KEGG   Thalassolituus hydrocarboniclasticus: HUF19_07725
Entry
HUF19_07725       CDS       T08537                                 
Symbol
recB
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit beta
Organism
twan  Thalassolituus hydrocarboniclasticus
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 PDDEXK_1 SLFN-g3_helicase AAA_11
Other DBs
NCBI-ProteinID: UXD87324
LinkDB
Position
1774831..1778619
AA seq 1262 aa
MKTLSIPDFPLYGQSLIEASAGTGKTFTITGLYNRLILGHGRSNADGQSERLGCDQILVV
TFTRAATEELRGRIRQRLRDTLEDLLSLENGQPIEAQQLQYLQQLAEARHSDIDSLCKQL
KPWLQSNLALMDEAAIYTIHGFCQRMLKQFAFDSGVVFSAELVLDSDSYLQQACEDIWRQ
QAYSLNEQQSRYLISRYAGPDDVLAKVKARINRPDMTVIPPLSADGLNRAWQSAEAAFTS
AKAAWSQISAADVVQLIADSGLDKKSYSKRFAPNWVEEAAGYFAGRFYMPAPKNLYRMTP
TAMAEKLKDGGELPQHAAFDATEDFLQAAKQLALLLEAAWMDAIKERYFELLEKAGALTP
DDLLRLLVNALRADQGELLASHIRRLYPLAMIDEFQDTDPQQYEIFNRIYPPLSENDNAL
ATQPGQHGLIMIGDPKQAIYGFRGADIFTYIKARRQLSEERRFTLEKNWRSHTRLVAGVN
QLFAGHDSPFVFDQDIQFVNVSAAGKPDGHPLKIAGEEQTPLQLWHDGGEYSRSRAQFTA
AEQCAEKIDALMHGDATLGDEPVQARDIAVLVRSRKQAGLIREALSARQIGSVFLTRDSV
YDSLEAQDLFAWLQAVAHPTDERALRTAMATETQGLTAAQLDALLNDELAWERTLEQNHS
YHQLWQRRGVMAAIMQWLEEDGRAQRLRRHQDGERRITNLMHLGELLQSAARRLRGHEAL
LRWFGEHIFSDNRSGDEAQLRLESDANLVTIVTIHKSKGLEYPLVFLPFLWDDSYLPNPK
SDTQYFSERDGMVLNLEPDDEAKALAQRDSLAESLRLLYVALTRAVQGCFIWLADAVDGK
SKKEKKSRIAQTALGYLLALENDPDWAGLKQSASAECLITGLPVWPIDELRRQAVIQEPP
KAAVCRPHSWDSWRVSSYSQLTADDHSGHSAHDDVLVMDEVSGQNDSDESLAELIGAELI
ETSVMDDMPNREFDATAPALTFAKGANAGTCLHAIFEHWDFVDADALLSITERELSHYGL
ALSEDEAGAEEKQKQINNLAGWMQAVVNSSLMNEQGEQFALADISAANRLDEMEFYLPVQ
QLKAADINRLLTDPAKSGRFHFDTLSGYLKGFIDLIFCHNGRYYVADYKSNHLGFSINDY
TPAALKVAMADHQYDLQAWLYTVALDQLLRQRLNHYDPAKHLGGVYYFWLRGMHLGSNAP
RLNADDAAVSQQDLFAAPALTQVPGVYYHAVDPDELQRWRQVLLPDSVCARNRTDNKAEA
GV
NT seq 3789 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaccttatccattcctgattttccgctgtacggtcagtcgctgattgaagccagt
gccggtaccggtaaaacctttaccattaccggcctgtataaccgtctgattctcggtcat
gggcgcagcaatgctgatggacagagtgaacggctgggctgtgatcagattctggtggtg
acctttacccgtgccgctaccgaagagttgcgtggccgtatccgccagcgtctgcgtgat
acgctggaagatttattgtcgctggaaaacggccagccgattgaagcgcagcagctgcaa
tatttacagcaactggctgaggcacggcacagcgatatcgacagcctgtgtaagcaactg
aaaccctggctgcaaagcaatctggcgttaatggatgaagcggcgatttataccattcac
ggtttctgtcagcgcatgcttaagcagtttgccttcgacagtggtgtggtgttcagcgcc
gagctggtgctcgacagtgacagctacctgcaacaggcctgtgaagatatctggcgtcag
caggcctatagcctgaatgaacagcagagccgttatttaatcagccgttatgccggcccg
gacgatgtgctggcgaaagtgaaagcacggattaaccgcccggatatgacggtaattccg
ccgctttcagctgatggtctgaacagggcgtggcaaagtgccgaagccgcatttacgagc
gccaaagccgcctggtcgcaaatcagtgcagctgatgtggtgcagttaattgcggattcc
gggctggataaaaaatcctacagcaaacgttttgccccgaactgggtggaagaagcggcc
ggttattttgccgggcgtttttatatgccagcgccgaaaaatctctaccgtatgacgcca
accgcgatggcagaaaagctgaaagacggtggtgaattaccgcagcatgcagcctttgac
gccactgaagattttctgcaggcggccaagcagttagcactgctgctggaagccgcgtgg
atggacgccattaaagaacgttatttcgagctgctggaaaaagccggtgctttaaccccg
gatgatttattgcgtttattggtgaatgccttgcgtgccgatcagggcgagttgctggcc
agtcatatccgccgtttatatccgctggcgatgatcgacgagtttcaggataccgaccca
cagcagtacgaaatttttaaccggatttatccgccgttaagtgagaatgataacgcgctg
gcgacgcagccaggtcagcatgggttaattatgatcggcgaccctaaacaggccatctac
ggcttccgcggcgctgatatttttacctacatcaaagcccgccggcagctttccgaagag
cgccgttttactctggaaaaaaactggcgcagtcatacccgactggtcgccggggtaaac
cagttattcgccggccacgacagtccctttgtattcgatcaggatattcagttcgttaat
gtatcggcggcaggtaaacccgacggccatccattaaaaattgccggtgaagaacaaacc
ccgctgcaactgtggcatgacggcggtgaatattcccgtagcagggcgcaatttaccgct
gcagaacagtgtgctgagaaaattgatgccttaatgcacggtgatgcgacgctgggggat
gagccggtgcaggcgcgcgatattgccgtgctggtgcgcagccgcaagcaggccggatta
atccgtgaggcgttatccgcgcgtcagatcggcagtgtgtttttaacccgcgacagcgtg
tacgacagtctggaagcgcaggatttatttgcctggttgcaggcggtggctcacccaacc
gatgagcgtgcactgcgtaccgcgatggcaacggaaacccagggcttaactgccgcgcag
ctggatgctctgttaaatgacgagctggcgtgggagcgcacgctggaacaaaaccacagt
tatcatcagctgtggcaacgccgtggcgtgatggcggccattatgcagtggctggaagaa
gacggccgcgcgcaacgcttacgccgccatcaggatggtgagcgccgtattaccaacctg
atgcatctgggtgaattactgcagagcgctgcccgccgtttacgcggccacgaggcatta
ttgcgctggtttggtgagcatattttctccgataaccgcagtggcgacgaagcacagttg
cgtttagagagcgacgccaatctggttactattgtcaccatccataaatccaaggggctg
gaatatccgctggtgtttttacccttcctgtgggacgacagttatttaccgaatccgaaa
agcgatacccagtatttcagtgaacgcgacggcatggtgctgaatcttgagccggatgat
gaagccaaagcgttggcgcagcgtgattctctggcggagtctttgcgtttgctgtacgtg
gccttaacccgtgcggtgcagggctgttttatctggctggccgatgccgtggatggcaaa
agcaaaaaagagaaaaaatcccgtattgcgcaaaccgcgctgggctatttgctggcactg
gaaaatgatcctgactgggccggcttaaaacaatcagcttcagctgaatgtttaattacc
ggtttgccggtctggccgatagatgagctgcgtcgtcaggctgtaatacaggagccgcca
aaggcggctgtgtgccggccgcacagctgggacagctggcgggtaagcagttacagccag
ttaaccgccgatgatcatagcgggcattctgctcacgacgatgtattggtgatggatgaa
gtatccgggcagaacgacagtgatgagtcccttgccgagcttattggggccgagctgatc
gaaacctccgttatggatgacatgccaaaccgcgaatttgatgcaacagcaccggcactg
acctttgctaaaggcgcgaacgccggtacctgtctgcacgcaatttttgaacactgggat
tttgtggatgccgatgcgctgctcagcattaccgaacgtgaactgagccactatggttta
gcactcagtgaggatgaagccggcgctgaggaaaaacaaaagcagatcaataaccttgct
ggctggatgcaggcggtggtgaacagttcgttgatgaatgagcagggcgagcaatttgcc
ttagcggatatttctgcggccaatcgcctcgatgaaatggaattttacctgccggtgcag
cagcttaaggcggcggatattaatcgtctgttaaccgacccggcgaaaagcgggcgcttt
catttcgataccttaagcggctatttaaaaggttttattgaccttattttctgccataac
ggccgctattacgtggcggactataaatccaatcatctggggttcagcattaatgactac
accccggcggcattaaaagtggcgatggccgatcatcagtatgatttacaggcctggctc
tatacggtcgcccttgaccagctgctgcgtcagcgtctgaatcattatgatccggctaag
catctgggtggcgtgtattacttctggctgcgcggtatgcatttaggtagcaatgcgccg
cgtttaaatgccgatgatgcggctgtctcacagcaggatttatttgccgcgcccgcgctg
actcaggtgccgggcgtgtattaccacgctgtcgaccctgatgaattgcagcgctggcgg
caggtgctgttgccggattctgtctgtgcgcgaaacagaactgataacaaagcggaggcc
ggtgtatga

DBGET integrated database retrieval system