Turicibacter sanguinis: HLK68_05160
Help
Entry
HLK68_05160 CDS
T06584
Symbol
pulA
Name
(GenBank) type I pullulanase
KO
K01200
pullulanase [EC:
3.2.1.41
]
Organism
tsg
Turicibacter sanguinis
Pathway
tsg00500
Starch and sucrose metabolism
tsg01100
Metabolic pathways
tsg01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsg00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
HLK68_05160 (pulA)
Enzymes [BR:
tsg01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.41 pullulanase
HLK68_05160 (pulA)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PUD
pulA_all-beta
Alpha-amylase
CBM_48
Pullul_strch_C
GlgB_N
SusG_C
RNaseT2L_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJS18678
LinkDB
All DBs
Position
complement(1053520..1056585)
Genome browser
AA seq
1021 aa
AA seq
DB search
MRRKISLMLAIAIMVTSILQNGRIHATDDAKLTIHYQRTDGVYDEWNIWAWDTGTEDMEQ
IDFTAKDDFGYIAEIEVAKGNEAGFIIRKGDWQEKNCDEDQRIKVEDDTEIWVSEGQCGY
LTEAPAGAGGEVVKLETAGNDTVSTVSDEEAEVQVFVHYRRYDDKYKKWNIWGWVDGQEG
LSYSFEDEDDYGKIFKINLKDLNGADKLGIIMRKGNWDSRDIDQDRFIDLTKATEGVLNV
YLLEGDSNIYYSEADVDLTPRLSTATFKSLNKIMFTGAAPITSTEGVEVRDSQGNILELD
QVMLDESSSTIVALLKENISLEDSYTIAKEGFKDAIEVSFTGLFDSEEFNDAFYYEGDDL
GFTYSKDKTSFRVWAPTASHVVLNLYEAGSGDNLIEQIDMTRDVKGTWVADVSGDLNLTY
YTYEVTVSGQTNEAVDPYARAVGVNGNRAMVVDLDLTDPENWSSDVSPEFSGTPTDAVIY
ELHMRDWSSHESAGFKNIGKFLQFTEEGATDHLTDLGITHLHLLPAFDHRSIDETKLDEP
QFNWGYDPQNYNVPEGSYSTDPEHGEVRINEFKQMVQSLHENGIRVVMDVVYNHTGATAD
SDFNKIVPGYYYRQTTDGGFSNGSGCGNETASDRSMMRKFIVDSVKYWATEYHIDGFRFD
LMALHDIETMNEVRAALTEIDPTIIVYGEGWDAGGSALEQNEAALKIYASQMPGIGMFSD
DIRDGVKGSVFNAEEPGFVNGQFSFDERVKFGIVGATKHSQIDYNRVSLAGGSRGPWATE
ASQSINYVSAHDNNTLYDKLVATLPDADEETIKLMQKQANAIVLTAQGVPFLHAGVEMMR
TKDGDHNSYNASDEVNQIDWNWKEENADVYNYYKGLIALRSAHPAFRMSAQEDIQANLTF
MEDVPVGVIAFNLGNNANGDTASDITVIHNATDSEQVITLPKSADWQLVANGEVAGTDVI
EVVKGDSVTVTPHSSYVLMIDDSISSDGEWAQVLLIAGAALLVVAGTVAYIVYDKKKKSS
K
NT seq
3066 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgacgtaaaatttctttgatgctagcaatagcaattatggtaacatctattttacaa
aatgggaggattcatgcgacggatgatgcgaagttgacgattcattatcaacgcactgac
ggagtatacgatgaatggaatatttgggcttgggatactgggactgaggatatggagcaa
attgattttactgctaaagatgactttggttatattgcagagattgaggttgccaaaggc
aatgaagcgggattcattattcgtaagggggattggcaagagaaaaactgtgatgaggac
cagcgaatcaaggttgaggatgatactgagatttgggtttctgaggggcagtgtggttat
ttaactgaagcaccagcgggagccggtggcgaagttgtgaagttagagactgcaggtaat
gatactgtatcgactgtaagtgatgaggaagctgaggttcaagtgtttgtacattatcgt
cgatatgatgataagtataagaaatggaatatttggggatgggttgacggtcaggaagga
ttgtcttattcatttgaagatgaagatgattatggaaagatctttaagattaatttaaag
gatttaaatggtgccgataagcttggaattattatgcgaaaaggtaactgggattctaga
gatattgatcaggatcgttttattgatttaactaaagcgactgagggtgtattgaatgtt
tatttattagaaggtgattctaatatttattatagtgaggcagatgttgatttaacgcca
cgtttatcaacagcaacgtttaagtcgttaaataaaattatgtttacaggagcagctcca
attacatcgacggaaggtgtcgaagtacgcgatagccaaggaaatattttagaattagat
caagtgatgttagatgagtctagttctacaattgttgctttattaaaagagaatattagt
ttagaggattcttatacgattgcaaaagaaggatttaaggatgcaatcgaagtatcattt
acagggctttttgattctgaagagtttaatgatgcattctattatgaaggtgatgattta
ggatttacttattctaaggataaaacatcatttagagtatgggcaccaacagctagtcat
gtcgttttaaatttatatgaagcaggtagtggagataatttaattgagcaaatcgatatg
actcgtgatgttaaaggaacttgggttgcagatgttagtggtgatttgaatctgacttat
tatacgtatgaagtgacggtttcaggtcaaacgaacgaagcagttgatccttatgctcgt
gcggttggggtaaatgggaatcgtgcaatggttgttgatttagatttaacggatcctgaa
aactggtccagtgatgtgagtcctgagtttagtggaactccaacagatgcggtgatttat
gagttgcatatgcgtgactggtcaagtcatgagtcagcaggatttaaaaatatcgggaag
tttttacagtttactgaagagggggcaacggatcatttaacggatttgggtattactcat
ctgcatttacttccagcatttgatcatcgttcaatcgatgagacaaaattagatgagcct
caatttaactggggttatgatcctcaaaattataatgttcctgaagggtcttattcaacg
gatcctgagcatggtgaggttcgtattaatgagtttaaacaaatggtccaatctttacac
gaaaatggaattcgtgtggtaatggatgtggtttataaccatacaggagcaacagcggat
tctgattttaataagattgtaccaggatattattatcgtcaaacaactgatggtgggttc
tcaaatggatctggttgtggaaatgagacagcatctgatcgctcaatgatgcgtaagttt
attgtggattcagtgaagtactgggcaactgagtatcatattgatggattccgttttgac
ttaatggcgttacatgatattgaaacgatgaatgaagttcgtgcagctttaactgagatt
gatccaacaatcattgtttatggtgaaggttgggatgctggtggttctgcgttagaacaa
aatgaggcagcattaaaaatttatgcgtctcaaatgcctggtatcgggatgtttagtgat
gatattcgcgatggagtaaaaggtagtgtattcaatgctgaagagcctggttttgttaat
ggacagtttagttttgatgagcgtgtgaagtttggtattgttggagcgacaaagcattct
caaattgattataaccgtgtttcattagcaggaggatctcgcggtccttgggcaactgaa
gcttctcaatcaattaactatgtttcagcacatgacaacaatacgctttatgataagtta
gttgcaacgttaccggatgctgatgaggaaacaattaaattaatgcaaaagcaagcgaat
gcgattgtgttaactgctcaaggtgttcctttcttacatgctggtgttgagatgatgcgt
acgaaagatggagatcataatagttataatgcatctgatgaggtaaaccaaatcgattgg
aattggaaagaagaaaatgctgatgtttataactactataaaggattaatcgctcttcgt
agtgcgcatccagcattccgtatgtcagcacaagaagatattcaagcgaatttaacgttt
atggaagatgttcctgttggtgtgattgctttcaatttaggaaataatgcgaatggggat
acagcgtctgatattacggttatccacaacgcgacagatagtgagcaagtgattacttta
ccaaaatcagctgattggcaattagttgcaaatggtgaggtagcgggaactgatgtgatt
gaggttgtgaaaggtgattctgtaacagtgacacctcattcatcttatgtgttaatgatt
gatgattctatctcatctgatggtgagtgggctcaggttttattaatcgcaggtgcagcg
ttacttgtggttgctggaacagttgcttatattgtttacgataagaaaaagaaatcttct
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
