Tenacibaculum singaporense: D6T69_00035
Help
Entry
D6T69_00035 CDS
T09846
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
tsig
Tenacibaculum singaporense
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NPCBM_assoc
DUF8186_C
CHU_C
BamM_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZJ34000
UniProt:
A0A3Q8RPG1
LinkDB
All DBs
Position
complement(9716..16909)
Genome browser
AA seq
2397 aa
AA seq
DB search
MTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVN
GLPGGTTSALTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSY
NVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSTLTANDTLNGSP
VTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTS
VVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSTLTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTG
LTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVN
GLPGGTTSTLTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSY
NVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSALTANDTLNGSP
VTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTS
VVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSALTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTG
LTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVN
GLPGGTTSALTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSY
NVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSALTANDTLNGSP
VTVGTNPGGVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTS
VVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSALTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTG
LTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVN
GLPGGTTSALTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSY
NVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSALTANDTLNGSP
VTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTS
VVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSTLTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTG
LTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTITSVVEVSAPVIDAVTETTTPVN
GLPGGTTSALTANDTLNGSPVTVGTNPGGVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSY
NVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSALTANDTLNGSP
VTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTS
VVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSALTANDTLNGLPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTG
LTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVN
GLPGGTTSALTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSY
NVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSTLTANDTLNGSP
VTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTS
VVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSTLTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTG
LTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVN
GLPGGTTSTLTANDTLNGSPVTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSY
NVEYTICEVNNPTNCDTVTSVVEVSAPVIDAVTETTTPVNGLPGGTTSALTANDTLNGSP
VTVGTNPGDVTVTPVTVPTGLTLNSDGTVTVAANTPAGSYNVEYTICEVNNPTNCDTVTS
VVEVTGAPIIATDDLTPINLSNVNGFTGGVAGDLTVNDTLNGILVNDSDIIINVVDDGGL
IGVTIDAEGNLIVPANTQEGVYVIQYQICEVLNPGNCDTAEAIVIVEPDNDGDGIVDALD
LDDDNDGILDVDEGDGSVDTDGDGIPDSLDSDSDNDGVPDVIEGNDDNGDGIPDVLPSGN
DTDGDGIDDSYDPDNGGDPVDIPDSDGDGIPDYQDTDDDNDGIDTMDEGPGDGDPTTNDA
LDTNGNGIPDYLDSDTNPCGTPYNILTPDGDGDNDVFYISCIDSLEYQNNSVEIFNRWGN
TVYKASGYNNEDVAFRGISNGRANINVDEKLPSGTYYYVIDLGDGSKPKVGWLYINR
NT seq
7194 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctacattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctacattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctacattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggaggtgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctacattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacaataacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggaggtgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggttacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctacattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctacattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctacattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaagtgcaccggttatagatgcggtaacagagactactacaccagtgaat
ggattaccaggaggaacaacttctgcattaacagcgaatgatacattaaatgggtcacca
gtaacagtaggtacaaacccaggagatgtaacagtaacaccagtaacagttccaacagga
ttgacattaaattcggatggaacagtaacagtggcggcaaatacaccagcgggaagttat
aatgtagagtatacaatttgtgaggtaaacaatcctactaattgtgatacagtaacttct
gtagtagaggtaacgggggcgccaataattgcaacggatgacttaaccccaattaatttg
tcaaatgtaaatggatttacaggaggggttgcaggagatttaacagtgaatgatacatta
aatggaatattagttaatgatagtgatattattataaatgtagttgatgatggaggctta
attggtgttacaatagatgcagaaggtaatttgattgttccagcaaatacacaggaaggg
gtttatgttattcagtatcaaatatgtgaggtcttaaatcctggtaattgtgatactgca
gaagcaattgtaattgtagaaccagataacgacggagatggaattgtagatgccttagat
ttagatgatgataacgatggaattttagatgttgatgaaggagatggatctgttgatact
gacggagacggaattccagatagtttagattctgatagtgataatgatggagtaccagac
gtaatagaaggaaatgatgataacggagatggaattccagatgtacttccttctggaaat
gataccgatggagatggaatagacgattcttatgatccagacaatggaggagatccagtt
gatattcctgattctgatggagatggaattccagattatcaagataccgatgatgataat
gacggaattgataccatggatgaaggtccaggagatggagatccaacaacaaatgatgct
ttagatacaaatggaaatggtattccagattatttagattcagataccaacccttgtgga
actccgtacaatattttaactccagatggagatggagataatgatgtattctatatttct
tgtattgacagtctggaatatcaaaacaattcagttgaaatatttaatagatggggtaat
actgtttacaaagcatcaggctataataatgaagacgttgcttttagaggtatttcaaac
ggaagagcgaatataaatgttgatgaaaaattaccttcaggaacttattattatgtcatt
gatctcggagacgggtctaaacctaaagtaggatggttatatattaacagataa
DBGET
integrated database retrieval system
