Tenuifilum thalassicum: FHG85_09780 Help Entry FHG85_09780       CDS       T06728                                  Name (GenBank) tandem-95 repeat protein Organism ttz  Tenuifilum thalassicum Brite Cell adhesion molecules [BR:ttz04515]  Cadherins   Cadherin related    FHG85_09780 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Cadherin Cadherin_4 Big_9 Cadherin_5 CHU_C FG-GAP_3 FG-GAP Cadherin_CELSR2_9th CLSTN_C N_BRCA1_IG PKD Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  QKG80546 UniProt:  A0A7D4CHI7 LinkDB All DBs Position 2353736..2362615 Genome browser AA seq 2959 aa AA seqDB search MSVKKLIIRFLAIVQVFVLSYGFATAQEVCNDGKDNDGDGLIDCYDSDCRGNSQCSYFFY NLPIPECSAKPPVFYTWSLQEKFNTNEANGGTLSGTPPFPIDQRCAVFVGDLDSDGVPEL VGKDGGTDGKVQVFSGINGKHIADFAVTSHAFTQVALGDVDNDGNGDIFLVDNSANLVRL EFNPTTKSLELPSEFTQNSVTSNQQSPQLADFNQDGIPEVYVGNKIYNAITGDLLASGTG NMGKHSQNDSWPIAYNVFNESDLDPDGVGAFGPEANGLELIAGNQIYLVDATNYSTTGTF SLILAAEFPAGNIVTSSGATISSADGYTSLGDLNGDKHADVIVTTNGDDGYSYIYAYDPM ELKQIGVAYQFPNKNSKSGRCNVADFDGDGELEIATAGQNEYVVLETDLTLKWRKNGLDD GSAQTGSTVFDFEGDGSAEVVYSDEEYLYVWSGADGRELARVTSRSGTRTDYPLVADADN DGQAEIIVTAQYGNGPSPYSDGLGWISVYRSADAPWVPARKTWNQHGYFVTNINDDLSIP VEQQDFISPWFHDDFNTAFNQFLVQTTYLTFEGQPTFATGDITTENVEFDLSQCPIDGTV KFTLTFENHGSWKIPRYTPIAFYDGDPYQPGAVYLDSMLIPVNIEPGETYTLSGEVKDPN NDGKMNLYVLVNHSHFRVDGTPLNLPLQAGTINSPTLECDYDNNLGFIVRINNCVAISNP EVDLDRNNSSGVSGNDYQIGFAVGETTTYKVTDEDVFIRDADSPNSLKRAVVTLTNPLDP EETLGITTTGQNYADQYGITVNITPTKVTLTSLGKSLLEYERVLKNITYSNTNTSPNMTN RVITVEVSDEYLSNDPLAQTTVIYTNRPNIDLDKDNSSGATGNDFKTTYTEGDGKITFVD SDAEITDADGTTISEAIITLTNKIDGTFEDIEVPFSLPSGILRDFSILTPGKIRFYGDAS FADYMTAISSLTYRNYSEDPTPGDRTIEITVNDGKIDSKIATSTITVVPVNDNPAISGSN EAAVYTSGNLQVLPLPEITDLDDDHLKMATISITTGFVPGGEDVLSFTPEFGITGTYDNS TGILTLSGDATIDNYRTVIGSVEFSSTLATSNANRAVAVKVVDPNNGESNVFHRTIILIN TTGNDAPYAANDDYSVFKSNTLTKAAPGVMENDLDPDSNPINVSPTVSATGSLNGTLVVN ADGSFNYDPDETNPAISVLNYGESVSETFTYTITDGTVSSNTATITFVIKGENNNPVAVA DSYSVDQDANLIQSAPGLLGNDSDPDGITGVEVKMVNSSYSSVIRSAYGTLTWYGDGSFI YKPDNSNPSVQALKVGQSLTDNFTYTIEDPHHGQGSSTLAINIQGTNDPPYIYAGKLDEV VEKNTNLTFNDVNANKIYITDNDNDDQNVTITVTNGTFTLATTAGLTSVTGDGTANVSFT GGLANVNSALDGATFTPTNNFTGNASVVIDTWDQQAGTPAETRDNETINILVTDPNNAPV VTLPTSHSINEDQTITYTSAELNISDANGDDQTVTIYVSNGVFNLSQTTGLNGLVGNGTS NLTFSGALTDINNALNGATFTPILNFSGSAKVQVYTNDGKGGSDVKSDNITVIDVDEAPV ANDDYKTIDEDNQVTLYVLSNDEDKDGNGISIISHTNPSHGTLVDNLDGTFTYTPDANYN GSDSFTYTIQDGDATNPDSDVATVTITINAVNDSPSISNGSKTIDENTSNGTSVYNVNDD NTNSDTDVDGDAISYSITAGNGSGAFAIDASTGNITVADATKLDFETTTIFNLTVQASDG TLTDNATITINLNDVNEAPAISDASVSIDENSPNGTSVFNVNDDSSGNDTDIDGNAITYS ITAGNGSGAFAINPSTGEITVADATKLDFETTSIFNLTVQASDGTLTDNATITINLNDVN EAPAISDASVSIDENSPNGTSVFNVNDDSSGNDTDIDGNAISYSITAGNGSGAFAINPST GEITVADATKLDFETTSIFNLTVQASDGTLTDNATITINLNDVNEAPAISDASVSIDENS PNGTSVFNVNDDRSGNDTDIDGDAISYSITAGDGSGAFAINPSTGEITVADATKLDFETT STFNLTVQASDGTLTDNATITINLNDVNEAPAISDASVSIDENSPNGTSVFNVNDDSSGN DTDIDGDAITYSITAGNGSNAFAINSSTGEITVNDATKLDFETTTSFSLTVQASDGTLTD AATITINLNGINEAPSISNASTTIDENTSNGTSVYNVNDDNTNSDTDVDGDAISYSITAG NGSGAFAIDASTGNITVADATKLDYETTTSFSLTVEASDGTLTDVATITINLNGINEAPS ISNGSTTIDENTSNGTLVYNVNDDNTNSDTDVDGDAISYSITAGNGSGAFAIDASTGNIT VADATKLDYETTTSFSLTVEASDGTLTDVAIITINLNNLAEYSPVISDKTVDLPEDAPNG TSVYDVNDDNTLGDTDADGQAIAYSITGGNTDGIFDIDPNTGQITVADNTNLDYETTTSY TLTVHAVDTDGNSDDAVITVNITNVPENGPAISDHTTSIPEDAPNGTPVYNVNDDNSGID TDADGQAITYSITAGNADGIFDIDPNTGQITVADNTNLDYETTTSYALTVHAVDTDGNSD DAVITVNITNVPENGPAISDHTTSIPEDAANGTSVYDVNDDNSGSDTDADGQAITYSITA GNADGIFGIDPNTGQITVADNTNLDYETTTSYALTVHAVDTDGNADDATITVNITDVPEN GPAISDHTTSIPEDAPNGTSVYDVNDDNTLGDTDADGQAISYNIINGDMDGIFAIEPSSG LITVVDNTKLNSKATPVYYLEVRAADTDGNTDDAIITVNITEVETGLDIPEGISPGDGIH NDTFEIGGLEQFQQVSIRIYNRWGNIVYKSDNYKNDWDGTNNMRNGLGTKLPSGTYFYIL EIKDNGKKYSGYVYLKRMD NT seq 8880 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgagcgttaaaaaactaattattcgattcttagccatagtgcaggtttttgtgctttcg tatggttttgcaactgcccaggaggtatgcaacgatgggaaggataatgatggagatggg ttaatcgattgttatgatagtgattgtagaggaaattcacaatgttcatatttcttttat aacctacctatccccgagtgtagtgccaaaccaccggttttttacacatggtcgcttcag gagaagtttaatacgaacgaggcaaatggtggtacattatcgggaacaccaccattccca attgaccagcgttgtgctgttttcgtgggggatttagattctgatggagtaccggaacta gttggaaaagatggtggaaccgatgggaaagtacaagtatttagtggaataaacggtaag catattgccgattttgctgtaaccagccatgcctttactcaggttgcactaggtgatgta gataatgatgggaatggggatatttttcttgtagataactccgctaaccttgttaggcta gagtttaacccaaccaccaagtcccttgaattaccaagtgaattcacacaaaactctgtt actagcaatcagcaatcaccacagctagccgattttaatcaggatggcatacccgaggta tatgtaggtaataaaatttataatgccataactggcgaccttttagcttcaggcactggc aacatgggtaagcatagccaaaatgattcctggcccattgcctataatgtttttaatgaa agcgatttggatcctgatggagttggtgcttttggcccagaagctaatggattggagttg attgccggcaatcagatttacctggttgatgctacaaactatagcactacagggactttt agcctaattcttgcagcagaattcccagctgggaatattgtcacatcaagcggggcaacc atttccagtgccgatggttacacaagtcttggcgacctgaatggcgataagcatgccgat gtgattgttactactaatggtgatgacggctactcctacatatatgcctacgacccaatg gagctaaaacaaataggagttgcataccaattccctaataaaaatagtaaatcgggtaga tgtaatgtagccgattttgatggggatggagaattggaaattgcaactgctggacaaaac gagtatgtagtacttgaaacagacttaactcttaaatggcgtaaaaatgggcttgacgat ggttctgcccaaacaggtagtactgtctttgactttgagggcgatggttctgccgaagtg gtttatagtgacgaggagtacctttatgtttggagtggagccgatggtagagagctggca agggtaacatctcgttctgggacaagaacagactacccattggttgccgatgccgacaat gacggtcaagctgaaattattgttactgcacaatatgggaatgggccatccccctattcc gatggtttgggttggattagcgtctatcgttctgccgatgcaccgtgggttccagcacgc aagacttggaaccagcacggctattttgttaccaatattaacgatgacctctcaattcct gtggagcagcaagactttatctcgccatggtttcatgatgactttaatacggctttcaat cagtttttggttcaaacaacctacctcacctttgaagggcagccgacttttgctactggc gatatcaccaccgaaaatgttgaattcgatctttcgcaatgccctattgatggtactgtg aaatttacacttaccttcgagaaccatggttcatggaaaataccccgatatactccaatt gcattctacgatggtgacccataccaaccaggggccgtttatctcgatagcatgcttata cccgttaacattgaaccgggtgaaacatacacgctttccggcgaggtaaaagacccgaat aacgatggcaagatgaacctctatgttttggttaaccatagccattttagggttgatgga acccctctgaatctaccccttcaggctggaaccataaattcaccaaccctggaatgtgac tacgataataatcttggctttattgtaagaattaacaactgtgtggcaatatcaaatccc gaagttgatttggacagaaataacagtagcggcgtttcgggtaacgactaccagattggt tttgccgtgggagaaacaacaacctataaagttaccgatgaggatgtctttattcgtgat gccgattcacctaacagccttaagcgagctgtggtaacattaactaatccgctagacccc gaggaaactcttggaataactactactggccaaaattacgccgatcagtatggcataacg gtaaacataacgcccacaaaagttactctcacaagcctaggaaaatcacttctggaatat gagcgtgttcttaaaaacattacctatagcaataccaacacctctcctaatatgaccaat agggttattactgttgaggttagcgatgaatatttatctaacgacccgttagcacaaact acagtaatatacaccaaccgtccaaacatcgatttggataaggataatagctctggtgct acaggaaacgactttaaaacaacctataccgagggtgatggtaaaattacctttgttgat tccgatgccgaaataaccgatgccgatggaactactatttccgaagcaattatcacgtta accaacaaaatagatggtacatttgaagatatcgaagtgccattctcattaccatcagga attctgagagacttttcaatactcactccaggtaaaataagattctatggagacgcctcc tttgctgattacatgacagcaatttcttcgttaacctatagaaactatagcgaagatcca accccgggagatagaacaattgagattactgttaatgatgggaagattgactctaaaatt gcaacttcaacaattaccgttgtgcctgtaaatgacaatccagctatttcaggttcaaat gaggctgctgtgtatacttctggtaatcttcaagtacttcctcttcctgaaataacagat ctcgatgacgatcatttaaaaatggccaccatatccataactaccggttttgtgccaggt ggcgaagatgtgctttcattcacccccgaatttgggatcaccggaacctacgataattca accggcattttaactttatcaggagatgcaacaattgacaattacaggacagttattggt tctgttgaattctcttcaactcttgctactagtaatgctaatcgcgctgtggcagtaaaa gttgtcgacccaaacaatggagaaagtaacgtttttcatagaacaattattctgataaac actacaggtaacgatgctccttatgcagccaacgatgactattccgtgttcaaaagcaac acacttacaaaagccgctccaggagtaatggaaaacgaccttgatcctgatagcaaccca ataaacgtaagcccaacagttagtgcaactggctcgctgaacggtacccttgtagttaat gcggacggatcattcaactacgaccctgatgaaaccaatcctgcaatctcagtattaaac tatggagaaagcgtttcggaaactttcacctatacaattaccgatggaacagtttcatct aatactgctacaattaccttcgtgattaaaggggaaaacaacaatcctgttgcagttgcc gactcatactcagttgatcaagacgcaaacctcattcaatcagcacctggattattgggt aacgattccgatcctgacgggattactggtgttgaggttaaaatggtaaatagttcatac tcttctgtgataaggagtgcttatggaacactcacatggtatggcgatggtagttttatt tataaacccgacaactcaaatccatctgttcaagccctaaaagttggtcaaagtttaacc gacaatttcacttataccatcgaagatccacaccatgggcaaggatcttctacattagca ataaacattcaaggcacaaacgaccctccatacatttatgcaggtaaacttgatgaggtt gtagaaaagaataccaaccttacttttaacgatgttaatgccaacaagatatatataacc gataacgataacgatgaccagaatgtaaccattacagttaccaacggtacattcacgctt gctaccactgctggtttaacatcggttactggtgacggaacagccaatgtttcatttact ggtggtttagccaatgtaaacagtgcccttgatggtgcaacatttacaccaaccaacaat tttacaggtaacgcatcggttgtaattgatacttgggatcaacaagctggaaccccggct gaaactcgcgacaatgaaaccattaacatccttgtaaccgatccgaataatgctccggtt gtaacattaccaacatcgcattcaattaacgaagaccaaacgattacttacacatctgca gaactcaatatttctgatgccaatggtgatgaccaaactgtaactatttacgtttctaat ggtgtgtttaacctttcccaaaccactggtttaaatggattagtggggaatggtacaagt aacttgaccttctctggcgctcttacagatattaataacgctttgaacggtgcaacattt acaccaatcttaaatttcagcggttcagctaaagttcaagtttatacaaacgatggcaaa ggaggtagcgatgtaaagtccgacaacataactgtaattgatgtggatgaagcccctgtt gctaatgacgattataaaacaatcgacgaagacaaccaagttaccctatatgtcctttca aacgatgaggacaaggatgggaatgggatttcaataatctctcacaccaatcctagccat ggtactttggtcgacaatctggatggaacctttacttatactccagatgcaaattacaac ggaagcgatagtttcacctatacaattcaggatggtgatgctaccaatccggattctgat gtcgctactgtaaccataactatcaatgcagttaacgactcaccctccatctcaaacggt agcaaaaccatcgacgagaacacatccaacgggacatcagtgtataatgtaaacgacgac aacacgaacagcgacacagatgtggatggcgatgccatctcttacagcataactgcaggt aacggaagcggagcgtttgcaatagacgcatcgactggcaatattacggttgctgacgcc accaagctggacttcgagacaaccaccatattcaacctcaccgttcaggcttccgatggt acactcaccgacaatgcaacgattaccatcaaccttaacgatgtcaacgaggctcctgca atctccgatgctagcgtgagcatcgacgagaactcgcccaacggaacttcggtgtttaac gtgaatgatgacagttccggtaatgataccgatattgatggcaatgccatcacctacagc attacggctggtaacggaagcggtgcgtttgctataaacccatctaccggagagattacc gttgctgatgcaaccaagctcgacttcgagacaaccagcatattcaacctcaccgttcag gcttccgatggtacactcaccgacaatgcaacgattaccatcaaccttaacgatgtcaac gaggctcctgcaatctccgatgctagcgtgagcatcgacgagaactcgcccaacggaact tcggtgtttaacgtgaatgatgacagttccggtaatgataccgatattgatggcaatgcc atctcctacagcattacggctggtaacggaagcggtgcgtttgctataaacccatctacc ggagagattaccgttgctgatgcaaccaagctcgacttcgagacaaccagcatattcaac ctcaccgttcaggcttccgatggtacactcaccgacaatgcaacgattaccatcaacctt aacgatgtcaacgaggctcctgcaatctccgatgctagcgtgagcatcgacgagaactcg cccaacggaacttcggtgtttaacgtgaatgatgacagatccggtaacgataccgatatt gatggcgatgccatctcctacagcattacggctggtgacggtagcggtgcgtttgcaata aacccatctaccggagagattaccgttgctgatgcaaccaagctcgacttcgagacaact agcaccttcaacctcaccgttcaggcttcagatggtacccttacagacaatgcaacgatt accatcaaccttaacgatgtcaacgaggctcctgcaatctccgatgctagcgtgagcatc gacgagaactcgcccaacggaacttcggtgtttaacgtgaatgatgacagctccggtaac gataccgatattgatggcgatgccatcacctacagcattacggctggtaacggtagcaat gcttttgcaataaactcttcaaccggagagattacggttaatgacgccaccaagctggac ttcgagaccacaacctctttcagcctgaccgttcaggctagcgatggaaccctaaccgat gctgccaccatcaccatcaaccttaatggtattaacgaggccccctccatctcaaacgct agcacaaccatcgacgagaacacatccaacgggacatcagtgtataatgtaaacgacgac aacacgaacagcgacacagatgtggatggcgatgccatatcttacagcataactgcaggt aacggaagcggagcgtttgcaatagacgcatcgactggcaatattacggttgccgacgcc accaagctggactacgagaccaccacctctttcagcctgaccgttgaggctagcgatgga accctaaccgatgttgccaccatcaccatcaaccttaatggtattaacgaggccccctcc atctcaaacggtagcacaaccatcgatgagaacacatccaacgggaccttagtgtataat gtaaacgacgacaacacgaacagcgacacagatgtggatggcgatgctatctcttacagc ataactgcaggtaacggaagcggagcgtttgcaatagacgcatcgactggcaatattacg gttgctgacgccaccaagctggactacgagaccaccacctctttcagcctgaccgttgag gctagcgatggcaccctaaccgatgttgcaattattacgataaatttgaacaacttagcc gaatattctccagtaatttcagataaaactgttgatttaccagaggatgcccccaacggc acatcagtttacgatgtaaatgacgacaataccctaggcgacaccgacgccgacggccag gcaatagcctacagcatcaccggaggtaacaccgacggcatatttgacatcgacccaaat accggacagataaccgttgccgacaacaccaacctcgactacgagacaaccacctcatac accctgaccgttcatgccgtggataccgatggaaactcggatgatgctgttatcaccgtc aacatcaccaacgtgcccgagaatggccccgccatctccgaccacacaaccagcatcccc gaggatgcacccaacggcacaccggtttacaacgtgaacgacgacaattcgggcatcgat accgacgccgacggccaggcaataacctacagcatcaccgcgggtaacgccgacggcata tttgacatcgacccaaataccggacagataaccgtggccgacaacaccaacctcgactac gagaccaccacctcatacgcccttaccgttcatgccgtggatactgatggaaactcggat gacgctgttatcaccgtcaacatcaccaacgtgcctgagaatggccccgccatctccgac cacacaaccagcatcccagaggatgccgcaaatggcacatcggtttacgatgtgaacgac gataactcgggtagcgataccgacgccgatggtcaggctatcacctacagcataactgcg ggtaacgccgacggaatctttggcatcgacccaaataccggacagataaccgttgccgac aacaccaacctcgactacgagacaaccacatcgtacgcccttaccgttcacgcagtggat accgatggcaacgccgacgatgcaaccattaccgtgaacattaccgatgttcccgaaaat ggccctgccatctccgaccacacaaccagcatccccgaggatgcacccaacggcacatca gtttacgatgtgaacgacgataataccctaggcgacaccgatgctgacggccaggcaatt agctacaacatcataaatggtgatatggatggtatttttgccatagaaccatccagcggt ttaataactgtagttgataatactaaactaaattcaaaggcaacacctgtttattatctg gaagttagagctgctgataccgatggtaatactgacgatgcgataataaccgttaatatt actgaagttgagacaggtttagatattcccgaaggaatctcacccggtgatggtattcat aacgacacctttgaaattggcggtcttgagcaatttcaacaggtttccataagaatttat aaccgttggggcaatatcgtttacaaatcagacaactataagaacgattgggatggaacc aacaatatgagaaatggattaggaacaaaattaccttcgggaacctatttctacatcctt gaaataaaagataatggcaagaagtatagtggttatgtatacttaaaacgtatggattaa

DBGET integrated database retrieval system