Thomasclavelia spiroformis: NQ543_11715
Help
Entry
NQ543_11715 CDS
T09467
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein/permease
KO
K18887
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
tsf
Thomasclavelia spiroformis
Pathway
tsf02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsf00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
NQ543_11715
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tsf02000
]
NQ543_11715
Transporters [BR:
tsf02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
NQ543_11715
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
RsgA_GTPase
ATP-synt_ab
AAA_29
DUF87
MMR_HSR1
MeaB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWO89595
LinkDB
All DBs
Position
complement(2450157..2451869)
Genome browser
AA seq
570 aa
AA seq
DB search
MKLSKYLKVYWLPATVGFIFKIAEAFLELMVPLVMADIIDIGIKNNDKNYILIKGLVLVA
LAIIGYLFALVCQYYASLTSQSVGTELRKDMYHQINKYDHHNLDKLGTPTLVTRLINDVV
QIQLAIAMTIRLTSRAPFIMIGSLVLAFFISGSLASIFIIGAIILAIIMFVITLTSIPYF
NNIQHKLDQISLIVRENLTGIRVIRAFASQKKEVSKFTRETDNQKEIQIKVGKIQALLNP
FTYLIVNLAIVLIIYFGGIKVNVGDLSQGEIIALVNYMNSILLALIVFANVISIYNKAGA
SYSRIVEVLETQPEIKNEATFDKWLDTKEIICFKNVSFAYDKRNVLDDISFTIEQGQSIG
VIGGTGAGKSTLVNLIGRFYDVSSGEILINGKSIKDYDLHTLRSFVGYVPQSISLISGTI
RENLQFSNKDADDNLLIQALKMAQAEELIEGKKGLDTFIEQGGKNLSGGQRQRLTIARAL
VKQPKILILDDSSSALDYATDYRLRQELKKLDMTKIIVSQRIASLENMDKIIVLYHGKLV
GFDRHEILMKNCKIYQEIYASQRGGDKCEQ
NT seq
1713 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaagtaagtatctaaaagtatattggttaccagcaacagttggttttattttt
aaaattgccgaagcatttttagaattaatggtacccttagtaatggcagatataattgat
ataggaataaaaaataatgataaaaattatatcttaataaaaggtttagtattagttgct
ttagcaattattggatatttatttgctttggtttgtcaatattatgcttcattaacttcg
caaagtgttggaactgaacttagaaaagatatgtatcaccagataaataaatatgatcat
cataatttagataaattaggaacaccaactttggtaactagattaataaatgatgttgta
cagattcaattagcaattgcaatgacgattagattaacatctagagctccttttatcatg
ataggctcattggtattggcattttttattagtggctcattagcttcaatttttattatt
ggagcaataatattagcaataataatgtttgtaattactttaacatcaattccttatttt
aataatatacaacataaattagatcaaattagtttaatcgtccgtgaaaatttaaccgga
attagagttattagagcatttgcttcacaaaaaaaagaagtaagtaaatttactagagaa
actgataatcaaaaagaaattcaaataaaagttggtaaaattcaagccctacttaatccg
tttacatatttgattgtaaatttagcaattgtattaatcatatattttggtggtattaaa
gtaaatgttggagatttatctcaaggagaaataatagctttagttaattatatgaattca
attttactagcattgattgtttttgcaaatgtaatatcgatttataataaagcaggagct
agctattctagaattgttgaagtattagaaacccagccagagattaaaaatgaagcgact
tttgataaatggttagatactaaagaaattatatgttttaaaaatgtaagttttgcatat
gataaaagaaacgttttagatgatataagttttacgattgaacaagggcaaagtattggt
gttattgggggaactggggctggcaaaagtactttggtaaatttaatcgggcgtttttat
gatgtgagtagtggagaaattttaataaatggaaaatcaattaaggattatgatttgcat
acattaagaagttttgttggatatgttccacaatcgataagtttaatttctggaacaatt
cgcgagaatttacagttttcaaataaagatgctgatgataatcttttaattcaggcttta
aagatggctcaggcagaagaattaattgaaggtaaaaaggggctagatactttcattgaa
caaggtggaaagaatttatcagggggacagagacaaaggttgacgattgcccgagcttta
gttaaacaacctaaaatattaattttagatgatagttcaagtgcattagattatgctact
gattatagattacgtcaagaattaaagaaattggatatgacaaaaatcatagtttctcag
cgaattgcctcacttgaaaatatggataagattatagttttatatcatggtaagttagtt
ggatttgatagacatgaaatattgatgaagaattgtaaaatttatcaagaaatctatgct
tctcaacgtggaggtgataagtgtgaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
