Thomasclavelia spiroformis: NQ543_03005
Help
Entry
NQ543_03005 CDS
T09467
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
KO
K03657
ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:
5.6.2.4
]
Organism
tsf
Thomasclavelia spiroformis
Pathway
tsf03420
Nucleotide excision repair
tsf03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsf00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
NQ543_03005
03430 Mismatch repair
NQ543_03005
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
tsf03400
]
NQ543_03005
Enzymes [BR:
tsf01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
NQ543_03005
DNA repair and recombination proteins [BR:
tsf03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
NQ543_03005
MMR (mismatch excision repair)
Other MMR factors
NQ543_03005
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
Viral_helicase1
PcrA_UvrD_tudor
AAA_30
AAA_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWO90231
LinkDB
All DBs
Position
682924..685068
Genome browser
AA seq
714 aa
AA seq
DB search
MDLDKLLNKNQKEAATYLDSHLRIIAGAGSGKTRVITYRIAYLIDEIGVDPRKILAITFT
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NT seq
2145 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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acattaatggcaggacacaaggcattgaaaaaattaactaattag
DBGET
integrated database retrieval system
