Tenuifilum thalassicum: FHG85_12190
Help
Entry
FHG85_12190 CDS
T06728
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
ttz
Tenuifilum thalassicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5018
Big_5
LTD
DUF5018-rel
Por_Secre_tail
Kre9_KNH
Big_12
DUF6383
PEGA
DUF1410
CopC
ThiS
phage_tail_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKG80989
UniProt:
A0A7D3Y5Y4
LinkDB
All DBs
Position
complement(2952313..2957088)
Genome browser
AA seq
1591 aa
AA seq
DB search
MPMKTRNLLKTLALTVILLIAGKVGWGQGSEDFTNFPETSSSYVDGTFTGLDGSTWTYVQ
CRGDNAIAAPTPMLGRNRTPAAEVTSGIISGGIGTLTFDYKQAFSTNVNLEVYVNGNLIT
TVTTSSEQDVLKSSGTINVNVPGDFTLSFKQPSGSGQVCIDNIVWTGYADTQAPQATFDP
ADGATNVAVDANITITFDEPIRNIDNSEITDANVASLLTLKETDASGADVLFTATIDAGK
QVITITPSSNLANNQDYYVAIAPVEDASDNPTSLLSSTFTTIDATAPTIKLTYPNGGETF
HAGDVVTITWTSANMDAENIKIEVYARDGQTPTWNWVEVIASTANDGTEDYTIPADASYG
TQYKVRVTGLTSSTADESDATFTVISTPTINMIQSDNTAGASNYSDDIVKFSGIVTAVSS
SNFFVQDGSGAWNGIYVKSSPTTVSVGDLVEVEGTVAESYDLTVISPVSSVNITSSGNAL
PDPVTLTIPEANNEQYESVLVKLSNVECSNADAGYGEYTLSDGTNEINADDLFFAYTPTL
GKKYDITGILNYSFGAFKVEPRDASDIHEYSSDATLSAFTLGGQDAMVLANVSVADPVND
AGATMYVANFTGFAGIVATTTNTNATFTVTLNGAVVDPANYATQALADGDVVVVTVTAED
GTMGYYKVTLTGENRSLTVTAPTGGETYNTGEVATISWTSANITNVNIYAEDAVTSELYP
IAANVDATLGTFDYTIQNGDHGTVYIRVADAADENFFAKSAGTVTVTDNVAPSITDRYPA
VDATDVPVSFTLTITFDEDVQDGTNGALEIRKTSDNSVVLSKSFADLTHQDNNLTLNVSG
LEYSTSYYVTIPAGFVVDMSTANGNAEVAANAWTFTTMAQPPMDLFFSEYIEGGSVSKAL
EIYNPTDNDIALSNYLLKGTANTSSDWEYDYPFPAGAVVPAHGTYVIVDDASDASLLALA
DWVSTGYECAFNGNDARGLFKFNGTNYDLIDVIGDPNNPGSANYSVAGIADATADHTLVR
KSNIVIGNPDWTASAGTDAASSEWEVYGVDEFSYLGWHIAKSSAKDIVGFELAEQTGPAT
IDNASHTVNIEVAYGTDVTSLTPTITVSKYATVSPASGVAQNFTNPVTYTVTAQDGTTQD
WVVTVTVAATQSSANDIVTFEIPGQISATIDANAATVDVLMPFGTDVTSLTPTITVSAAA
TISPASGVSQDFTNPVTYTVTAQDGSTKVWTVTVTVQQLSLTSIYDIQYTSDSNGDSPLV
GQQVKTKGCVTAIYEGSSSYNIWIQDSSKAWNGVEVYGIDNALGLVSLGDTVEVVGDVEE
NYNLTRLTNVTYINVKNSGNTISPLEVSIADALTEAYEGVFIKLSNVECTNADAGYGMFE
VSDGTNSILIDDDLYKYTATQGTRYNIVGLGHYSYSARKVLPRSASDVEVAETKYTVTFT
VTDGTNAVEGATITVTGQGDLTTDASGQATMQLPNGDYTFIVLKDGFNTYNGSFTVADAD
KAVEVTLVPTGVPVNTLAKLTVYPNPFTSRINFEGAEVTRVTVTSVIGQVVLDQIVENAR
SIDLSNIEKGIYLVRFYNNKGESVLRKLIKE
NT seq
4776 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctatgaaaacaagaaatctactcaaaacattagccctaacagtcatcctgctcatt
gcaggtaaagtcgggtgggggcaaggaagcgaagattttacaaatttcccagagactagt
tctagttacgtagatgggacttttacaggactggatggctctacctggacatatgtgcaa
tgtagaggggataacgctatagctgcaccaactcctatgttaggaagaaacagaacccct
gctgcagaagtgacgtcaggtataatttctggtggtattgggactttaacgtttgattat
aaacaagccttctctaccaatgttaatctagaagtatatgtaaacggtaacttaattaca
actgtaactacatcctcagagcaggatgttttgaaaagttctggaacaattaatgtaaat
gttcctggagattttactttatcttttaagcagccatctggatctggtcaggtatgtata
gataatatagtttggacaggatacgctgacacccaagccccacaggccacctttgaccct
gccgatggtgcaactaatgtagctgttgatgctaacataacaattacatttgatgagcct
atacgtaatattgataactctgaaattaccgatgctaatgtggcaagcctgcttacctta
aaggaaacagatgcttctggtgcagatgttctatttactgctactattgacgctggaaag
caggtaattaccattacccccagctcaaatctagctaataatcaggattactatgttgca
attgctccagtagaggatgcgtccgataacccaacttcacttttatcctctactttcaca
actattgatgctactgctcctacaattaaattaacctatcccaacggtggcgaaacattc
catgctggcgatgttgtaaccattacttggacctcagccaatatggatgctgaaaatatt
aagattgaagtttatgcaagagatggccaaacaccaacatggaactgggttgaagttatt
gctagcactgctaatgatggtacagaagattataccatacctgcagacgcttcatatggc
actcaatataaagtaagagttactggattgaccagcagtacagccgatgaaagtgatgca
accttcactgtaatttcaaccccaactattaatatgattcaatcggataacactgctggt
gcatctaattatagcgacgatattgttaagttttcaggtattgttactgctgttagttcg
tcaaacttcttcgtacaggatggttctggtgcttggaatggtatttatgttaagagtagc
ccaacaactgtatctgtaggcgacctggttgaagttgagggaactgtagctgaaagttat
gatctaaccgtgatatcccctgtttcatctgtaaatattacatcttcaggcaatgcttta
ccagacccagttacacttacaataccagaagcaaataacgaacagtatgaaagtgttttg
gttaagctgtccaacgtggagtgctcgaatgctgatgctggttatggtgagtacacctta
agtgatggaacgaatgaaattaatgccgatgaccttttctttgcatacaccccaactctt
ggaaagaaatatgatataactggcatactaaattattcttttggtgcatttaaggttgag
cctcgtgacgcttccgatatccacgagtacagctccgatgccacactttcagcctttacc
cttggtggtcaggatgctatggtgctagctaacgtgagcgttgccgaccctgttaatgat
gccggtgcaacaatgtacgttgccaactttaccggttttgccggtattgttgctactaca
accaataccaatgctacatttacggtcaccctgaatggagctgttgttgaccccgcaaac
tacgcaacccaagcattagccgatggtgatgtggtggttgttacagttactgccgaggat
ggtaccatgggatactacaaggtaactctgacaggtgagaaccgctcactaaccgtaact
gctccaactggtggcgaaacctacaatactggtgaagtggcaacaatttcatggacctca
gcaaatatcaccaatgtaaacatttatgctgaggatgccgtaacatccgagctctatccc
atagcagctaatgttgatgccacccttggtacattcgattatacaattcaaaatggcgat
cacggtactgtttacatccgcgttgcagatgcagctgatgagaacttctttgcaaagagc
gcaggaacggttaccgttaccgataatgttgccccaagcattaccgataggtatcctgcc
gtagatgccaccgatgtacctgtaagctttacactaaccattaccttcgacgaggatgtt
caggatggaaccaacggtgcgctcgaaatccgtaagaccagcgataacagcgttgttctc
tctaaatcttttgccgacctaacacatcaagataacaacctaacccttaatgtttcgggt
ctggagtactccacctcttactatgtaaccattcctgctggctttgttgttgatatgagc
actgcaaacggcaatgcagaggttgctgcaaatgcatggacatttacaaccatggcacaa
ccaccaatggacctattctttagtgaatacattgaaggtggaagtgttagtaaagctctt
gagatttacaacccaacagataatgatattgcccttagcaattacctattaaaaggtact
gctaatacctcatcagattgggagtatgattatccattccctgctggcgctgttgttcca
gcccatggtacctatgttattgttgatgacgcatctgatgcttcgttgcttgctttagct
gattgggtatcaactggatatgaatgtgcatttaatggtaatgatgctcgcgggttattt
aagtttaatggaaccaattatgatctaattgatgtaattggtgatcctaataatcctgga
agtgccaattattctgttgctggcattgctgatgcaactgctgatcacaccctagttcgt
aagagcaatatagtaattggaaaccccgattggactgcttccgctggtaccgatgctgct
agctctgaatgggaggtttatggtgtggatgaattttcttacctgggttggcatatagct
aagagctctgcaaaggatattgtaggctttgagctggctgagcagactggaccagctact
attgataatgctagccataccgttaatattgaagttgcttatggtacagatgttacaagt
cttactcctactattactgtatcaaaatatgcaacagtaagcccagcaagtggagtagcg
caaaacttcactaatcctgtaacatatacagttacagcacaggatggaacaactcaggat
tgggtggtaacagttaccgtagctgctactcaaagttcagcaaatgatattgtaacattt
gaaattcctggacagatctctgctaccattgacgccaatgcagccactgttgatgtattg
atgccatttggaacagatgttaccagcttaactccaaccattacagtttctgcagcagct
acaataagcccagctagtggggtatcccaagactttaccaatcctgttacctataccgtt
accgctcaggatggctcaaccaaggtttggactgttactgttacggtgcagcagttatcg
ctcacaagcatttatgatatccagtatacctcagattcaaatggagactcacctcttgtt
ggtcagcaggtaaaaactaagggctgtgtaactgcgatttatgagggttcttcatcgtac
aatatttggattcaggattcatcaaaggcatggaatggtgttgaggtgtatggcattgat
aatgctctaggccttgtttcgcttggcgataccgtagaggttgttggcgatgtggaagaa
aactataatctgacacgtctaactaacgttacctacattaacgttaaaaactcaggtaac
actatttcacctcttgaggtatcaatagcagatgcgctaaccgaagcttatgagggtgta
tttattaagctaagcaatgttgagtgtacaaatgccgatgcaggctatggaatgtttgag
gtaagcgatggaaccaattcaatcctaattgacgatgatttatacaaatataccgctact
caaggtacacgttataacattgttggtttaggacactacagctatagcgcacgaaaggtg
ttaccacgttctgccagtgatgttgaggttgcagaaaccaagtacactgttactttcacc
gttaccgatggcacaaatgcagtagaaggtgctactattacagtaacaggacaaggcgac
ctaacaacagatgctagcggtcaagctaccatgcagctgccaaatggcgactataccttc
atcgttctaaaagatggatttaacacctacaatggttcattcaccgttgccgatgccgat
aaagctgtagaggttacacttgttccaactggtgtgccagttaatacccttgccaagcta
accgtttatcctaacccatttacttcccgtatcaactttgagggtgcagaagttacccgt
gtaactgttacctcagtaattggacaggttgttctggatcagattgttgaaaatgcaagg
tcaattgacctaagcaacattgaaaaaggtatctaccttgttcgtttctacaataataaa
ggtgaatctgttctccgtaagttgatcaaggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system