Candidatus Pseudothioglobus singularis: W908_04645
Help
Entry
W908_04645 CDS
T04071
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
tsn
Candidatus Pseudothioglobus singularis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tsn02000
]
W908_04645
Transporters [BR:
tsn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
W908_04645
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
RhaB_D2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALE02702
UniProt:
A0A0M4LI96
LinkDB
All DBs
Position
898884..900653
Genome browser
AA seq
589 aa
AA seq
DB search
MFTKKLILAASLSAILVSQAAYAVIGPIKITLNTEYRTSNPVIGDIATTIKLDKSEIRAT
GARTFTGLLQSIPSVSFEGGQGNLRALRLRGNEASHTLLLLDGHKVTITGSQPNLDVIPL
DQIERIEISKGPFSSLYGPGAIGGVIHVFTDKDINSITSSKIDVSSGSKGTVKVNLNTYF
KNENSYFDFAATDFHTDGIDALGNGDLDPIDRTTYGLNLGGQITENTSISVNLLDTKAII
QYDDPYGSPVLPDNNLKQMNLGITHNYGKRSKVSFDIMNQDIQRRTAKYELNTITVINEI
DLDNSKLSLGLSNSVDKDLNNLSTPSVAKKIKHTDLFGQWQGLVADNEISVGARLIDHDK
FNSHITYNLNWAKDLTLTTRVNASFGSATNLPDHYKNNANIVAGKTSLNPERSKNIELGF
TNNFKWGDAGIKLYKSRVADAFKWQSGSPAYYINDGTVNIQGAELSIGTELFGWELDSSI
DFNKAIAASTDLQKGRRPNRSISLNLNKSSEKWKRNINWTAHSWVWDKDNHSNGKNGGYG
LLNLSTSYDFTENLSAYLNRNNVLDKNYEMAKGYDTLGKTTTLGLTYNF
NT seq
1770 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttactaaaaaattaattcttgctgcttctctatcagcaattctagtgtctcaagca
gcatatgctgttattggaccaattaaaattactctcaatacagaatacagaacatctaat
ccagtcattggagatattgcaactaccattaagcttgataaatcggaaattagagctact
ggtgcaagaacatttacaggacttcttcaaagtatcccttccgtctcttttgaaggtgga
caagggaacctaagagcccttagattgagaggaaatgaagctagtcatacattattatta
cttgatggtcacaaagtcacaattactggttcacagccaaatttagatgtgattcctctt
gatcaaattgagcgaattgaaatttctaaaggaccattttcttctttatatggtccagga
gctataggaggagtaatacatgtttttactgataaagatattaattcaattacaagcagc
aagattgatgtttcatcaggctctaaaggaactgttaaagtaaaccttaatacctatttt
aaaaatgaaaatagctattttgactttgctgcaactgattttcataccgacggtattgat
gctttaggaaatggcgacttggacccaattgataggacaacttatggcttgaatctgggt
ggtcaaattactgaaaatacctctattagtgtaaatcttcttgatacaaaagctattatc
caatatgatgatccctatggttctccagttttgccagataataacttaaaacaaatgaac
cttggaattactcataattatggcaaaagatcaaaggtttcttttgacataatgaaccaa
gatatccaaagaaggacggcaaaatatgagttaaatacaattactgttattaatgaaata
gatctcgataacagtaaattatcccttggtttatcaaattctgtggacaaagaccttaac
aacctttctactccgtcagttgctaagaaaattaaacatactgatttatttgggcagtgg
caaggtttagttgctgataatgaaatatcagtgggtgcaaggcttattgatcatgataag
tttaattctcatattacttataacctgaattgggcaaaagatttaactttaactactaga
gtaaatgcctcttttggaagtgcaactaatttgcctgatcactataaaaacaatgcaaat
attgttgcaggcaaaactagcctcaatcctgagagatcaaagaatattgaattaggtttt
actaataatttcaaatggggagatgctggtattaagttatataaaagtagagtggctgac
gcttttaaatggcaatctggaagtcctgcatactatataaatgatggcactgtaaacatt
caaggtgctgaactgtcaattggaacagagttatttggctgggaattagattcaagtatt
gacttcaataaggctattgcagcttcaactgaccttcaaaaaggtagaagacctaatcga
tctatttcattaaatcttaataagtcttctgaaaagtggaaacgaaatattaactggacc
gctcattcttgggtttgggataaagataatcactctaatggaaagaatggtgggtatggt
ttacttaatttgagtacgagctatgattttactgaaaatctgagtgcttatttaaaccgc
aataatgtattagacaaaaactatgagatggctaaaggttatgatactcttggaaaaaca
actactttaggtttaacatataatttctag
DBGET
integrated database retrieval system