Thomasclavelia spiroformis: NQ543_04580
Help
Entry
NQ543_04580 CDS
T09467
Name
(GenBank) ABC transporter permease
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
tsf
Thomasclavelia spiroformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tsf02000
]
NQ543_04580
Transporters [BR:
tsf02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
NQ543_04580
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Ly49
DUF4296
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWO90527
LinkDB
All DBs
Position
complement(1000250..1002256)
Genome browser
AA seq
668 aa
AA seq
DB search
MLFRLSIKNQKKSIKDYSIYFFTLILGIAVFYIFNAVESQTSMMELSQTKSQIIDVMNTA
LEAMSVLVSFILGFLIAYASQFLIKKRKKEFGLYLLLGMKKINVCMIIFFETVIIGFISL
VIGLILGISLSQFMSLFVASLFEANMQKFVFVVSSKAIIKTILYFILIFIFVTIMDLIIV
SKAKLIDLLTAHYKKEKNIIKNPYLSFILFIIACLMLSYAYYNVTVRYNMLTSKSDILIQ
IILGIIGTFLIFYSISGFVLAIIKKIPNIYHRQLNSFVVSEIGNKINSTVISGSIICLLL
FMTICLLSSSFSLKNFKEDSLKDTAPISASFSKKMDDSYSIKEIFNKQGIDASIYKNSYD
FYTYTSLETTIGSILGNYSIQMLNLDPTMEEYFATKLPILNESTYNKAAKLYNNKTVNLN
KDEYQLVGNSEIFNDALKQGNQTITFMNQTLHAKYNRTIDGFLMMNNNACFGEDCFGFII
VPDEFDLSNLNYSTNYLLVPKMSDENNKYISSSKFDQTINPENNKWQHVLISSQTDLYDE
SIGSSGVIIFVSLYLGFIFMISGAALLALKEMSDAIDNKGKYEILRKIGTSNQKINNALF
KQMLVFFGFPLLLAIIHSIFGIQVCNIMLEIYNSDALLQSIIITAGMIIVIYGGYFLVSY
LSCKRVIK
NT seq
2007 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttatttagattatctattaaaaatcaaaaaaagagtattaaagattattcaatttat
ttcttcactcttattttgggtatcgcagtattttatatttttaatgccgttgaatctcaa
acttcaatgatggaactctcacaaacaaaatcacaaatcatcgatgtaatgaacactgca
ttagaagctatgagtgtattagtatcatttatcttaggttttttgattgcttatgcaagt
caatttttgattaagaaaagaaaaaaagaatttggattatatctattattaggaatgaaa
aagatcaatgtttgtatgatcatcttttttgaaacagttattattggttttatttcttta
gtaattggtttgattttaggaatcagtttatcacaatttatgtctttatttgttgctagt
ttgtttgaagcgaatatgcaaaaatttgtttttgttgtttctagtaaggctattatcaaa
actattttatattttattttgatttttatttttgtaacaattatggatttaatcattgta
agtaaagctaaacttattgatttacttacagctcattacaaaaaagaaaaaaacataatc
aaaaacccttatcttagctttattttatttatcattgcttgcttaatgctatcatatgca
tattataatgttactgttagatataacatgcttactagtaaaagtgatattttaattcaa
attattttaggaattatcggtacttttttaattttttattcaatctctggttttgtttta
gcgataattaaaaaaatccctaatatttatcatcgtcaattaaattcttttgttgtatcg
gaaattggaaataaaattaattctactgttatttctggaagtattatttgtttactttta
tttatgactatctgtttattatcttcatcattttctctaaaaaactttaaagaagatagt
cttaaagataccgcccctatttctgcatctttttcaaagaaaatggatgattcttacagt
atcaaagaaatctttaataaacaaggaatagatgcttctatatataaaaatagttatgat
ttttatacttatacatctttagaaactacaattggttcaatattaggaaattatagcata
caaatgcttaacttagatcctactatggaagaatattttgctactaagttaccaatcctt
aatgaaagtacttataataaagcagctaagctctacaataataaaacagttaatttaaat
aaagacgagtatcaactcgttggaaacagtgaaatatttaatgatgctttaaaacaaggt
aatcaaactatcacttttatgaatcagacattacatgcaaaatataatcgtactattgat
ggatttttaatgatgaataataatgcttgctttggtgaagattgttttggtttcatcatt
gttcctgatgaatttgatttaagtaatctaaactatagcaccaattatttacttgtacca
aaaatgagcgatgaaaataataaatatatttctagttcaaaatttgatcaaacgattaat
cccgaaaataataaatggcaacatgttttaatcagcagtcaaacagatttatatgatgaa
agtatcggctctagtggcgtaattatctttgtttcattgtatttaggttttatctttatg
atttctggagcagcacttcttgctttaaaagaaatgtctgatgcaattgataataaaggt
aaatatgaaatactaagaaaaattggtacttcgaatcaaaaaataaataatgcattattt
aaacaaatgttggtgttctttggatttccactacttttagccatcatccattctattttt
ggaattcaagtttgtaatataatgttggaaatttacaattctgatgcacttttacaatca
attataattactgcaggaatgataatagtaatatatggtggttatttcttagtatcatat
ttaagttgtaaaagagttattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
