KEGG   Tenacibaculum vairaonense: T19A02B_2090
Entry
T19A02B_2090      CDS       T11462                                 
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-dependent receptor precursor
Organism
tvai  Tenacibaculum vairaonense
SSDB
Motif
Pfam: Plug TonB_dep_Rec_b-barrel CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg MetallophosN
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAL2086822
LinkDB
Position
T190524A02B:complement(2474987..2478064)
AA seq 1025 aa
MNSRYRNVICVFLFFSFLLNINAQQKKIAGTVSDSTGPLPGVNVILKGTMNGTETDFEGN
YLINAKQGDVLVFSFVGMKTVEKAVGTQTTINVLLEDDNDMLEEIVVVGYGSVAKKDLTG
AISTIGIEQLEDKPVASVTQALQGATSGLQIVSTGGRTGDATQISIRGNGSLSASNNALY
VIDGVPQEDMTGISPEDIKSISVLKDAASTAIYGSRASNGVVLIQTKRGSYGKGIQVSLN
TSYGIQNIVKRPSLLNSTQYKHISDVARVNYENDIAAGILAGPKDPNSLTPLPTSNYDVD
WLSLVLKENAAVKRHQFSISGGGENTRAYLSASLFDQEGVIKEDTYKIARVKLNMEQKMN
DYIKFGINSNFAFSEATPIVDDNNSYQPYTKALEARPDVSPYTADGKIAEYTFRNPLYAF
ERQLTSKWQNLGGTFYFDVKPVESVVWHSAYSGNIRSNRYNRYDAPNTRRGLNGDGVPTG
YGYYSTDNNRDYLIENTVTFRDSFFNDKLNVNLLGGHSFQKWEYEDSFVEGEGFPSSDLK
WLTSAGEINRGRSYYKAMALESYFTRLQLSWDAKYHLMLSTRYDGSSKFTKDNRWGNFPA
VSAGWTVSNEDFFNVSAINSLKIRGSFGYNGNQSGISYASGQNLIGSGENYDQAPGLAST
SIFNPNLIWEKAEDFNVGFDMTLFNKIDINFDYYQKETQDLLSRINVPQESGFRTMLANV
GKISNKGFEVNVNARIIEKEDFRWSFGGNFSYNKNEVLKVGSETGQYTTGFVSVVKEGNS
LGSFFILEAAGIANESYTYKDKDGNDGYTVAAGDMIYVDQNQDGQINDDDKKVFEGGIAP
IYGGFNTRIDYKGFDLGISGQYSIGKKVYALFKRDLLNGGAVGAPSYSNNMITEMLDYWT
PENPNAANPRPHLASTISSWNTRESTRFLENADYLRISNITLGYSFNFLKDNPKMNFIKS
LRIYAQLVNPFTFTSYSGADPETSYVDQTEENSQDRSDGSKIEAGVDLGGIPNIKSFSVG
LNVKF
NT seq 3078 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaattcacgttacagaaacgtaatctgtgtgtttttattttttagttttctactaaat
ataaatgcacaacaaaaaaagattgctggaacagtgtctgatagtacaggtccattacct
ggggttaatgtaatcctaaagggaaccatgaatggaacggaaacagactttgaagggaat
tatctaataaatgctaaacagggagatgttttagtgttcagttttgtgggaatgaaaact
gttgaaaaagcagttggaacacaaacaactattaatgtattattagaagatgataatgat
atgttagaagagatagtggtagttggatatggttcagtagctaaaaaagatttaacaggg
gcaatttctacaattggaattgaacaattagaagataagccagtagcttctgttactcaa
gcattacaaggagcaacttcagggttacaaattgtaagtacaggaggtagaacaggagat
gcaacgcaaattagtataagaggaaatggatcacttagtgcttcaaataatgcgctatat
gttattgatggtgttcctcaagaagatatgacaggtatttctcctgaagatattaaaagc
attagtgttttaaaagatgcagcttctacggcaatttatggatctagagcttctaatgga
gttgttttaattcaaactaaaagaggttcttacggtaaagggattcaagtttcattgaat
acttcttacggaattcaaaatattgtaaaaagaccaagtttattaaatagtacacaatac
aaacatatttctgatgtagctagagtaaactatgaaaatgatattgctgctggaatttta
gcagggccaaaagatcctaattctctaacaccattaccaactagtaattatgatgtagat
tggttgtctttagtattaaaagagaatgcagcagtaaagaggcatcagtttagcatatct
ggaggtggtgaaaatacaagagcttatttatctgcttctttatttgatcaagaaggagtt
attaaagaggatacttataaaattgctcgtgtaaagttaaatatggagcaaaaaatgaat
gattatataaagtttggaataaactcaaactttgcattctcagaagctaccccaatagtt
gatgataataattcataccaaccgtatacaaaagctttagaagccagaccagatgtgagt
ccttatacggctgatgggaaaatagcagaatacacttttagaaatccattatatgctttt
gaaagacagttaactagtaagtggcaaaatttaggaggaactttttattttgatgtaaag
cctgtagagagtgtagtgtggcattctgcttatagtggaaatattagaagtaatagatat
aatagatatgatgctccaaatacacgaagaggtttaaatggagatggtgtgccaactggt
tacggttattatagtacagataacaatagagattatttaatagagaatacggtaactttt
agagatagctttttcaatgataagttaaatgtaaatttattaggaggacattcatttcaa
aaatgggaatatgaagactcatttgttgaaggagaaggttttccatctagtgatttaaag
tggttaacttcagctggagagattaacagaggtcgtagttattataaagctatggcttta
gaatcgtactttacaaggttacaattatcatgggatgctaaatatcatttaatgttatct
actagatatgatggttcatctaagtttacaaaagataatagatggggtaatttccctgct
gtatcagcaggttggacagtttcaaatgaagatttctttaatgtctcagctataaatagt
ttaaaaattagaggttcttttggttataatggtaaccaatcaggtatttcttatgcgtct
ggtcaaaacttaataggctcaggtgaaaactatgatcaagctccaggtttagcttcaact
agtattttcaatccaaatttaatttgggaaaaagcagaagattttaatgttggttttgat
atgacgttatttaataagattgatattaattttgattactatcagaaagaaactcaggat
ttattaagtagaattaatgttcctcaagaaagtggttttagaacaatgttagctaatgtt
ggtaaaatttctaataaaggttttgaagtaaatgtaaatgctagaattatagagaaagaa
gatttcagatggagttttggaggaaatttttcttataataaaaatgaggtgttaaaagta
ggttctgaaacgggacaatatactactggttttgtatctgttgtaaaagaaggtaatagt
ttaggttctttctttattttagaagctgcaggaatagctaatgaaagttatacatataaa
gataaagatggaaatgatggatataccgtggctgcaggtgatatgatttatgttgatcaa
aatcaggacggtcaaattaacgatgatgataaaaaagtttttgaagggggaattgctcca
atttatggaggttttaacacaagaattgattataaaggatttgatttaggtattagtgga
cagtattctattggtaaaaaagtatatgcattatttaaaagagaccttttaaatggaggt
gctgtaggagctccttcttactcaaacaatatgataacagaaatgttagattattggacg
ccagaaaatccaaatgctgctaatccaagaccacatttagcatcaacaatatcttcatgg
aatactagagaatctacaaggtttttagaaaatgcagattatttaagaatatctaatatt
acattaggatatagttttaatttcttgaaagataatcctaaaatgaactttattaagtct
ttaagaatttatgcgcagttagtaaatccatttacttttactagttattcaggagcagat
ccagaaactagctatgtagaccaaacagaggagaatagtcaagatagatcagatggaagt
aaaattgaagcaggagttgatttaggaggtattcctaatattaaatctttttcagttgga
ttaaatgttaaattttaa

DBGET integrated database retrieval system