Tenacibaculum vairaonense: T19A02B_0238
Help
Entry
T19A02B_0238 CDS
T11462
Name
(GenBank) conserved protein of unknown function precursor containing a type A C-terminal secretion signal
Organism
tvai Tenacibaculum vairaonense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LTD
Por_Secre_tail
TP_1001_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL2076305
LinkDB
All DBs
Position
T190524A02B:complement(276666..279593)
Genome browser
AA seq
975 aa
AA seq
DB search
MKQNYFLRIFSLLMLLNSFIFLNAQTLSSGDIAIIGVGVDNEEVLLVALKDIPANETVFF
TDEEWGGTSFNSGEGFVQWTTTAINAGTTVTISFNSDSSTDGGTITNITGSLVLGNSGDG
MYIYQTADNLYNGTPTILGFAGEDSGDAGTLTGTGLTLGTNAVYFGGDNGIYTGARTGGN
QASYLSLIYDSANWTTSGSSQTFDTTLFSLSSDQAINFDTSSSTENETDTNFNTSIPVTL
SNYTADVTISVSVNASSTAESGDYTLNTTSLTFTGNGTQNISLDINDDADMDNETVILDI
AVTSGTANITTDTHTVTIQDDDLPEVMFSEIMYNTPTSGGTDDEWIEITNNSGGTITLTN
WTIEYSGGTFTFPSAVINNGQYITIALGSNGDGTFNNDAPFPPDFNDLGVTNDAVKDTDN
TNNLTNSSGTITLKNDSGTTIDTVFYDDGHVSSTDGNGDSYELINVNNNNSSTSSNWQGS
IKDGGSPKRASGATWTGTTSNDWANSNNWLNDTNPSFSSDVLIPNTVTNYPTASSFIITN
SITFEEGASLITSSFVNGTITYNRSLTTNWHLIASPVINETVEDIISNHSLATGSGSNVG
LGFYNNSGANAWTYQTSTSTGTINEGTGMIIKLDAAGTVKFSGDFNKDPITIGLTTGDRT
SFNLIGNSFTAYVNSTAFLNSISNAPTFSEQTVWLWDGTQYITRNLANPIEIAPAQGFFV
KAAINNNVFLNPSMLSHQGTDTFMREEPKTNIELFVESNNVKKSTDLFYINNTTTTFDNG
YDSSVFDGVSENFNIYTQLLSNPNNEIKKLAIQSLPNNNYENMVVPVGITSEAGKEITFS
ITTTNLPNTIEVYLEDRLNNVFTNLSKENYKVVVNGSTTDQFYIHTTSQKLGVDSFENSL
ENIRIYQSSKNELTVTGLSSKVNNIHVYSIVGKSISSIKTNGNNTTISLPRASTGVYLVE
ITSEVGKTSKKIIFE
NT seq
2928 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaaactattttttaaggatatttagccttctaatgctccttaactcatttatt
tttttaaatgcacagacattaagctcaggggatatagctattattggagtaggtgtagat
aatgaagaagtattacttgtagctttaaaagatatacctgcaaatgaaaccgtttttttt
actgatgaagaatggggaggaacaagttttaattctggagaaggattcgttcaatggact
actactgctataaatgcaggaactactgttactatttcttttaactcagacagttctact
gatggaggtacaatcaccaacattactgggtctcttgttttagggaattcaggcgatggt
atgtatatttatcaaactgctgacaatctttacaatggtactccaacaattttaggattt
gcaggagaagatagtggtgacgctggtacattaacaggaactggtcttacacttggtaca
aatgctgtttattttggtggagataatggtatatatactggtgctagaacgggaggaaat
caagctagttatctttctttaatttacgatagtgctaattggactacctctggaagctca
caaacttttgataccactttattttcgctttcttctgatcaagctattaattttgatact
tcttctagtaccgaaaatgaaactgacacaaactttaatacttcaatacctgtaacttta
tctaattatacagctgatgttactattagtgtttctgtgaatgctagtagcacagctgaa
agcggtgattacactttaaacactacctctttaacttttacaggtaatggaacacaaaat
atttcattagatattaatgatgatgctgatatggataacgaaactgtaatattagatatt
gctgtaacctctggaacagctaatataacaactgatacacatacagtaactattcaagat
gacgaccttcctgaggtaatgttttctgaaattatgtataatacgcccacttcaggtggt
actgatgatgaatggattgaaattacaaataacagtggaggaactattactttaacaaac
tggactattgaatatagcggtggtacttttacatttccttcagcagtaattaacaatggc
caatatattaccattgctcttggtagtaatggagatggtactttcaataatgatgcacct
ttccctcctgattttaatgatttaggcgtaacaaatgatgctgttaaagacactgacaat
acgaataatttaactaattcatctggtactataacacttaaaaatgatagtggaactact
atagatactgttttttatgatgatggacacgtaagttcaaccgatggaaatggcgattct
tacgagcttataaacgttaataataacaactcttctactagctctaattggcaaggtagt
attaaagatggaggatctcctaaaagagctagtggtgctacttggactggtacaactagt
aatgattgggctaatagcaataactggctaaatgatacaaatccttctttctctagtgat
gtattaattcctaatacagtaactaattaccctactgcttcaagttttattattactaat
agtataacttttgaagaaggagcatcgttaataactagttcttttgtaaatggaacaatt
acttacaacagaagcttaactacaaactggcatttaattgcttctcctgttattaatgaa
actgtagaagatattatttcgaaccatagtttagctacaggttctgggtctaatgttggt
ttagggttttataataatagtggtgctaatgcatggacataccaaactagtacatcaaca
ggtacaattaatgaaggaactggtatgattatcaaactagacgctgctggcactgtaaaa
tttagtggagactttaataaagacccaatcacaattggcttaactacaggagacagaact
agttttaacttaattggaaattcttttactgcgtatgttaactctactgctttcttaaac
agtattagtaatgcacctacatttagtgaacaaacggtttggttatgggatggtacacaa
tacattactagaaacttagccaatcctattgagatagcaccagcacaaggattctttgta
aaagctgctattaataacaatgtatttttaaatccttcaatgctttctcatcaaggtact
gatacttttatgagagaagaacctaaaacaaacattgaattatttgtagagagtaataat
gtaaaaaagtctactgatttattttacataaataacactactactacgtttgataatgga
tatgatagtagtgtatttgatggtgtttctgagaacttcaatatatatactcagttatta
tctaatccaaataacgaaattaaaaagttagctattcaatcattacctaataataattat
gaaaacatggttgttcctgttggtataacttcagaagcaggaaaagaaatcactttttct
ataacaacaactaatctacctaatactatagaagtttatttagaagatagattaaataat
gtatttactaacttgtctaaggaaaattataaggtagttgttaatggatcaactactgac
caattttatatccacactacctctcaaaaactaggggttgattcttttgagaattcttta
gagaatatccgtatttatcagtcttctaaaaatgaattgacggttactggtttatcttca
aaagttaacaatatacatgtttattctatagtaggtaaatctattagctcaattaaaact
aatggtaataacacaaccatttctttacctagagcgtcaactggtgtatatttagttgaa
attacttctgaagtaggtaaaactagtaaaaaaataatttttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
