Utexia brackfieldae: RHO15_09890
Help
Entry
RHO15_09890 CDS
T10516
Symbol
btuB
Name
(GenBank) TonB-dependent vitamin B12 receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
ubr Utexia brackfieldae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ubr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ubr02000
]
RHO15_09890 (btuB)
Transporters [BR:
ubr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RHO15_09890 (btuB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVD63760
LinkDB
All DBs
Position
complement(2178415..2180223)
Genome browser
AA seq
602 aa
AA seq
DB search
MKTIFGLAVISSTSSVAIAAETTSHNTLVVTANRFAQPISSVVAPINVITRAEIDRWQTQ
SVPEILRRLPGVTVSQAGGRGQVASVFIRGNESKHVLILIDGIRIPSSATIMGNTDLSQI
PVALIQRIEYIRGPHAATYGSDAIGGVINIITESDSPVSKINATYGSQAYQNYNAAIRQD
ITDKTTLSLAGGYESTTGYNVMPQSNEPDKDGFREKSLWLGLKHQFSNEVTGFIRGYGNS
NNVEYDGYYNESNIYTHNYDTGLQYQNENYSSQLVTSFRQYKIFNFNHIQGKNSTAPNDV
TQQSIQWGNTYRLAQGAIISGGVDFYANKIGAGSGGILTSHSKNNTGIYLTGQKQLNTVL
LETAVRLDDDQQYGRHATWQVASEWEFIDNHRISLSYGTAFKAPTFGEIYDGAWGVIGNP
DLRPETSRQWELGVSADYDLFAWRTSAYYNKVQDLIQWKSLSDWTSTYENIDNANIKGIE
FNLNFDTGPVHHNATFEYIDARKANGELLLKRPHKNFQYQLDATINEIEFSLAYLYKGQS
RDYGKVQPIDSYSVWDISASYRIVKNIIVSGKIANLFDKKYETAIGYPAPEREYSMTLSY
EF
NT seq
1809 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaatatttgggctcgctgttattagctcaacttcctctgtggcaatagctgca
gaaacaacatcgcacaacactttagtggtgaccgccaaccgctttgcacagccgatctct
tcggttgtcgcgccaatcaatgtgataacccgcgcggagattgatcgttggcaaactcag
tcagtgccggaaatcttaagacgtttacccggcgtaaccgtttctcaggcaggtggccga
ggccaagttgcctctgtatttattcgcggcaatgagagtaaacatgtattaattttgata
gatggtattcggattccctcgagtgcgacgattatgggtaatactgatttaagccaaatt
ccagtcgcacttatccagcggattgaatatattcgtggtccgcacgctgcaacatatggt
tcagacgcgattggtggtgtgattaatatcattactgaatctgattctcctgttagtaaa
attaatgcaacctatggttctcaagcttatcaaaactataatgccgctatcagacaagat
atcactgataaaacgacgttatcgctggctgggggctatgaatcaacgacaggttataat
gtaatgccacaaagcaatgagccagataaagatggttttcgtgaaaaatcgctgtggcta
ggccttaagcatcaattttctaatgaagtaaccggatttattcgtgggtatggtaatagt
aataatgttgaatatgatggctattataatgaaagcaatatttatacccataattatgat
acgggcttgcaatatcaaaacgaaaattactcctctcagttagtcaccagttttcgtcaa
tataagatctttaattttaatcatattcaaggtaaaaactcaacagcgcccaatgatgtt
acgcagcaaagtatacagtggggaaatacttatcgtcttgctcaaggtgccattatcagt
ggtggcgtcgatttttatgcgaataagattggtgcgggttctggcggtatattgacgtct
cattcgaaaaataatacgggaatttatctcacagggcaaaaacagctaaacactgttttg
cttgaaacggcggtccgccttgacgatgatcagcaatatggccgtcatgcaacctggcaa
gtggcgagtgaatgggagtttatcgataatcatcgcatcagtttatcgtatggcaccgct
tttaaagccccgacttttggcgagatctatgatggtgcatggggcgtaatcggtaaccca
gatttaaggcctgaaaccagtcgtcagtgggagttaggtgtatctgctgactatgatctt
tttgcctggcgtacctcagcctactataataaagtgcaagatttgatccagtggaaatca
ctctctgactggacctcaacctatgaaaatatcgataatgctaatattaagggaattgag
tttaatcttaattttgatacgggtccggttcaccataatgcgacctttgaatatattgat
gcgcgcaaagcaaatggcgagctgttattaaagcgtccgcacaagaactttcaataccaa
cttgatgcaacaataaatgagattgagttttcgcttgcctatttatataagggacaaagc
agagactacggtaaagttcagccaatcgatagttatagtgtttgggatatttcagcctca
tatcgaatcgtcaaaaatattattgttagtggaaaaattgctaatttatttgataaaaag
tatgaaactgctataggatatccagcgccagaacgtgaatattcgatgacattatcctat
gagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system