Thomasclavelia spiroformis: NQ543_09710
Help
Entry
NQ543_09710 CDS
T09467
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
tsf
Thomasclavelia spiroformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tsf02000
]
NQ543_09710
Transporters [BR:
tsf02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and toxin extrusion (MATE) family
NQ543_09710
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWO89233
LinkDB
All DBs
Position
2027491..2028837
Genome browser
AA seq
448 aa
AA seq
DB search
MNKKIINQKFYKYVIPSMITMLLSGFYSIIDGLFVANAVNDSALAAINIAYPIQVILNAT
AIGIGIGGAVNYSYYNGQNKIKQMHKTIGSTCSLLLISGIILPIILNYFVNDLLVFLGAK
GNIYTGAYEYIHIILIGGILPIIGNGINPLLRNQGKTIYATISMSSGLIVNIILDYLFVY
KMQLGLHGAALATIIAQGVVAFSGTIMLIYFKLKELSLIDYIPNLITIKKILTIGISPFG
QTLIPCIITVITNWMCIRYGGDNALTIFSIISYVLSSIQLFLQGVGDGIQPLLSYYHGCK
QPQLIKYIYKKAITLSLAISTTLTILVIIFPNILTSLFNVDNIIYNECRNALIITALSFP
FIGNNRLSCALFYATERTLFSSIIVYLEPCVIIPGCLIYFSNIFKLTGIWLAYPIAQVIL
TIIALYFIYFILLKAKNINVTVDTEYSI
NT seq
1347 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaaataattaatcaaaaattttataaatatgtaataccatcaatgattaca
atgttacttagtggtttttattcaattattgatggtttatttgtcgccaatgctgtaaat
gatagtgctttggctgctattaatattgcttatccaattcaagtaattttaaatgctact
gcaattgggattggaattggtggcgctgttaattattcatattataatggtcaaaataaa
ataaaacaaatgcataaaacaatcggtagtacctgttcattattattgatcagtggcata
attttaccaattattttaaattactttgtaaatgatttattagtttttttaggtgctaag
ggaaatatttacactggtgcttatgaatatatccatattattttaatcggtggtatctta
ccaataataggaaatggaattaatcctctattaagaaatcaaggtaaaaccatttatgct
actattagtatgagtagtggtttaattgttaatattattttagactacttatttgtatat
aaaatgcaacttggtttacatggagcggcattagcaacaattattgcccaaggtgttgtt
gcatttagtggaactataatgctgatttattttaaattaaaagaattaagtttaatcgat
tatattcctaatttaataactattaaaaaaatcttaacgattggtatttccccttttggt
caaactcttattccttgtatcattacagtaattactaactggatgtgcattcgctatggt
ggtgataatgcattaacaattttttctattatcagttatgttctttcgtctatacaatta
tttttacaaggagtcggcgatggtattcaaccgttattaagttattatcatggctgtaaa
caaccgcaattaattaaatatatttataaaaaagcaatcactttatccctagctatttca
actactttaacaatacttgtgattattttccctaacatattaacatcattatttaatgtt
gataatattatctataatgaatgccgcaatgctctaataattactgcactatcatttcca
tttattggcaacaatcgtttatcatgtgctttattttatgcaactgaaagaacattattt
tcatcaattattgtctatcttgaaccatgtgtaataatccctggctgccttatttatttt
tctaatatttttaaattaacagggatatggcttgcttatccaatagctcaagttatttta
acaatcattgctttgtattttatttattttattttactgaaagctaaaaatattaatgta
actgttgatacagaatattcaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
