Thomasclavelia spiroformis: NQ543_02185
Help
Entry
NQ543_02185 CDS
T09467
Name
(GenBank) UvrD-helicase domain-containing protein
KO
K16898
ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
tsf
Thomasclavelia spiroformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
tsf03400
]
NQ543_02185
Enzymes [BR:
tsf01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
NQ543_02185
DNA repair and recombination proteins [BR:
tsf03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
NQ543_02185
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
T2SSE
DEAD
AAA_30
ResIII
DUF4743
AAA_11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWO90083
LinkDB
All DBs
Position
complement(507388..511092)
Genome browser
AA seq
1234 aa
AA seq
DB search
MPISPLNDGQYEAVITRNCSILVSAPAGSGKTKILVNRILALIEEENYNVDELLVLTFTN
AAALEMKQRLQVALDQRLQDDITNELSNHLLKQKQLLPKAYITNFHGFCSTLLKQYGYLI
GINSKFDICTDPTTIKHQILDQCIEKWINDDEFMEFINLYFPEYYFKSFKNAILKFENLS
NTIYNFYDYINEIEKNIYDHIINGNEDDYNSWPINEKIFELLTKQAKMGLNKVYELASFA
KNNNLSFYYQNPFGSDNPKKADLPSPFDCHLKYYNDVIKAIDSKDINKIITASNASLIKS
YDARGLFNEDNENAKAEYNRLKNGIVKFYKDTFNDLVYDNLDEFKLTLSTSKIPLKTLIN
YLKKFKIAYQEYKTQNNLLDFNDLEANALELLEPKYKIANLLYNQLKEIMIDEYQDTNQI
QETLINKIADLKKPVINRFMVGDMKQSIYRFREADPKIFSDKYNTFNRLPNTKRIDLKFN
YRSNKIVLDSVNYIFNQIMDNDIGGLDYYLDESAKLNYDYLRKEGAKELEDLDSVTLNAS
KRLDQENRFTTEVLLSYQTNISSKDAELEAKIVAKKIQDMVGKLELDNFNKTKRLTEYKD
IVVLMRNTRNFIAFKKIFSKYNIPSHIVLSQGFLQSNEIISIFNVLSAFDNHLNDIAFTS
LLKGNYVISNFSEDLLLKIRCDDSISMYDNVLNYIESKQKYYQELSTFIDYYHEMRQYFN
YHSVKEGLNKFYQDSEYLSFLASLVNGAQRVANMELLLQKMDEMKNESLHSIVCKFDEMM
KNGVNMSPAMVSSNDDNVVSFMTIHKSKGLEFPIVFVSNLQNKFNQQDARERIISDKQLG
IAIKPRLSKQLGNYQNVFIEYENKYRKVIAKCQTNESIDEEMRIFYVALTRASQKLILTG
LIKEPQDIIKWQKYIINNNEDSIINPRCNDKVILYLNARKQNSYLDWLGISLMRHDDIIN
QGINKNLLDKNNSDELINEIKHNFQTIMIHKSKNLIKENTKHSKFSIKLFSHEDIEQQIL
INNQIETTLDLANYQRNNEYVYQYPLIENKAIAVTKKIQNIYPNFNDLNHDNTSDFGFEA
TTRGNIIHSVLEHMDFNLDLDDNLKILKDIELYNQDEWNIINKYYSHFKAFFESDVCKLM
NSAKQLYKEKSFSMMDEGQIIHGIFDAICINDNNVTIIDYKTDTLKKSTSNETLINLHKA
QMDYYKKILARVFPQANIQAIVYYLNIDKYIIIK
NT seq
3705 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgattagtcctttaaatgatggtcaatatgaagccgttattacccgtaattgttca
attttagtttcagctccagctggttctggtaaaacaaaaatattagtaaatcgcattctt
gccctaatcgaagaagaaaattataacgttgatgaattattagttttaacattcactaat
gctgctgccttagaaatgaagcaaagacttcaagtagcattagatcaacgtcttcaagat
gatataactaatgaattatctaatcacctattgaaacaaaaacaattacttcctaaagcc
tatatcacaaacttccatggcttttgtagtactttattaaaacaatatgggtatttaatt
gggataaatagtaaatttgatatttgtactgatccaactacaataaaacatcagattctt
gatcagtgtattgaaaaatggatcaatgatgatgaatttatggaatttattaatttgtat
tttcctgaatattattttaaaagttttaaaaatgctattttgaaatttgaaaatctaagt
aacacaatctataacttttatgactatattaatgaaatagaaaaaaatatttatgatcat
attattaatggtaatgaagatgattataatagttggccaattaatgaaaaaatttttgaa
ttattaactaaacaagcaaaaatgggattaaataaagtatatgaactagcaagctttgct
aaaaataacaatttatcattttattatcaaaatccttttggtagtgataatccaaagaaa
gctgaccttcctagtccatttgattgtcatttaaaatactataacgatgttattaaagca
attgatagtaaagatattaataaaataataactgctagtaatgcttcattaattaaatca
tatgatgctcgaggactttttaatgaagacaatgaaaatgctaaagctgaatataatcgt
ttaaaaaatggaatagtaaaattctacaaagatactttcaatgatttagtatatgataat
ttagatgaatttaaattgactctatcaacatcaaaaatcccattaaaaacactaatcaat
tatttaaaaaaatttaaaattgcttatcaagaatacaaaacccaaaataatttattagat
tttaatgatcttgaagcaaatgcccttgaacttcttgaaccaaaatacaaaattgctaat
cttttgtataaccaattaaaagaaatcatgattgatgaatatcaagatacaaaccaaatt
caagaaactttgatcaataaaatagctgacttaaaaaagcctgtaatcaatcgttttatg
gttggtgatatgaaacagtcaatttaccgttttagagaagcagatccaaaaatatttagt
gataaatacaatacatttaatcgtctaccaaacacaaaaagaattgatttaaaatttaat
tatcgttcaaataaaatagttctagatagtgttaattatatatttaatcaaattatggac
aacgatattggtggtcttgattattacttagatgaaagtgctaaattaaattacgattat
ttaagaaaagaaggtgcaaaagaactagaagatttagattcagttacacttaatgcctca
aaacgtcttgatcaagaaaatcgttttacaactgaggtattattatcatatcaaactaat
ataagttcaaaagatgctgaattagaagcaaaaatagttgcaaaaaagatccaagatatg
gttggtaagcttgaattagataattttaataaaacaaaaagattaactgaatataaagat
attgtagtattaatgagaaatactcgtaattttattgcttttaaaaaaattttttctaaa
tacaacattccaagtcacattgttttatctcaaggatttttacaatcaaatgaaataatt
agtatctttaatgtacttagtgcttttgataatcatttaaatgatattgcctttactagt
ttactaaaaggtaattatgtaattagtaattttagcgaagatcttcttttaaaaattaga
tgtgatgatagtatttcaatgtatgataatgttttgaattatatcgaatctaaacaaaaa
tattatcaagaacttagtacatttattgattactatcatgaaatgcgtcagtattttaat
tatcacagtgttaaagagggtttaaataaattttatcaagatagtgaatatttgagtttt
ttagcttcattagtaaatggtgctcaaagagttgcaaatatggaattattattacaaaaa
atggatgaaatgaaaaatgaatcattacatagcattgtttgtaaatttgatgaaatgatg
aaaaatggtgttaatatgtcgccagctatggtttcaagtaatgatgataatgttgtctct
ttcatgacaattcataaatcaaaaggattagaatttccaattgtatttgtatcaaacctt
caaaataaatttaatcaacaagatgctcgagaacgaataattagtgataaacaattagga
attgcaattaaaccgcgtttatcaaaacaactaggtaattatcaaaatgttttcattgaa
tatgaaaacaaatatcgtaaagttatagccaaatgtcaaacaaatgaatcaattgatgaa
gaaatgagaatattttatgttgctttaactagagcatcacaaaagctcattttaaccggt
ttaatcaaagaacctcaagatattattaaatggcaaaaatacattatcaataacaacgaa
gattcaattatcaatcctcgctgtaatgataaagtaattctttatctaaatgctagaaaa
caaaactcatatttagactggttaggtatttctttaatgcgccatgatgatattatcaat
caaggaataaataaaaatttactagataaaaataattctgatgaattaattaatgaaatc
aagcataatttccaaacaattatgattcataaaagtaaaaatctaattaaggaaaatact
aaacacagtaaattttcaattaaattattttcacatgaagatattgaacaacaaattcta
atcaacaatcaaatagaaactacactagatctagcaaattatcaaagaaataatgaatat
gtatatcaatacccacttattgaaaacaaagctattgcagttaccaaaaaaattcaaaac
atttatcctaatttcaatgacttaaatcatgataatactagtgattttggttttgaagca
acaacacgtggaaatattattcacagtgtattagagcatatggattttaatctagattta
gatgataatttaaaaatattaaaagatattgaattgtataatcaagatgaatggaatatc
attaataaatattattcacacttcaaagctttctttgaaagtgatgtctgcaaactaatg
aatagtgctaaacaattatataaagaaaaaagtttttcaatgatggatgaaggacaaatt
atccatggtatctttgatgcaatttgtataaatgacaataatgttacaatcattgattac
aaaacagatacactcaaaaaatcaacttcaaacgaaacattaattaatttacataaagct
caaatggattattataaaaaaattctagctcgcgttttcccacaagcaaatattcaagca
atcgtttattatttaaatattgataaatatattataataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
