Turicibacter sanguinis: HLK68_03090
Help
Entry
HLK68_03090 CDS
T06584
Name
(GenBank) DUF5057 domain-containing protein
Organism
tsg
Turicibacter sanguinis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5057
VWA_2
VWA_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJS18318
LinkDB
All DBs
Position
complement(629325..634025)
Genome browser
AA seq
1566 aa
AA seq
DB search
MKCRKTPSLTKYLNLILVASLLLGTGVLEPLIALAAQLETTITEDVKVGIEEIISESNEG
GIDEQVLEENTVENDELQINELAETLSSNITPLINVELVSESIVSAKHGDEIEVTYQITP
ESFSQSNFSNTEDKNIAILFDVSKDNKYLDSYMMNALDNMIANHFKSNKGKFAIIPYSDT
VELKVDDPIHPNGWYDQIHNFIRGLKSSNSNERKLGSALSTASKFFDSLSNGYSNHIVIV
TMGNPTDSLPNLNFSQYNVVVLAVNSSNNTVETDYKVLYEWFNKMSSTKDNYIVGKNDGN
EINNTYGTTIKDRINGASIQNNINSTLNFDLGSKFSHVSGLEHVSGTTYKINVPQIEYLQ
KSQNSDGTYNYEAKPIEVKFTVRVNSQSTGTITFNNPDSSESNYFVYNDFNGNKVPNINI
ETPSVYIGETYTNDSIKILEIEPADYFQLGSKKGLTTGTEELTINGEKVEITRITMPEFI
GTVEKINGKYDIVVLGRIVNKNWGTDLNKQTKYQDYNFTRTESFEENDITNRKAQEIIDF
IDSGQLVYIDKNIFETSISDTKLYRNFVDVSGTNLIRTTSVSELSIERIVQYYKDNVLVQ
QKQLLLQVTDATASDITSSNLDVADGVAANRTRKMIVSATSLNNSVEEILTEDVSINLYL
DLNGDGLYSDDEVAVSRDNLKTPLNDLILHYNIHPDFLGLLSWKLEVTKGDSKNPIKTYV
TGDMNFHRLPDRPKKEINVLHLIPQSNYESADENGNLDNNGRYEVLDLSRNPKFQTLLDD
VALKDYNIEVTTISVSRYNQIMNKTANLSLFEVGIKELNGYYDMLILGFGDCYTGCGPTF
GINDAGVQNIYDFVETGQGLMLTHDTLFYQRDTNIENSKNSMLNLFRGISGQSRYGLGSN
GVYTALKDLDGSNIPFDPDKPSITSLSKYSGSASVWADTGSMGNVSKASNIYETNAALIT
EYPFNLITTGNTLRIRTTHAQYLQLNLEDEAVIPWYTLYGSSDSRMNPYDVRNNYYTYSR
NNITFSGTGENKRENAPYPDLEMKLFVNTIIKAERGANHAPTVELVNISKSTVISKHQGD
LSFSVIPYDMDLDQMKLSIEVFGCTNNICSDTSILEQKDSEFVRVNGVGVDVEFDIKNKL
TNFDQIKIKVVATDEHHASSQAAELVIQLTNQALLDVSFTADKIGYLIGDEAVVTANIKA
NGDSAKDGIFSLLTPISSLISLQSSSVGLTSFNFNIGQNETLNKTFKFIVNNHTDIQTDN
NKAVNVSANYSYCLNINSQSCVELPETPDTKTAVLNVKRGQIIVEFSSNVATLFNDYEVA
IQLLDSNKNILTTQRVTNSNNVIFDAVSSGDYFVKIIKPDTLSEDDYILQSLTESLVNWE
TLHPASVSYTENIEKLSFELNQVRFDLVHGLFKSQSNNQIVIEPSIYQNPKQVTGNTLVN
FAATYTTKHRNNDAILTVSNKLNNFKKDSIKIYKLEKDTSSGALTIKPFVGAMVTQVEQA
YHITLPENTNSDVKVLIYYTGLVANEDINYLTNTLQVGATNEDVVIRVNEEVIITPDPNS
YLPDLF
NT seq
4701 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatgtagaaaaacccctagtttaacaaagtatttaaatttaatattagtggcttct
ttattattgggaacaggagttttagaaccgctcattgctttagcagctcaattagaaaca
acaataacagaagatgtaaaagttggaatagaagaaattatttcggaatccaatgaaggt
ggcatagatgaacaggtattagaagaaaatacagtggagaatgatgaacttcaaattaat
gaactagcagaaactttatctagtaatataactccacttataaatgttgaattagtatca
gaaagtatagttagtgctaagcacggtgatgaaatcgaagtaacttatcagataacacct
gaatcattttctcaatctaatttttctaatacagaagataaaaatattgctattttattt
gatgtttcaaaagacaataaatatttagatagttatatgatgaatgctttagacaatatg
atagctaatcatttcaagagtaataaggggaaatttgctattataccttatagcgatact
gtagaattaaaagtagatgaccctatccatccgaatggatggtatgatcaaatacataat
tttattcgtgggttaaaatctagtaactctaatgaaagaaagttagggagtgctctatct
actgcttcgaaattttttgattcattgagtaatggttatagtaatcatattgtaatagtt
acgatgggaaatcctacagattcattgcctaatttaaattttagccaatacaatgttgta
gttttagctgtcaatagttcaaataatacagttgagacagattataaagtgttatatgaa
tggtttaacaaaatgagctctacaaaagataattatattgtggggaaaaatgatgggaat
gaaattaataatacttatggaacaacaataaaggatagaataaacggagcgagtattcag
aataatattaattcaactttgaatttcgacttaggtagtaaattctcacacgtaagtgga
ttggaacatgtgagtggcacaacatataaaattaatgttcctcaaattgagtatctacag
aaaagtcagaatagtgatgggacttataattatgaagctaaaccgatagaggttaaattt
acagtgagagtaaatagtcagagtacaggaactattacatttaataatcctgattcttct
gaaagtaattattttgtatataatgatttcaatggaaataaagttccaaacattaatata
gagacacctagtgtctatattggagaaacttatacgaatgatagtattaaaattcttgag
attgaaccagctgattattttcaattaggatcgaaaaaggggctaacaactgggacggaa
gagttaactatcaatggtgaaaaagtagagattacaagaatcacaatgccagaatttatt
ggaacagtcgaaaagataaatggtaaatatgatattgttgtgcttggaagaattgttaat
aaaaattggggaacagacttgaataagcaaactaaatatcaagattataattttacaaga
acggaatcatttgaagaaaatgatattacaaatcgcaaagcacaggaaattattgatttt
attgactctggccaattagtttatattgataaaaatatttttgaaactagtattagtgac
actaaattgtatcgaaattttgtagacgtatcaggtactaatttaataagaacaacttca
gtgtctgaattatcaattgagagaattgttcaatattacaaggacaatgttttagtacaa
caaaagcaattattgttacaggtaactgatgcaacagcttccgatatcacatcttctaat
cttgatgtagctgatggagttgctgctaatcgaacacgaaagatgattgttagcgcaaca
tcattaaataatagtgtagaagagattttaactgaagatgtttcgataaatttatattta
gatttaaatggcgacggattatattctgatgatgaagtcgctgtatcacgtgacaattta
aagacaccattgaatgatttaattttgcactataatattcatcctgattttttaggatta
ttaagttggaaattagaagtgactaaaggggattcaaaaaacccaatcaaaacatatgta
acaggagatatgaattttcatcgtttaccagatagacctaaaaaagaaattaatgtattg
catcttattccgcagtctaattacgagtcagcagatgaaaatggtaatttagataataac
ggaagatatgaagtgctagatttgagtagaaatcctaaatttcaaaccttattagatgat
gttgctttaaaagattataatatcgaagttacgactataagtgtttctagatataatcag
attatgaataaaacagctaatttgtcattatttgaagtagggattaaagaattaaatggt
tattatgatatgttaattcttggttttggagattgttatacaggatgtggtcctactttt
ggaattaacgatgcaggtgttcaaaatatctatgactttgttgaaacaggtcaaggctta
atgttgacacatgacacactgttttatcaaagagatactaatatagagaattctaaaaat
tcgatgcttaatttatttagaggaatttcagggcaatcacggtatggtttgggaagtaat
ggagtatacacggcattaaaagatttagatggaagtaatattccatttgatcccgataaa
ccatcgattactagtttgagtaagtattcagggtctgcatctgtatgggcagatacgggg
agtatgggaaatgtttcgaaggcttctaatatttatgaaaccaatgctgcattgataact
gagtatccttttaatttaattacaacaggtaatacactgagaatcagaacgacacatgca
cagtatttacaattaaatttagaggatgaggcagttatcccttggtatacgttatatggg
tcatctgatagtaggatgaatccatacgatgttagaaataattactatacgtattcacga
aacaatattactttctccggtacaggagaaaataaacgcgaaaatgctccttatccagat
ttagaaatgaaattatttgttaatacgatcattaaggcagaacgtggagctaatcatgcg
ccaacagtggaacttgttaatattagtaagagtacagttatttcaaaacatcaaggtgat
ttaagctttagtgttattccttacgatatggatttagatcaaatgaagttatcaattgag
gtatttggatgcacaaataacatctgttctgatacatcaattttagaacaaaaagattca
gaatttgttcgagttaatggagtaggtgtagacgtcgagtttgatattaaaaataaattg
actaactttgatcaaataaaaattaaagttgttgcaactgatgaacatcatgcaagttct
caagcagctgaattggtaattcaactaacgaatcaagcattgctagatgtttcttttacg
gctgataagataggatatttaattggtgatgaggcggtagtgacagcaaatattaaggcg
aatggtgatagtgctaaggatggaatcttcagtttattaactcctatttcttctttaatt
tcattacagtcatcgagtgttggattaactagctttaattttaatattggtcaaaatgaa
actttaaataaaacgttcaaatttatagttaataaccatacggatattcaaactgataac
aataaagcggtaaatgtatcagctaattattcatactgtttaaacattaatagtcaatct
tgtgtggaattaccagaaacccccgataccaaaacagcagttcttaatgttaaacgtggg
cagattattgttgaatttagctctaacgtagctactttatttaatgattatgaagttgca
attcaacttctagatagtaataaaaatatattaacaactcaaagagttacgaattcaaat
aatgttatttttgatgctgtatcaagtggagattatttcgtgaaaataattaaaccggat
acattatcagaagatgattatatattacaatctttaactgaatcattggttaattgggag
actttgcatccagcatctgtatcttatactgaaaatattgaaaaattaagctttgaattg
aatcaagtaagatttgacttagtacatggtttgtttaagtctcaatctaataaccaaatt
gtaatagaaccttcaatatatcagaatccgaagcaagtgactggaaatacactagtgaat
tttgcagcgacttatacgacaaaacacagaaataacgatgccatattaacagttagtaat
aaattaaataattttaaaaaagactcaataaaaatttataaattagagaaagatactagt
tcaggtgccttaactataaaaccttttgtgggtgcaatggttactcaagttgaacaagcg
tatcatattactttaccagaaaatacgaattcggatgttaaagtgttaatttactatacg
ggattagttgcaaatgaagatataaattatttaaccaatactctacaagttggagcaaca
aatgaggatgttgttatacgtgtaaatgaagaggtcataataactccagaccctaattca
tatcttccagacttgttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
