Thomasclavelia spiroformis: NQ543_11200
Help
Entry
NQ543_11200 CDS
T09467
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
tsf
Thomasclavelia spiroformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tsf02000
]
NQ543_11200
Transporters [BR:
tsf02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
NQ543_11200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
MAP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWO89502
LinkDB
All DBs
Position
complement(2348954..2350297)
Genome browser
AA seq
447 aa
AA seq
DB search
MKINKNNFAQGSIAKHITNLAGPMIVAQLINVLYNVIDRVYIGRIPEISTLAMGGLGLCL
PLISIIIAFANLFGMGGSPLCSIARGQGKNDEAEEIMGNSFSLLVIFGILLTVIVFVLKE
DLLWLFGASKDTIVYANDYMTIYLFGTIFVLISLGMNSFINSQGFAKIGMCTVLIGAILN
IVLDPIFIFTFELGVKGAAIATVISQFISALWTIYFLTGNKTILKLKKKNMRLKIIHVKR
IVSLGMAGFMMAITNSTVTIVCNATLQKYGGDLYIAIMTIINSIREVASLPGQGISNACQ
PVLGYNYGAGKSDRVIQGIKFVTFSALLMMLILWFAITFFPELFIKIFSHNPEIVKDGVN
ALRLYFFGFFMMAFQMVGQAVAVGLGKSRQAIFFSVFRKVIIVVPLTLILPIYIGINGVF
IAEAISNFIGGGACYITMWLTIVKKLR
NT seq
1344 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaataaaaataactttgcgcaaggaagtatagctaagcatataacaaactta
gcaggaccgatgattgtagcccagcttatcaatgttttatataatgtaattgatcgagta
tatataggaagaattccagaaatttcaacgttagcaatgggtggtttaggattatgttta
ccgttaatatcaattattattgcttttgctaatttatttggaatgggaggttctccatta
tgttcaattgctagaggacaaggaaaaaatgatgaagcagaagagattatgggtaattct
ttttctttattagttatttttggaatattattaacggtaattgttttcgttttaaaagag
gatttattatggttatttggtgctagtaaagatacgattgtttatgcaaatgattatatg
acaatttatttatttggaacaatttttgttttaattagtttaggaatgaatagttttata
aatagtcaaggatttgcaaaaattggtatgtgtacagttttaataggggcaatattaaat
attgttcttgatccaatatttatttttacttttgaattgggggtaaaaggagctgcaata
gcaactgttatttcacaatttatctcagcgctttggacaatatattttttaacgggaaat
aaaacaatcttaaaattaaaaaagaaaaatatgagattaaaaataattcatgttaaaaga
atagtttccttaggaatggcaggttttatgatggcaataacaaattcaactgtaactatt
gtttgtaatgctacattacaaaaatacggaggagatttgtatattgcaattatgacaata
ataaattcaattcgtgaagtagcgtcattaccaggacaaggaatttctaatgcgtgccaa
ccagtattaggttataactatggtgctggtaaaagtgatcgtgtaattcagggaattaaa
tttgtaacttttagtgctttattaatgatgttgattttgtggtttgcaattacatttttt
ccagaattatttattaaaatttttagtcataatccagaaatagtaaaagatggtgttaat
gcattaagattatatttctttggcttttttatgatggcatttcaaatggtaggacaagct
gtcgctgttggtttaggtaagtctagacaagcaatctttttttcagtttttagaaaagtt
attatagtagttccactaacattgatattacctatttatataggaattaatggtgttttt
attgctgaagcaataagtaattttattggcggtggagcttgttacattacaatgtggtta
acaattgttaaaaaattaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
