Thiothrix unzii: J9260_17290
Help
Entry
J9260_17290 CDS
T07174
Name
(GenBank) choice-of-anchor L domain-containing protein
Organism
tun
Thiothrix unzii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Big_9
DUF11
Cadherin_4
HAP2-GCS1
K319L-like_PKD
TSP3_bac
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTR53433
UniProt:
A0A975IHA7
LinkDB
All DBs
Position
3466241..3469897
Genome browser
AA seq
1218 aa
AA seq
DB search
MKIKTIRAGTLVWSVLTAVLAGLSSTASAGLSFNPNVTPAQMAAVLDGPGLSIQNAQITR
GAGEQYGVLGGAKALLGFESGIFLTTGRVASLQPPNNTGSYSYDTPQALYRDADLLAISP
YAKYDPVAFEFDIVPQGDRANFVFSFGSEEYPEFVCSQYNDAFGLFITGPGISGTRNAAF
LPNTQTPIAVNNVNGGAAGSQADGAACQLSNTGYFIDNGNGTGSSASQLDGFTKTLTTAI
TGLQAGQVYHVKLAMADARDSGYDSGAAFKWLTSTNSTPVDLALTASTNRPNPSYNSTVE
LTWTVSNSSATAASLTQVGLEWPAGLTWLSDNAGGAYNPATGEWQAGDIPAGGSKSITIR
AQVATAAQYAIVGEILYAFNEDPDSTPFNRHINANEDDTATVLLSPVENNAPTMPATATA
TAAENQYAVTPAVQAVDPDGDVLSYSISGGADAGRFLVNSSTGVLTFIAAPDYEKPVDAD
KNNSYVVQVTVSDGKLSATQTLTITVGNVNEAPTLPATTIFPVLENQTIAATVSGTDVDG
NVLNYSISGGADAAKFAVNASTGGLMFIAAPDYEKPADADKNNSYVVQVTVSDGKLSATQ
TLTITVGNVNEKPTLPASATVSVLENQTVVTPAVQAVDPDGEALSYSISGGADAGKFVVN
ASTGVLTFIAAPDYENPADADKNNSYVVQVTVSDGKLMATQTVTVNVTNDTTENALPVIL
PGNNAATHTQNYVENSTNLLVLDYDATDADGDTEGSGLTWLLTGGDDKWAFTIHPTEGWL
EFTGAPDFERPLDADKKNTYEVQVTVCDSKGGCASQKLTVALTNVAEDSDGDGIPDALEI
QEGIADPYTDGKDTDGDKVPDYLDNDDDGDGLLTQYEVADPNTDGDLADARDTDGDKIPD
YLDADDDGDGKPTATEKADLNGDKNPADAVDSDDDGIPNYLDNNDEPSVHLSVRAYLQGA
YNTQTGLMTDKLLTKGFLPKPQPFDKLVTSFGYTVFEGVPPFNHFGKEVMSDSVKAMPAG
NTPVDWMLLELRDVDDPVKRVAAKATLLQRDGDVINAETGSTNIVFRGVPPGDYYVVLRH
RNHIGVMTATRLSLTETATVIDFTQPSYAVYGNNQRYLAGDKAFLWAGDANNSNSVVGSG
PGSDANIMLGSLLISPDNTLVTTHFKMAGYYATDLNLDGLTVFSGPGNDLNLLFGNIMVH
PLNDNSNANFVIYGAVPR
NT seq
3657 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaagacaatccgtgcaggaacgttggtttggtctgtccttaccgccgtactt
gcaggcttgagcagtaccgctagtgctggactcagtttcaatccgaacgttacacccgcc
cagatggctgccgttttagacggcccagggttgagtattcaaaatgcacaaatcacgcgc
ggtgcgggcgagcagtatggcgttctcggcggtgctaaagccttgctgggttttgagtcg
ggtatttttcttaccaccggacgggttgccagtttacagccgcctaacaacaccggctct
tacagttacgataccccccaagctctctatcgtgatgctgatttattagctattagccct
tatgcaaaatatgacccggtggcttttgagttcgatattgtgccgcagggtgatagagca
aatttcgttttcagcttcggttcggaagaatacccagaattcgtgtgcagccaatacaac
gatgcattcggcctatttattaccgggccggggatttcaggtacacgtaacgcggctttt
ttgccgaatacccagacgccgattgcggttaataatgtgaatggtggtgcggctggctct
caagcggatggtgcggcgtgccagttgtcaaataccggctattttatcgacaatggtaac
ggtacgggcagtagtgcttcgcagttggatggttttaccaagactttgaccactgcgatt
acaggtttgcaagcggggcaggtttaccatgtgaaattggcaatggcagatgctcgcgat
tcagggtacgactctggtgcagcttttaaatggcttaccagtactaattccacgccggtt
gatttggcgttgactgccagcactaaccgcccgaatcctagttataacagcacggtagag
ttaacttggacggtaagtaacagttcggcaacagccgcaagtttgacgcaggttggtttg
gaatggccagcgggattgacttggcttagtgataatgcaggtggagcttacaaccctgca
acgggtgagtggcaggctggggatattccggcgggtggttccaaaagcatcacgattcgg
gcgcaagttgctacggcggcacaatacgctattgtcggtgaaattctgtatgcgtttaat
gaagatcccgattcaactcccttcaatcgccatatcaatgccaatgaagacgatactgca
acagtactgttaagcccggttgagaacaatgcgccgactatgcctgctaccgcaacggca
actgctgccgaaaatcagtatgccgtaaccccggcggtacaagcggttgaccctgatggt
gatgtattaagctacagcatcagtggtggtgcagatgcggggaggttcttagtgaactcc
agcacgggggtattaacgttcatcgcggctcccgattacgaaaaacccgttgacgcagat
aaaaataacagctacgtggtacaagtaacggtcagtgatggcaagctaagcgcgacacaa
acgctaacgatcacggttggcaacgttaacgaagcaccaacattacctgcaactactata
tttccggtactggaaaaccaaacgatagcggctacggtgagtggcacggatgttgatggc
aatgtcctcaattacagtattagtggtggagcagatgctgcaaagtttgctgtgaacgcc
agcacaggggggctcatgttcatcgcggctcccgattacgaaaaacccgctgacgcagat
aaaaacaacagctacgtggtgcaggtgactgtcagtgacggcaagctaagcgcgacacaa
acgctaacgatcacggtcggcaacgttaacgagaaaccgactctgccagctagtgccact
gtttcggtgttggaaaatcaaacggtagtgaccccggcggtacaagccgttgaccctgat
ggtgaggcattaagttacagcatcagtggtggtgcagatgcagggaagttcgtggtgaat
gccagcacgggggtattaacattcattgcagctcccgattacgaaaaccccgctgacgca
gataaaaataacagctacgtagtgcaggtgacagtcagcgatggcaagttaatggcaacg
caaacggtgactgtcaatgtcactaacgacaccactgaaaacgctttacccgtaatcctt
cccggtaacaatgccgctacgcatacccaaaactatgtggaaaatagcactaacttgcta
gtgcttgattacgatgcaaccgacgcagatggtgatacagagggtagcggtttaacttgg
ttgctgacgggcggtgatgataaatgggcgtttacgattcatccgaccgagggttggtta
gaatttaccggtgcgccggattttgaacgcccattggatgcggataaaaagaatacttac
gaggtgcaagtcacggtttgtgacagtaaaggcggttgtgcgagtcaaaaactaacagtg
gcgttaaccaatgtggctgaagatagtgatggtgatggaattcccgacgcattggaaatt
caggagggaatagctgacccttacacggacggcaaggataccgatggagataaagtgccc
gattacttggataatgatgacgatggcgatggtttgctgacccaatatgaagtggctgat
ccgaatacagatggagatttagccgatgctcgtgatacggatggggacaaaataccggat
tacctggatgccgatgatgatggcgatggtaagccgacagctaccgaaaaagctgatctg
aatggtgataaaaatccggctgatgcggttgatagtgatgatgatggcattcccaattac
ctcgataacaacgatgagcctagcgtgcatttgtcggtgcgggcgtatttgcagggagcg
tataacactcagacgggtttaatgaccgacaaacttttgacgaaggggtttctgcctaag
ccacaaccgtttgataagttagtgaccagttttggctataccgtatttgagggtgttccg
ccttttaatcacttcggtaaggaggtcatgagtgatagcgttaaagcaatgcccgcaggg
aatactcccgtggattggatgttattggagttacgtgatgtggatgatccggtaaaacgg
gtggcagcgaaagcgacgctgctgcaacgcgatggtgatgtcatcaatgcagagacaggt
tctactaacattgtgttccgaggggttccgccgggggattactacgtggttttgcgtcat
cgtaatcacattggcgttatgacggcaacgcgactgagcttaactgaaacggctacagtg
attgattttacccaacccagttacgcagtctacggtaataatcagcgttatttggcaggt
gataaagcctttttgtgggcaggtgatgccaataacagtaattccgtggtgggttcgggg
ccgggtagtgatgctaatatcatgttgggctcactgttgatctcacctgataacaccttg
gtgaccacacattttaaaatggcgggttattacgctactgacttgaatctggatgggtta
acggtgttttcggggccgggtaatgatctgaatttgttattcggcaacattatggtgcat
ccgcttaatgacaattccaatgcgaacttcgttatctatggtgcagtgccacgctaa
DBGET
integrated database retrieval system