Tetranychus urticae (two-spotted spider mite): 107371842
Help
Entry
107371842 CDS
T04901
Name
(RefSeq) laminin subunit alpha-1
KO
K05637
laminin, alpha 1/2
Organism
tut
Tetranychus urticae (two-spotted spider mite)
Pathway
tut04512
ECM-receptor interaction
tut04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tut00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
107371842
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
107371842
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_1
Laminin_G_2
Laminin_B
Laminin_EGF
Laminin_G_3
DUF3439
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107371842
NCBI-ProteinID:
XP_015795490
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1709 aa
AA seq
DB search
MASLTKSIFKFMAGSKPHRNKFTSSSSTNYQDFFFAFIFVNILCFISLTFLTTVSAVTSP
ESEESNSVDCSPNDPNFPLCRHCPCNRAGVLDPENCDEPCECKPSVIGQFCDQCKPGYVN
LNSDNPEGCTKCFCFNVTTSCRITYWPSQIITNPADWQITTLSGGEIVDPQQEDDHLVIA
DDDAPSAPYYYWSAPREYLGDMYAAYGRKAKISLSATVLRGDSAGSPVYGPDIVLEGEDS
QGSRLLIGHSWKPIPFVRAERTKINRKIVLSERNWFRLNDDGSNSSRVTRDEFVMVLSNL
KRFLIRAYFHTDQIEGSFYNVDVLVASPNGETDSATGRITQECDCPEGYERPSCGPGCSP
GYRRVNNTLIGGICEKCYCNNHSLTCDAFTGECTQCLHNTQGARCNMCSFGFYGFPLNGQ
PDDCKPCACPRLEPSNNFSPTCIAISRDDYVCDACQWPYTGPKCNQCVEGFTGDPTTLGG
SCVPIEITSTTSTTTTTTTTTSIPSTTTRTTTTTMSSWIPTEMTTYYWPTYTETWKPYET
TYWYEPSTTVPPPPCRSYETTTLPPPPPPPPPTKPFIVTYENCQHSCAGLHYSDIWDMEV
TLSKINIDDIFHFPYALASLIRKEVNLRESLKHRHFILTNGLTLIGGLTGELEFNLTMDP
FVGRVNTSEVIAINMINSLSELLGLSTTEMNNVRSLQSSIHQTISYINSISSDISANEPN
FWDEMIRRANSWVTEMSNIDLTSKLADSIVEREQSVVFLNQVSSFLSTYREQNSLLERIN
RLKYILHQIEFIINEQVNSPVYLVDQQMTSVRNSINALVLNATYNQERIVKYSESIREGF
NHLEGSQVYFSIINKVTGDLETMSNDLNRSILAVERVRSIYSRLNPFYEDVYVNRCRDRV
DKELSRINGAIEEYNMTINLLKPYIDIPQSNNQTVVLIERAEIDAEKAINTIVSQVIDSV
VNQGTTSRATELRGTSNQIYREVVQQSLTISERSSELIEVTRFNEESRLVTDCFKSHETI
LEELNNFTVSIEASSRDTIEFSYILDMGLKSIESRVAEINESLGIIEGPSAVRVEEKWLA
EMNEASNLVNQSSNLVQSISVNTERLSDVASKVRRQRQGMDTNLADLRKRILLAKQKAAE
IRIALASEPDMYCIRSYVVETQPSSANSISMNYAIDQEKVRDALIFSIVNPDDGDFLAID
MVDRSIRFLWSLGTNGLTIIEHPMKLETSPENMEEDAHWYHIEAERIGTIGTLNVQRVVD
GNALSGNPVKSVSSANYSILDVTSAHRLWIGGHLELDGFFVPSGAVSKGFQGCLADLMYD
EKHIGLWDFSYTSPTGCKPCSKSALESGEYGVFQFNGKSSYSVLDQIPRYDNRNYQVVML
MRTFDESAIIFFCSDVDTGNYIAIHIVNGRVSFSFRDSPETWLKLVTTDKYNNGEWFRVT
AARSETRAILSVDKENIEGEVEAYNSDLGDCKIHFGGVPPNFTTHHWPNLDFKPFLGCMK
DVQIDTTPLNLMNGETFGLSTGCKNDLPRSAKFNGQGYLEMKGLPLRDNDVISLTFKTNQ
SEAILLMATFKNPKKPKKELQYYSLAITVGSLEARFNPGSSEALLISRVSVNDGKFHTVA
ITKRNRRVWMTVDDYEVVTAKLGPGRNIGASASESELFIGGVPQSSEWFKILGTNQSLNG
VIKDFITDGKVIYFNNFVTFDSVEIGRGV
NT seq
5130 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcatctttaaccaaatcaatttttaaattcatggccggatcaaagccacatcggaat
aaatttacttcatcatcatcgacaaattatcaagacttttttttcgccttcatttttgtt
aatattttgtgtttcatttcattaacttttttgacgacagtttcggctgttacatcaccg
gaatcggaggaatccaattcagtagattgttcaccaaatgatcccaattttccattgtgt
cgacattgtccctgcaatcgagctggagttttggatccagaaaattgtgatgaaccttgt
gagtgtaaaccttcagtgatcggtcaattttgtgaccagtgtaaacccggttatgttaat
cttaattcagataatccagaaggatgtacaaagtgtttttgttttaatgtaacaacatct
tgccgaataacttattggccttcccaaataataacaaacccagcagattggcaaataaca
acattatctggaggtgaaatagttgaccctcaacaagaagatgatcacttagtaattgcc
gatgatgatgcaccttcagctccatattattattggtcggctcctcgtgaatatcttggt
gatatgtatgcagcttacgggcgaaaagcaaagatatctttaagtgccaccgttcttcga
ggtgattcagctggtagtcctgtctatggacctgacattgttttggaaggagaagattcc
caagggtcaagattgttgattggtcacagttggaaaccaattccatttgttcgcgctgaa
cgaacaaaaattaatagaaaaattgtactttctgagcgcaattggtttcgattaaatgat
gatgggtcaaatagttccagggttacacgtgatgaatttgttatggttttaagtaacttg
aaacgttttctgatacgagcttattttcatacagaccaaattgaaggatctttttacaat
gttgacgttttagttgcatcacctaacggagaaacagattcggcaacgggtcggattaca
caagagtgtgattgtcccgaaggctacgagagaccttcttgtggtccaggatgttcacca
ggctatagacgagtaaataatacgctaattggaggaatctgtgagaaatgttattgtaac
aaccattcattaacttgtgatgcttttactggagagtgtacccaatgtttacacaatacc
caaggtgctagatgtaatatgtgctcttttggcttctatggtttcccgttaaacggtcaa
cctgacgattgtaaaccttgtgcttgtccacgtttagagccttccaacaatttttcacca
acctgcattgcaattagtagagatgattatgtttgtgatgcctgtcaatggccttatacg
ggtcccaagtgtaatcaatgtgtagagggttttactggagatccaacaacattaggcggc
tcatgtgttccgattgagattacaagtactacctcaactactacaacaacaacaactaca
acaagtataccaagcacaacaacacgaaccacaaccacaacaatgtcatcttggattcca
actgaaatgacaacgtactactggccaacatatacagaaacatggaaaccatatgaaaca
acgtattggtatgaaccatcaacgacggtaccaccaccaccctgtcgatcctacgaaaca
acaacactacctcctcctcctcctcctcccccgccaacaaaaccattcatagtaacttat
gagaattgtcaacactcttgtgctggtcttcactattcagatatctgggatatggaagta
actttgagtaaaataaacatcgatgatatatttcattttccatatgcattagcctctttg
ataaggaaagaggttaatttaagagagtctttgaagcatagacattttatcttaactaat
ggattaactttgattggtggtttgacgggtgaactggaatttaatttaaccatggatcca
tttgtgggaagagtaaatacttcagaagttatagcaatcaacatgattaactcactctca
gagcttcttggactgtcaaccacagaaatgaataacgtgcggtcccttcaatcttccatt
catcaaacaatttcttatattaattccatttcaagtgatatcagtgcaaatgaaccaaac
ttttgggatgaaatgattcgacgagccaattcttgggttactgaaatgtcaaacattgat
ttgacctccaaattagccgattcaattgttgaacgagagcaaagtgtagtttttctcaat
caagtttcatcttttctatccacctacagagaacaaaattcgcttctcgaacgaataaac
cgattgaaatatattttgcaccaaatagagtttataataaatgaacaagtcaattcgccg
gtttatttggtagatcaacaaatgacgagcgttcgtaattcaataaatgctttagtattg
aatgccacttataaccaggaacgaattgttaaatatagtgaatctattcgagaaggtttt
aatcatctggaaggatctcaagtgtacttttcgataatcaacaaagtaactggagactta
gaaactatgtcaaatgatttaaatcgttcaattctggctgttgaaagagtccgatccatt
tattccagacttaatcctttttatgaagatgtttatgttaatcggtgtcgtgacagggta
gataaagaattgagcaggatcaatggagccatagaagagtataacatgacaattaattta
ctcaaaccctacattgatatcccacagtcaaataatcaaaccgttgttttgattgaacgg
gcagagattgatgcagaaaaggcaattaacaccattgtaagtcaagtaatagattctgtt
gtgaatcaaggaacgacaagtagggcaacagagttgagaggaaccagcaatcaaatttat
cgggaagttgttcaacaatctttaaccattagcgagcgttcgtctgaattgattgaagtt
actcgttttaatgaagagtctcgattggtaactgattgttttaaatctcatgaaaccatc
ctagaggagttgaataatttcacagtttcaattgaagcttcatccagggatacaattgaa
ttttcatatatcttggatatgggactgaaaagtattgaaagtagagttgctgaaatcaac
gaatcactaggtataattgaaggtccaagtgcagtacgagttgaagaaaaatggcttgct
gaaatgaatgaggcatcaaacctggttaaccaatcatcaaacttagttcaatcaatttcg
gttaatactgaacgactatcagatgtagcttcaaaagtaaggcgtcagcgtcaagggatg
gacactaatttagctgatttaagaaaacgcattctactagccaaacaaaaagctgcagaa
ataagaattgccttagcctctgaacctgatatgtactgtatcagatcatatgtggtagaa
actcaaccatcgtcagccaattccatctctatgaattatgctattgatcaggaaaaggtt
cgagatgctttgattttttccattgtgaatccagatgatggcgattttcttgccatagat
atggtggatcgctctattagatttctttggtctttaggcactaatggtttgacaataata
gagcatccaatgaaactcgaaacaagcccagaaaacatggaagaggatgcccattggtac
cacatagaggctgaaagaataggaacaattggaacactgaatgtacaaagagtcgttgat
ggcaatgctttatctggtaacccggttaaatctgtttcatcagccaactattcaatatta
gatgtaacaagtgctcatcgtttgtggataggtggtcatcttgaattagatggattcttt
gttcctagtggagctgtttccaaaggattccaaggttgtctagctgatttaatgtatgat
gagaagcacattggtctttgggatttcagttatacctctccaaccggttgtaagccatgt
tcgaagagtgcattagaatcaggagaatatggcgtctttcaatttaatggcaaatcatca
tattccgtattggatcaaatcccacgatatgataatagaaattaccaagtagtgatgttg
atgagaacctttgatgaatccgcaataatctttttctgttcagatgttgatacaggaaat
tacatcgctatacacattgtaaatggacgtgtatcattctctttccgagatagtccggaa
acatggctaaaattggttaccacagataaatataacaacggtgaatggttcagggtaaca
gctgcaagatcagaaacacgggcaatattatcagtggataaagaaaacattgaaggtgaa
gttgaagcatataattccgatctaggtgattgtaaaattcactttggaggagtcccacca
aactttacaactcaccattggcctaatcttgattttaaaccattccttggttgcatgaaa
gatgttcaaatcgatacaacaccgttaaatctaatgaatggagaaacatttggattatcg
actggatgtaaaaacgatttaccaagaagtgcaaaattcaatggacaaggatatcttgaa
atgaaaggcttacctttacgtgataatgatgtaataagtttaacattcaaaactaatcaa
agtgaggccatccttttgatggccacttttaagaatcccaaaaaacctaaaaaagaactt
caatattattctttagctataactgttggatctcttgaagctcgatttaatcctggctca
agtgaagctttgttaatttctcgggtctcggtaaatgacggaaaatttcatacggtagca
attaccaaaagaaatagaagagtttggatgactgttgatgattatgaagtcgttacagct
aaacttggaccaggtcgtaatattggtgcctcagccagtgaaagtgaactctttattggt
ggtgtaccacaatcgtctgaatggtttaaaattttgggaactaatcaatctctgaatgga
gttatcaaagattttattactgatggaaaagttatttatttcaataattttgtgactttt
gactccgttgaaattggacgaggagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system