Tachysurus vachellii: 132863173
Help
Entry
132863173 CDS
T09596
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
tvc
Tachysurus vachellii
Pathway
tvc04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tvc00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
132863173
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tvc00536
]
132863173
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tvc00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
132863173
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132863173
NCBI-ProteinID:
XP_060751789
LinkDB
All DBs
Position
20:12907113..12954670
Genome browser
AA seq
2899 aa
AA seq
DB search
MWSKRNLRCLTSCLALLGALVGSLSGEMPGRIQFQVERSSQAADSRVRRRGKQESLRGPN
VCGSRLHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGEGYCSRPNMCTCPTGQIAPSCAAKSSQ
QCSIRCMNGGVCEVDHCQCQKGYTGNYCGQPVCEKKCQNGGRCIGPSRCACVYGFTGPQC
ERDYRTGPCFSQVVNKMCQSQVSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEECPAQTQPCRRGFIP
NIRTGACQDVDECQAVPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHRLNDGTNKCEDVNECTTIPH
VCDGGQCTNSVGSFSCVCPSGFLLSADKTRCFGQHTGSCFAAVVSGRCAQEMSEHYTKAQ
CCCDRGHCWARGTVPVICPSRRSDEFQKMCLEGGYPDVEPGFRADRVPQQPYGPDGLPHY
PTNGNGHIYPELPQIPQIPQIPQIPQIPQIPHIPINGHGNGNGQRPQGPVVSLNQTTNKC
LLMPNLCLNGRCIPVGFGHRCECNIGYQVDSQKECSDINECASDPCTNGDCVNTAGSYYC
KCHTGFHRPPGKQACIDTDECLHNGVLCQHGRCLNMAGSFRCICNAGFQLTPDGRNCMDH
DECSITNMCLNGMCINEDGSFKCVCKPGFTLASSGRYCTDIDECLNPGTCINGRCINTEG
SYRCECLAGLTVGPDGRSCVDTHMRSTCYGAIKKGVCVHPFHGAVTKSVCCCASTDYSFG
EPCQLCPALNSAEFNALCQSGIGFSVDGTDINECALDPDICSNGVCENLRGGYRCICNTG
YETDQSGRACLDVDECLVNRLLCDNGLCRNIPGSYTCTCPPGYVFRQDTDTCEDLNECES
SPCINGVCKNNAGSFSCVCSPGSVLDRTGLICIDSLKATCWMIIQEGRCEMNINGATLRS
ECCATLGAAWGSPCEPCEKDLVCQRGFTRPKGTICEDVNECEVFPGVCLNGRCVNTQGSF
KCQCPEGLTLDGTGRLCIDIRSELCYLTYDEDMCGQPVPGRFRMDVCCCTVGAAWGKECD
ACPEPGTRNYEMLCPRGPGFANRGDILTGRPMYKDINECKVFTSICTHGTCRNTIGSFRC
RCNSGFTLDMDGRNCTDIEECQISPDLCGHGTCVNTPGSFECDCLPGYVSGFMMMKNCMD
IDECEQNPALCRGGSCENTEGSYQCVCPPGHQLSENEEACEDVNECELSATLCPNGECAN
VAGTYHCTCFSGYQSIPDRKGCTDIDECTIENGGCDFHCTNSEGSYTCSCGQGYALMPDQ
RTCTDVDECEEEPDICDGGQCTNVPGEYHCDCYDGYMSSMITKTCIDVNECELNANICMF
GECENTKGSFICHCEVGYSVQKGSSGCTDFDECKMNAHNCAIHATCVNTPGSFQCSCKKG
WVGNGIDCVDVDECTNQTHMCSPNAKCMNAPGSYRCACSMGFNGDGFTCLDIDECTENAE
LCENGQCLNIPGGYRCDCEMGFTSTPDNRACQDIDECSFQQLCVFGTCKNLPGLFLCICD
EGYELDRSGGNCTDVDECLDPINCVNGHCVNIPGSYECNCPTDYELNPTGVGCVDPRVGT
CFLEVVNRGRAGLTCSVEVGVGVSRSSCCCSKGRAWGNPCEFCPPVNSSDYNTLCPGGEG
FRPNLITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCDCPNGYYLNADSRICEDIDECLV
NPEICGPGTCYNTLGNYTCVCPQDYMQVNGGNKCLDMRKSLCFRNYNGTTCENELAFNIT
HSICCCGYNMGKAWNKPCQACPKPGTEGFHVLCGNIAPGFEISIETGKPVDIDECQQIPG
ICANGVCINHIGSFHCECPRGFSYNDLLLICEDNDECSGSEILCQRNADCINSPGSYRCE
CSDGFKLSPIGACIDRNECLETPNLCSHGKCVDIQGGYMCTCHAGFIATPSGKMCMDIDE
CVIQPCRNGTCKNTVGSYNCLCHPGFELTLNNQCTDIDECSSAYSQLCRNGHCINSIGSF
QCLCEDGYDLTQDRKNCVDVNECIMLPGICAPGTCQNLDGSFRCICPPGYIVQNNQCVDE
NECEEDPNICLFGSCYNNPGSFECVCKPGFVLSENGRRCYDTRESFCFTRFENGKCSNPQ
AFNTTKDKCCCSTMSNEGWGYPCELCPKEHDAGFQDICPFGYGIIPGIGDTIIDLNECVE
NPGICHNGHCINTDGSFRCECSTGYTLNYTGTHCIDVDECAVGNLCGNGSCTNVIGSFEC
NCEEGFEPGPMMTCEDINECAQNPLLCAFRCINTFGGYECSCPSGYTLRDDGRMCQDLNE
CAEGLHDCDTKGMNCKNLIGTFMCLCPVGMVRKMDDDVCHDENECRTKPGICENGHCVNT
IGSYMCECGEGFQSDSSHTQCLDYRQGFCFTEVLQTMCQMSSSSRIPSTKSQCCCYGGRG
WGNQCELCPLPGTVKYKKLCPHGPGLATDGTDIDECKVIPDACKNGQCINTMGSFKCHCN
PGYTATITATACVDLDECLMSPKPCNFICKNTDGSYMCSCPRGYILQEDGRTCKDLDECQ
LKRHNCQFMCINTIGGFACKCPAGFTQHHTACMDNNECAAESSLCGAKGICQNSPGSFSC
ECQQGFSLDSTGLHCEDIDECKSNHRCQHGCDNVLGGYRCSCPQGYTQHYQWNQCVDENE
CSIPGTCGSASCYNTLGSFKCACPSGFNFEQLSSSCQDVDECTSFKNPCSYGCSNTQGGY
KCGCPPGYYRVGQGHCVSGLGFGKGQLGSVSSAGMAEDNSLSPEICNDCTVNSPQKRGIR
KRHAIHQTEPEEVKEEAPVNLDSVDMEQPLLLVLNISQCTHKDHILELVPALRPLVHHIT
YNITEGNQDKIFHLRQHEELSYLHCMPEKAFPGFYILKISSSPLYDHTELRELEKKRDRD
YLSGELGQNLHMKLHITLQ
NT seq
8700 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggtctaaaaggaatttgaggtgtttaacaagttgtctagctcttcttggtgcttta
gtagggagtttatccggagagatgcccgggagaatccagtttcaggtggagcgcagctca
caagccgccgacagccgagtgaggagacgcggcaaacaggagtctctcagagggccaaat
gtgtgtggatctcgtttgcactcttactgctgtccaggctggaagactttgcccgggggc
aaccaatgtatcgtaccaatatgccgtaacagctgtggtgaaggctactgttccaggccc
aacatgtgcacgtgccccactggtcaaattgctccttcttgtgctgccaaatcatctcag
caatgtagcatcagatgtatgaatggaggtgtgtgtgaagtggatcactgccagtgtcag
aagggttacacaggaaactactgtgggcaaccggtgtgtgaaaagaagtgccagaatggt
ggccgttgcattgggcccagtcggtgtgcatgtgtgtacgggttcacaggtcctcagtgt
gaaagagattacagaacaggtccgtgcttctcccaggtcgtcaacaagatgtgccagagc
caggtgagtggcattgtgtgcactaagacactgtgctgtgccactgttggccgagcctgg
ggtcacccttgtgaggaatgccctgctcaaacacagccctgccgcagaggcttcattccc
aacattcgtaccggagcatgccaagatgttgatgaatgccaggctgtaccaggtttgtgc
caaggaggaaactgcattaacactgtgggctcttatgagtgcaaatgccctgctgggcat
cgcctgaatgatggcaccaataagtgtgaggatgtgaacgaatgcaccacaattccacat
gtgtgtgatggaggacagtgcaccaactcagttggcagtttctcctgtgtatgtccatct
ggatttttgctctctgcagacaagactcgatgctttggccagcacacaggttcctgtttt
gcagctgtggtgagtgggcgatgtgctcaggagatgtctgagcactacactaaagcgcag
tgctgttgtgacagaggccactgctgggcccgagggacagtgccagtgatatgtccaagc
cggagatctgatgaattccaaaagatgtgtttagagggaggttatccagatgtggaacct
ggcttcagagcggacagagttcctcagcagccctatggacctgatggcctaccacattat
ccaacgaatgggaatggtcatatttatccagagcttccacaaatcccgcaaatcccacag
atccctcaaatcccccagatcccccaaatccctcatattcccattaatggacatggtaat
ggcaatggacaaagaccacaaggacctgttgttagtttaaatcagaccacaaacaaatgc
ctgctgatgcctaacttatgtcttaatggccgctgtatcccagtggggtttggtcatcgt
tgtgaatgtaatattggctaccaagtggacagccaaaaggagtgctcagatataaatgaa
tgtgcttctgacccatgcacaaatggagactgtgtgaacactgctggctcttactattgc
aagtgccatacaggctttcacaggcctccaggcaagcaggcctgcattgacactgacgaa
tgcctgcataacggtgtgctttgtcagcacggccgctgtctgaacatggcaggtagtttc
cggtgcatctgcaatgcaggcttccagctaacaccagatggcaggaactgtatggaccat
gatgaatgttccataacaaacatgtgtttgaatggcatgtgcatcaatgaagatggcagc
tttaaatgtgtgtgcaaacctggtttcacacttgcctcaagcggtcgctattgcacagat
attgatgagtgcttgaaccctggtacctgtataaatgggcggtgtataaatacagaaggt
tcttacaggtgtgagtgcttggcaggactgactgttggacctgacggacgctcatgtgtg
gacacacatatgcgcagcacctgctatggagctattaaaaagggtgtgtgtgtccaccct
ttccatggagcagtcaccaaatcagtgtgctgctgtgctagcacagactatagctttggg
gagccctgccaactgtgtcctgccctgaattcagcggaattcaacgctttgtgtcaaagt
gggattggattttcagttgatggaacggacattaatgagtgtgcactggatcctgatatc
tgctcaaacggagtatgtgagaatctaagaggaggctaccgctgtatctgcaacacaggc
tatgagactgaccagagcggccgggcctgtttagatgttgatgaatgcctggtgaacaga
ctgctctgtgataatggattatgcaggaacattccaggtagctacacctgtacatgtccc
ccgggttatgttttcagacaagacacagatacatgcgaagatctgaatgaatgtgagagc
agtccatgtattaatggagtgtgtaagaacaatgcaggttctttctcatgtgtatgctct
cctggcagtgtacttgatcggactggcctaatatgcatcgactctctgaaggcgacatgc
tggatgatcatccaagaaggccgctgtgagatgaatataaatggtgccactttgagatcc
gagtgctgtgccacactgggagctgcatggggaagtccctgtgagccctgtgagaaggat
cttgtctgtcaaagaggcttcacacgaccaaaagggaccatttgtgaagatgttaacgaa
tgtgaggtgtttcctggtgtttgtctgaatggacggtgtgtaaacacacaaggatctttt
aagtgccagtgtcctgaaggactgacactggatggcacaggacgcctctgtatcgatata
cgctcagagctttgctacctgacctatgatgaggacatgtgtggtcagccagtgcctgga
agattcaggatggatgtttgctgctgcacagttggagctgcctgggggaaggagtgtgat
gcatgccctgagcctggcacacgcaattatgaaatgctgtgtcccagaggacctggcttt
gccaatcgtggagacatacttacaggcagacctatgtataaagacattaatgaatgtaaa
gtgttcacaagtatctgtacacatggaacatgccggaacacaatcgggagctttagatgt
cgctgtaatagtgggtttaccctggatatggatggacgtaactgtacagacattgaggag
tgtcagatctcccctgacctgtgtggacatgggacatgtgtgaacactccaggcagtttt
gagtgtgactgcttgccaggttatgtgagtggcttcatgatgatgaagaactgcatggat
attgatgagtgtgaacaaaatcctgcattgtgtcgcggaggctcctgtgagaacacagaa
ggtagttatcaatgtgtgtgtccacctggtcatcagttatccgagaatgaggaagcttgt
gaagatgttaacgagtgtgaactaagtgccactctctgccccaatggggagtgtgcgaat
gtggctggcacttaccactgtacttgtttttctggataccagtcaatcccagacagaaag
gggtgcacagatatagacgagtgcaccattgagaatggaggctgtgacttccactgcact
aattcagagggcagctacacctgcagttgtggtcagggatatgccctaatgccagatcag
agaacctgcacagatgtggatgaatgcgaagaagagcctgatatatgtgatggtggtcag
tgtactaatgttcctggagagtaccactgcgattgttatgatggatacatgtcgtccatg
atcacaaagacctgtatagatgtgaacgagtgtgagcttaatgccaacatctgcatgttt
ggagaatgtgaaaacaccaagggctcattcatctgccattgtgaggttggctactctgta
cagaagggttcttcaggctgcacagattttgatgagtgtaagatgaatgcccacaactgt
gccatacatgcaacctgtgtcaacacccccggaagcttccaatgctcctgtaaaaaggga
tgggtaggcaatggaatagactgtgttgatgtggatgaatgcaccaatcagacccacatg
tgcagtcctaatgctaagtgtatgaatgcacctggctcttatcgctgtgcctgctcaatg
gggtttaatggtgacggctttacctgccttgacattgatgagtgcacagagaatgctgag
ctatgtgagaacggccagtgtctaaatataccaggaggctatcgctgtgactgtgagatg
ggctttacttcaacccctgacaacagagcttgccaagatatcgacgagtgctcctttcaa
caactctgtgtgtttggtacatgtaaaaacctccctggcttgttcctctgcatctgtgat
gaaggctatgagttagaccgatcaggggggaactgcacagatgttgacgaatgtttggac
cccataaactgtgtcaatggacactgtgtaaacataccaggctcttatgaatgtaactgc
cctacagactatgaacttaacccaactggagttggctgtgttgatccacgtgtagggacc
tgcttcctggaggtagttaaccgtgggcgtgctggcctgacctgtagtgtggaggttggt
gtcggagtcagtcgctcatcctgctgctgctccaagggccgagcctggggaaacccctgt
gaattctgtcctcctgtcaactcctcggactataacacactgtgtccaggaggagaggga
tttaggcccaacctaataactataatactggaggacatagacgagtgtcaggagcttcct
ggtctgtgccagggtggaaattgtataaacacctttggcagcttccagtgtgactgtcca
aatggctactacctcaatgcagatagtcgtatttgtgaggatattgatgagtgtttggtg
aatcctgagatctgtggtcccggcacatgctataacactctggggaattacacttgtgtg
tgtcctcaggactacatgcaggttaatggaggcaataagtgcctggacatgaggaaaagc
ctttgctttcgcaactacaatggcaccacatgtgagaatgagctggccttcaacataaca
cacagcatctgttgttgtggatacaacatgggcaaagcctggaacaaaccctgtcaggca
tgtcccaaaccaggcactgagggctttcatgttctttgtggaaacattgcaccagggttt
gaaattagcattgaaactgggaaaccagtggatattgatgagtgtcagcagatcccaggg
atatgtgccaacggtgtgtgcatcaaccatattggaagttttcactgtgaatgtccaaga
ggattcagctataatgatttgctacttatatgtgaagacaatgatgagtgtagtggttca
gagatcttgtgccagaggaatgcagactgtattaacagccctggcagctatcgctgtgaa
tgttcagatggcttcaagctctcacccattggagcctgtatagatcgaaatgagtgtttg
gaaacccccaacctttgcagtcatggcaagtgtgtggacatacaaggtggctatatgtgt
acatgccatgctggcttcatagccacccccagtggaaagatgtgcatggacattgatgag
tgtgtgattcagccctgtaggaatggcacatgtaagaatactgtgggatcctacaactgc
ctctgccatcctggctttgagctcactctaaataaccagtgcacagatatcgatgaatgt
tcatcagcatatagtcagctgtgtaggaatggccattgcattaacagtattggctccttc
cagtgtctatgtgaggatggctatgatctcacccaggataggaagaactgtgttgatgtg
aatgagtgcataatgctacctggaatatgtgctcctggaacatgccagaacttggatggc
tcttttcgctgtatttgtccacctggttacatcgtacagaataatcaatgtgtagatgag
aatgagtgtgaggaagaccccaacatctgtctatttggctcttgctacaataacccaggc
agctttgagtgtgtgtgcaaaccaggctttgttctctcagaaaatggacgccgctgttat
gacacaagagagagtttttgcttcacccgctttgagaatggaaaatgctccaaccctcag
gcattcaacaccaccaaagacaaatgctgctgtagcaccatgtccaatgagggctggggc
tacccctgtgagctctgccctaaagagcatgatgctggatttcaagacatttgtcccttt
ggctatggaatcattccagggattggggatacaatcattgatctgaacgaatgtgtggag
aacccaggcatttgtcacaatggccactgcatcaacactgatggctcctttcgctgcgag
tgttctacaggctacacactcaattacactggaacacattgtatcgatgttgatgagtgt
gcagtggggaatctatgtggaaacggatcttgcactaatgtaataggaagctttgaatgc
aactgtgaggaaggttttgagccagggccaatgatgacatgtgaagatataaatgaatgt
gcgcagaaccctttgctctgtgcgttccgctgcatcaatacatttgggggatatgagtgc
tcctgcccgtccggctacacactccgagatgatgggcgaatgtgccaggacctgaatgag
tgtgcagaaggtttacatgactgtgacacaaagggtatgaactgtaagaacctcatcgga
accttcatgtgcttgtgtcctgttggaatggtgcgcaagatggatgacgatgtgtgtcat
gatgagaacgagtgccgcactaagccaggtatttgtgagaatggccactgtgtgaacact
ataggcagttacatgtgtgagtgtggtgaaggcttccagtctgattcttcacatactcaa
tgccttgactacagacaaggattctgtttcactgaggtgctgcagaccatgtgtcagatg
tcctccagcagtagaatacccagcaccaaatcccagtgctgctgttatggtggacgtggc
tgggggaaccagtgcgagctctgtcctctgccaggcactgtcaaatacaagaaactgtgt
ccacacgggcctggcttagccacagatggcacagatatagatgaatgtaaggtcataccg
gacgcatgtaagaatggccagtgtatcaatactatgggttcctttaaatgtcactgtaat
ccaggctacacagccaccattacagccacagcttgtgttgatttggatgagtgtttaatg
tccccaaagccatgcaacttcatctgcaagaacacagacggcagctatatgtgctcctgt
ccacgtggctatatattgcaagaggatggcagaacatgtaaagatttggacgaatgccag
ttaaagaggcacaactgccagtttatgtgtattaacactattggtggattcgcttgcaaa
tgtccggcaggctttacacagcaccacactgcctgtatggataataatgagtgtgctgca
gagtctagtctgtgtggagctaagggcatctgccagaactcaccaggcagctttagctgt
gaatgccagcaaggattcagtctggactctacgggcctgcactgtgaagatattgatgag
tgtaaaagcaaccataggtgtcagcatggttgtgacaacgtgttaggggggtaccgctgc
agttgcccacaaggctacacccagcactaccagtggaatcagtgtgttgatgagaatgag
tgctccattcctggcacctgtggctctgcatcatgttacaacacactgggcagcttcaag
tgtgcctgtccctctggattcaacttcgagcagctctccagcagctgccaggatgtggat
gaatgcacctccttcaaaaacccatgcagctatggctgctcaaacacccaaggaggctac
aaatgtggctgtcctcctggatactatagggttggacaagggcactgtgtgtcaggtctg
ggctttgggaagggtcagctgggatctgtcagttcagctggaatggcagaggataacagt
ctctctcctgaaatctgcaatgattgcactgtcaacagtccacaaaagagaggaatccgg
aagagacatgccatccatcaaacagagccagaggaggtaaaagaagaagctccagtcaac
ctggacagtgtggacatggagcagcccctgctactggtactcaacatatcccagtgcacc
cacaaagaccatatccttgagctggtgcctgccctcaggcctctcgttcatcacattact
tataacatcacagagggaaatcaggacaaaatattccatctccggcagcatgaggagctc
agctacctgcactgcatgcctgagaaagcttttccagggttttatattttgaagatcagc
agttctccgctctatgatcacacagagctgcgggagttagagaaaaagagggacagagac
tacctctcaggtgagctaggacagaacctgcacatgaagctgcacattacactacaataa
DBGET
integrated database retrieval system