Tripterygium wilfordii (thunder duke vine): 120014553
Help
Entry
120014553 CDS
T07256
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
twl
Tripterygium wilfordii (thunder duke vine)
Pathway
twl03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
twl00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
120014553
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
twl03019
]
120014553
Messenger RNA biogenesis [BR:
twl03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
120014553
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120014553
NCBI-ProteinID:
XP_038722463
LinkDB
All DBs
Position
14:10518983..10522282
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKDYFSPYGDVLQTVVMRDKITGRPRGFGFVVFADPAVL
DGVLQDKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSGRAGNFNPSRNSGGTGNVRTKKIFVGGLPPT
LTEDGFRQYFEAYGLVADVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKKALPKDANPGGGNRSMGGGGGYQGYGASAGNTSSYDGRIDSSRYMQSQGTGGGYPSY
GSSGYTTPGYGYGPANNGVGYGGYGGYGSANSGFGGPAGAAYGNPNIAGAGYGSAPAAAA
RTSWSNQAPSGYGAMGYGGATPWGAPGAGSGGPGSGPAGQSPSGATGYGNQGYGYGGYGG
GDGSYGNPSGYGAVGGRSGGTPNSNASGGGVDLQGSGGTYMGSGYGDANGNSGYGNSGWR
SDPSQANGPHASQVGYGSGYGGGQSRQAQQQ
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcagggaaagcttttcattggcgggatttcgtgggaaacgtcggaggat
aagctcaaggactacttctctccttacggagatgttttgcagactgtggtgatgcgagac
aagatcactggaagacctagaggctttggatttgttgtcttcgctgatcctgctgtcctc
gatggggttcttcaggacaagcacaccatcgatggtagaacggttgaggcaaagagggcc
ttatccagagaggagcagcaaacctctggaagagctggaaatttcaatccttctagaaac
agcggaggtactggaaatgttaggaccaagaaaatatttgttggagggttgcctcccact
ctgacagaagacggatttcgtcagtattttgaagcctatggccttgtagcagatgtagtt
ataatgtatgaccagaatactcaacggcctcgtggatttggattcatttcttttgattct
gaagatgcagttgacagagttttacacaagacctttcatgatcttaatggtaagcaagtt
gaagttaagaaggctcttcctaaagatgccaatcctggtggaggtaaccgttccatgggt
ggtggtggtggttatcagggatatggtgcttctgctggtaatactagtagttatgatggt
cgaattgactccagtaggtacatgcagtctcagggtactggagggggttatccatcttat
ggctcttctgggtatactacacctggctatggctatggtcctgccaataatggtgttggc
tatggtggctatggtggttatggtagtgccaatagtggatttggtgggcctgctggagct
gcctatggtaacccaaacattgcaggcgctggttatgggagtgctcccgctgctgctgca
agaacttcgtggagcaatcaggctccctctggttatggtgctatgggctatgggggtgct
actccatggggtgctcctggtgctggcagtggtggtcctggttcaggacctgctggacaa
tctcccagtggagctacgggttatgggaatcaaggttatgggtatggtggttacggtgga
ggtgatggatcttatgggaatccatctggatatggtgctgttggagggcgttctgggggt
actccaaacagcaatgctagtggtggtggggttgatttacaaggcagtggtggcacctat
atgggcagtggctatggtgatgccaatgggaattcagggtatggaaattctgggtggaga
tctgatccatctcaagcaaatggtccccatgcatcacaagttggttatgggagtggctat
ggcggtggtcagtctcggcaagctcaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system