Thalassobellus suaedae: RHP49_05015
Help
Entry
RHP49_05015 CDS
T10801
Name
(GenBank) LacI family DNA-binding transcriptional regulator
KO
K02529
LacI family transcriptional regulator, galactose operon repressor
Organism
tsx Thalassobellus suaedae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsx00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
tsx03000
]
RHP49_05015
Transcription factors [BR:
tsx03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
LacI family
RHP49_05015
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peripla_BP_1
Peripla_BP_3
Peripla_BP_4
LacI
HTH_3
HTH_10
HTH_11
Fe_dep_repress
HTH_24
SpoIIID
HTH_23
Sigma70_r4
HTH_19
HTH_36
GntR
MarR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNH13615
LinkDB
All DBs
Position
complement(1136485..1137492)
Genome browser
AA seq
335 aa
AA seq
DB search
MVTLKQLAKELNVSISTVSKALNNSEEIGEETVKRVKELAELYNYKPNRMALSLKQNKTK
TIGVIIPNILNHFLAKVLFGIEREATKLGYNIITCISNESLETEKASLQLLASGSVDGFI
LCVSEETQIKNEIDHFKKTISQGLPIVMFDRVAHDVMCDKVIVDDFDATYNATKNLLLEN
RKNIVFISNIDDLSVGKLRERGYNKAILENGGQDPLVLRIFKKDDHQKKIKSFFRKNNTI
DGVVSADSSSAIIAINSAINLGKKVPKHMSVIGFASKSDSNHTLPRLTTIRQHAKVIGAN
ATQLLVNRLQNMHLNEDVRTIIVKTSLVKNKSTLL
NT seq
1008 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttactttaaaacagcttgcaaaagagttaaatgtttctatctctacagtttctaaa
gctttaaataatagtgaagaaattggagaggaaaccgtaaagcgtgttaaagaacttgct
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DBGET
integrated database retrieval system
