Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571: Tthe_1385
Help
Entry
Tthe_1385 CDS
T01299
Name
(GenBank) SMC domain protein
KO
K03546
DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
ttm
Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ttm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ttm03400
]
Tthe_1385
DNA repair and recombination proteins [BR:
ttm03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
Tthe_1385
Archaeal homologous recombinant proteins
Tthe_1385
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_23
Rad50_zn_hook
SbcC_Walker_B
AAA_29
AAA_13
AAA_27
ABC_tran
HrpB7
UCR_hinge
Baculo_LEF-10
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADL68899
UniProt:
D9TLN7
LinkDB
All DBs
Position
complement(1390953..1393514)
Genome browser
AA seq
853 aa
AA seq
DB search
MVPIKLTLKNFMSYSEHEVMDFTRFHVAAIVGKNGNGKSALWDAITWCIWGRARGLDSAG
RGSDDLIRIGADEMEVEFIFKINNTKYRILRKKKRNSNSILEFNIINDDGTLKSLTQEKL
EDTKNKIEKTIMLDYDTFVASSFMPQNKYGFFSEADPTKRKEIFSEVLGLDIYDKLQEKS
KLKRNEYEKKVNIIDEQLKLYMNEIKDKNELINQKEELSKKCNEKKSEIDKLNNEMNILQ
EKKRNMDDTIIKYNEYIERIKMDEKVISEYKFMLSDLKNKINEINKLIKNEDSIIEGYNT
FKSLQDQLKELDNKYMQFNVLEKDKMKIKNDISLLKKETELELKNLQFKYNESLEKYKDI
ENNTKEVETLEKELEKLSNLQDEIMNNEDEIQKCTQKIAELKASFKGCNDRINELKENYN
TILKTDAKCPLCNSPLDQDKKSSLLGDFKEKINGYKKEISILKDKILKEQNNLEVLREER
ENLSILQQKRERLVANINTLKNNLSDKENLLNQLNELKRKIEDISDRLNSNRYAVKEIEK
LASIENKLKELNFSVEFYEDIKVKYEKYRDYEKKYERLNISKQNIVDYQNTYSNYKKTID
MYTENLKKDKEALEYFKSQCSGYDVLINDIKSLKQKLDISNNEFLNLNANLASISDRISR
IKYLETKIDDLNKEKDNYLTEIHYYEILERSFSKKGIQALIIENALPEFEDTANNFLSKL
SDGKMYVSLLTQKTNKSGSVQETLDIEISDELGKRKYELFSGGEAFRINFALRIALSKFL
SKRAGVNLQTLIIDEGFGSQDVIGRQNIIDVLNMIKDEFELIIVITHIDELKDSFPYSIE
ITKDENGSHIVYS
NT seq
2562 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaccaataaaactcactttaaaaaactttatgtcttattctgaacatgaagtgatg
gattttacaaggtttcatgtagcagcaatcgtaggtaaaaacggaaatggtaagtcagca
ctttgggatgctataacatggtgtatatggggaagagccagaggattggatagtgcaggc
agaggcagtgatgaccttataagaattggtgctgatgaaatggaagtagaattcatattt
aaaatcaataatactaaatatagaattttaagaaagaaaaaaaggaattcaaattccatt
ttggaatttaatattataaacgatgatggaacattaaaatcattaactcaagaaaaattg
gaagacacaaaaaacaagattgaaaaaaccattatgctggattatgacacttttgtagca
tcgtcatttatgccacaaaataaatacggtttcttttcagaggctgatcctactaaaaga
aaagaaatattttcagaagtattgggcttagatatctatgacaaattacaagaaaagtcg
aaattaaagcgaaatgaatatgaaaaaaaagttaatataatagatgaacaattaaaattg
tatatgaatgaaataaaagataaaaatgaattaatcaatcaaaaggaagaattatctaaa
aagtgcaatgaaaaaaaatctgaaattgataagttaaacaatgaaatgaacatattgcaa
gaaaaaaagcgaaacatggacgatactataataaagtacaatgaatacatcgagagaatt
aaaatggatgaaaaagtcatttcagaatataaatttatgctgagtgaccttaaaaataaa
ataaatgaaatcaacaaacttataaaaaatgaagattctattattgaaggttacaatact
tttaagtcattgcaagatcaattaaaagagctagataataaatatatgcaatttaatgtt
cttgaaaaagataaaatgaaaataaaaaacgatattagtttattgaaaaaagaaaccgaa
ttagagcttaagaatttgcaatttaaatacaatgaaagcttagaaaaatataaagatatt
gaaaataatactaaagaagtagaaactctggaaaaagagctagaaaagctcagcaattta
caagatgaaataatgaataatgaagatgaaatccaaaagtgcactcaaaaaatagccgaa
cttaaagcttcatttaaaggctgcaacgatagaattaatgaacttaaagaaaattataat
acgatattaaaaacagatgctaaatgtcctttgtgtaattcgcctcttgatcaagataag
aaaagtagtttgctaggcgattttaaagaaaaaattaatgggtataaaaaagaaatatct
atactcaaagataaaattttaaaagaacaaaataatttagaagttttaagagaagagcga
gaaaatctatcgattttacaacaaaagcgtgaaagattagttgctaatataaacacatta
aaaaataatctatcagacaaagaaaatcttttaaaccagttaaatgaattaaaaagaaaa
atagaagatatatcagatcgtttaaatagcaatagatatgcagttaaagaaatagaaaag
ttggcttcaattgaaaataagttaaaagagttgaatttttcagtggaattttatgaagac
ataaaagttaaatatgaaaaatatagagattatgaaaagaaatatgaaaggctaaatatc
tcaaaacaaaatattgttgattatcaaaacacatacagcaattataaaaaaacgatagac
atgtacactgaaaacttaaaaaaagacaaagaagctttggagtattttaaatctcaatgc
agcggatacgatgtattaataaatgatattaaatctctaaaacaaaaattagatatttca
aataatgaatttctaaacttgaatgcaaatttagcatcaatttctgacagaataagcagg
atcaaatatttagaaacgaaaattgatgacttaaataaagaaaaagataattatttgact
gaaatacattattatgagatattagaaaggtcctttagcaagaaaggcatacaagcactt
ataatcgagaatgctctgccagaatttgaagatacagcaaataattttctttctaaactt
tcagatgggaaaatgtatgtaagtttattaactcaaaagactaataaaagtggttcggta
caggaaacccttgatatagagatctctgatgaacttggcaaaagaaaatatgaactattc
agtggaggtgaagccttcaggattaactttgcattgagaattgcactatcaaaattttta
tcaaaaagagcaggagttaatttacaaacattaataatagatgaaggttttgggtcacaa
gatgtaatagggcgtcaaaatattattgatgtcttaaatatgataaaagatgaatttgaa
ttaataattgttataacgcatatagatgaacttaaagatagttttccatactcgatagaa
ataacaaaagatgaaaatggttcacacatagtatattcttaa
DBGET
integrated database retrieval system