Telopea speciosissima (New South Wales waratah): 122645982
Help
Entry
122645982 CDS
T07910
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
tss
Telopea speciosissima (New South Wales waratah)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tss00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
tss01003
]
122645982
Glycosyltransferases [BR:
tss01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
122645982
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Baculo_IE-1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122645982
NCBI-ProteinID:
XP_043695360
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(35218762..35223935)
Genome browser
AA seq
1148 aa
AA seq
DB search
MASKNFQPSRSNVSTTSDGSEALQGRPPIPQHVTFARRTSSGRYVSYSRESNDLDSEVGN
PEYMNYTVHIPPTPDNQPMDPTISQKVEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESEANH
PQMAGAKGSSCAVPGCDGKVMSDERGQDILPCECDFKICRDCYFDAVKTGSAICPGCKES
YRTADLDEMAADDGQPLSLPPAAGVSKMERRLSLMKSTKSVLMRSETRDFDHNRWLFETK
GTYGYGNAIWPQEGTFSDDKDDGIHESAELVSKPWRPLTRKLKIPAAVISPYRLLIFIRM
IALVLFLMWRVMNVNTQAVWLWGMSVVCEIWFAFSWLLDQLPKLNPVNRSTDLAVLKEKF
ETSGPHNPTGKSDLPGIDIFVSTADPEKEPPLVTSNTILSILAADYPVEKLACYVSDDGG
ALLTFEAMAEAASFANLWVPFCRKHAIEPRNPETYFNLKRDPYKNKVRPDFVKDRRRVKR
EYDEFKVRINGLPDAIRRRSDAYHAREEIKAMKLQRQNAREDELAEVVKVPKATWMADGT
HWPGTWLHPGVEHSKGDHAGIIQVMLKPPSDEPLQGTADETKLIDLTEVDIRLPLLVYVS
REKRPGYDHNKKAGAMNALVRASAIMSNGPFILNLDCDHYIYNSQAMREGMCFMMDRGGD
RLCYIQFPQRFEGIDPSDRYANHNTVFFDGNMRALDGLQGPVYVGTGCLFRRIALYGFDP
PRSKDHSSGCCSCCLGPRKRKASVANTPEENRALRMGDDDDDEMNLALFPKKFGNSSILV
DSIPVAEYQGRPLADHPSVKNGRPPGALTIPRDLLDASTVAEAISVISCWYEDKTEWGQR
VGWIYGSVTEDVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEI
FFSRNNALLASSKMQFLQRIAYLNVGLYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQTLNVQF
LVYLLAITVTLCMLAILEVRWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVVAGIE
ISFTLTSKSGGDDLDDEFADLYVVKWTSLMIPPITIIMVNLIAIAVAFSRTIYSTIPQWS
QLIGGVFFSFWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVYVWSGLIAITISLLWVAISPPSGSTT
IGSGFQFP
NT seq
3447 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtcaaaaaactttcagcctagccggtcgaatgtatcgacgacatctgatggttct
gaagcactacaggggaggcctcctattcctcaacatgtgacgtttgctcggaggacttca
tccggtcgctatgttagctactcgagggagtcgaatgaccttgatagtgaagttggtaat
cctgaatacatgaactacacggtgcacataccaccaactcctgataatcagcccatggat
ccaaccatctcacagaaggttgaagaacagtatgtgtcaaattctcttttcactggtggg
ttcaacagtgtcactcgagctcatctcatggataaggtgattgaatctgaagcaaatcat
ccccagatggctggtgccaagggatcttcgtgtgctgtacctgggtgtgatgggaaagtc
atgagtgatgagcgaggacaagacatccttccttgtgaatgtgattttaagatctgcagg
gattgctattttgatgctgttaagactggtagtgcaatatgccctgggtgcaaggagtca
tataggactgcagatttagatgagatggctgctgatgatggacagccactgtcgctgcca
ccggcagcaggggtgtccaagatggaaaggaggttgtctttgatgaaatcaaccaaatcg
gtgttaatgaggagtgagactcgggacttcgatcataaccgatggctgtttgaaaccaag
gggacatatgggtatgggaatgctatatggcctcaggaggggactttttcggatgacaag
gatgatgggattcatgagtctgcagaactagtgagtaaaccttggaggccgcttacacgc
aaactaaagatccctgctgcggttattagcccgtataggcttctaatatttattcgaatg
attgctcttgttctgttcctgatgtggagagttatgaacgtaaacacgcaggcagtctgg
ctgtggggtatgtctgtggtctgcgagatctggtttgcgttttcttggctgcttgatcag
ctgccaaagctcaatcctgttaaccgttccactgatcttgctgtgctgaaagagaaattt
gaaacttctggaccccataatcccactggaaaatctgatcttccaggcatagatatcttt
gtctctactgcagatcctgagaaggagccacctctagtcacttcaaacaccatcctttca
atccttgcagctgattatcctgttgaaaagcttgcttgctatgtttcagatgatggtggt
gctcttcttacctttgaggccatggccgaagcagcaagttttgccaatttgtgggttcct
ttctgccggaaacatgccattgaacccaggaacccagagacttactttaatctgaagaga
gatccttataagaacaaggtgcgccctgattttgtcaaggaccgtagacgagtgaaacgt
gagtatgatgagttcaaggtacggattaatggcctacctgatgctattcgtcgccgttct
gatgcctatcatgctcgggaggagatcaaagctatgaagctgcagagacaaaatgcaaga
gaagatgaacttgcggaggttgtgaaagttccaaaagctacttggatggctgatggaacg
cactggcctggcacttggttgcatcctggggtggagcactcaaaaggtgatcatgctggt
atcatacaggtgatgttgaagcctcccagtgatgaaccattacaaggcactgctgatgag
acaaagctcattgatctcactgaagtggatatccgccttcccttgcttgtctatgtttcc
cgtgagaaacggccaggatatgatcacaacaagaaggcaggggccatgaatgcccttgtt
cgggcctctgcaattatgtccaatggccccttcatcctcaacctggattgtgaccactac
atctacaattcccaggcaatgagagaaggcatgtgcttcatgatggaccgtggtggtgat
cgcctttgttatatccaattccctcagaggtttgagggtattgacccctctgatcgctat
gcgaaccacaatactgtcttctttgatggtaacatgagggcccttgatggtcttcagggt
cctgtatatgtgggaactggatgccttttccgcaggatagccctctatggctttgaccca
cctcgatcaaaagatcacagctctggttgctgtagctgctgtttgggccctcgcaaacgt
aaggcatcagttgccaatacccctgaagagaaccgggcccttcgaatgggagatgatgat
gatgatgaaatgaaccttgctctgtttcccaaaaagtttggcaactcatcgatccttgtg
gattcaatccctgtggcagaataccaaggccgcccccttgctgatcacccatctgtgaag
aatggacgtccaccaggtgctctgacaattcctcgtgatcttcttgatgcttctacagtt
gcagaggcaatcagtgtcatctcttgctggtatgaggataagaccgagtggggtcaacgt
gttggatggatttatgggtctgtgacggaagatgttgtgacaggatatcggatgcacaac
agaggatggaaatctgtttattgtgtgaccaagcgtgatgccttccgagggacagcccca
atcaatctcaccgatcggcttcaccaggtcctccggtgggccactggctctgttgagata
ttcttctctcgtaataatgcccttctggccagctcaaaaatgcagtttctgcagaggatt
gcctacctcaatgtcggactctatcccttcacctctatctttctcattgtttattgtttc
cttccagcactctccctcttctctggccagttcattgtgcagaccctcaatgtccaattc
cttgtttacctactggccatcactgtgaccctttgcatgcttgccatactggaggtcagg
tggtcaggtattgagctagaggaatggtggaggaatgagcagttctggcttattggaggc
acaagtgctcaccttgctgctgttcttcagggtctactgaaagtagttgctgggattgag
atttcattcacattgacatccaaatcgggtggtgatgacttggacgacgaatttgctgat
ctctatgttgtcaagtggacatctcttatgattccacccatcacaatcattatggtgaac
ttgattgcaattgctgttgcattcagcaggaccatttatagtactataccacaatggagc
caattgattggtggggttttcttcagcttctgggtcctggcacatctttaccctttcgcc
aaaggtttgatgggaagaagaggtagaacacccacaattgtgtatgtgtggtcaggtctc
attgcaatcaccatatccctcctctgggtggcaatcagccccccttcgggcagtactact
atcgggtctgggttccaattcccttga
DBGET
integrated database retrieval system
