Tenuifilum thalassicum: FHG85_06155
Help
Entry
FHG85_06155 CDS
T06728
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
ttz
Tenuifilum thalassicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Por_Secre_tail
Big_7
AMPK1_CBM
Pur_ac_phosph_N
DUF220
Malt_amylase_C
DUF4397
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKG79860
UniProt:
A0A7D4BBA1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1474404..1477226)
Genome browser
AA seq
940 aa
AA seq
DB search
MRPFFKFNTMKKFLFFTVLFTISYFIHSQPITVSPTLPTDADEVTITFDATKASRTDLVG
YTGDLYAHTGVKVEGNTSWQYVIGSWGNNTTQPKLSRTGTNTYQLVISPSIREFYSVPTD
KKITQMCFVFRSADGSKQTEDVFYDVYEQGLSVSITNPTQNNPIYEINDIIDIQASANNA
TSVSLFIDNQLVENVTSQTVTHSYTAAEYGKHWIKVLATDGTSTVKDSVYILVRSNVNVA
ELPQGAHPGVNIIDENTATIVLYDPPALKSYVYLIGNFSNWLPDDPYYMNRTPDGKYYWI
TLTDLNPNTEYAFQFLIDGYLRIADPFTNKTLDPNDVYIPSSTYPNLMSYPTGKTSGIIS
VFSTNQEQYTWQVTDFTPPSKQNLIIYELHIRDFVGDSYIQTVRDSLSYLKKLGINAVEL
MPINEFEGNDSWGYNPSFYFAPDKAYGTPNDYKAFIDEAHSMGMAVIIDMVLNHSFGQSP
LVQMYSNSDGTSLGEPTADNPWYNTTCPHPPYCWGYDFNHESVETQKFVDSVLTYWLTEY
KVDGFRFDFTKGFTNNQNANEGSAYDASRIAILERIADKIWSINPNAYVILEHFCDNTEE
KTLAEYRSSEGKGMLIWGNMNYSYNEATMGWISSSDFSWIAAKQRGWHVPHVVGYMESHD
EERLMYKNITYGNSSNPEHDVKSLPIALKRMETAANLFIPFPGPKMIWQFGELGYDISID
YNGRVGKKPIHWEYYQNDDRREVFNTFAHLNRLKQQYDAFKTDNYDYSTTGSIKWLKLNG
SDMDVVIAGNFDVTSKSTTITFNNTGWWYEYFSGDSIELSTTSYNLTLNPAEYRIFTSKR
INKNDIFVGINQPKTSSDLSIWPNPAADELFISYNQPQLGIATFKIYSLTGQLVYSFQKQ
NFSGSNIVNIMLPSNLPSGVYLLNLTSNGINRTEKIIIRK
NT seq
2823 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgccctttttttaaatttaacactatgaaaaagtttttattttttacggttttattt
acaatttcgtattttatccactcccaaccaataaccgtttcccccactctcccaaccgat
gccgatgaggttaccattacatttgatgcaacaaaggcatcgagaactgatttggttgga
tatacaggcgatttatatgctcatacgggagtaaaggttgaaggaaacaccagttggcaa
tatgttattggtagttggggaaacaataccactcaaccaaaactttcccgaacaggtaca
aacacctaccagctagttatctctcctagtataagggagttttacagcgttcctactgat
aaaaagataacccagatgtgttttgtgtttcgaagcgccgatggctcaaaacagaccgag
gatgtcttttacgatgtttacgagcaaggtctttcggttagtattactaaccctacccaa
aacaatcctatttatgagattaacgatataattgatattcaagctagtgcaaacaatgct
acctccgtttctctttttattgataatcagctagtggaaaatgtcactagccaaactgta
acacattcttatacagcagcggaatacggtaagcactggatcaaagttctagcaactgat
ggaacaagtacagtcaaggactcggtttacattctagtcagaagcaatgtaaacgttgct
gaactcccccaaggtgcccatcctggtgtaaatattattgacgagaatactgctaccatt
gttctttacgatccccccgccttaaaaagctatgtttacctaattggtaatttctccaat
tggctacccgacgatccatactatatgaaccgtactcccgatgggaagtactattggatt
actcttacagatctcaatccaaacaccgaatacgctttccaattccttatagatggctat
ctgagaattgcagacccatttaccaataagacactagatcctaacgatgtttatataccc
tcttctacctatcctaacttgatgtcgtatccaactggtaaaacaagtggaatcatttct
gttttctcaactaatcaagaacaatacacgtggcaagttacggatttcactcccccttca
aaacaaaaccttataatttacgagcttcatatacgcgactttgtgggcgactcatacatt
caaaccgttcgcgattctttaagctacttaaaaaaacttggcatcaatgctgttgagcta
atgcctataaatgagtttgaaggtaacgatagctggggctataacccgtcgttctacttt
gcacccgataaagcatatggtaccccaaacgactacaaggcgtttattgatgaagcacat
agcatgggaatggcagtaataatagatatggttttaaaccattcgtttggtcaatcgcct
ttagtacaaatgtactcgaattccgatggtacatcgcttggcgaacctactgccgataat
ccatggtacaatacaacttgccctcacccaccctattgctggggctacgattttaaccac
gaaagcgtggaaacccaaaaatttgtcgattctgttcttacttattggcttacagagtat
aaagttgatggttttcgtttcgattttaccaaaggctttacaaataatcaaaatgctaac
gagggttcagcctacgatgcttctcgtattgcaattctagaacgtatagctgataagatt
tggtctatcaaccctaatgcttatgtcattcttgagcatttctgcgataataccgaagag
aaaaccttagcagagtatcgcagcagcgagggtaaaggtatgcttatttggggtaacatg
aactactcctacaacgaggcaaccatgggttggatctcttcatctgacttctcgtggatt
gcagccaagcaacgtggttggcatgtacctcatgttgtgggctatatggaaagccacgat
gaggagcgattgatgtacaaaaatatcacctatggaaactcatcaaaccctgagcatgat
gtaaagtcactacccattgctctgaaaagaatggagactgccgccaacctattcattcca
ttccctggcccaaaaatgatttggcaatttggtgaacttggctacgatataagcattgat
tacaacggtagagttggcaaaaaacctatccattgggaatactaccaaaacgatgacaga
agagaggtattcaacacttttgcccatctgaataggctaaagcagcagtacgatgctttt
aaaacagataactacgactattctaccactggatcgataaaatggcttaagctgaatggt
agtgacatggatgttgtgattgcaggcaactttgacgttacaagcaaaagcaccactata
acctttaacaacacaggctggtggtacgaatattttagcggcgactctatcgagttaagc
acaactagctacaaccttacccttaatccagctgaatacaggatttttacctcaaaaagg
attaacaaaaacgacatcttcgttggaattaatcaacctaaaacatcatccgatctgtca
atttggccaaaccctgcagctgatgaattattcatctcatacaaccagccacaattggga
attgctacctttaaaatatacagcttaacaggtcaacttgtttactcattccaaaaacag
aatttctcgggtagtaatatcgttaacattatgctacccagcaatttaccaagtggtgtt
tatcttttaaatcttacctcaaatggcataaacagaactgaaaaaataattattcgaaaa
tag
DBGET
integrated database retrieval system
