Candidatus Thiothrix sulfatifontis: L3K52_17695
Help
Entry
L3K52_17695 CDS
T09924
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
tsj
Candidatus Thiothrix sulfatifontis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
LRR_4
Cadherin_4
Cadherin_5
LRR_8
Cadherin_3
LRR_14
LRR_9
LRR_LRWD1
LRR_EndoS
GspH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOG91999
LinkDB
All DBs
Position
complement(3530958..3534029)
Genome browser
AA seq
1023 aa
AA seq
DB search
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ASY
NT seq
3072 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system