Tetranychus urticae (two-spotted spider mite): 107372285
Help
Entry
107372285 CDS
T04901
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 13
KO
K19525
vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C
Organism
tut
Tetranychus urticae (two-spotted spider mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tut00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tut04131
]
107372285
Membrane trafficking [BR:
tut04131
]
Endosome - Golgi transport
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
107372285
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
VPS13_N
VPS13_M
VPS13_VAB
VPS13_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107372285
NCBI-ProteinID:
XP_015795977
UniProt:
T1JZV2
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
3184 aa
AA seq
DB search
MVFESLTSNLLNTYLNEFIDDLSANQLKIGAFTGDVELKNLAIKGNAFDSLNLPFRVVYG
HIGKFKARVPWVSLYTSPVVFTVSDVFIVCVPNVESKYDAEVEKKQMDAEKKKQLKQIEE
AMKTAQIKESDGEQAQGDDFVTKLVAQIMRNLEIQVDNVHICYEDKFTNPKSPFSIGLTL
SRLAFVTSQETCTKYTSSNQENSFLKEISLEYLSVYWNCSEDMKFISDLKEEDMDREFMW
RIASKWNRPKDLTYVLRPNNFTAKTFINRKPKEEDFKVPMFDIDMLLDQFTLAFNRGQFE
SFLLLLDSVDRMKLAAPYRQWRPHLPIKGNARVWWKFVQTAILETEIRQRNRVWSWSYIK
AHRQLMKEYEETYRKHLLTPKKVKQGLIDELESKLDVFNIILVRSQVDLGIEKMQAEKAE
ETKSGGWLSWVWGSSKKDDEGSLTKPILDEIKKEMTSDEKGKLYAAIGYEESVPAEYPPF
YEAYLVAIKLRAIQICIFDEKKEANIISFGLNDVATQLGYRPSSNGVRVGTTVRAIDLKG
VGENQLVTNQVCDQDLLEIILETNPLDASFDYGATIKARGVDVMYHAQTFNALFDIITPQ
EDVSLDQIQALAEIKFNQFKLMSVTGLEYAIEKHNTLKIDIVIEPSYIVIPDRGCVNDCE
NVLILSCGEVAVFSEFTDDSTSSLRLKYQDSGEEALINAVRESAYERFRLKVSRTQIILT
TGENWRNDLAESRTQTTPSVNNLLEPFGLELCLMRSIIADDPHMPQMRIEGTIPSIFFKA
RNIQLCRLFNLLLTVPTPKKSETMHIGPKIESNEVHEAKATTDALKIAQETAKLEARSSK
IQMTHLVLNFKVESLTCDLQTDHGVELLLLRVKRVGTEIFVKSFDTVVDLFLGQILVQVH
DLDVAGSPVFKLIETIENENLLQLKYKSTLKNGPTFEDVIQSIDIQMSQCKLFIDSPILD
ELLLYTQKIANSLPSTNDDVDRALTRRRPSVSSQISTTILAGIMVKPKKKHAEMCKVINL
RTKICVDSVVLAIGGICSTTLKGLEAILTIYETGRLNMKAFWNDFAILNCVRDPSNPRLL
DRKLVHEHILVSPGKRVLELELTMFTPTETKYSPGNVDMQLNVQFGRLKIVFLNEFVVRL
MNFLAVFETAKKRAIAASSAAAGFAKQTALDAYQNATKIGLNVVLEAPLIVIPRNWESKH
CILVDLGRIGISNRIESTHSNLLDHIKCELTNTHVFMSTDDREDNIDSIVKPISFNLSAI
RNLNFEGNKQIPELKLSATLEEIYCQISQTNLMLMMSILNENVSAGYEINQPVGEDVTCS
AIVPTAAEPRTKKIKTKKLHPSYTEVSLPLSTTTIVEEAVVHVDAIEEEKVSEQIFSRYQ
VSFAMPKVDLVLYQEEVKSVQNKLTNAYLAGFDVNCEMNTDDSLTLTMTMSDIVLCDERP
SKNKRLRKLMYCNDYISTSNGSQGKTLKIYFKKEKDTIVNMEMSGFTLIFALDYLLQLSN
IVTSSLQGLPSDSANAVSTDFQSLTASTREGIKARVAELSPDKMYISRPIDTPLMTIRFT
MSEADIVLIESTEMENPPAVIFNSLMDFDVKMKDDVMSLKGSIGHIQLGITSLENYQKTK
KVDNYIVRPFEIYLIAEMNGSSSQHIDIDFTDIGLFISPNTIQILMSIMSALGQSSEEKS
DDQDEDKLREELAIFLPKPLSAVTKYSFLHYSVAPAIEATEDLTFDEPDSKKVDFILQQL
VVKVKNISITIESGGMDSQPLIKLISSHTIILDNWNKLNMNSSCYMDYYNEKTFAWEPII
ETIDTEPWFFDLKAKIVSEEGANSRISAFLESKSQLEMTLSKSAISVITDLGQAFTNVVK
QPDTSLLGQNLIEFSNFTGMDLSIVVDTRKFVHDLPDAIKMADYHEKIEIKNGQVAKLNN
LRETAFDHDNEVVCELSHKGQTITRRFSLRGTERKCFRFPLLSYPGDEYRWMFDIGHRDS
RTKRVIFGSTVEITNHFHIPLRLYYIDISGNMEEYTFLYQIEPSASYFLPVDIVYSKYQC
IFVKPSDDYCTPRDAICWKAKEVKAFTHFFSTITCESKKKEPDFFIRVGCKTENVLFEDT
QRSAPDCFCYKFNIYPVLKLRNLLPFSISYSLEFPDEQSPKEGTIKPGEAHNLSNLNMKT
NKIVIVLNDYRGKKWVCRNKFPVRWMKEDQIEIFSFTQIDPIESGSVPTLDLAFNFCNSD
EIGCRVASLFAPFWMLNKTGIPLTYKIGDNLTIHPPEQQVPVLLCFKPKTLFSKKKLSLA
FGDSKFSDSFSIDAVGNKGNVIAKGKDKLNYCASIEIELSSFGFTKIVTVSPFYSIVNKS
NLDLEISEDDEEWIVVQSRSTRSLWPKTSKECSLFFRLPGHQAESSRPISLKDSVSILLR
VSDRLVVVNVDITDNSVVIQLTNYFPGSAPVRIFNTLEDLSVDFGQNLVSYRKRIPPLHC
TYFTWHDPSISPLSLIWSTQSSEEVVIDLAHDAIGESEQGDIYWACFLYGKQRILLITRD
QLLAQSTLKQTEFIKPLFDVEILLRGIGISLVNNDNLKEIAYIGITSSDILWEVRKQRGK
RFKPLSVKQIEALENAYQKFLRRDEISGALKIPKSEHKSNIFLVETLKVDFSDIENMRLL
EPYKGFLRRNSASGIWCTVSISEHIIQFHSKINRIQIDNQMNDCIFGIVMCPITPPRSLA
IDRAPKAFFEVSTVIQKQLNMFRFNFIQVLIQEFLIQIDGDFLIALTELVSLQRKRSISF
EKMIQDTMKKCLEDTTDYTEIPVSSKNYYDSIHFSPIKVHVSFNLGDADSFQLFGVFDFL
IKSAGVTLTEFKDVLFKIDYFERRNILLSDSELIYLAIGHYVRQVLKQFYVVVLGLDVIG
NPVGLFLGLKQGVGDFFYEPFVGIIEGPEEFAEGLAIGVRSLVSHTVGGAAGALGKITGT
LGDGISTLTMDQEARRKRRERINKKQSFAQSSKDLARGFFTGITGVVTKPMKGAQQEGFE
GLVKGFGRGVVGIIADPATGVIDFTSGSLNALQRAVDINAEAEKQRPTRHFHIDGVLRPY
NRHEAIGKSILRDVDKGRFASTDNYVAHCHLTPETVLLITDNRVMYLKQSFLSKCLDLEW
HEAYDNVAQVEVVDGTNILITLKEHKRKLGGLMSGEGTHLIHCPKADIAKALSQKIINVK
KSGP
NT seq
9555 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtttttgaatctttaacttctaacctactcaacacttatctcaatgagtttattgat
gatctttctgctaatcagttaaaaatcggtgccttcacaggtgatgttgagttgaagaat
ttggcaatcaaaggaaatgcctttgactctcttaatttacccttcagagttgtctatgga
cacattggaaaattcaaggctcgagtgccttgggtgtcgctttacaccagcccggttgtc
ttcaccgtttcagatgtattcatagtctgtgttcctaatgttgagagcaaatatgatgct
gaagttgagaagaagcaaatggatgcagagaaaaagaagcaactgaaacaaattgaagaa
gcaatgaagactgcccagataaaagaatcggacggtgaacaagcccaaggtgacgatttt
gttaccaaattggttgctcaaattatgagaaatctagaaattcaagtcgacaatgtccat
atttgttacgaggataaatttactaatcccaagtcaccattttctataggcttaacattg
agtcgattagcttttgtaacatctcaagaaacttgcactaaatatacttcatcaaaccag
gagaactcttttcttaaggaaatctcattggaatacttatctgtctattggaactgttca
gaagatatgaaattcatctcagatttgaaagaagaagacatggatcgtgagttcatgtgg
agaatcgctagcaaatggaatcgacccaaagatttaacctatgttttaaggccgaataat
ttcaccgcaaaaacatttatcaatagaaaacctaaagaagaagattttaaagttcctatg
ttcgacattgatatgttactggaccaatttactttggcctttaacagaggacagtttgaa
tcttttcttcttcttctcgactcagttgatcgtatgaaattagcagctccttatcgtcaa
tggcgaccacatcttccgataaagggaaacgcccgagtttggtggaaatttgttcaaacc
gctattctagaaacggaaatacgacaacgaaatcgtgtatggagttggtcttacataaaa
gctcatcgacaactaatgaaagaatatgaagaaacctacagaaaacatcttcttacacct
aaaaaagtaaaacaaggtttgattgatgaattagaatcaaaattagatgttttcaatata
attttggttagaagtcaagttgatttggggattgaaaaaatgcaagctgaaaaagctgaa
gagactaaaagcggtggatggctttcatgggtttggggttcatccaaaaaagatgatgaa
ggttcattgacaaaacctatcttggatgagattaagaaagaaatgacttcggatgaaaaa
ggaaaattatatgcagcaattggttatgaagaatctgttcctgccgagtatccgcctttt
tacgaagcgtatcttgtagcaatcaaattacgagccattcaaatttgtattttcgatgag
aaaaaagaggccaacatcatatcgttcggtttgaatgatgtcgcaacacaacttggctac
cgaccatctagtaatggagttcgtgttggtactactgttcgtgcaatagaccttaaagga
gttggtgaaaatcaacttgtgactaatcaagtttgtgatcaagatttgttagagattata
ttggaaacaaatccattggatgcttcatttgattatggggcaacaataaaagctcgaggt
gtggacgttatgtaccatgcacaaactttcaatgcactgtttgatattataacaccacaa
gaagatgtatcacttgaccaaattcaagcattagctgagataaagttcaaccagtttaaa
ttgatgtcggtgacaggattagagtatgcaattgagaaacacaatactctgaaaattgat
attgttattgaaccatcgtacatagttattcctgaccgtggctgtgttaatgattgtgaa
aacgtcttgatcctgtcttgtggtgaagttgctgttttctctgagttcactgacgattca
acctcatcattgcgactaaagtaccaagactctggcgaagaagctttaattaacgcagtc
cgtgaaagtgcatacgaaagattccgtttgaaagtctcccgaactcaaattattctgaca
acaggtgaaaattggagaaatgacttggcagaaagtagaacacaaacaacaccttctgtg
aataatttactcgaaccttttggacttgaactttgtttaatgcgttctatcatcgctgat
gatcctcatatgcctcaaatgagaatcgaagggacgattccatcgatatttttcaaagct
cgtaatattcaattatgtcgactgtttaacttacttctcacagtgcctactcctaaaaag
tcagaaactatgcatattggacctaaaatagagagtaatgaagtgcacgaagccaaggcg
acaactgatgccttgaagatagctcaagaaacagccaaacttgaagctagatcatctaaa
attcaaatgactcatcttgttttaaatttcaaagttgaatcattaacctgtgatctccaa
actgaccatggagttgaactgctactacttcgtgttaaaagagtaggaactgaaatattt
gtcaaaagctttgatacggttgtcgacttattcctgggtcaaattctagtccaagttcat
gatcttgatgtagccggttcgccagtcttcaagcttatcgaaactatcgaaaatgaaaat
ttgttgcagctcaaatataaatcaaccttaaagaatggtccaacttttgaagatgttatt
caaagcattgatattcaaatgtctcaatgtaaattattcattgattcgcccattttggat
gaacttcttctatacacacaaaaaattgccaacagtttaccatccaccaacgacgatgtt
gatcgagccctcactagaagaagaccttcagtctctagtcaaattagtaccacaattctt
gccggtatcatggttaaacctaaaaagaaacatgcagaaatgtgtaaagtaattaatctc
cgaactaaaatctgtgtggatagtgttgttcttgcaattggcggtatttgttcaacaacc
ttgaaaggtttagaagctattttaacaatttatgaaactggacgactcaacatgaaagct
ttttggaatgattttgccatccttaattgtgtccgtgatccaagtaatcctcgtttgcta
gatcgtaaacttgtccatgaacatattcttgtttcgcctggtaaaagagttctagaactt
gaattgaccatgtttacccctacagagacaaaatactcacctggtaatgttgatatgcag
ctaaatgttcaatttgggcgtttaaagattgtgtttttaaatgaatttgtcgttcgctta
atgaactttttggccgtttttgaaacagccaaaaaacgtgcaattgcagcttcttctgcc
gcagccggattcgctaaacagacagctcttgatgcttaccaaaatgcaacaaaaattggt
cttaatgttgtattagaagctcctttaattgttatccctcgaaattgggagtccaaacat
tgtatccttgtggatcttggtcgaatcggtataagcaatagaatcgaatctactcattct
aacttactggatcatattaaatgtgaattaaccaacacccatgtcttcatgagcacagat
gatcgtgaagataatattgatagtattgttaaacccatcagctttaatctttcagcgatt
cgaaatctcaactttgaaggaaacaaacagatccctgaattaaaactcagtgctactttg
gaagaaatttattgtcaaatctctcaaaccaatcttatgctaatgatgagcattctcaat
gaaaatgtatctgctgggtatgaaattaaccaacctgttggcgaagatgttacttgttct
gctatagttccaactgctgctgagcctcgaacgaaaaaaatcaaaacgaaaaaacttcac
ccttcgtatactgaagtgtctttgccattatcgacaacaaccatcgtggaagaagctgtg
gttcatgttgatgcaattgaagaggaaaaagtttcagagcaaatattttctcgttaccaa
gtatcgtttgcgatgccaaaggttgatcttgtcttgtatcaagaagaggttaaaagtgtg
caaaataagttgaccaacgcttatctggcaggtttcgatgttaattgcgagatgaatacc
gatgattcgttaactcttaccatgacaatgagtgatattgttttatgtgacgaaagacca
tccaaaaataagcgattacgaaaattgatgtattgtaatgattatatctcaacatccaat
ggttctcaaggaaaaacgctcaagatatatttcaaaaaagaaaaggatacaatcgtaaac
atggaaatgtcaggatttacgcttatatttgctcttgattaccttcttcaactgtctaac
attgtcacctcgtccttgcaaggtttaccttccgattctgctaatgcagtttctacagat
tttcaatctttaactgcatctactcgagaaggaatcaaagcaagggttgccgaattatct
cctgataaaatgtacattagcagacctattgatactccattaatgactattagatttacc
atgtctgaagctgatattgtactgattgagtctacggaaatggaaaatcctccagcagtt
atcttcaatagtttaatggattttgatgtaaaaatgaaggatgatgtaatgtctcttaaa
ggttcaattggtcatattcagttaggaattaccagtcttgaaaattaccagaaaaccaaa
aaagtagataattatattgttcgtcctttcgagatttatttgattgctgaaatgaatgga
tcatcttcacagcacattgatatcgattttaccgatattggtttattcatctcacccaat
acaatacaaattttaatgtccattatgagtgctttgggacaatcctctgaagaaaaatct
gatgaccaagatgaagataaattacgagaagagttggcaatatttttgcctaaaccatta
tctgctgttacaaaatacagtttcttacattactctgttgcccctgcaatcgaagcgact
gaagatttaacttttgatgagcctgactctaagaaagttgacttcatcttgcaacaatta
gttgtcaaggttaaaaatatttctatcactattgaatctggtggaatggattcgcaacca
ttaatcaaactgatctcatcacatacaatcattcttgacaattggaataaattaaacatg
aactcatcttgctacatggattattataacgagaaaacttttgcttgggaacctatcatt
gaaaccattgacacagaaccctggttctttgatttgaaagcaaaaatagtttctgaagaa
ggtgcaaattcacgaataagtgcttttctggaatccaaatcgcagttagagatgacattg
agtaaatcagcaattagtgttatcactgatctaggccaagcattcaccaatgttgttaaa
caacctgatacctcattacttggacaaaatttgattgagttttcaaatttcactggaatg
gacctttcaattgttgtggacacacgaaaatttgttcacgatctacctgatgcaattaaa
atggctgattatcacgaaaaaattgaaattaaaaatggtcaagtggctaaattaaataac
ttacgagaaaccgcatttgaccatgacaacgaagttgtttgtgagctttcgcataaaggt
caaaccataaccagacgattttctttgcgaggaactgaacgtaaatgtttccgatttcca
ttgttaagttatccaggagatgagtatagatggatgtttgatattggacatcgtgattct
cgaacaaaacgggtcatatttggatctactgttgaaattaccaatcattttcacatacca
ttgagattgtactatattgatatttcgggtaacatggaagaatacacttttctttatcag
attgaacccagtgcatcatattttcttccagttgacattgtctattctaaataccaatgt
atttttgtaaagccgagtgatgattattgtacacctcgagatgcaatttgttggaaagcc
aaagaggttaaagcattcacacacttcttctccacaattacgtgtgaatctaagaaaaaa
gaaccagattttttcattcgtgttggctgtaagacagaaaatgtactttttgaagatacc
caaagatcagctccagattgtttctgttataagtttaacatttatcctgttttgaagctc
cgcaatctattacctttcagtatttcctattctctcgaatttccagatgaacaatcaccc
aaagaaggaacgataaagcctggtgaggctcacaacttaagtaatttgaatatgaaaacc
aacaaaattgtaatcgtattgaacgattatcgaggtaaaaaatgggtctgtcgaaacaag
tttccagttcgatggatgaaagaagatcaaattgaaattttttctttcactcaaatcgat
ccaattgaatcaggatcagtacccactcttgacttggcatttaacttttgcaattcggat
gaaattggttgtcgtgttgcttctctgtttgcaccattctggatgctcaataaaactgga
atcccgttgacttacaaaattggtgataatttaactattcatcccccagaacaacaagta
cctgttcttttatgtttcaagcctaaaacgttattcagtaaaaagaaattatctcttgcc
ttcggggattcaaaattttcggactccttctcaattgatgctgtgggtaataaaggaaac
gtaattgctaaaggaaaagataaactaaattattgtgcttcaatagaaatcgagttaagt
agttttggttttaccaaaatagtcaccgtttcaccattttactcgatcgtaaataaatca
aatctagatttggagattagtgaagacgacgaagaatggattgtagtgcaaagccgtagc
actcgttctttgtggcctaaaaccagcaaagaatgttctttattcttccgattacctgga
catcaagccgaatcctcaagacccatttcactcaaagattctgtctctattttacttcga
gtatctgatcgtttggttgttgttaatgtagatattacagataattcagtggtcatccaa
ttaacaaattatttccctggctcagctccagtaagaattttcaacaccctcgaagatttg
tcggttgattttggtcaaaatttagtttcttaccgcaaacgaatcccacctcttcattgt
acttactttacatggcatgatccatctatttcacctctaagcttgatttggagtactcaa
tcgtctgaagaagttgttattgatttggctcatgatgctattggtgaatctgaacaaggt
gatatttactgggcttgctttttgtatggaaagcagcgaattttattaattacaagagat
caacttcttgctcaaagtacccttaagcaaactgaatttattaaacctttatttgatgtc
gagattcttttacgaggaattggcatctcattggtaaataatgacaatctcaaagaaatt
gcttatattggaatcacaagctctgacatattatgggaggttcgaaaacaacgtggcaaa
cgttttaaacccttatctgtgaagcagattgaagctcttgaaaatgcatatcaaaagttt
ttgcgtcgtgatgagatttctggtgctcttaagatacctaaatctgaacataagtcaaat
atctttttggttgaaactctcaaagttgactttagtgacattgaaaatatgagacttctt
gagccttacaaaggattcttacgtcgtaactctgctagcggtatctggtgtaccgtttct
atttctgaacatatcattcaattccattctaaaattaatcgtattcaaattgacaatcaa
atgaacgattgtatatttggaatcgtcatgtgtcctattacaccacctcgttccttagct
attgatcgtgctccaaaagccttttttgaagtcagcacggttattcaaaagcaacttaac
atgttccgattcaactttatacaagttttgattcaagagttcctgatacagatcgatggt
gattttctaattgccttgactgaacttgtttctttacaaagaaaacgaagcataagtttt
gagaaaatgattcaagacacgatgaaaaagtgtttagaagatacaacagattatactgag
attcctgtttcatctaaaaattattatgattcaattcatttctcacccataaaagttcat
gttagttttaaccttggtgatgcagactccttccaactcttcggagttttcgatttcctc
ataaaatcagcgggtgttactctcactgaatttaaagatgtactattcaagatagattat
ttcgaaagaagaaatattcttctcagcgattcagagcttatttaccttgccattggtcat
tatgttagacaagtgttgaaacaattttacgttgttgtattgggcttggacgttattggt
aatccagttggactgtttttgggccttaaacaaggagtcggtgactttttctacgaacca
tttgtgggaatcattgaaggacccgaggaatttgctgaaggtcttgctatcggtgttcgc
tcattggttagtcacactgttggtggtgctgctggagctttgggtaaaattactggtact
cttggagatggtatttcgacacttactatggaccaagaagctcgccgaaaaagacgagag
agaatcaataagaaacaatcgtttgctcaaagtagtaaggatttggcgcgtggatttttc
accggcataactggtgttgttaccaaacctatgaaaggggcacagcaagaaggttttgaa
ggattggttaaaggttttggtcgaggggttgttggtattattgctgacccagctacaggt
gtcattgattttacttcaggatctcttaatgctttgcagcgtgcagttgatattaatgct
gaagctgaaaaacaacgtcctactcgtcatttccacattgacggagttcttcgtccttac
aatcgccatgaagccattggtaaatcaattttacgagatgttgacaaaggaagatttgca
tcgacagataattatgtagctcattgtcatctgactccagaaactgttctgcttatcact
gataatcgagttatgtatctcaaacaaagtttcctatccaaatgtcttgatttggaatgg
catgaagcttatgataatgtagcccaagttgaagttgttgacggaaccaatattctgatt
actttaaaggaacataaaaggaaacttggaggtttaatgtctggagaaggaactcattta
atacactgcccaaaagctgatatagctaaggcattaagtcaaaaaataataaatgtcaaa
aaatctggtccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
