Tenacibaculum vairaonense: T19A02B_4194
Help
Entry
T19A02B_4194 CDS
T11462
Name
(GenBank) Outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
tvai Tenacibaculum vairaonense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tvai00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tvai02000
]
T19A02B_4194
Transporters [BR:
tvai02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
T19A02B_4194
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Cadherin_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL2095882
LinkDB
All DBs
Position
T190524A02B:4947653..4949800
Genome browser
AA seq
715 aa
AA seq
DB search
MPSKINLLRMFLNKFKAIVLVMLSITSFSQEKKQKLDSLKNNKLDEVIVTATRTARQLSS
VPMPVTLISKEQIQKSGSVRLRDILLEQTGITMVKDFGNSEGVQLQGISADYTLVLIDGV
PIVGRTSGNIDLSRITVNNIKQIEIVKGPSSSLFGSEAIGGVINIITEKPKRDQLKIKYH
ILSRGGAKNELDLNADVVYRKKNMSVVSGLNFNSSEGFDLTPKSPAKTVNPHQSYTGNLQ
FSYDVSEKLKVLVSQRIYQINQYVNESVNKEIDWNFNGNIKHQISNTWKVDYSFYGTRFK
TESQFNGETALFNRSLFRPEVKTELALWKGTMIAGVGGNFDALDRTSISGNKTYNAMYAF
GQFDFYPFENFNVILGARFEDSDTYESNFSPKLSIGYEVTDWLTLKASGGFGFKAPDFRQ
LFFDFRNVNNGYVVLGTQTVHTLYPNVNGINTVKKELKPETSTGINVGFDAKPIGGLTVS
VNAFRNDITDLIDVYDTQLNDPGRFGNTPEQFGLKAGDRLFSYRNINEVFTQGVEVDIKW
RLTDNFKFFAGYQFLDTGNKEAIKKLEEESLFIKDASGTSIRLNSSAYFGLADRSKHMIN
AKLFYENYEHNFSANIRGVYRSKYAPLDTNSNGVIDTFDDFVVANTQINFSMDKSFFDNL
LVIQFGIDNLFDNTAIENGEVFNFPDPNSNTGETIPIDTYLQLGRTYFGRIQFNF
NT seq
2148 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgccgtcgaaaattaatttattaagaatgtttctaaataagtttaaggctatagtttta
gtaatgttgagtatcactagcttttcacaagagaaaaagcaaaagctagattctttaaaa
aataataaactagatgaagttattgtaacggcaactagaacggcaaggcaattatcatcc
gttccaatgccagtaactttaatctctaaagaacaaatacaaaagtctggttcagtaaga
ctacgagatatcctattagagcaaacgggaattacaatggttaaagattttggaaattca
gaaggtgtacaattacaagggatatcagcagattacacacttgtactaattgacggagtt
ccaattgtgggaagaacatcaggtaatattgatttaagtagaataacagtgaataatatt
aagcaaatagaaattgtaaaaggcccttcttcttccttgtttggatcagaggctatagga
ggagttattaatattattacagagaaaccaaaaagagatcagttaaaaataaagtatcat
attttaagtagaggaggtgctaagaatgagttggatttgaatgcagatgtagtgtacaga
aagaaaaatatgagtgtggtttctggtttaaattttaattcaagtgaaggttttgattta
acgcctaaaagtcctgcaaaaacggtaaacccacaccagagttatacagggaatctacaa
ttttcgtatgatgtttcagaaaagttgaaagtgttagtgtctcaacgaatttatcaaata
aaccaatatgtaaatgagtctgttaataaagagattgattggaattttaatggaaatata
aaacaccagatatctaatacatggaaagtagattattcattttacggaactcgatttaaa
actgagagtcaatttaatggagaaacggctttgtttaatagaagcttgtttagaccagag
gtaaaaacagagttggctttatggaagggtactatgatagcaggtgttggaggaaatttt
gatgctttagatagaacttctataagtggtaacaaaacttataatgccatgtatgctttt
ggtcagtttgatttttatccttttgaaaattttaatgtgattttgggagctagatttgaa
gatagtgatacatacgaatctaatttttcacctaaactatcaataggttatgaagtaact
gattggttaacgcttaaagcatccggaggttttggatttaaagcaccagattttagacaa
ttattttttgattttagaaatgtaaataatggatatgttgttttaggtacgcaaacagta
catactttatatcctaatgtaaatggtataaatacagttaaaaaggaattaaaaccagaa
acctctacaggtataaatgtaggatttgatgcaaaaccaattggcggattaactgtaagt
gtaaatgcttttagaaatgatattactgatttaattgatgtttatgacacacaattaaat
gatccaggaaggtttggaaacaccccagagcagtttggtttaaaagcaggtgatagattg
ttttcatacagaaatataaatgaagtatttacgcaaggagtagaagtagatataaaatgg
aggttaacagataattttaagttttttgcagggtatcagtttttagatactggaaataaa
gaggctataaagaaattggaagaggagtctttatttatcaaagatgcaagtggaacatct
atacgtttgaattcatcagcttattttggattagctgatagatcaaagcacatgataaac
gctaagttgttttacgaaaactatgagcataatttttcagcaaacataagaggggtttat
agaagtaaatatgctcctttagataccaatagtaatggggtaatagatacgtttgatgat
tttgttgtggcaaatacacaaataaacttttcaatggataaatcgttttttgacaattta
ttagtgattcagtttggcattgataatttgtttgataatacagctatagaaaatggtgag
gttttcaattttcctgatccaaattcaaacactggagaaaccatacctatagatacatat
ttgcaattaggaagaacatattttggaagaatacagtttaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
