Tripterygium wilfordii (thunder duke vine): 120013032
Help
Entry
120013032 CDS
T07256
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
twl
Tripterygium wilfordii (thunder duke vine)
Pathway
twl03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
twl00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
120013032
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
twl03019
]
120013032
Messenger RNA biogenesis [BR:
twl03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
120013032
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120013032
NCBI-ProteinID:
XP_038720576
LinkDB
All DBs
Position
13:15244674..15248020
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEDKLQDYFSHYGEVLQAVVMRDKITGRPRGFGFVVFADPAVL
DAVLQDKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSGRAGNFNPPRNSGGSGNVGTKKIFVGGLPPT
LTEDGFRQYFEAYGHVADVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDSEDAVERVLHKTFHDLNGKQV
EVKKALPKDANPGGGNRSMGGDGGGSYQGYGASAGNTSSYDGRMDSSRYMQSQSTGGGYP
SYGSSGYAAPGYGYGPANNGVGYGGYGGYGSANSGYGGPAGAAYGNPNIAGAGYGSAPAA
AARASWSNQAPSGYGAMGYGSATQWGAPGAGSGRPGSEPAGQSPSAAAGYGNQGYGYGGY
GGSDGSYGNPSGYGAVGGRSGSTPNSNVSGGGVDAQGNGGSYMGSGYGDANGNSGYGNSG
WRFDPSQANGPHATQVGYGSGYGGGQSRQAQQQ
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcagggaaagcttttcattggcgggatttcgtgggagacaacggaggac
aagctccaagactacttctctcattacggagaagttttgcaggctgtggtgatgagagac
aagatcactggcaggcctagaggctttggatttgttgtcttcgctgatcctgctgtcctt
gatgcggttcttcaggacaagcacaccatcgatggtagaacggttgaggcaaagagggcc
ttatccagagaggagcagcaaacgtctggaagagcaggaaacttcaatcctcctaggaac
agcggaggttctggaaatgttgggaccaagaaaatatttgttggagggctgcctcccact
ctgacagaagacggatttcgtcagtattttgaagcctatggccatgtagcagatgtagtt
ataatgtatgaccagaatactcaacgtcctcgtggatttggattcatttcttttgattct
gaagatgcagttgaaagagttttacataagacctttcatgatctgaatggtaagcaagtt
gaagttaagaaggctcttcctaaagatgccaatcctggtggaggtaaccgttccatgggg
ggtgatggtggtggcagttaccagggatatggtgcttctgccggtaacacaagtagttat
gatggtcgaatggattccagtaggtacatgcagtctcagagtactggagggggttatcca
tcttatggctcttctgggtatgctgcacctggctatggctatggtcctgccaataatggt
gttggctatggtggttatggcggttatggtagtgccaatagtggatatggtgggcctgct
ggggcagcctatggtaacccaaacattgcaggtgctggttatgggagtgctcccgctgct
gctgctagagcttcatggagcaatcaagctccctctggttatggtgctatgggctatggg
agtgctactcaatggggtgctcctggtgctggcagtggtcgtccaggttcagaacctgct
ggacaatctcctagtgcagctgcgggttatgggaatcaaggttatgggtacggtggttat
ggtggaagtgatggatcttatgggaatccatctggttatggtgctgttggtgggcgttct
gggagtactccaaacagcaatgttagtggtggtggggttgatgcacaaggcaatggtggc
agctacatgggcagtggctatggtgatgccaatgggaattcagggtatggaaattctggg
tggaggtttgatccatctcaagcaaatggtccccatgcaacacaggttggttatgggagt
ggctatggtggtggtcagtctcggcaagctcaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
