KEGG   Turicibacter sp. H121: AT726_06425
Entry
AT726_06425       CDS       T04254                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K09952  CRISPR-associated endonuclease Csn1 [EC:3.1.-.-]
Organism
tur  Turicibacter sp. H121
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tur00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:tur02048]
    AT726_06425
Prokaryotic defense system [BR:tur02048]
 CRISPR-Cas system
  Type II CRISPR-Cas system
   Type II signiture cas proteins
    AT726_06425
SSDB
Motif
Pfam: CRISPR_Cas9_WED Cas9_PI2 HNH_4 RuvC_III Cas9_REC Cas9_RuvC Cas9_a DUF6845 HNH
Other DBs
NCBI-ProteinID: AMC08573
UniProt: A0A0X1TKX4
LinkDB
Position
1343564..1346887
AA seq 1107 aa
MGYTLGLDIGIASVGFGLIDNVDGKILESGVRLFSSADPDNNQTRRSSRQARRLNRRKVH
RLERVAHLLEEAGFEKGEVLAPTPYHLRVKGLTEKLSKPEVYAALYNLMKHRGISYLEDV
ELDEADSSSVSQNVELLKEYYPCEIQLERYEEYGQIRGIIETYNKDGEKESLVNIFPTGA
YKKEAEAIILKQGQFYPELDKVFLEKFTEILTVKRPYYVGPGNKKSRTDYGIYRENGETL
ENLFDILIGKCTIYPQEARAAKFSYTAQLFDFLNDMNNISIAGEKLTEVQKREIYHQIMS
SKTVNMMKIITKVTGCLKEEVTGYRVDSKYKAEFHSFASYRQFRNKMLDYGFDVQTLNVE
MFDKLAAKLTLNTEYHQIITQLESLNLGLSKELIEKIADFRKKNRSLFSKWHSLSLKAMN
EVVDELWSTSKNQMQIFSELGGFKSNIEVFKGLKYIPLDAMVDEIYNPVVRCSIRESIKI
INALLKKYGALDKVVIEMPRDSNEKEEKDRITKLNKENDNKKKQAIEKARNEYGFGEEAY
RQQNDLNTKLRLWYEQKQRCLYSGEIIKIFDLIKNPHLFDIDHIIPKSISYDDSLSNKVL
CYATENREKGNLTPYRYFKRKASLTWNYEAYKSYVIELYKDGKGDLSRTKLELLLFEEDI
NKYEVRQRFINRNLVDTRYASKVVLNTLQDFMKENYPTTTVEVVRGKFTAQLRRHWGIRK
NRDENHAHHAIDALIIACVPHLSLWKEQKKVFSTDEFRVDETTGEIIEQSYNQLTYQEPF
SQFFYQLEKVSIDCRYSYKVDRKFNRQVADATIYSTRQGIVKQTSGDKSFTLDSNSKEHY
VIAKIKNIYEDVDAKRFMDRYKKDKTQFLMYHHDPQTFSILEDVMKTYPDKKNPFQAYRL
EYGPIRKYSKKGNGPQIQSIKYYDSKLGQHIELKQANQSTKKVVLQSLNPWRCDIYYNKK
DKRYIAAGLKYADLSYQKGTGLYGISLQRYQQILNSEKIELSIEQIELLLEGRLNESNFE
FCFSLYKNDFIQWNDENNQTFQYRFLARNLSSPNRIEVKPINKSKYDKQAEGLKTLKKGL
NRFYKISVDVLGYQHFIKKEKLKLTFK
NT seq 3324 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggatatacactaggcttagatattgggattgcatcagttggatttggtttaattgac
aatgttgatgggaaaattttagaatcaggagttcgtttgttttcttctgctgatcctgat
aataatcaaacacggcgtagctccagacaggctagacgtcttaatcgtcgaaaggtgcat
cgtttagaacgagttgcgcacttgttagaagaggctggttttgaaaaaggagaggtttta
gctcctacgccttatcatttacgagtaaaaggattaacggaaaagttaagtaagccagaa
gtttatgctgctttatataatttaatgaaacatcgaggaatttcttatttagaagatgtt
gagttagatgaggcagatagtagctctgtgagccaaaatgttgagttattaaaagagtat
tatccatgtgaaatccagttagaacgttatgaagaatatggccaaattcgagggattatt
gaaacttataataaagatggtgaaaaagagtcattggttaatatttttccaactggtgct
tataaaaaggaagctgaggcaatcatcttaaaacaaggtcagttttatcctgagttagat
aaagtgtttttagaaaaattcacggaaattttaacagttaagcgcccttattatgtaggg
ccaggcaacaaaaagtcacgtactgattatggaatctatcgtgaaaatggagaaactcta
gagaatttatttgatattttaattggaaaatgtacgatttatccacaagaggcacgtgct
gctaaattttcttatacagcccaattgtttgactttttaaatgacatgaataatatttct
attgctggtgagaagttaacggaagttcaaaaacgtgaaatttatcatcagattatgtca
tcaaaaacagtgaatatgatgaagattataacgaaagttacaggttgcctaaaagaagaa
gtgacggggtacagggtagatagtaaatataaagccgaatttcattcatttgctagttat
cgtcaatttagaaacaaaatgttagattatggttttgatgttcaaacgttaaatgttgaa
atgtttgataaattggcggctaaactaacattaaatacagaatatcatcaaattattact
cagttggaatcgcttaatttaggattaagcaaagagttaattgaaaaaatagctgatttt
agaaagaaaaacaggtctcttttctctaagtggcacagtttatctttgaaagctatgaat
gaagttgtagatgaattgtggtcaacatctaaaaatcagatgcagatatttagtgaatta
gggggttttaaatcaaatatagaagtttttaaaggactgaaatatattcctttagacgca
atggtcgatgaaatttataatcctgtcgttagatgttccatccgtgaaagtataaagatt
attaatgccttactaaaaaaatatggggctttagataaagtagttattgaaatgcctcgt
gatagtaatgaaaaagaagaaaaagatcgtattacaaaattaaataaagaaaatgataat
aagaagaaacaggccattgagaaagcgagaaatgaatatggatttggggaagaagcttat
cgtcagcagaatgatttaaatacaaagttgcgtttatggtatgaacaaaaacaaagatgt
ttatatagtggagaaataattaaaatatttgatttaattaaaaatccacatttatttgat
attgatcatattattcctaaatcaatttcttatgatgatagtttatcaaataaagtttta
tgttatgcgactgaaaatcgtgaaaaaggaaatttaacaccgtatcgttattttaaaaga
aaagcgagtttaacttggaactatgaggcttataaaagttatgttattgaattatacaaa
gatggaaaaggtgatcttagtcgcaccaaactagaattattgctttttgaagaggatatt
aataagtatgaagttcgtcaacggtttattaatcgtaacttagttgacactcgttatgcc
tcaaaggttgtcttaaatactttacaagattttatgaaagaaaattatcctactacaact
gtagaagttgttcgaggaaagtttactgctcagttaagaagacactggggaattagaaaa
aatcgtgatgaaaatcatgcacatcatgcgattgatgccttaattattgcttgtgtacca
catttatcattatggaaagaacaaaagaaggtatttagtacagatgaatttagagttgat
gaaacaactggcgaaattatcgaacaaagttataatcaacttacatatcaggaaccattt
agtcaatttttctatcaacttgaaaaagtatcgattgattgtcgttactcatataaagta
gatcggaaatttaatcgtcaagttgcggatgcaactatttattctacaagacaggggata
gtcaaacaaacgagcggtgacaaaagttttactcttgattcaaatagtaaagagcattat
gttatcgcaaaaattaaaaatatttacgaagatgtagatgctaaacgatttatggatcga
tataaaaaagataaaactcaatttttaatgtatcatcatgatcctcaaacattttctatt
ttagaggatgtgatgaaaacttatcctgataaaaagaatccatttcaagcctatcgatta
gagtatggaccaattagaaagtatagtaaaaaaggaaatggacctcagattcaaagtatt
aaatattatgattcaaaattaggacaacatattgaattaaaacaagcaaatcaaagtact
aaaaaagttgttttgcagtcgttaaatccatggcgttgtgatatttattataataagaaa
gacaaaagatatattgcagcagggttaaaatatgctgatttgtcatatcaaaaaggaaca
ggactatatggtatttcacttcaaagatatcaacaaattttgaattctgagaaaatcgaa
ttaagtatagaacaaattgaattattattggagggaagactaaacgaatcaaattttgag
ttttgtttttcactttataaaaatgattttattcaatggaatgatgagaataatcaaacc
tttcagtatcgattcttagctcgtaatttgagtagccctaatcgaatagaggtaaaacca
attaataagtcaaaatatgataaacaagctgaaggtttgaaaacgttaaagaaaggacta
aataggttctataagatctcagttgatgtattgggatatcaacattttattaaaaaggaa
aaattaaaattaacgttcaaataa

DBGET integrated database retrieval system