Tenacibaculum vairaonense: T19A02B_1733
Help
Entry
T19A02B_1733 CDS
T11462
Name
(GenBank) conserved protein of unknown function precursor containing a T9SS type A C-terminal secretion signal
Organism
tvai Tenacibaculum vairaonense
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NHL
TEN_NHL
YDG
SGL
MBG_2
Vgb_lyase
Por_Secre_tail
SBBP
FN3_DSCAM-DSCAML_C
Colicin_E5
DUF3124
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL2084730
LinkDB
All DBs
Position
T190524A02B:complement(2100635..2105365)
Genome browser
AA seq
1576 aa
AA seq
DB search
MRKITFFLTMLVTLFFISHAFSQRTKKTITNTVPNFITTAITSVKEGEIYTYTIDASDVD
GDVVSVTAPTKPNWLSLATKSGGEVTTFAGISGTFGHVDGTGTAATFGQPSSIVFDASGN
LYIAEYGNHTIRKITPNGEVSTFAGLADFTGTTDGNGTSARFNLPIGLTIDASGNLYVTD
QGNHSIRKVTPSGEVTTIAGSGGIGSADGNGTSASFNSPVGITVDNSGNLYVSDTGNHAI
RKITPSGEVTTIAGTKGTLGTVNANGTSASFHFPYGIIIDSSENLYVAEGGNHTIRKITP
NGDVTTLAGTMGVSGTTDGNGTNATFNTPTGMVKDKVGNIYVTDLQNHAIRKITPNGDVI
TIAGIIGTSGIVNGNGTSASLSQPIGVAINPSGNLFITEFDKYTVRKLTLPSATLTGDST
GNAGVHNVVLEANDGNGGITQQSFTITVKVAPSVTTNTVSLIGVNTATLNAEVTANGGDA
ITERGFVYALTSEDATPTLAEVNGTTIIKQVVVGTTGVFTKELTGLIANSEYSVVAYATN
SAGTTEGSVQTFTTTNTAPTITSTAAATVNEGNTYNYVVTTNDADGDVVTVTAITKPDWL
SLTTTSNVTTIAGAPGTTGAIDGNGNDALFDRPIGTAVDASGNLYIADTNNHRIRKITPS
GEVSTFAGSTQGFADGTGTAAQFRSPRGIVIDASGNLYIADNNNHRIRKITPAGVVTTLA
GSTQGYTDGTGVAAQFYFPSGLTIDKSGNLYVADQLNHRIRKVTPTGVVSTFAGSTAGFT
NGNGTSAQFNEPFSIDIDASGSMYVVDRLNHSIRKITSSGEVSTLAGNGTGGFADGNGAS
AQFNSPFDVALDVYGNVYVADFINHRIRKITTTGEVSTVAGTGTVGNTNGAATEATFNFP
AGLDVDTYGNIYVADYYGHAIRKITAPIITLTGDTKGSEGNHNVVLEANDGNGGVVQQTF
TIEVKAKPTVVTGTVNMIAKNGATLQGTVINDGGATITERGFVYALTANDASPTLAEVNG
TTVKKVLVSGTTETFNSAITGLENNRAYSVIAYATNMVGTTEGEVKTFNTLHISFEAVTK
TYGEANFDLAAGSNSSGSISYAIVEGGTGSAELSGVNNATVNIGNAGTVTIRATQAAAGN
FSTGSQDMTLTIEKATLTITPKQQTKTYGSNYTLTNMVSYTGFVNGDNAGDLAATPTVIS
LSDLEGNTTAGVNTYTEVLSVAAFTDSNYEITFGKGNFEITTKQLSVEDITGANKVYDGT
ITASVIGTANLVGVINSDNVSLAGTPVHNFVKATIGTNIEITTTGYSLTGADAYNYTVKQ
PNLSATITAKELEIVGLQGVNKVYDGTTNALATGTASLSGVIDGETVSVIGTPVYTFASK
NVGLGIAITTTGYSLTGTDTSNYILTQPSLSGAITAKLITVTADAKTKEKGAEDPELTYQ
ITTGELVGVDDFSGSLEREEGEEVGDYVIRQGTLAVSDNYSITYKEALFTITKALSIREF
SVNTDITLYPNPTSGIVNIKSEKGIAINKVVLYNVLGRALNTFNKEVLDISTLKAGTYIL
RIETEKGVGVKRIVKD
NT seq
4731 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaattacttttttcctaaccatgttagtcaccttattttttataagtcatgct
ttttcgcagcgtactaaaaaaacaataactaacacagtgccaaactttataactacggca
attacttccgtaaaagaaggagaaatatatacatacacgattgatgctagtgatgttgat
ggagatgttgttagcgtaacagcacctacgaaacccaattggctaagtttagcaacaaaa
agtggaggagaggtaactacgtttgcaggtatttcggggacatttggtcatgtagatggt
actggtacagcagcaacttttggacagccaagttcaatagtgtttgatgcttcaggaaat
ttatacatagcagaatatggaaatcataccatcagaaaaattaccccaaatggtgaagta
tctacctttgcaggcttagctgattttacaggaactacagacggaaatggaacgtctgct
agatttaatctgccgattggtttaactattgatgcttctggtaatttatatgtaacagat
caagggaatcattccattagaaaagttaccccaagtggagaagtaacaacaatagcaggt
tctggaggtataggaagtgcagacggaaacggaacatccgctagttttaattcgccagtt
gggattacagttgacaattctggtaatctttatgtatcggatacaggaaatcatgccatt
cgaaaaattaccccaagcggagaagtaactacgatagcgggaacaaaaggaactttagga
actgtaaatgcaaatggaacgtcagctagttttcatttcccatatggaattattatagat
agttcagaaaatttatacgtggcagaaggaggtaatcataccattcgtaaaattacaccg
aatggagatgtaaccactttggcaggaacaatgggcgtatcaggaactacagacggaaat
ggaacaaatgctacatttaatactcctacaggaatggttaaggacaaagtagggaatatt
tatgtgacagatttacaaaatcatgctattagaaaaattaccccgaatggagatgtaatt
accatagcaggaatcattggtacctctggaattgtaaatggcaatggaacatctgcaagt
ctttctcaaccaataggagtagctataaatccttcaggaaatctttttatcactgaattt
gataaatatacagtaagaaagttaacattgccatcagcaacattaacaggagatagtact
ggtaatgcaggagtgcataatgtggtattagaagctaatgatggtaatggaggaattaca
caacaaagttttaccattacagtaaaagtagctccatcagtaactacaaatacagtaagt
ttaattggtgtaaatacagcaacattaaatgcagaagtaacagcaaatggaggagatgcc
ataacagaaagaggttttgtatatgcattaacctcggaagatgctactccaacactagca
gaagtaaatggaacaacaattataaaacaagtggttgtagggactactggggtttttact
aaagagttaacggggttaattgctaatagtgaatacagtgtggtagcctatgctactaat
agtgcgggtactaccgaaggtagcgtacaaacatttacaacaaccaatacagcacctacc
attacatcaacagcagcagctactgtaaatgaagggaatacgtataattatgtagttaca
acaaacgatgcagatggagatgtggttactgtaacggctataaccaaaccagattggttg
tctttaaccactactagtaatgtaactactattgcaggagcacctggaacaactggagct
attgatggaaatggaaacgatgcactttttgacagaccaataggtacagcagtagatgca
tctggtaatctatacattgcagatactaataaccaccgtattcgaaaaataacgccaagt
ggagaagtgtcaacttttgcaggaagtacccaaggattcgcagatggaactggtactgcg
gcacagtttcgttcgcctagaggaattgtgatagatgcctcagggaatttatatatagcg
gacaataataatcaccgtattcgaaaaataacaccagcaggagtagttacaactcttgca
ggaagtacccaaggatatacagatggtactggtgttgcagcacaattttattttccttct
gggttgactatagataaatcaggaaatctttatgtagcagaccaacttaatcatcgtatt
agaaaagtaacaccaactggagtagtaagtacatttgctggaagtacagccggctttaca
aacggaaatggtacatcagctcaatttaatgaaccattttcaatagatatagatgcttca
ggttctatgtatgtagtagataggttaaaccatagtataagaaaaataacatcttcaggt
gaggttagtactcttgcaggaaatggaacaggaggttttgcagatggaaatggagcatca
gcccagtttaactctccatttgatgtggcattagatgtttatggtaatgtttacgtagcg
gattttattaatcatcgtatcaggaaaattactacaacaggagaagtgtcaacggttgct
ggtacaggaactgtcggaaataccaatggagcagctacagaagcaacatttaattttcca
gctgggttagatgtagatacctatgggaatatctatgtagcagattattatggacatgcc
attcggaaaattacagcaccaataattacgttaacaggagatactaaaggtagtgaagga
aatcataatgtggttttggaagcgaacgatggtaatggaggcgtagtgcaacaaactttt
acaattgaagtaaaagcaaaacctaccgtagtaacaggtacagtaaatatgattgctaag
aacggagcaactttacaaggaactgttattaatgatggaggagctaccataacagaaaga
ggttttgtatatgcattaaccgcaaacgatgcaagtcctaccttagcagaagtaaacgga
actactgtaaaaaaagtgttagtgtcaggtactacagagacatttaatagtgcgataact
ggcttagaaaacaatagagcttatagtgttatagcatatgctaccaatatggtaggaact
actgaaggtgaggtaaagacatttaatacacttcatattagttttgaagctgtaactaaa
acctatggagaagcaaactttgatcttgcagcaggctcaaattcatcaggtagtattagt
tatgcaatagttgaaggaggaacaggttctgcggaattatcaggagttaataatgctacc
gtaaatataggaaatgcaggtacggttactattagagcaacacaagccgcggcaggtaac
ttttcaacaggaagtcaagatatgaccttaactattgaaaaagcaactttaactattaca
ccaaagcaacaaacaaaaacttatggaagtaattacacattaacaaatatggttagctat
actggttttgttaacggtgataatgctggtgatttagctgctactccaacagttatttct
ttgagtgatttagaaggaaatacaacagcaggtgtaaatacatatacagaggttttatca
gtagcagcttttacagatagtaattatgagattacctttggtaaaggtaattttgaaatt
actactaaacaattaagtgttgaagacattacaggagctaataaagtatatgatggaaca
ataacagcatcagtaattggaacagctaatttggtaggtgtcataaattcagataatgta
agtttagcgggtacgccagtacacaattttgtaaaagcaaccataggaacaaatattgaa
attactactacaggatatagtttaactggagcagatgcctataattatacagtaaaacaa
ccaaacttatctgcaactattacagcaaaagagttagaaatagtaggtctgcaaggagtt
aataaggtttatgatggaacaacaaacgcattggcaacaggaaccgcaagtttatcaggt
gtaattgatggagaaacggtaagtgtaattggtacgccagtatatacttttgcatctaaa
aatgtaggattaggaattgcaataactactacaggttatagtttaacaggaacagatact
agtaattatatactaacacaaccaagtttatcaggggcaattacagctaagttaattaca
gtaacagctgatgctaaaacaaaagaaaaaggagcagaagacccagaattaacctatcaa
ataacaacaggagaattagtaggggtagatgatttttctggaagtttagaaagagaagaa
ggagaagaagtaggcgactatgttatacgacaaggaactttagcagtgtctgataattat
agtattacctataaagaagcattatttactataacaaaagcattgagtataagagaattt
tcagtgaatactgatattacattataccctaatccaacaagtggtattgtaaatatcaaa
tctgaaaaaggaatagcgataaacaaagttgttttatacaatgtactaggaagagcatta
aatacgtttaataaagaagttttagatatttcaacattaaaagctgggacttatatactg
cgtatagaaactgaaaaaggagttggtgtaaaaagaatagtaaaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
