Telopea speciosissima (New South Wales waratah): 122659246
Help
Entry
122659246 CDS
T07910
Name
(RefSeq) glutamate receptor 2.8-like
KO
K05387
glutamate receptor, ionotropic, plant
Organism
tss
Telopea speciosissima (New South Wales waratah)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tss00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
tss04040
]
122659246
Ion channels [BR:
tss04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
122659246
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ANF_receptor
Lig_chan
Peripla_BP_6
SBP_bac_3
Lig_chan-Glu_bd
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122659246
NCBI-ProteinID:
XP_043710312
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(34941602..34948073)
Genome browser
AA seq
901 aa
AA seq
DB search
MTEFVDACSFLNKYVVAQNGSINSNTSLFHVGVVLDLKSKMGEIAESCISMALSDFYEIH
ANYTTRIMLHAMDSEQNVVVSASSALYLMKDVKVQAIIGPQESTQASFVIELGENAQVPI
VSFSATSPSLSPLKSPYFIRTAIDDSTQVKAVVSIIQAFEWKEVVLIYEDTNYGNEVIPY
FIDAFQKIDVLVPYKSTIPLDATDDQILKELHNLTTMPTRVFIVHMSSSIGSRLFMNANN
AGMISQGYAWIVTDGLSRLMASMNSSVIDSMEGVLGVRPYIPKSKKLEEFKVRWKRNFYS
NNSYGEISEPSLYGIWAYDTVWALAMAVEGVKTMDPQFLSSNTTNNLSDLSCLGYSTIGP
QLLQTILSTRFKGLSGDFHLVNGELESSAFQIFNVIGEGERVVGHWTPMGGISRQLNTTN
NLTDSGFLSSLKAIVWPGDSTTKPKGWVMPTNSQERLKVLVPVKTGFSQFVSMERDNITN
EMIDITGFCIEVFSNITSRLPFGLPYEFLPYPINGTVLESYDDLIYQIYLNNFDAAVGDV
SILFNRSNYVDFTLPYTDSGVTMVVAMQDNLEKELWLFLKPLSLELWLVTLGGFVCIGVV
VWILEHKINPEFGDSRRQQIQSSIWFSFLTLVFAQREKIESNLTRLVLFTWVFFVLILTQ
SYTASLSSTLTVRQLQPTITDVNVLKSNGYYVGYQDGSFVGEFLTNYLQFDPSKLKSYGS
PEEYHYALSNGSGNGGVAAIFDEIPYIQVFLNMYCNQYTMVGHIYSSEGFGFVFPKGSPL
VSYMSRAILNLTDDGTLDTIKQGWLENQTNCNNADATSISTNQLTLQSFGGLLSIIAVVS
FVALLIHFFPLGYGKYQATFKIFSNIINGLKVMPQATEGGSMEHQHKDAEHMEEATVEEK
E
NT seq
2706 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgaatttgttgatgcttgcagcttcttaaacaagtatgtggttgctcaaaatgga
agtatcaattcaaatacatccttgtttcatgttggagttgttcttgacttaaaatcaaaa
atgggagagatcgctgagagctgcatctctatggctttatctgatttttatgaaattcat
gcaaattatacaacaagaattatgctccacgccatggattctgaacaaaatgttgtggtt
tcagcatcctcagctttatacttgatgaaagatgtaaaggtgcaagccatcattgggcca
caagagtcaactcaagcttcatttgtgatcgaactcggagaaaatgcccaagtgccaatt
gtttctttttcagcaacaagtccttctctttctccccttaaaagtccttattttataaga
acagctattgatgactcaactcaagttaaagctgttgtttccattattcaagcctttgaa
tggaaggaagtagttttgatatatgaagataccaactatggaaatgaagttataccctat
ttcattgatgccttccaaaagattgatgttcttgtgccatataagagtaccattcctctg
gatgcaactgatgatcaaatattaaaagaacttcataacttgacaaccatgccaactagg
gttttcattgtccacatgtcttcttctattggatctcggctttttatgaatgcaaacaat
gcaggaatgataagccaaggttatgcttggattgtcactgatgggttatcaagattaatg
gcttccatgaattccagtgttattgattcaatggaaggtgtattgggtgtaagaccatac
ataccaaagtccaaaaagcttgaagaatttaaagtcagatggaaaagaaatttctactca
aacaattcatatggtgaaatatctgagccaagtctatatggtatatgggcatatgataca
gtttgggcactagccatggcagttgagggagttaaaaccatggatcctcagtttctgagt
agtaacactaccaataatttaagcgatctttcatgccttggatactcaacaattggccca
caacttctccagactatcttgagcactagatttaaaggcctaagtggtgatttccatttg
gttaatggagagttggaatcttcagctttccaaatatttaatgtgattggggaaggggag
agagtggttggacattggaccccaatgggagggatttcaagacagttaaacacaacaaat
aacttaacagattcaggttttctgagtagcctcaaagctattgtatggccaggagactca
acaaccaagccaaagggttgggttatgccaacaaatagtcaagagaggttaaaagttttg
gtgccagttaagactggctttagtcaatttgtgagcatggaaagagacaatatcaccaat
gagatgattgatatcacagggttctgcatagaagtattcagcaatataacaagtagacta
ccctttggtctcccctatgagtttctaccttaccctatcaatggaactgttcttgagagc
tatgatgacctaatttatcaaatttatcttaataacttcgacgcagcagtaggggatgta
tcgattttgtttaatcgatctaattatgtagatttcacattgccttatacagactctgga
gtgaccatggttgtggcaatgcaagataatttggagaaagagttgtggttgttcttaaag
cctttaagcctagaactttggttggtgactttaggaggttttgtctgcataggggtcgtg
gtttggattcttgaacataaaataaatcccgagtttggtgactcacgtagacaacaaatt
caatcaagcatttggttctccttcttaacacttgtatttgcccaacgagagaagattgag
agcaacttaacaaggttggtgttgttcacatgggtgttttttgtgttaatcttaacacag
agttacactgctagcctctcatcaactttgacagtacggcagttgcagccaacaattaca
gatgttaatgtcctaaagagtaatggatattatgtgggataccaagatgggtcgttcgtg
ggagagttcctgacaaactatttgcagtttgatccgtctaaactcaagagttatggttct
ccagaggaatatcattatgctttatctaatgggtctggtaatgggggagttgctgcaatt
tttgatgaaattccttatattcaagtcttcctcaatatgtattgtaatcaatacaccatg
gtcggacacatctactcttctgaaggatttggctttgtattccctaaaggctctccttta
gtctcttatatgtcaagggcaatcttaaatcttactgatgatggaacattagacacaatt
aagcaagggtggctagaaaatcaaacaaattgcaataatgcagacgctacatccatttca
accaaccagctcaccttgcaaagcttcggaggtctcctgtccataattgcagttgtttca
ttcgttgcactgctaatacactttttcccgttggggtatggcaagtatcaggctacattt
aagattttcagtaatatcataaatggtctcaaggtcatgccccaggcaactgaaggtgga
tccatggaacatcaacataaggatgctgagcatatggaagaagccactgttgaagaaaaa
gaatga
DBGET
integrated database retrieval system