Tenacibaculum vairaonense: T19A02B_2090
Help
Entry
T19A02B_2090 CDS
T11462
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-dependent receptor precursor
Organism
tvai Tenacibaculum vairaonense
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL2086822
LinkDB
All DBs
Position
T190524A02B:complement(2474987..2478064)
Genome browser
AA seq
1025 aa
AA seq
DB search
MNSRYRNVICVFLFFSFLLNINAQQKKIAGTVSDSTGPLPGVNVILKGTMNGTETDFEGN
YLINAKQGDVLVFSFVGMKTVEKAVGTQTTINVLLEDDNDMLEEIVVVGYGSVAKKDLTG
AISTIGIEQLEDKPVASVTQALQGATSGLQIVSTGGRTGDATQISIRGNGSLSASNNALY
VIDGVPQEDMTGISPEDIKSISVLKDAASTAIYGSRASNGVVLIQTKRGSYGKGIQVSLN
TSYGIQNIVKRPSLLNSTQYKHISDVARVNYENDIAAGILAGPKDPNSLTPLPTSNYDVD
WLSLVLKENAAVKRHQFSISGGGENTRAYLSASLFDQEGVIKEDTYKIARVKLNMEQKMN
DYIKFGINSNFAFSEATPIVDDNNSYQPYTKALEARPDVSPYTADGKIAEYTFRNPLYAF
ERQLTSKWQNLGGTFYFDVKPVESVVWHSAYSGNIRSNRYNRYDAPNTRRGLNGDGVPTG
YGYYSTDNNRDYLIENTVTFRDSFFNDKLNVNLLGGHSFQKWEYEDSFVEGEGFPSSDLK
WLTSAGEINRGRSYYKAMALESYFTRLQLSWDAKYHLMLSTRYDGSSKFTKDNRWGNFPA
VSAGWTVSNEDFFNVSAINSLKIRGSFGYNGNQSGISYASGQNLIGSGENYDQAPGLAST
SIFNPNLIWEKAEDFNVGFDMTLFNKIDINFDYYQKETQDLLSRINVPQESGFRTMLANV
GKISNKGFEVNVNARIIEKEDFRWSFGGNFSYNKNEVLKVGSETGQYTTGFVSVVKEGNS
LGSFFILEAAGIANESYTYKDKDGNDGYTVAAGDMIYVDQNQDGQINDDDKKVFEGGIAP
IYGGFNTRIDYKGFDLGISGQYSIGKKVYALFKRDLLNGGAVGAPSYSNNMITEMLDYWT
PENPNAANPRPHLASTISSWNTRESTRFLENADYLRISNITLGYSFNFLKDNPKMNFIKS
LRIYAQLVNPFTFTSYSGADPETSYVDQTEENSQDRSDGSKIEAGVDLGGIPNIKSFSVG
LNVKF
NT seq
3078 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattcacgttacagaaacgtaatctgtgtgtttttattttttagttttctactaaat
ataaatgcacaacaaaaaaagattgctggaacagtgtctgatagtacaggtccattacct
ggggttaatgtaatcctaaagggaaccatgaatggaacggaaacagactttgaagggaat
tatctaataaatgctaaacagggagatgttttagtgttcagttttgtgggaatgaaaact
gttgaaaaagcagttggaacacaaacaactattaatgtattattagaagatgataatgat
atgttagaagagatagtggtagttggatatggttcagtagctaaaaaagatttaacaggg
gcaatttctacaattggaattgaacaattagaagataagccagtagcttctgttactcaa
gcattacaaggagcaacttcagggttacaaattgtaagtacaggaggtagaacaggagat
gcaacgcaaattagtataagaggaaatggatcacttagtgcttcaaataatgcgctatat
gttattgatggtgttcctcaagaagatatgacaggtatttctcctgaagatattaaaagc
attagtgttttaaaagatgcagcttctacggcaatttatggatctagagcttctaatgga
gttgttttaattcaaactaaaagaggttcttacggtaaagggattcaagtttcattgaat
acttcttacggaattcaaaatattgtaaaaagaccaagtttattaaatagtacacaatac
aaacatatttctgatgtagctagagtaaactatgaaaatgatattgctgctggaatttta
gcagggccaaaagatcctaattctctaacaccattaccaactagtaattatgatgtagat
tggttgtctttagtattaaaagagaatgcagcagtaaagaggcatcagtttagcatatct
ggaggtggtgaaaatacaagagcttatttatctgcttctttatttgatcaagaaggagtt
attaaagaggatacttataaaattgctcgtgtaaagttaaatatggagcaaaaaatgaat
gattatataaagtttggaataaactcaaactttgcattctcagaagctaccccaatagtt
gatgataataattcataccaaccgtatacaaaagctttagaagccagaccagatgtgagt
ccttatacggctgatgggaaaatagcagaatacacttttagaaatccattatatgctttt
gaaagacagttaactagtaagtggcaaaatttaggaggaactttttattttgatgtaaag
cctgtagagagtgtagtgtggcattctgcttatagtggaaatattagaagtaatagatat
aatagatatgatgctccaaatacacgaagaggtttaaatggagatggtgtgccaactggt
tacggttattatagtacagataacaatagagattatttaatagagaatacggtaactttt
agagatagctttttcaatgataagttaaatgtaaatttattaggaggacattcatttcaa
aaatgggaatatgaagactcatttgttgaaggagaaggttttccatctagtgatttaaag
tggttaacttcagctggagagattaacagaggtcgtagttattataaagctatggcttta
gaatcgtactttacaaggttacaattatcatgggatgctaaatatcatttaatgttatct
actagatatgatggttcatctaagtttacaaaagataatagatggggtaatttccctgct
gtatcagcaggttggacagtttcaaatgaagatttctttaatgtctcagctataaatagt
ttaaaaattagaggttcttttggttataatggtaaccaatcaggtatttcttatgcgtct
ggtcaaaacttaataggctcaggtgaaaactatgatcaagctccaggtttagcttcaact
agtattttcaatccaaatttaatttgggaaaaagcagaagattttaatgttggttttgat
atgacgttatttaataagattgatattaattttgattactatcagaaagaaactcaggat
ttattaagtagaattaatgttcctcaagaaagtggttttagaacaatgttagctaatgtt
ggtaaaatttctaataaaggttttgaagtaaatgtaaatgctagaattatagagaaagaa
gatttcagatggagttttggaggaaatttttcttataataaaaatgaggtgttaaaagta
ggttctgaaacgggacaatatactactggttttgtatctgttgtaaaagaaggtaatagt
ttaggttctttctttattttagaagctgcaggaatagctaatgaaagttatacatataaa
gataaagatggaaatgatggatataccgtggctgcaggtgatatgatttatgttgatcaa
aatcaggacggtcaaattaacgatgatgataaaaaagtttttgaagggggaattgctcca
atttatggaggttttaacacaagaattgattataaaggatttgatttaggtattagtgga
cagtattctattggtaaaaaagtatatgcattatttaaaagagaccttttaaatggaggt
gctgtaggagctccttcttactcaaacaatatgataacagaaatgttagattattggacg
ccagaaaatccaaatgctgctaatccaagaccacatttagcatcaacaatatcttcatgg
aatactagagaatctacaaggtttttagaaaatgcagattatttaagaatatctaatatt
acattaggatatagttttaatttcttgaaagataatcctaaaatgaactttattaagtct
ttaagaatttatgcgcagttagtaaatccatttacttttactagttattcaggagcagat
ccagaaactagctatgtagaccaaacagaggagaatagtcaagatagatcagatggaagt
aaaattgaagcaggagttgatttaggaggtattcctaatattaaatctttttcagttgga
ttaaatgttaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system