Thalassobellus suaedae: RHP49_06520
Help
Entry
RHP49_06520 CDS
T10801
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
tsx Thalassobellus suaedae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tsx00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tsx02000
]
RHP49_06520
Transporters [BR:
tsx02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
RHP49_06520
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNH13905
LinkDB
All DBs
Position
complement(1490581..1491924)
Genome browser
AA seq
447 aa
AA seq
DB search
MSKIASQDLGTQAIGKLLIKQAVPASIGILVMSLNILVDTIFVGHWIGSVAIAAINVVLP
VSFFIAALGMSIGIGGASIISRALGANNTIKALKTFGNQITLTLLLTVTLVVFGLWFVDG
IIPAFGGKGTIFEPAKIYYKIVLYGVPILALSMMGNAVIRAEGKPKFGMYAMMIPSVSNL
LLDYIFINLLDFGMEGAAWATTISYVLCFLFIVWFFMSKHSELKIDFSHFGLNFGIVSEI
SSLGFVTLARQAVVSITYLLMNNILYDFGGETSVTSYAIVGRMLMFAMFPVLGITQGFLP
IAGFNYGAQNYTRVRETINIAIKYASILATLVFLVLMFFPEAITKMFTTDVSVISQTPSA
MRWVFAATPIIAVQLIGAAYFQAIGKAKPALILTLLRQGVFFIPLIFILPEFYGELGVWI
SFPIADVLATLVTAYFLNREIVKTLKP
NT seq
1344 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaaaatagcttctcaagatttaggaacgcaagccatagggaaacttttaattaaa
caagcggttcctgcctctataggtattttggtaatgtctttaaacatacttgtagatacc
attttcgtggggcattggataggctctgtagctattgcagctataaatgttgtgcttcct
gtatccttttttatagctgctttaggtatgagcattggtattggaggagcgtccataata
tcaagagcattaggagctaacaataccataaaagcattaaaaacttttggaaatcagatt
accttaaccttattacttacggttacacttgttgtttttggattatggtttgttgatggt
attattcctgcttttggtggtaaaggaaccatttttgaacctgccaaaatttattataaa
attgtgctttatggtgtgcctattttggcgctaagtatgatgggaaatgctgttattagg
gcagaaggcaaacctaaatttggcatgtatgctatgatgatcccttcagtaagtaatctg
cttttagattatatttttattaatcttttagactttggaatggaaggtgctgcatgggca
accaccatttcatatgtgctttgttttctttttattgtttggttttttatgtctaaacat
tccgaattaaagattgatttttcacatttcggattgaatttcggcatagtttcagaaata
agttctttggggtttgttacacttgcaagacaagccgtagtaagtatcacttatttactt
atgaataatattttgtatgattttggaggtgaaacctctgtaacgtcctatgctattgtt
ggtcgtatgcttatgtttgctatgtttcctgtgttaggaattactcagggctttttgcct
attgcaggatttaattatggcgctcaaaactatacaagggttagagaaacgattaatatt
gctataaaatatgcctctatcttagcaactttagtatttttggttcttatgttttttcca
gaggctatcaccaaaatgtttactaccgatgttagtgtaattagtcaaactccaagtgca
atgcgctgggtatttgctgcaacacctattattgcagtacaattaataggggccgcttat
tttcaagctataggtaaagctaaacccgctttaatattaactttattacgtcaaggagtt
ttctttataccgctcatttttattttacccgagttttatggcgaattaggtgtttggata
tcgttcccaattgcagatgttctagcaactttagttactgcatattttttaaatagagaa
atagtaaagactttaaaaccttaa
DBGET
integrated database retrieval system