Thomasclavelia spiroformis: NQ543_00195
Help
Entry
NQ543_00195 CDS
T09467
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
tsf
Thomasclavelia spiroformis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ChW
Big_2
Ig_NUP210_5th
Glug
HL_N-beta
Big-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWO89697
LinkDB
All DBs
Position
43787..47437
Genome browser
AA seq
1216 aa
AA seq
DB search
MKIKLVIAMLIGSLIMGSFTVISVYGKNDELDTTLLEEHAGGLLDYTKMYGLEKEEVKPI
THNRYLRSSAPQENNYLAIMVEFPDKTGTSLDDVQTLSKAEAVMNKGNRNMETPNGSVPI
ISLKEYVEKYTYHKMTTKTTFFPQDKSGNVVSVMLSKNRSYYMKKSASNPNGYTLTQARE
REEELVNEILSKAKESIERVFNASDLDKNNDGNVDAISFFIEADKVTEDKVEWSDLLWSH
KISGMNLNVTLEGKKVNTYNLINTYDSNYLGGVFSMNQGTYGTIIHEYMHVLGLPDLYRY
NSGGDPVGFYDIMATTTNYNPQGILAYMTSEYNNLGWNSLSEVKSSTSVTLNKPQYSNPS
EKRAVKIVSPVNEDEFFIVEYYEKRDKVYASDTSISDGLVVYRINSKVKNGNMNGTSTGK
NDYLYVFRPNETGCGKGEGNLNQAVLSKNGRSSIGKPLNTTYSWNNDTLFYSNGTNSGIT
INITSSSSNSITFDINVPIVQGDGSTAKPYLISSVDDLDLIRKNSTKVFKLLNDIDLSGV
SNFQTISNFSGTLDGNGFAIKNLTLNNQSSFINTLSSRGVVKNLNFENISITNRNSSHTG
IFGTVSGQLENIAIKSGKISNQSSNNGQYLGTGALAGVLSSGGAIKDCYSSANVTQGINV
GGLIGLNQNGTIQDCYVNGVVSSGKKSSGAVVGTQYFTSYDRYKQPENVLYDINKTKQNE
AIGTVYGSDKLIDNKTGKEGFIGVDLLKEITLDISGIKEKELGLTIKANPIISLSKKVTI
KDTSIATYNSITNRIQAHKRGKTELTVSLPVGNNTMILSSTINVINSNIPITRVTLDRSL
LTLNLNQSTNLKATINPSDTTDSKALTWTTSNSKVATVDSNGKVTGISEGEATITVRTSN
GKTASCKVTVIEQEPELVYQAHVADYGWLETVGDGETAGTTGKNKQMEAIKINLINNVYK
GTVEYSAHVADYGWMAWTDNGNQAGTTGENKQMEAIKIKLTGELEEKYDIYYRVHAEELG
WLDWTLNGKAAGTAGYCYQIEAIEIKLVEKGSRAPGATERAYVQKRYIKYASHVADYGWL
SDVYDGSISGTIGKCKQMEAISISLENQPYGGNIEYRTHSADIGWQEFRSNGTVAGTVGR
NKQMEAIEIKLTGEMEKEYDIYYRVHIADYGWLDWAKNGASAGSEGMSKRIEAIEIRIVQ
KGGSEPGNTARPFIKK
NT seq
3651 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaattaaattagttattgcaatgttaataggttcattaattatggggtcatttaca
gttatatctgtttatggaaaaaatgatgaacttgatacaacattattagaagaacatgcg
gggggattattggattatactaaaatgtatggtttagaaaaagaggaggtaaaaccaata
acacataatcgttatttacgttcaagtgcacctcaagaaaacaattatcttgcaataatg
gttgaatttcctgataaaacaggaacaagtcttgatgatgtacaaacattaagcaaggcc
gaggctgtaatgaataagggtaatcgaaatatggaaacacccaacggtagcgtaccgatt
atttcattaaaagaatatgttgaaaaatatacatatcataaaatgactactaaaactact
ttttttccacaagataaaagcggtaatgtagtatcagtaatgttatcaaaaaatcgcagt
tattacatgaaaaaatctgctagtaatccaaatggttacacattaactcaagctcgtgaa
agagaagaagagttagtaaatgaaattctatctaaagctaaagaaagtatcgaaagagtt
tttaatgcaagtgatttagataaaaataatgatggtaatgttgatgctatttcttttttt
attgaggctgataaagtaactgaggataaagtagaatggtctgatttattatggtctcat
aaaattagtgggatgaatttaaatgttactttagaaggaaagaaagttaatacatataac
ttaattaatacttatgatagtaattatttaggtggcgttttttcaatgaaccaaggtact
tatggtacaattattcatgagtatatgcatgttttaggattacctgatttatatcgttat
aatagcggtggtgatccagttggattttatgatattatggctactacaacaaattataac
ccacagggtatattggcatatatgacaagcgagtataacaatttaggatggaatagctta
tcggaggtaaaatcgtctacaagtgttactttgaataagccacaatattctaacccaagt
gaaaaaagagctgttaaaatagtttcaccagttaatgaagatgagttttttattgtggaa
tattatgaaaaacgagataaagtttatgcatctgatacaagtattagtgatggacttgtt
gtatatcgaattaattctaaagtaaaaaatggaaatatgaatggtacttcaactgggaaa
aatgattatttatatgtttttaggccaaatgaaactggttgtggtaaaggagaaggaaat
ctaaatcaagcagtattaagtaaaaatggtcgcagtagcattggtaaaccacttaataca
acgtatagttggaataatgatacattattttatagtaatggtacaaatagtgggattact
attaatatcactagtagtagtagcaatagtataacttttgatattaatgtaccaatagtt
caaggtgatggaagtactgctaaaccatatttaattagtagtgttgatgatcttgattta
attagaaaaaatagtacaaaagtatttaaattactaaatgatattgatttaagcggtgtt
agtaattttcaaacaatttccaattttagtggaactttagatggaaatggttttgctatt
aaaaatttaacacttaataatcaatcaagctttataaacaccttatcaagtagaggagtt
gttaagaatttaaattttgaaaatatttcaattacaaatagaaattcttcacatactgga
atctttggaacagttagtggtcaattggaaaatattgcaattaaatcaggaaaaatatct
aatcaatcaagtaataatggtcaatatttagggactggagcattagcaggagtattatct
agtggaggagcgattaaagattgttatagtagtgccaatgtaactcaaggaataaatgta
ggtggtttaattggtttaaatcaaaatggaacaattcaagattgttatgttaatggtgtt
gtaagcagtggtaagaaaagtagtggagctgtagttggaacacaatattttacaagttat
gatcgatataaacaacctgaaaatgtattgtatgatattaataaaactaaacaaaatgaa
gcaattggaacagtttatggaagtgataaattaattgataacaaaacaggtaaagaagga
tttattggagttgatttattaaaagagataacattagatatatctggtataaaagaaaag
gaacttggtctaacgattaaagctaatccaataataagtctatcaaaaaaagtgactatt
aaagatactagtattgctacttataatagtattaccaatagaattcaagcacataagaga
ggaaaaacagaattaacagtatcattaccagtcggtaataatacaatgatactttcatca
acgataaatgttattaattcaaatataccaataacaagagttacattagatagatcatta
ttaactctaaatttaaatcaatctactaatttaaaagcaacgatcaatccaagtgataca
acagacagtaaagcattgacatggacaacaagcaacagtaaagtagcaacagtagacagt
aatggaaaagtaacaggaatatcagaaggagaagctacaattacagtaagaacaagtaat
ggaaaaacagcaagctgtaaagtaacggtaatagaacaagaaccagaattggtttatcag
gcacatgtagctgattatggctggttagaaacagttggtgatggagaaacagcaggaaca
actggcaaaaacaaacagatggaagccattaagataaatttgataaataatgtatataaa
ggtacagtggaatacagtgcacatgtagctgattatggctggatggcatggacagataat
ggaaaccaggcaggaacaactggtgaaaacaaacagatggaagctatcaaaattaaatta
acgggtgagcttgaagagaaatatgatatatattatcgagtacatgcagaggaattagga
tggctagattggacattaaatggaaaagcagcagggacagcaggatattgctatcagatt
gaagcaattgaaataaaattggtagaaaaaggaagcagggcacccggagcaacagaaaga
gcatatgtgcagaaaagatatataaaatatgcttcgcatgtagctgattatggatggcta
tcagatgtatatgatggaagtatttcaggaacaataggaaaatgcaaacagatggaagca
ataagcatttcattagaaaatcagccatatggagggaatatcgaataccgaacacatagt
gcagatattggatggcaggaatttagaagcaatggaacggttgcaggaacagtaggaaga
aataagcagatggaagcgatagaaatcaagcttacaggagaaatggaaaaagaatatgac
atctactatcgtgtacatatagccgattatggctggttagattgggcaaaaaatggagca
agtgccggaagtgaaggaatgtccaaaagaatagaggcaatagaaataaggattgttcaa
aaaggaggaagcgagccaggaaatacagcaagaccgtttataaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
