Thiosulfativibrio zosterae: THMIRHAT_23170
Help
Entry
THMIRHAT_23170 CDS
T06856
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
tzo
Thiosulfativibrio zosterae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS_4
PAS
PAS_8
PAS_3
PAS_7
efThoc1
TssN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBP44571
UniProt:
A0A6F8PR21
LinkDB
All DBs
Position
complement(2573356..2576205)
Genome browser
AA seq
949 aa
AA seq
DB search
MTNPASKTESVFSTWFKIIVPSLVIPVAGALVLNQLFDSAQWVNEPFHALLESMGSFSAL
FLAMFIITMRNNQRLCPRYIWVATTLMGMGLLDGFHAGISAGNAFVWLHSLATFVGGVTF
ALVVLPVRYAQLPAVNKAPWIMSLFAVTVGIGSVVFPEWIPQMIRDGHFSGTAEVLNFIG
GLGFILAAIHFMQKQNTTDVFERALLANHTLLFGAAALLFHFSLIWDATWWLWHVLRLIA
YVVILVFFLRLYFDSVREIRINEQKLTEKTRELERERSLTSGIIENSPSIISLKDTDGRY
MVVNQPFCRLFGLDKTQVYGQSANDLFETAIAAGLLSADTQVLNQNQSVESEIAITLNGK
IFTFISTKFPLKDASGSVYAIGSILTDITQRKRIENELLLSQKIIDHTNEGVLVTDSQGI
ITKVNIAYSEITGYSARELLNKSPRFLKSGLHDDAFYQKMWKFLTDTGHWSGEIWDHKKN
GQAFPQWLSISAIKDAQKVVTHYVGIMHDITAEKNIEAELKNIAYYDALTGIPNRVLFKD
RLTHEMAHNHRENTQIALLFIDLDDFKLVNDSLGHDAGDELLALVAKTLKQQVRSSDTVA
RLGGDEFAIILPQLTEFETASKIAQKIITELRAPVSIQGRSLTVGASIGISTFPNDALSV
EELTKFADLALYSAKNAGRNNFKFFSQALQDQTNHYIELQAGLKKATQNHEFEVYYQPKI
CLQTQSLVGMEALIRWNHPVKGVLTPIEFISFAEQTGLILPIGAWILQAACRQAEIWSQA
LNRSLEVAINLSTQQFKDEKLIKVIQQALQESGVHKARVELEITETSLFDNIEQAIQTMH
AIRELGITLAIDDFGTGFSSLSYLKRFPISTLKIDRSFVKDLAVDEDDKAIVESIIAMSE
KLKLKVVAEGIETQAQLDLLKERNCHYGQGYLFAKPLRAEEFERLYIQS
NT seq
2850 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaaccccgcatcaaaaacagagtctgttttcagcacttggttcaaaattatcgta
cccagtctggtgatacctgtggcgggggcgctggttttaaaccaactgtttgatagcgcg
caatgggttaatgagccgttccatgccttattggaaagtatggggtctttctcggcctta
tttttggccatgttcattatcaccatgcgcaacaaccaacgcctttgccctaggtatatt
tgggttgccaccaccttgatgggcatgggattgttggatggatttcatgcagggatatca
gcgggtaatgcctttgtttggctccacagtttggcaacctttgtcggtggggtaactttt
gccttggttgtgctaccggtgcgttacgcgcagctgccagctgttaataaagcgccttgg
atcatgtcgttgttcgcggtgacggtgggcataggttcggttgtctttcctgaatggatt
ccgcagatgattcgtgatggccacttcagtggcacggctgaagtgcttaattttattggc
ggtcttgggtttatcttagcggccattcactttatgcaaaagcaaaataccacagatgtc
tttgagcgagcgctcttggccaaccatacgcttttatttggtgcggctgctttattgttt
catttttcattgatttgggatgccacctggtggctatggcatgttttgcgattgattgcc
tatgtggtgattttggttttctttttaaggctctacttcgacagtgtccgagaaattcgc
atcaacgagcaaaagcttaccgaaaaaaccagagagttagagcgcgagcgtagcttaacc
tctggcattattgaaaacagtccttccatcatctctttaaaagataccgatgggcgatac
atggtggttaaccagccattttgccgtttatttggactcgataaaacgcaggtttatggt
cagagcgcaaatgatttatttgaaaccgccattgcggcaggattgttaagtgccgacacg
caagttttaaatcaaaatcaaagcgttgaaagcgaaattgccatcactttaaatggcaaa
atattcacttttatatccactaaatttccgctcaaagatgccagtggcagtgtttacgcc
atcgggtctatcctgactgacatcacccaacgcaaacgcattgaaaatgaactcttgctc
tcgcagaaaatcatcgaccataccaacgaaggtgtgctggtcaccgacagccaaggcatc
attaccaaagtgaatattgcctattcggaaattaccggttattccgctagagaactgctc
aataaaagccctagatttttaaagtcggggttacatgacgatgctttttaccaaaaaatg
tggaagtttttaaccgacacaggccactggtctggcgaaatttgggaccacaaaaaaaac
ggtcaagcgtttccgcaatggttgagtatttcagcaattaaagatgcccaaaaagtcgtg
acccattatgtcggtatcatgcacgatattaccgccgaaaaaaatatcgaagctgagctt
aaaaacattgcctactacgatgctttaaccggcattcccaaccgtgtgctgtttaaagac
cgacttacccacgagatggcgcacaatcatcgcgaaaacacccaaatagccctgttgttt
atagacctggatgactttaagctggtgaatgattccttgggtcatgatgcgggtgatgag
ttactggcattggtggccaagaccctcaaacagcaggtgcgtagcagtgataccgtggcc
agattaggcggtgatgagtttgccattattttgccgcagctcaccgagtttgaaaccgcc
tctaaaattgcgcaaaaaatcatcaccgaacttcgagcaccggtgagcattcaaggccgc
tctttaacggtgggcgccagtatcgggatttcaacctttcccaatgatgctttaagcgtg
gaagagctcaccaaatttgcagatttagcactctattcggctaaaaatgccggccgcaat
aactttaaattcttttcacaagcgctgcaagatcaaaccaatcactatatcgaattacag
gccggattgaaaaaagccactcaaaaccacgagtttgaggtttattatcaacccaaaatc
tgtttgcaaacccaatccttagtgggcatggaagcccttattcgttggaatcatccagta
aaaggcgtgttgactcccatcgaatttatcagttttgccgaacaaaccggcttgattttg
cctatcggtgcttggattttacaggcagcttgtcggcaagcggagatttggtcacaagca
ctcaatcgctcgttagaagttgcgattaacctctcgacgcaacaatttaaagatgaaaag
ctcatcaaggttattcagcaagccttgcaagaaagcggtgttcacaaggcgcgtgttgaa
ttagaaatcaccgaaaccagtttgtttgacaacattgaacaagccattcaaaccatgcac
gccattcgtgaattgggcataacgctagcgattgacgatttcggcactggtttctcatcc
ctcagttacctcaagcgttttcccatcagcacgctcaaaatagaccgctcgtttgttaaa
gatttggccgtcgatgaagacgacaaagcgattgtagaatccattatcgccatgagtgaa
aaactcaaattaaaagtggtggccgaaggcatagaaacccaagcacaattggatttgttg
aaagagcgcaattgtcactatggccaaggctatctgttcgccaaacccctcagagccgaa
gagtttgaacgcttatatattcaatcttag
DBGET
integrated database retrieval system