Candidatus Pseudothioglobus singularis: W908_07135
Help
Entry
W908_07135 CDS
T04071
Name
(GenBank) LPS heptosyltransferase
KO
K02849
lipopolysaccharide heptosyltransferase III [EC:
2.4.99.25
]
Organism
tsn
Candidatus Pseudothioglobus singularis
Pathway
tsn00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
tsn01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsn00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
W908_07135
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
tsn01005
]
W908_07135
Enzymes [BR:
tsn01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.25 lipopolysaccharide heptosyltransferase III
W908_07135
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
tsn01005
]
Core region
W908_07135
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_transf_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALE02318
UniProt:
A0A0M4LG77
LinkDB
All DBs
Position
complement(1394320..1396320)
Genome browser
AA seq
666 aa
AA seq
DB search
MYFLALLFIEILKKIKKILIVIQRSNGDVFLSQSLISSIYKHYNSPQIDLLVNDDTLQIA
KLMQFINYIHTFSYKKKQEAQWTQEKTLVKSIYRKYDLSINLTSSDRSVIYSLLASRKSI
TAIDENIKKSWWKKILPNDYYFFDSNKHILLNNLEPLNLLKIPHESIQECPLIKKESITN
VKKKLFKKGINNFVIFHPSTQYEYKIYPKKLRHELLVHLSSIGISVLVTGSNNQIDLSIK
NSLPILPNVFDLIGETTLEEYFALSHLSLAYIGMDTLNMHIAASQNKRIFAIFGPTNINM
WSPWSNTIFRSARKDAPIQNYGNITLFQANLPCVACGKAGCNDLHLHSDCLDKIKPKNIF
NEFNNWLLRKDSQVQLQQSISIEQQNRKIILYIVYGNDEGYYDGAKYSFLTLMNWIEEKD
PIEIIVLTEKPEKFIGYPVKTLLIEAHQKKEWSLSGAYEFRIKNRGLAYVMNKMKLNSHD
KILFFDTDTYFHKSPFPLFELIKFNQAVFYLNEGLIYNRKRFKVYLESLKDQKIEYGGQC
YELSPNSEIWGSLMIGVMPNMLSSLDWADKLMLEFFEIVPSHTIESFSLSEILLKKYQIV
EGKRFVSLYSTRRKKEHAVQILSKFFQENKLLSIKDQVYLAQKIKIKRPFFTLIKQRFFK
IKEYRN
NT seq
2001 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtattttttagctcttttatttatagagattttgaaaaaaattaaaaaaattcttata
gttattcaaagatctaatggtgatgtttttttaagtcaatcattaatatcatctatttat
aagcactataattctccccagattgacttattagttaatgacgatactcttcaaattgca
aaattaatgcaattcataaattatattcatacattttcttataaaaaaaaacaggaagct
caatggactcaagagaaaacattagtaaagagtatttatagaaaatacgatttaagtatt
aatttaacttctagtgataggagtgtaatctactctcttttagcaagtagaaaatctatt
acggctattgacgaaaacattaaaaaatcttggtggaaaaaaatcttaccaaatgattac
tatttttttgattcaaataaacatatcttattaaataatttagagccactgaatttgctt
aaaattcctcacgaaagtattcaagaatgtcctcttataaaaaaagaatcaattacaaat
gttaaaaagaaattatttaaaaaaggcatcaataattttgtaatatttcatccatctact
caatatgagtacaaaatttatccaaaaaaattaagacatgagctcttagtccatttgagt
tctattggaataagtgttttagtaactggaagtaacaaccaaattgatttaagtataaaa
aactctttacctatattgcccaatgtatttgatttaattggtgaaacaaccttagaagaa
tattttgcattaagtcatttgtcgctcgcctacattggtatggacacattgaatatgcat
atagcagcctcacaaaataaacgaatttttgcaatttttggccctacaaacataaacatg
tggtcaccatggtccaatactatttttagatcagcacgaaaagatgctccaatacaaaat
tatggaaatattacacttttccaagcaaatcttccatgtgtagcatgtggtaaagcagga
tgtaatgatcttcacttgcacagtgattgtttagataaaattaaaccaaaaaatattttc
aatgagtttaataattggcttttacgaaaagattctcaagttcaattacaacaaagtatt
agtatagaacaacaaaatcgaaaaataattctatatatagtttatggtaatgatgaaggt
tattatgatggagcaaaatatagttttttaactctaatgaattggatagaagagaaagat
ccaattgaaataatagttttaactgaaaaaccagaaaaatttattggttatccagttaag
actctcttaattgaagcacatcaaaaaaaagaatggtccttatctggtgcttatgaattt
aggattaaaaatagaggtttggcttatgtgatgaataaaatgaaacttaattctcatgat
aagattctattttttgatactgatacatattttcataaatcaccatttccattgtttgaa
ttaattaaattcaatcaggcagttttttatttaaatgagggattaatatacaatagaaaa
agatttaaggtttatttggaaagtttaaaagatcaaaaaattgaatatggtggacagtgt
tatgaattaagtccaaattcagaaatttggggctctcttatgataggagtaatgccaaat
atgctttccagtctggattgggctgataagttgatgcttgagttttttgaaattgtgcca
tcacatacaattgagtcattttcattatcagaaatcttattaaaaaaatatcaaatagtt
gaaggaaaaagatttgtaagtttatattcaactcgaagaaaaaaagagcatgctgttcaa
atactatcaaaatttttccaggaaaacaagctgctttctattaaagatcaagtttattta
gcacagaagattaagattaagcgtccattttttacattaataaaacaaagatttttcaaa
atcaaagaatatagaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
