Candidatus Thiothrix sulfatifontis: L3K52_13805
Help
Entry
L3K52_13805 CDS
T09924
Name
(GenBank) AMP-binding protein
Organism
tsj
Candidatus Thiothrix sulfatifontis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
AMP-binding_C
PP-binding
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOG91266
LinkDB
All DBs
Position
2773899..2775710
Genome browser
AA seq
603 aa
AA seq
DB search
MDFHSIWKNLKKSKNNDFLVTPEYRLSHSDLIELINRLVTLFDEYNILPSSRVIILTHNE
GAAIVGFIASLLDGVVPIMLTPDTPHRRVASIVSSTEPALVIIDYSRLDEDWVKQIPARI
VIHDSNNYPRKKLFNFSHKRSAMHHCGLNLPTAIREPHLPKVNDDLAYILFTSGTTQAPS
GVMISRKNIIANLQTISRLFDCNPNVRLFNDMVLAHADGLVQGILLAMANAATLIRSGGF
KISNLENWLNRVRQEKATHFITVPTIWSLIDQYANHDDYFDSSECLHLISVAAKLEQELW
GRLQNRFGKSISNQYGLTETVTSALYSGDFHSEMGGFGSIGKPIDCEARIRNADDVDSEI
GELQLRGDNIFLGYWKNSKRTTETFTQDGWMKTGDLVQSCSDGSYKILGRLKTIIMSGGF
LIRPEEIDEVLLTHPSVIEAVTVSMPDPNFDEVPVTAVVLSDERIDEDTLLEYARSNLEA
LKVPKRIISLASIPRGDAGKPKLKELREELLMMLSRKKEYTQERNSRDVSGEVYQVAAQV
LHIDPKLLQADSSPASVRSWDSFSQIALIIAMESHFSIRIPVAKAASIRNLGELVTTVKD
LLK
NT seq
1812 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactttcattctatttggaaaaaccttaaaaaatccaaaaataacgatttcttggta
acgcctgagtatcggttaagtcatagtgatcttattgagcttattaaccgcttagtaacg
ttatttgatgaatataatatcttgccatccagtagagttatcatccttactcacaatgaa
ggggctgctattgtcgggtttatcgcctctctattagatggtgtagtccctattatgtta
acacctgatacgcctcatcggcgcgttgcttcaattgtcagctctacagaacccgctctt
gttatcattgattatagtcgcttagacgaagattgggtaaaacaaatccctgctcgcatt
gtaattcacgattctaataattacccccgtaaaaagttattcaacttcagccataaacgc
agcgcaatgcatcattgtggtttgaatttgccgaccgcgatacgagagcctcatttacca
aaagtaaatgatgatttagcctatatactgtttacatcgggcactacacaagctcccagt
ggagtaatgatttcccgaaaaaatattattgctaatttgcaaactatatcgcgattattt
gactgcaacccaaatgtacgactatttaacgatatggttctagctcatgctgacggtttg
gtgcaaggaattttattggctatggctaatgcagcaaccttgattcgatcaggtggattt
aaaatcagtaaccttgaaaattggttaaatcgagtgcgccaagaaaaggctactcatttt
attaccgttcctacgatatggtcgcttattgatcaatatgcgaatcatgatgattacttt
gactccagtgaatgccttcatttaatctcagtcgctgcaaaacttgagcaagagctgtgg
gggcgtttacaaaatcgatttggcaaaagcatttccaatcaatacggtctaacagaaact
gttacctctgctctttattctggagattttcattcagaaatgggtggttttggtagcatt
ggaaagccgattgattgtgaagctcgcattagaaatgccgatgatgtggattctgaaatt
ggtgaattgcaattacgcggtgataatattttcttaggttattggaaaaattctaagcgt
acaacagaaacgttcacacaagatggctggatgaaaacaggggatctggtgcaatcttgt
tcggatggttcttataaaatattaggtcgcttgaaaacaattattatgtcaggtggattt
ttgattcgccctgaagaaattgatgaagttctactgacacacccatcagtaattgaggca
gttactgtttcaatgccagaccctaactttgatgaagttcctgtaacggcggttgttttg
tcagacgagagaattgatgaagatactttattagaatatgcgcgttctaaccttgaagca
cttaaagtacctaaaagaattatttctttggcttctataccgcgaggggatgcgggtaaa
cctaaattaaaagagctgagagaagagcttttgatgatgcttagtcgtaaaaaagaatac
acacaagaaagaaattctcgtgatgtttctggagaggtttatcaggttgcggcacaggtc
ttacacatagatcctaagttacttcaagcagattcaagccccgcttctgttcgaagctgg
gatagtttttcccaaattgcgcttattattgcgatggaaagtcatttctcgatcagaatt
ccggtggcaaaagctgcaagtatccgtaatcttggtgaattggtaacaactgtcaaagat
ttgttaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system