Tachysurus vachellii: 132860423
Help
Entry
132860423 CDS
T09596
Name
(RefSeq) uncharacterized PE-PGRS family protein PE_PGRS54-like
Organism
tvc
Tachysurus vachellii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pentapeptide_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132860423
NCBI-ProteinID:
XP_060747598
LinkDB
All DBs
Position
17:complement(20311671..20327786)
Genome browser
AA seq
1891 aa
AA seq
DB search
MVLEESDREVLAQVELVQESDQEASDQEELAQVELVQELGQEELVFVEWEKANMEHMAVL
EVFILDRNHQKLESDLVVLQLALELELVQVVQVPALVELDLALVELDLAQVELELVQVEL
ELVLVELDLALVELDLAQVELELAQVELELFLAELEFALVELDLALVELELAQVELDLAL
VELELALVELELAQVGPGGAGFGPGGAPILPQSGLPSTGTGSGRKFGKTGKAPVPGINIP
GLYQGGIVPGQGFGGQGVLPGVASGSQTAQLGQGGLGANGGRGSFAGQQLPGVFRGYPLI
SPKSGVPGSAKSQAKAAKYAAGLGVGAGVGGVPGAVPGAGGVPGAVPGAVPGAGGLVLVL
YLEQEVYLVLYLVLSLERVVYLVLCLEQVVYLDLVLLLEQVVCLVLVLVLEACIPVVLVP
IREEQEPKHGSMVLEDCQQVLVLELVDFLGLVLDLVGFLGLELELVEFLGPELELVDFLG
RDLELVDFLGLELELVDFLGLELELVDFLALELDLEVLEDCQQALVLELVDVLALELELV
DFLGQELELVDFLGQELELVDFLALVLELVDFLALVMELVDFLGQELELVDFLGLELELV
DFLALELELVDFLGQELELVDFLGLELELVDFLALDLDLELGGPGGALGAGGLPGGIGTG
GLPGSGIGAGGLPGSGLGAGGLPGSGYGAGGLPGSGIGAGGLPGSGIGAGGLPGSGLGAG
GLPGSGLGAGGLPGSGLGAGGLPGSGYGAGGLPGSGIGAGGLPGSGIGAGGLPGSGLGAG
GLPGSGLGPGGYAGAKARKYAQLGGPGGALGAGGLPGGLGTGGVPGIGLGAGGIPGSGLG
AGSLPGSGIGAGGLPGSGIGAGGLPGSGLGAGGYAAAKARKYAQLGGPGGALGAGGLPGG
LGAGVGGLPGGGLGPAIGTGVGGAGGAQGGPGSGFQPGSGLRPGGTTGGGPGSVPGGGLG
PGGVPGGGLGLGSVPGGGFGPGGVSGGSLGPGGYAGAKARKYGFPSGTGTAGAGLPGGLG
GVLGGGLGPGVPAGGFGTGVAPGGGVGTGSVPAGGYGPGGVPGGYGPGGVPGGYGPGGVP
GGYGPGGVPGGYGPGGVPGGYGPGGVPGGYGPGGVPGGYGPGAVPGGYGPGAVPGGYGSA
YPSGSKALKYGQAGRVTPSGVGGPAQGYGTGAGSVGGYGQGTGLSPGAGYGLGAGSVPGG
TGFRGGPTGYGPGSKAAKYGQLGAGGVLGTGTGGVASTGQAVPGGFGGAAGSPFGGVPGS
GPGTGLGSFGGYGSGGKPPKYGQPGFGTGTVLGGAGSVPGVVGAGTTTTGIGTATGTGTA
VGAGGVPVTGSKADKYGVPVVTGGATGGTRVPGSIPTASTAQRTKTDVDGAIKPDNDSTE
GPGSTKAPRLGETGVLEGSGSSIGGAPGEGVSSGPTDGDGLDGVTGTGIPILAGGRPGGV
GDDLPGAKPLKPPGGVIPGRGDTPGRFEEPSGTDIVLDRVEGGPGGVGGGPGRDGRGPGG
VGGGPGGDGGGPGGVSGGPGGFGGGPGGVGGGPGGDGGGPGGVGGGPGGVGGEPGGVSGG
PGRDGRGPGGVGGGPGRVGGGPGGVGGGPGGVGGEPGGLGAGTGAQDTGRPGGVSTSPVG
GTIKPPKGYASTAGGLLGGIGGPGGVTGPGVTTGTGFLPGSSSQLPGGTGTGTGGQRFPS
GAAVGSKGPGYGPGKAAKGYWGTGALGGVGGSGALGGVPGGVGTGLGGVGGGPGAAGVGL
GGQGGGFGYPGGAGLRAGKPGKSGFGSLGGAGGLGLGGTGGALEGGPGGVGGGLAGIGGG
VGGPGRIYPGGAGLGAGVGKPGKPGYGTGALWGQGYQPGSGVPGYTGGGAGGYQQPLPGY
AGAGQGGAGSAPLTPQQCRSFLFQFCSYMSQ
NT seq
5676 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtcctggaggagtcagaccgggaggtgttggctcaggtggaattggttcaggagtcg
gaccaggaggcatcagaccaggaggagctggctcaggtggaattggtccaggaattgggc
caggaggagttggtcttcgtggagtgggaaaaggcaaatatggagcatatggcagtgctg
gaagtctttatcctggacagaaaccaccaaaaactggagtcagacctggtggttctgcaa
ttggctttggagctggagttggtccaggtggtgcaggttccagccctggtggagctggat
ttggccctggtggagctggatttggcccaggtggagctggagttggtccaggtggaactg
gagttggtcctggtggagctggatttggccctggtggaactggatttggcccaggtggag
ctggagttggcccaggtggaactggagttgttcctggcggaactggagttcgccctggtg
gagctggatttggccctggtggaactggagttggcccaggtggagctggatttggccctg
gtggagctggagttggccctggtggaactggagttggcccaggttggaccaggtggagct
ggatttggccctggaggagcacctatattgccacaatctggattaccaagtacaggaaca
ggttctggacgcaaatttggcaagacagggaaggcaccggtaccaggtattaatattcct
gggttgtaccagggtggtattgttcctggacaaggttttggtggtcaaggtgtcctgcca
ggcgtagcttcaggatctcagactgctcagcttggtcaaggtggacttggagccaatggt
ggtcgtggaagctttgctggacaacagttaccaggagtgtttcgtggataccctctcatt
tcaccaaagtctggagtaccaggctcagctaagtctcaagctaaagctgctaaatatgca
gctggacttggtgtaggagctggtgtaggtggtgtaccaggtgctgttcctggagcaggt
ggtgtacctggtgctgtgcctggtgctgttcctggagcaggcggtctggtgttggtgctg
tacctggagcaggaagtgtacctggtgctgtacctggtgctgtccctggagcgggtggtg
tacctggtgttgtgcctggagcaggtggtgtacctggatttggtgctgctcctggagcag
gtggtgtgcctggttttggtgctggtcctggaggcttgtatcccagtggtgctggtacct
atccgggaggagcaggagccaaagcatggaagtatggtgctggaggattgccagcaggtt
ctggtcttggagttggtggacttcctgggtttggtcttggacctggtgggcttcctgggt
ctggaattggagctggtggagttcctgggtccggaattggagctggtggacttcctgggt
cgggacttggagctggtggacttcctgggtctggaattggagctggtggatttccttggt
ctggaattggagctggtggacttcctggctctggaattggacctggaggtgctggaggat
tgccagcaggctctggtcttggagctggtggacgtcctggctctggaattggagctggtg
gacttcctgggtcaggaattggagctggtggacttcctgggtcaggaattggagctggtg
gacttcctggctctggtcttggagctggtggacttcctggctctggttatggagctggtg
gacttcctgggtcaggaattggagctggtggacttcctgggtctggaattggagctggtg
gacttcctggctctggaattggagctggtggacttcctgggtcaggaattggaactggtg
gacttcctgggtctggaattggagctggtggacttcctggctctggatttggacctggag
cttggaggtcctggtggtgctttaggtgctggaggattgcctggaggaattgggactggt
ggacttcctgggtcaggaattggagctggtggacttcctggctctggtcttggagctggt
ggacttcctggctctggttatggagctggtggacttcctgggtcaggaattggagctggt
ggacttcctgggtctggaattggagctggtggacttcctgggtctggacttggagctggt
ggacttcctgggtctggacttggagctggtggacttcctgggtctggacttggagctggt
ggacttcctggctctggttatggagctggtggacttcctgggtcaggaattggagctggt
ggacttcctgggtctggaattggagctggtggacttcctgggtctggacttggagctggt
ggacttcctggctctggacttggacctggaggatatgctggagccaaagcaagaaaatat
gctcagcttggaggtcctggtggggctttaggtgctggaggattgcctggaggacttgga
actggtggggtccctggaattggactgggagctggtggaattcctggatctggtctcgga
gctggatcacttcctgggtctggaattggagctggtggacttcctggttcagggattgga
gctggaggacttcctggctctggtcttggagctggtggatatgctgcagccaaagcaaga
aaatatgctcagcttggaggtcctggaggggctttaggtgctggaggattgccaggagga
cttggtgcgggtgttggagggctgcctggtggagggcttggacctgctattggaactgga
gtaggaggtgctggtggtgcccaaggaggacctggttcaggatttcagcctggaagtgga
ctaagaccaggagggacaactggtggcggaccaggtagtgtgccaggtggtggccttgga
cctggaggtgtacctggtggtggccttggacttggaagtgtgccaggtggtggctttgga
cctggaggagtatctggtggcagtcttggacctggggggtatgctggagccaaagctcgc
aaatatggattcccaagtggaacaggtactgctggagcaggattgcctggaggattagga
ggggtacttggtggtggattaggaccaggagtaccagctggtggttttggtactggagtg
gcaccaggaggtggagtaggaactggcagtgtaccagctggaggatatggtcctggtgga
gtacctgggggatatggtcctggtggagtacctgggggatatggtcctggtggagtacct
gggggatatggtcctggtggagtacctgggggatatggtcctggtggagtacctggggga
tatggtcctggtggagtacctggaggatatggtcctggtggagtacctgggggatatggt
cctggtgcagtacctgggggatatggtcctggtgcagtacctgggggatatggttcagca
tatccaagtggatcaaaggcacttaaatatggtcaggctggacgtgttactccatctggg
gtaggtgggcctgctcaaggatatggaaccggagcaggatctgttggtggatatggccag
ggcactggattgagtcctggggctggatatggacttggagcaggcagtgtaccaggagga
acaggattcagaggagggcctacaggatatggaccaggttcaaaagctgctaaatatggg
caattaggagcaggaggagtacttggcactggaacaggaggagtagcaagcactggacag
gctgtgcctgggggctttggaggtgccgctggatctccatttggtggagttcctggcagt
ggaccgggcaccggtcttggaagctttggaggatatggatcaggaggaaagccaccaaaa
tatggtcagcctggttttggaactggaactgttttaggtggagcagggtcagtgcctggt
gttgttggagctggaaccacaaccacaggaatagggactgcaactggtacaggcactgct
gttggggcaggaggggtaccagtcactggaagcaaggcagacaaatatggagttccagtc
gtcacaggaggagcaacaggaggaacaagagttccaggcagtataccaacagcatcaacg
gctcagaggaccaaaacagatgttgatggagctattaagcctgataatgactctacagaa
ggaccaggttctactaaggcccctaggttgggggaaacaggagtcttagagggatctgga
agttctattggtggtgctccaggtgaaggagttagcagtggtcctactgatggggacgga
cttgatggagttactgggacaggaatacccatcttagctggtggtagaccaggtggagta
ggtgatgatcttccaggagccaaacctctaaaacctccaggtggtgtcattcctggacgt
ggtgatactccaggtagatttgaagagccaagcggaactgacattgtactggacagagtt
gaaggtggaccaggtggagtcggaggaggaccaggtagagacggaagaggaccaggtgga
gttggaggaggaccaggtggagacggaggaggaccaggtggagtcagtggaggtccaggt
ggattcggaggaggaccaggtggagttggaggaggaccaggtggagacggaggaggacca
ggtggagtcggaggaggaccaggtggagtcggaggagaaccaggtggagtcagtggaggt
ccaggtagagacggaagaggaccaggtggagttggaggaggaccaggtagagtcggagga
ggaccaggtggagtcggtggaggaccaggtggagttggaggagaaccaggtggacttgga
gcaggaacaggtgcacaggacacaggaagaccaggcggagttagtaccagtcctgtaggt
ggaacaattaaaccccccaaaggatacgctagtactgctggaggactccttggtggtatc
ggaggcccaggtggagttacagggccgggagtgacaacgggaactggctttttacctgga
agtagcagtcaactgccaggaggcacaggaacaggaactggaggtcaaaggttcccaagt
ggagctgctgtgggaagcaaaggtcctggatatggccctggaaaggcagctaaaggctac
tggggaactggagcactgggtggggtgggaggctcaggagcacttggaggagttcctgga
ggggttggcactggtttagggggtgttggtggaggtcctggtgcagctggtgttggtctg
ggtggtcaaggaggaggttttggctacccaggcggagcaggattaagagctgggaaacct
gggaaatcaggatttggcagtttgggtggagcaggaggcctaggacttggaggtacaggt
ggggctttagaaggaggtcctggaggtgtaggtggagggctagcaggcataggaggagga
gttggtggcccaggtcgaatctacccaggtggtgctggactgggagctggagttgggaag
cctggtaaaccagggtatggcactggtgccttgtggggtcaaggttaccaaccaggcagt
ggagtgccaggatacactggtggtggtgcaggcggctaccaacaaccactcccaggctat
gctggagctggacaaggaggagctggaagtgcaccacttacacctcaacaatgtaggtca
tttctatttcaattctgctcatacatgagtcaatga
DBGET
integrated database retrieval system
