Tetranychus urticae (two-spotted spider mite): 107362345
Help
Entry
107362345 CDS
T04901
Name
(RefSeq) TATA-binding protein-associated factor 172
KO
K15192
TATA-binding protein-associated factor [EC:5.6.2.-]
Organism
tut
Tetranychus urticae (two-spotted spider mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tut00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
tut03021
]
107362345
Transcription machinery [BR:
tut03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Other transcription-related factors
Others
107362345
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3535
SNF2-rel_dom
Helicase_C
HEAT_EF3_N
HEAT
TOR1L1_N
HEAT_2
TPR_Trm732_C
HEAT_EZ
ResIII
Vac14_Fab1_bd
Cnd1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107362345
NCBI-ProteinID:
XP_015784868
UniProt:
T1KBT3
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1869 aa
AA seq
DB search
MKSRLDRLFLLLDQGTSSVTRKAAAQQLGEVQRLHPHELNNLLAKVRGYLHSSSWETRIA
ASLAIEAIIKQIPKWLPNGTNDEPIDNTSLDCFGGEGRMKLDVFDINKVIECGRNLLASE
GTEYDLNLINCDNLSADNLREKLSAQRQLLNKKLGLDISQKLNLGIQSDDLVSNEDLSQI
QDVKMENTDSNVGANNDHSENNDKKIGNLNSKKVEISELLNLNKRKAADDRGSIELEEGD
KNIDSTAVCKFSVKKIKLESDKKDNELQNESKVIDLNNLKEWPLQSFCDELMSDLFNASW
EVRHGAATALREIIKVHGVCGGRPLNAPKSQMDALNQLWLEDLALRLICVLALDKFGDFV
SDQVVAPVRETAAQTLGSIFNIMSKDNVFSTVKILLQLLVRPEWETRHGGLLGLKYLLAI
RSDLTFELLPKVFDSIFNCLKDNEDDVSAVAAAALVPVRDSLIETLPDKVPIIIDFLWDA
LLEIDDLTSSTSDILKLLSSLLIKYHHNDQKRLRELVPRLWPFLGHNLPSVRKSVIESLL
VLIAADLAWADVEIISESLRLLYQRCLTESNNEILDLLFDCWSKFIKTCSLNDILAASTP
HLSGWICLMMHPAKNAIDSKVSPVWFVPRRRAFHGDSNQKVKYSDNGLNEPEKQYLGGAE
SLYDTPLKRERFVIRARLTAAKFIGLLAEYVYRVVASKSPSPSECFTNLLLFHLNSKSAI
QRTCVAWIIKEWSCAHGPTVSENSLPRCLLDKCLECLKETVYYDEIALSFNRLQHDARDF
ISTIKFNKLTIDDEIYKPGNILTIQQLSDLVSTVYQSSIESSKVKVKASTLESMEERRKA
IASSIEELTRYQNSLSMMVTSALSSCIISWKILPDKLNPVVRPLMDSIKRESNEQLQRAS
ANHLTFLLDLCLSQDKPDNSSPVNKIIKNLVTFLCSDPNFTPNLSNPVLSNLSSTINNNA
TSNSGSCSPSTPSTPGTPDLSNGILTLINMCKQAERYNLKRLNSSNSFKKSTENPDEETS
STNIPDDNDKFNELIRRGASFALTEIVAHFGDQLPERLPQMWAYITNFQNLVSEANDKVD
VNKAQELIQCLQVLEVIAPYLHLNLHPHLRQLLPKLCSCLENYFYAVRHLAARCIGVLST
VITPETMDKVLGLVLDMLGSSDSDLRRQGAVEAIYCVVDKLGISIVPFIVLLIIPMLGRM
SDTNEQVRLLATHCFAQLIQLMPLDDSKSNKVPIKSELLEKKNHEQHFLEQLMNPKKLEN
FKIPVPVNAELRSYQQEGVNWLSFLNRYKLHGILCDEMGLGKTLMSICILASDHYMRSEK
YKKTKAPDSKPLPSIVICPPTLTGHWVYEVEKFVDSTYLHPLNYAGPPIERAKLRNKLKN
QSNRKSYNLVIASYDIVRNDIDFFSSISWNYCILDEGHIIKNGKTKLSKAIKSLNTNHRL
ILTGTPIQNNVLELWSLFDFLIPGFLGTERQFAIRYSKPILQSRDAKSSSKEQESGVLAM
ESLHRQSLPFILRRMKEDVLKDLPPKIMQDYYCELSTLQSQLYEDFAKSRARASLESSVH
KLEGGTASLKSVDSTGSQANSSHIFQALQYLRKVCNHPKLVLTPHHPQYDSIISRLKDQS
TSLNDISHAAKLCALKQLLLDCGIGCSSSSTLMGGSQPVVNQHRALIFCQLKGMLDIVEN
DLLKTNMPSVSYLRLDGSIPPGSRQSVVFQFNNDPSIDVLLLTTQVGGLGLNLTGADTVI
FVEHDWNPMKDLQAMDRAHRIGQKKVVNVYRLITKGTLEEKIMGLQKFKMTIANTVISSD
NSQLQTMGTDQLLDLFCLDNKNGPDNKEGPGNAKGSGVKSVLENLPELWDTNQYEDEYDL
SNFIESLKS
NT seq
5610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcgcgactggatagactgttcctgttgcttgaccaaggaaccagtagtgttacc
cggaaggctgcggctcaacaattaggcgaagttcaacgtctacatccacatgagttaaat
aatttattagccaaagttcgaggctatcttcacagctctagctgggagaccagaatagct
gcaagccttgctattgaagcgataatcaagcaaataccaaagtggctaccaaatggtaca
aatgatgagccaattgataatacctctctcgactgttttggtggagaaggccggatgaaa
ttagatgtttttgatataaataaggtgatcgaatgtggccgtaatctacttgcttctgaa
ggaactgaatatgacttaaatttgatcaattgtgataatctttcagctgataatttgaga
gaaaaattgtctgctcagagacaattgttgaataagaaattaggtctagatataagtcaa
aagttaaatttaggaatccaatccgatgatcttgtttccaatgaggatctctctcaaata
caggatgttaaaatggaaaatactgactctaacgttggagcaaataatgaccatagtgaa
aataatgacaagaaaattggtaaccttaactcaaaaaaagtggaaattagtgaactgttg
aatctaaacaagagaaaagcagctgacgatcgtggatcgattgaactggaggaaggtgat
aaaaatattgatagtactgcagtgtgtaaattttctgttaaaaagattaaattggaatct
gataaaaaggataatgaactccaaaatgaatctaaagtgattgatttgaataatctcaaa
gaatggcctttgcaatctttctgtgatgaactaatgagtgatcttttcaatgcaagctgg
gaagtccgtcatggagcagcaacagctctgcgagaaataattaaagttcatggtgtttgt
ggtggaagaccgttgaatgctcctaaaagtcaaatggatgcacttaatcaattgtggctc
gaagatttagctcttcgattgatttgtgttcttgctttggataaatttggtgactttgtg
tccgaccaagtcgttgctccagtccgtgaaactgctgcccaaacgttaggatcaattttc
aacattatgtctaaagataatgttttctctactgttaaaattcttctccaattacttgtt
agaccggaatgggagactcgtcatggcggtcttttaggacttaaatacttactagccatt
cgctccgatttaactttcgaattactaccaaaagtttttgattctattttcaactgtctg
aaggataatgaagatgacgtttctgctgttgctgctgccgctttggtaccagttcgtgac
tccttaatagaaactttacctgacaaagttcccataatcattgattttctatgggatgct
cttctggaaattgatgatctaacctcatctacaagtgatattctcaaacttttatcttcg
cttttaatcaaatatcatcataatgatcagaaaagactacgtgaattggtacctcgtcta
tggccatttcttgggcacaatcttccttctgttcgtaaatctgtcatagaatcacttttg
gtattgatagcagctgatttggcctgggctgatgttgaaattatctcagaatctcttcgt
ctactatatcaaagatgtttaactgaaagtaacaatgaaatcctcgatcttttatttgat
tgttggtctaagttcatcaaaacatgcagtcttaacgatatattagcagcttctactcca
catttatctggatggatttgtttaatgatgcatccagctaaaaatgccattgattctaaa
gtgagtccagtttggtttgtccctagaagacgagcatttcacggcgattcaaaccaaaaa
gtcaaatattccgataatggactcaatgagcctgagaaacagtacttgggtggtgcagag
tccttatatgatactcctcttaaacgagaaagattcgttatccgtgctcgtctaactgcc
gccaagtttataggacttctggctgaatacgtttatcgtgtagtagcatctaaatctcca
agcccctccgaatgttttacaaatttacttcttttccatcttaactcaaaatctgctatc
caaagaacatgtgttgcttggattatcaaagaatggtcttgtgcccatggtccaacagtt
tccgaaaatagtttacctcgttgtttgctagataaatgtttagaatgtttaaaagaaaca
gtttattatgatgaaattgctctttcgtttaaccgacttcaacatgatgcccgagacttt
ataagcaccattaagtttaataaactcaccattgacgatgaaatctataaaccaggaaac
attttgacaattcaacagctttcagatctagtttcgactgtttaccaatcatctattgaa
tcgtccaaagttaaagtgaaagcatctactcttgaatcaatggaagaacgacgaaaagca
atcgcttcttctattgaagagcttactcgttatcaaaattccctttctatgatggttact
tcagcactctcgagttgtataatttcatggaagattttacccgacaaattgaatccagtt
gttcgccccttaatggattccatcaaaagagagagcaatgaacaattacagagagcatca
gctaaccatctaacttttttattagacctttgcttatctcaagataaaccagacaattca
tctccggtcaacaaaataatcaaaaatttagttacttttctttgttctgatccaaatttt
actcccaatctgtctaatcctgttttgagtaatttatcatcaaccatcaataataatgca
accagtaatagtggctcatgttcaccatcaactccatcaactccaggtactcctgattta
tccaatggcatactcacattgattaatatgtgtaaacaagcggaaagatataatcttaaa
cggttaaactcatccaactcattcaaaaaaagcaccgagaatcctgacgaggaaacaagc
tctactaatatacctgatgataatgataaatttaatgaacttatccgtcgaggagcatca
tttgcccttactgaaattgttgcgcattttggtgatcaattacctgaacggctacctcaa
atgtgggcttatattactaattttcaaaacttagttagtgaagctaatgacaaagtagat
gtgaataaggctcaagaattaatacaatgtcttcaagttttagaagtaattgctccatat
ctacatttaaatcttcatcctcatttacgtcagcttttaccaaaattatgttcttgtttg
gaaaattatttttatgctgtccgtcacctggccgctcgttgtattggtgttctcagcaca
gtcataactccagaaacaatggataaagttctcggattggtacttgatatgctgggatct
agtgactcagatctacggcgtcaaggagcggttgaagcaatttactgtgttgttgataag
cttggtatttctatcgttccatttattgttcttctgataattcctatgctgggtcgaatg
agtgatacaaatgaacaagttcgacttctagctactcattgttttgctcagttaattcaa
ttaatgccactggatgatagtaaaagtaacaaggtgcctatcaaatctgaattattggag
aaaaagaatcatgagcagcattttcttgaacagcttatgaatcccaagaaacttgaaaat
tttaaaattcctgtccctgttaatgctgaacttcgttcatatcaacaagaaggtgtcaat
tggctgtcattccttaatcgatacaagttacatggaatcctttgtgatgagatgggttta
ggtaaaactctcatgtctatttgtatattagcttctgatcattacatgagatctgaaaaa
tataaaaagacaaaggcccctgattcaaagcctttaccttccatagtaatttgtcctccc
actttaacgggtcattgggtttatgaagttgaaaaatttgtcgactcaacatatcttcat
ccattaaattacgcgggaccacctattgaaagagccaaattacgaaataaattaaaaaat
caaagtaatcggaaaagttataatctagttatagcatcttatgatattgtacgcaatgat
attgacttcttctcatcaatatcttggaactattgcattctcgatgaaggtcacattatt
aagaatggtaaaacaaaattatcaaaagccataaaatcacttaatactaatcatcgtctc
atattgactggaacaccaatacaaaataatgttctcgaattgtggtctctatttgacttt
cttatacctggtttcttggggactgaaaggcaatttgcgattcgttattccaaacctatt
ctccaaagtagggatgccaagtcatcatcaaaagaacaagagtctggtgttttggccatg
gaatcgcttcatcgtcaatctttaccttttatccttcgtcgtatgaaagaagatgtcctt
aaagacttgcctcccaagattatgcaagattattattgtgaactatcaactctccaatca
caattgtacgaagatttcgccaagagcagagctcgtgcaagcctggaaagttcagttcat
aaacttgaaggaggaacagcaagtttgaaatctgtagactccactggatcacaagctaac
tcatctcacatctttcaagcacttcaatatcttcgtaaagtttgtaatcatcctaagctc
gttctcacccctcaccatcctcaatatgattcaattatttctcgcctcaaagatcaaagt
acatctctcaacgatattagtcatgcggctaaattgtgtgcattgaaacaattgcttctt
gattgtggtattggctgttcaagttcatccactctcatgggaggaagtcaaccagtcgtt
aaccaacacagagcattgatattttgtcagctcaaggggatgcttgatattgttgaaaac
gatttactcaaaaccaatatgccttcagtcagctacttacgtctggatggaagtattcct
ccaggctctcgtcaatcagttgttttccaattcaataacgatccatcaattgatgtatta
cttttaactactcaggttggtggtcttggtcttaatttaactggagccgatacggttatt
tttgtggagcatgattggaatcctatgaaagatcttcaagcgatggatcgagctcatcgt
attggccagaaaaaagttgttaatgtttacagactaatcactaaaggaacactagaagaa
aaaataatgggcttacaaaagttcaagatgactattgctaatactgtgatcagttcagat
aattctcaattgcaaacaatgggcacagatcagttacttgacttattctgcttggacaat
aaaaacggaccagacaacaaagaaggaccaggaaatgctaagggttcgggtgttaaatca
gttctagaaaatttacctgaattatgggacacgaatcaatatgaagatgaatatgattta
agtaatttcattgaatcactcaaatcctga
DBGET
integrated database retrieval system