Thamnophis sirtalis (common garter snake): 106545465
Help
Entry
106545465 CDS
T06107
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
tsr
Thamnophis sirtalis (common garter snake)
Pathway
tsr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsr00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
106545465 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tsr00536
]
106545465 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tsr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
106545465 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106545465
NCBI-ProteinID:
XP_013917509
UniProt:
A0A6I9XNH8
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2855 aa
AA seq
DB search
MGRRRALCLQPYFLWLGCVALWAHGSSGQQRQGRPAEGADTSRYSILGSLEGGTASAAAA
AAANRVRRRGQQDMLRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVLQQCNVRCLNGGTCLD
DQCQCQKGYIGTYCGQPVCEHGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFIQVN
NQMCQGQLAGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDIDECQ
AIPGICQGGTCINTVGSYECKCPAGHKQNEITQKCEDINECSLIPGICDAGECSNTVGSY
ICLCPRGFVTSTDGSHCLDQRAGTCFSSLLNGRCAQELPGRFIKMQCCCESGRCWALGSI
PEICPARGSDEYRGLCIDGIPVIGGSRPGGTGGNGFGPGGTGFIPIPGGNGFSPGVHGTG
IGTGGQGPTGNGPIITGLTILNQTIDICKHHPNLCLNGRCIPTISSYRCECNMGYKQDAN
GDCTDVDECISNPCSNGDCVNTPGSYYCKCHTGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGR
CVNTDGSFQCICNAGFELTTDGKNCIDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLA
PNGRYCTDIDECKTPGICMNGHCINTEGSFRCDCPSGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGI
KKGACVRPFPGAVTKSECCCANLDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSGGVGITVDGRDIN
ECALDPDICSNGVCENLRGSYRCNCNSGYESDVSGQNCVDIDECFVNRLLCDNGLCRNTP
GSYSCVCPKGYIFSSETDTCEDINECESSPCVNGACRNNLGSFICECLSGSKLDSTGFIC
IDSLKGTCWLNIQDNRCEVNLHGATLKSECCATLGAAWGSPCERCEFGMISIDCQFPFMY
ISDVNECEVFPGVCPNGRCINNRGSFHCECPNGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLRWDEDDC
VQPVLGKFRMDTCCCAIGAAWGSDCEECPKPGTKEYEDLCPRGPGFSNRGDILTGRPFYK
DINECKMFSGMCTNGKCRNTIGSFKCRCNNGFALDMEERNCTDINECRISPDLCGSGTCV
NTPGSFECECFDGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGKCLNTEGSFRCDCPLGHELS
SSREECVDINECSLSDNLCRNGKCVNVIGMYQCSCNPGYQATPDKQGCIDIDECMIMNGG
CDTHCSNSEGSYECSCSDGYALMPDMRTCADIDECDSNPDICDGGQCINIPGEYRCLCYD
GFMASVDMKICIDVNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECE
IGAHNCDMHGLCLNVPGSFRCSCKEGWIGNGIKCIDLDECSNGTHQCSINAQCVNAPGSY
HCTCAEGFTGDGFICSDIDECAENINLCDNGQCLNIPGEYRCECEMGFTSTSNSRTCQDI
DECAFQNICVFGTCNNLPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGFCVNTPG
RYECNCPPDFQLNPTGVGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCSTEIGVGVSRSSCCCSLGK
AWGYPCETCPPVNSSEYNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGS
FQCECPHGYYLSEETRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNC
MDMRKSFCYRSYNGTSCDNELPFNITKRMCCCTYNIGKAWNKLCEPCPAAGTVEFKTLCG
NFPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDID
ECSNGDNLCQRNADCINSPGSYRCECATGFKLSPNGACIDRNECQEIPNVCSHGTCVDKE
GSYYCICQNGFKSSRDQTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCM
DIDECSSFFGQVCRNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTPDGKNCIDINECVVLPGSCFPGTC
QNLEGSFRCICPSGYEVKSESCIDIDECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPQGFVISDN
GRRCFDTRQSFCFTNFENGKCSVPKASNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQ
DLCPFGHGTIPGIDDTREDVNECLENPGICSNGHCINTDGSFRCECPLGYNLDYTGVQCV
DTDECSIGNPCGNGTCSNVIGSFECNCLDGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTY
GFYECTCPVGYELREDQKMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPD
GEGCIDENECHSKPGICENGRCINIIGSYICECNEGFQSSPSGTECIDNRQGFCFAEVLQ
TMCQMASSSRNLVTKSECCCDGGRGWGNQCEICPLLVTTQYKKLCPHGPGYTTDGTDIDE
CKVMPNLCRHGQCINTMGSFRCFCKVGYTTDISGTSCVDLDECSQSPKPCNFICKNTEGS
YQCSCPRGYILQDDGKSCRDLDECQSKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDN
NECGSQPSLCGSKGICQNTPGSFACECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNIL
GGYRCSCPHGYIQHYQWNQCVDENECTNPSICGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQLNSA
CHDVNECSSTKNPCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRAGQGHCVSGMGFGKGQYLPVDQGEE
NALSPEACYECKINGYSQKDSRKKRSLNPSQPREISLESLDIDLPLKMRFSVTGLGNKEH
ILDLMPAIQTLTNHNRYVISFGNHNSTFRIHQKDGLSYLQVAKKKPTAGIYTLEIVSIPL
YKKEELKKLEESNEDNYLLGELGEALKMRLWIELY
NT seq
8568 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggagacggcgggcgctttgcctgcagccttatttcctttggctggggtgtgtggcg
ctgtgggcgcatggatcctctgggcagcagcggcagggtcgtccggcggagggtgcggat
actagccgctactctatcttggggagcctggaaggaggcacagcgtccgccgccgccgcc
gccgccgccaaccgtgtccgcaggagaggccagcaggacatgctcaggggaccaaatgtg
tgtggctccagattccactcctactgttgccctggatggaaaacactccctgggggaaat
cagtgtattgttctacaacagtgtaacgtcagatgtctgaatggtggtacctgtctagat
gaccaatgccagtgtcaaaaaggatatattggcacttactgtgggcaacctgtctgtgaa
catggatgccagaatggaggtcgctgcattgggcccaatcgttgtgcatgtgtatatgga
ttcacaggccctcaatgtgaaagagattatagaacagggccttgttttattcaagtcaac
aatcagatgtgtcaaggtcagctagctggtattgtttgcacgaagacactttgttgtgca
actattggacgtgcatggggccatccttgtgaaatgtgccctgctcaacctcaaccatgt
cgtcgtggtttcattccaaacatccgcactggagcatgtcaagatatagatgaatgtcag
gctatccctggaatctgtcaggggggaacttgcatcaatacagtcggatcatatgaatgc
aaatgccctgctggtcataaacagaatgaaataactcaaaagtgtgaagatattaatgaa
tgcagcctcatcccaggaatctgtgatgctggtgaatgttccaatactgttggaagttac
atttgtctatgtccacgtggctttgtgacatccacagatggctctcattgccttgatcaa
agagcaggtacttgtttctccagtctgctgaatggtcgctgtgcacaagagcttccaggc
aggtttatcaagatgcagtgctgttgtgagtctggacggtgttgggctcttggatccatt
ccagaaatttgtccagctagaggctctgatgaatatcgtgggctttgcatagatggcatt
cctgttataggaggttccaggcctggtggcacaggaggaaatggctttggcccaggagga
acaggattcatccctattcctggtggaaatgggttttccccaggtgtgcatggaacggga
atagggactggtggtcaaggtcccacaggaaatggccccatcattacaggactgacaata
ctcaatcagacaatagatatctgtaaacatcatccaaatttatgtttaaatgggcgttgc
atcccaacaatttccagttaccggtgtgaatgcaatatgggatataagcaggatgccaat
ggagactgtactgatgttgatgagtgtatatcaaatccatgctctaatggagactgtgtg
aacacacctggctcttattattgcaaatgccatacaggtttccaaagaacacctactaag
caggcttgcattgacattgatgagtgtattcagaatggtgtcctttgtaagaatggtcgt
tgtgtgaacactgatggtagtttccagtgcatttgcaatgctggctttgaactaacaact
gatgggaaaaactgtattgaccatgatgaatgtacgactaccaacatgtgtttgaatgga
atgtgtattaatgaggatggcagtttcaagtgcatctgtaaacctgggtttgtcctggct
cctaatggacgttactgtactgatattgatgaatgcaagactccaggtatttgcatgaat
ggccactgcattaatacagaaggatcatttcgttgtgattgtccatctggactagctgtt
ggagttgatggtcgagtttgtgtagatactcatatgcgaagcacatgctatggaggaata
aaaaagggagcatgtgtacgcccttttcctggagcagtgacaaaatctgaatgttgctgt
gccaatttagattatggctttggcgaaccatgccacccatgtcctgccaagaattcagct
gagttccatggcctttgtagtggaggagtaggaattactgtggatggaagagatataaat
gaatgtgctttagatcccgatatttgctctaacggggtttgtgaaaacttacgtggcagc
tatcgttgtaactgcaacagtggatatgaatcagatgtttctggacaaaattgtgttgac
attgatgaatgttttgtgaatcgattattatgtgacaatggcctttgtcgaaatacgcct
ggaagttacagctgtgtgtgcccaaaaggatatatattcagcagtgaaactgacacatgc
gaagatataaatgaatgtgaaagcagtccttgtgtcaatggtgcttgcaggaacaatctt
gggtctttcatctgtgaatgtttatctggcagcaaattagactctaccggcttcatttgt
attgatagtctgaaaggaacatgctggttgaacatccaagataatcgttgtgaagtaaac
cttcatggagctactttgaaatcagaatgctgtgctactctgggagctgcttggggtagc
ccttgcgagcgttgtgaatttggtatgatttcaatagattgtcagttcccttttatgtat
atatcagatgtaaatgagtgtgaagtttttccgggtgtgtgtcccaatgggcggtgcatc
aacaacagaggctcttttcattgtgagtgtcccaacggtctaaccttggatggaacaggc
agggtgtgtttagatatccgaatggaacagtgttacctgagatgggatgaagatgattgt
gttcaacctgtgcttggaaaattccgtatggacacatgttgctgtgctataggtgctgct
tggggttcagactgcgaagaatgccccaagccaggcacaaaagaatatgaagacttatgc
cccagaggtccaggcttctccaaccgtggggatattttaactggaaggccattttacaaa
gatataaatgaatgtaaaatgttctctggcatgtgcacaaatggcaaatgtagaaataca
attggaagcttcaaatgtagatgcaataatggatttgcacttgatatggaagagagaaat
tgtacagatattaatgaatgccgtatctcacctgatctttgtggaagtggcacttgtgtc
aacactccaggaagctttgagtgtgaatgctttgatggctatgaaagtggatttatgatg
atgaaaaactgtatggacatagatgaatgtgaacgtaacccgcttctctgtagaggtggg
aaatgcttgaatactgaaggaagctttcggtgtgattgtcctcttgggcatgaattgtct
tcatcacgtgaagaatgtgtggatatcaatgaatgttctcttagtgataacctatgtaga
aatgggaaatgtgtgaatgtgattggaatgtatcagtgttcctgtaatcctgggtaccag
gcaactccagataagcaaggttgcatcgatattgatgagtgcatgattatgaatggaggc
tgtgacactcactgcagtaattcagaaggcagctatgaatgcagttgcagtgatggatat
gctctgatgccagatatgaggacttgtgcagatattgatgaatgtgacagcaacccagat
atctgtgatggtgggcagtgcattaacattccaggagaatatcgttgtctttgttatgat
ggattcatggcttcggttgacatgaaaatatgcattgatgtgaatgaatgtgatctaaat
tcgaacatttgcatgtttggggaatgcgagaacaccaaaggatccttcatttgtcattgc
caactgggttattctgtcaagaagggaactactggatgcacagatgtggatgaatgtgag
attggtgcccacaattgtgacatgcatggtctgtgtctcaatgttccgggaagcttcaga
tgtagctgtaaggaaggatggattggaaatggaattaagtgtatagatctcgatgagtgt
tctaatggaacacaccaatgtagcataaatgctcagtgtgtaaatgctcctggatcatat
cattgcacctgtgcagaaggatttactggagatggatttatttgttcagatattgatgaa
tgtgcagaaaatattaacctgtgtgacaatggacaatgtcttaatatccctggtgaatac
cgttgtgagtgtgagatgggctttacttcaacttccaatagccgaacttgccaagatatt
gatgaatgtgcctttcagaatatatgtgtgtttggtacttgcaataacttacctggcatg
tttcactgtatttgtgatgatggctatgaactggacagaactggaggaaattgtacagat
attgatgagtgtgctgatcctataaattgtgtcaatggcttttgtgtaaatactcctgga
aggtatgaatgtaactgtcctccagatttccagctgaaccctacaggagttggctgtgtt
gataacagagttggcaactgctacttgaaatatggaccaaggggtgatggaagtctgtcc
tgcagtactgaaattggtgttggagtcagtcgttcttcttgttgctgttctttggggaaa
gcctggggatatccctgtgagacatgcccacctgtaaatagcagtgaatataataccttg
tgtccaggaggcgaaggcttcagaccaaatcccataacaattatcttagaagacattgat
gaatgccaagaattgcctggtctatgccaaggtggaaactgcatcaatacttttggcagc
ttccaatgtgaatgtccccatgggtactatctcagtgaagaaacacgtatctgtgaagat
attgatgagtgtgttgcacatcctggtgtatgtggtcctgggacatgctataatacttta
ggaaattatacctgtatttgccccccggaatatatgcaggtgaatggaggacacaactgt
atggatatgagaaagagcttttgctatagaagttacaatggaacatcttgtgataatgaa
ctgccctttaatattaccaagagaatgtgttgctgcacttacaatattgggaaagcctgg
aacaagctctgtgagccatgcccagctgcggggacagttgagttcaaaacattatgtgga
aattttcctggtttcacctttgacattcatactggaaaagcagttgatattgatgaatgt
aaagagattccaggtatttgtgcaaatggtgtttgcatcaaccagattggaagttttcgt
tgtgaatgccccacaggatttagctacaatgatctgctcttggtctgtgaagatattgat
gaatgtagcaatggtgataatctctgtcaacggaatgcagattgtatcaatagccccggt
agttaccgctgtgaatgtgctacgggtttcaaactttcacccaatggtgcttgcattgat
cgcaatgaatgtcaggaaatacctaatgtatgtagtcatggcacatgtgtggataaagag
gggagctactactgcatctgtcaaaatggttttaagtcatcccgtgatcaaacaatgtgt
atggatgtagatgaatgtgaaagacatccttgtgggaatggaacttgtaaaaatacagtt
ggatcatataactgcctgtgctatccaggatttgagctaactcataataatgactgtatg
gatattgatgagtgcagttccttctttgggcaggtgtgcagaaatggaagatgctttaat
gaaattggttctttcaaatgtttatgtaatgaaggttatgaacttactccagatggcaaa
aactgtattgatattaatgagtgtgtagtgcttcctggctcatgctttcctgggacatgt
caaaatttggaaggatcattcagatgtatctgcccatcaggatatgaagtaaaaagtgaa
agctgcattgatattgatgaatgtaatgaggatcctaacatttgcctgtttggatcctgc
actaatactccaggaggatttcagtgcatctgccctcaaggttttgtaatatctgacaat
ggcaggagatgttttgatactcgacagagcttctgtttcactaactttgagaatgggaag
tgctctgtgccaaaagcatctaataccaccaaggcaaaatgttgttgcagcaagatgcca
ggagaaggttggggtgatccatgtgaactgtgtcctaaggaagaagaagttgcttttcag
gatctgtgtccatttggccatggaacaatacctggaatagatgatacaagagaagatgtc
aatgaatgtctggagaatcctggtatttgttctaatggacactgcataaacactgatgga
tcattccgttgtgaatgtcccttgggctacaaccttgactacactggagtgcaatgtgta
gatactgatgaatgttccattggtaatccttgtggaaatggcacatgttccaatgtgatt
ggtagttttgagtgcaattgcctggatggatttgaacctgggccaatgatgaattgtgaa
gatataaatgaatgtgcacaaaatcctttgctttgtgcttttcgctgtataaatacgtat
ggtttttatgaatgcacttgtccagtgggatatgaattaagagaggaccagaaaatgtgc
aaagatctcgatgaatgtgcagagggtctacatgattgtgaatcaagaggcatgatgtgc
aaaaatctgattggaaccttcatgtgcatatgtccccctggaatgactcgaagaccagat
ggtgaaggttgtattgatgaaaatgaatgccacagtaagcctggtatctgtgaaaatggt
cgttgtataaacattattggaagttacatatgtgagtgtaatgaaggtttccagtcaagc
ccatctggaactgaatgcattgacaaccgacaaggtttctgctttgctgaagtcttgcag
acaatgtgtcaaatggcttccagtagccgtaatcttgtcaccaaatcagaatgctgttgt
gatggtggaagggggtggggcaatcagtgtgagatttgcccactcttagtaacaactcag
tacaagaagctgtgtccacatggtccaggatacaccactgatgggacagatattgatgag
tgtaaggtcatgccaaatttatgcagacatggccaatgcataaacaccatgggttccttc
agatgtttttgcaaagttggctatactactgatataagtggtacttcttgtgtggatctt
gatgaatgctcccagtctcccaaaccctgtaattttatctgcaagaatactgaaggaagc
taccaatgttcatgtccacgtggctatatcctccaagatgatggaaaatcctgtagagat
cttgatgagtgtcaaagtaaacaacataactgtcaattcctttgtgtcaatactctgggg
ggattcacatgtaaatgtccaccaggtttcacccaacatcatacagcctgtatagataac
aatgaatgtggatcacagccttcactttgtggatctaaaggaatctgtcaaaatactcct
ggaagttttgcctgtgaatgccaaagaggtttctctttagattccactggattgaactgt
gaagatgtggatgagtgtgatggaaatcacagatgccaacatggctgccagaatattctt
ggtggctacagatgcagctgcccacatggatatatccagcattatcagtggaatcagtgt
gttgatgaaaatgaatgcacaaatcctagcatttgtggttcagcttcatgctacaacact
ctaggaagctacaaatgtgcatgtccctctggattctcttatgatcagctcaatagcgca
tgccacgatgtcaatgaatgttcttctactaagaatccctgcaattatggctgttccaat
actgaaggcggatacctctgtggctgccctccagggtattacagagcagggcaagggcac
tgtgtctccggtatgggatttggtaaaggccagtatctaccagtggatcaaggtgaagag
aatgctttgtccccagaagcatgttacgagtgtaaaattaatggatactcccaaaaagac
agcaggaagaaaagaagcctcaatccatctcagcctagagagatcagtttggaaagtttg
gacattgatcttccattgaagatgagattcagcgtaactggccttggcaataaagaacat
atattagatctcatgcctgcaatacagaccctcacaaatcacaaccgctatgttatctcc
tttggtaatcacaacagcaccttccggatacaccagaaagatggactcagttatcttcag
gttgctaagaaaaaacccacagctggtatttacacactggaaatagttagcattcctctg
tacaaaaaggaagaactaaagaaattggaagaaagcaatgaggacaactacctcctaggg
gaacttggagaagctcttaaaatgagactttggattgaactctattaa
DBGET
integrated database retrieval system
