataatctctcaa
acaccgagttttccacatcgcatcacagaggatacatttttttataaaggagacagtacc
tccgatgaaattaaagttaaatctgacagtagttcggagtctggcttattaagcagaaat
aaacgcagaaaatgttcacgaattgctgtagaaaagacagatcatttgacaacgaaagat
aaactgtccttaataaatttaatgttagcgtcgaaagaaagtctgattgtacattgttta
tggaaaggcaattttcagaaagcgcaagaggtagttgagatgtttcatatggaaaacaca
caattggatggtgagattcgattttcagaagcactacacacgtttaagcagaatctgtat
aaacacattcgtactttaaacacaatagattcctttaaagaaagctcaaaaacttctaca
ctagagaatataaaatttgctgcacaggaaggtgtacagtcctctaagtatatcaatcaa
cttcaaacatttttagcatctcaacaagtacatttactaatattagatacaaatattcta
cgtagcaacgaaatattaactcttagcgcgctggatctaagtttgactatgggccaaaca
tatcagatctcgagtaatctatgtgatgtagcgatgaaatatctaaaactctgtgaaacg
tttgacagcacagggcatgcgagtttcttttcaaaaatttatcaattgttttacgaaaat
aaaaataatgtgtctgtgaacgttatactgtgtgatgccagaatttcattacatgtaaag
gaatggagagaaaacgatgccatttggaacgaatttcagaataactatcacatactgtat
gacttcaaaagaatagagattatgaggacgcaatcttgcagcaataactatattttagga
ttaaaaacgatagaaaaaatatctgatatttttgatagcgagaaatatctttacaacatc
tacttgtatctacaacttatatctactatcatcccagacgacactaatatacaaacaata
tctgatttattaaaaactccattacatcattattttggatatcagatattcgacttgaat
acggagccagataagctcgaaaaagtcgcttctaatttgcaagtgaatttaatatacagt
atccttgtaaacgtatatccgaatatttcttgttatgataaaaaaaagtgcaatagtatc
aaagattcggaatacattatactgaataaaaatcaagaattgggtgtaaaaaatgtaata
aaaagaccaaaccaatatatttcggaaatattggcagagcttctacagattttatgcaac
ataagttcaggacgatctcatctggataattcgtacttgagaagtatttctaatcataca
gatatacgaatgattctaaacaaaacatcgaatcttgcaaatctcgatctcggcgaatta
tctggaggagacgaaacattgacattttttttgaatgtttggaacgttatgttccttcat
gcgagtttggatatatggtccaacgatccgcctctcgaaagtttgaggcatacgatttca
ttgacgtcgatcggttatataattggtgatttgggcctagtgacactcgctgctcttcga
tcgaaattactgggtaagcttgcgaatgacattaaattcttcacgcaagtggaagagctc
aacgaattggcatggcaggatttagatcttgtgcaaaatccaaggattatcttcgccatg
gctaatgaattttacggcacgcctgagattcgtgtgtatgaagcgcagacattaaacgat
gcattaaatgaagcgactaatgattatatcgcgtattattcattggtgtcacctgatgag
tctgtaaatgaaccaaaacaaaaaatcagcttactcaatcttgtcagacagtatcaaaac
acattttcacaagatactgatggtgagacaaatgctaacaggagtttgccttcaatagcc
gatttcgaaaaattaaacgaagatataaatctggaatacatgacgtctaattatacatac
gaagtgatactaaaatattccaaatataatatatctaatgtcacaaccacaaatcttata
cagacatcactttggcagagtcgtatattaagaactagtttattgcaatatctggaaaga
cattgttggctcgtttcttatcttgtacagagaatgcataacgaaaatccgactatttta
gagaacaattatgataatgtaaaacgtatagtgtgtcttgagaatcttatgaattctccg
tggatgaataagctaaaactcttatttaacaataatcaaattctcgccgctattcatgat
agcgtacctgagcacgagttatggcattattttgaacttaggaaagatcataattggcag
gattctttggagatgttaaatgctctaactgacatcatgataaaatacagtgcagagtta
cagcgcttcaaggatttgattttaagtcacatgctctccaatttaggtgtactatctgtc
acaagtatgctgcagtatctgtatcaaatcaaagatatacatatattgacacaaacgata
ttacacaatgttaacaagtggcctatgattttatgtgagcacgcattatgtcatgcattg
caacacgagcacaatcacaaattgccagtgcactgcaaacatcggatgaatgatatcttg
tgcagaataacgatcttccacaaaatgattccgtactgtatgaataagtcaaacattacg
tggtacgatattgtatattgtacggggaagatcgatccatttaaaattattaagtccttg
atcgacgcagatcagttcgagttatgtttggagtggctggaatgtcaagcgttttctctg
gagatgcaaaccactgtgagccaagactttttaataggccttttaaaaaatgagcagcaa
gatttcaagcaagctttaaagtttcttcaagcgttaccgttgagtcagccaatgaaaata
tgtaaaggggtgcttaaaaaattagaatctatcagcgcattacaatttatcactaactat
ttgttagactactgcaaagtagcagagcaaccgaagtatcggaaaactttgataggacta
caaattctaaagctgttggaagataaagacagatcgttatatatccatttgataaaagag
ccattattgatgttggaacaattattaatgaattgtaaatttgaaaatattcaaaatatt
ttgaactcgttgcaagagaatttacaacatcccgatataggcatcagcaatttttatgaa
attataaagttttacgccaaaaagtcgttagatttccgggtatcatttcggcgtgacggt
acaaaaaataaaaccaaaaatatgtcacaacctaatattgaggcagaaaataatgaattt
gttatgcctgtcaatgtacctactaaggaggaatgggtcccgaatgatagggctagagag
tgcagttgctgcaaggctgtgatattttcaatgtttaacagacgacatcactgtcgacga
tgtggccgtgttatttgtgctatgtgttctcggcatcgtatgcaagttgctggttatccc
agttccgtgttggtacgcgtgtgcgatgattgcaaccatcaaacgatattacagattcgt
gcggcgcaaggtgttccatcgacatccagtaatgagctatttgattattggcgattgaca
aaagacgaaaagcacaaccgcaccataagagaagagttctcatttgaatatgcgccaaat
atttcgctgtgtcttgctattcttaacttatattgcgattctaaaatatataccagtttc
ttattagaccgttgcgatgagatgaagcgattactccaacccgttagtggtgacaggata
aatcccgaaatcgatcatgcagtaatcatcaagatgatacgttctctgctaactgcggct
aaaatgaaatgcgcgaaatttggatttaatactggcctcgcgcactgcgatcgattttta
tcgcaggtggatctaattgcaactctagtccaatccgattgtgtgactcttatatcgatg
gacgacctcgacgagcacacactgaggaaattgcgtgatctccttaccgagaaggagcgt
tggacattggcgttggacgtcagcacgaaggcaggattggatacacagggcgtgtgggcc
gcatggggaaaagcttgcttgaaagtgggacatttagaacaagcgaaagagaagtttcaa
cattgcctggataaaattatacacgaggatcttgacgattgggtcatgctgttttatccc
aaggagctgatcgaaagtcccaagaaagagttaacggtaaagatgacgcagtcaacgcag
gagggaaacgaaatatcggatgaggaaaaacaagcgtgcaaaactagttacttgagaaga
aacgaatattttaaatgtcggccgctaaaggatccaccattgctaacggagatccttcaa
atattagataccttaagcattcatcgatcccgaacgcagcattcaagtccacaatccaag
tctgatacggcgcaagaaatcctacaaacgctcaatagtctgaaagctgttagccaaaat
caatttaacgttaaatatgtaatacccgctaatcaaacggtttattatcaagaaagtttg
tattatctattgacatacggaagttacacctctattttacaatttttcttgagacataaa
gagtttgataagtgccttgtatatatcttagataataacatagaacgtgatctatttctt
aacggagtttatttgtactgtttgaagaacggccaaatcgagaaacttcacaatgcgatg
agaacgaaagatcctactttagttacttggcggaaatacttaatatccgtttgtcatttc
atggaaagaaaacaatattggcatattttatatcagatacaactctttatgagagactat
gtacgagcatcgatgacgtgcatccgtttttatactaatgaagcaaacacttattcagac
ttgcacaacagggcgcatctgttacaagacgctcaaaagcacttggagttggaattacag
acggagagcttgactaaaagaagaaaaaacataaactctgatcacagcggccaaaatact
ttagtgatggaaccttcggagatagacagacatataaacactatatgcagacagacggaa
atcgtcaagtttctagcaaactgtgaaaaagaggaaagacctttaactgaattttttaat
ctctttccagatattgacagcaataattttcagacacttcaattacctacattatttggc
aaccaacaacagaagatacatctagccgttttagctatattatgcggccgcgatattgaa
gaaggatttggcatagccttcaggataatgcaagattataatcttccacaacagaaggtg
tattctttagctggccatgtgttagctttaaaaaataatgtagctgcaatcgaacaattg
atcaagtgttgccgtagctctggagcacctaatgcccacattatttcagatcatgttttg
gcacattgtgtgaaattattgttgacttattcatacactgaacagattccaacactcaag
catcatatagatattttaatcagactgataatcgacacggaactgagaataaatgcatac
attgaaaataaacaactgaaagctgcatacctgcttgcagtgaagtattctagagcacaa
gatataaggaggatcttaaaagaatcagatagacttggtcaaagtgcaattaaagcaata
tgcttaaaatggctacaacaaaacccaaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system