KEGG   Ureaplasma diversum: JM47_00565
Entry
JM47_00565        CDS       T09765                                 
Name
(GenBank) ATP-binding protein
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
ude  Ureaplasma diversum
Pathway
ude03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ude00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    JM47_00565
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ude03019]
    JM47_00565
Messenger RNA biogenesis [BR:ude03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     JM47_00565
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_C RNase_J_b_CASP SUKH_6
Other DBs
NCBI-ProteinID: AJQ45149
UniProt: A0A0C5RNU7
LinkDB
Position
129314..130996
AA seq 560 aa
MAKINFLALGGQDERDKSCFVVEVNDEIFVFNAGVKLPPNDISGINAIIADFSYLEANAK
KIKGIFVGTPSFANVTGLRLLLSQINPKTPIYTSSIGAGIIKRVFDQKSHIKKVEPNIIE
LEPIKDKKVGSIFATAFKITNSLPHSYGYVLKTEDGAIVYIDEFIISNDRNKTFDSQINF
LNSITKNNTLALIIGTGQSGLNAYTAPSHKNKSFYEDILNKANQRLIVACDSSDAYSIFT
LATIAKQQTKPFIIYSNNFINVFSSVIKQGLYNNKNLMSTPIAEMNKLEKAIIVIADNPD
NLFNRLKKIIGGEDKLLTINPNDYFVLGFPVIAGIEMLVANLCDELGRKDIDFSLLPKDY
LRMVQSDEDCKHVVNLLQPRYVIPINGLYKQEVKFTQAVTSSWIKNEQVISLDNGEQVFV
EDKNLLPKRNRVPIEEKFLSMYNALDVGSGVIYERLQMSENGVVSISFIFDKQCQKLLNS
VQFKYYGVVNNGPFSLSKVEEIEATFKERMGECLFYDKNKKLDIKETKAALKRLLARLFE
KKFNKRPLVLSNFIDYTTIK
NT seq 1683 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaaaaattaattttttggcattaggtggacaagatgagcgggataagtcatgcttt
gttgttgaagttaatgacgaaattttcgtatttaatgctggtgtaaagctaccacctaat
gatatttcagggatcaatgcaattattgcagattttagctatttagaagctaatgcaaaa
aaaattaaagggatatttgttggaacgccaagttttgcaaatgttactggtttacgttta
ttattaagtcaaattaatcccaaaacaccaatttatacaagttcaattggagctggtatt
attaagcgtgtttttgatcaaaaatctcacatcaaaaaagttgaaccaaacattattgaa
ctagaaccaattaaagataaaaaggttggttcaatttttgcaactgcttttaaaattact
aactcattaccacactcatatgggtatgtacttaaaacagaagatggagcaattgtttat
attgatgagtttattatttcaaacgatagaaacaaaacatttgattcacaaattaacttt
ttaaactcaattactaaaaacaacactttagctttaatcattggaactggtcaatctggt
ttaaatgcatatacagcaccaagtcataaaaacaaatcattttatgaagatattttaaat
aaagctaatcaacgtttaattgtggcttgtgatagttctgatgcttatagtatttttact
ttagcaacaattgctaaacaacaaactaaaccatttattatttattcaaacaactttatt
aatgtctttagtagtgttattaagcaaggtttatataacaacaagaatttaatgtctact
ccaattgctgagatgaataaattagagaaggcaattattgtaattgctgataatcctgat
aatttatttaatcgcttaaagaaaattattggtggcgaagataaattattaacaattaat
ccaaatgattattttgtactagggtttcctgtaattgcagggattgaaatgttagttgct
aatttatgtgatgaattaggaagaaaagacattgatttttctttattaccaaaagattat
ttaagaatggttcaatctgatgaagattgcaaacacgttgttaatttattacaaccaaga
tatgtaattccaattaatggactttataaacaagaagtgaagtttacacaagctgttact
tcatcttgaatcaaaaatgaacaagtaatctcacttgataatggtgaacaagtctttgtt
gaagacaaaaacttacttccaaaaagaaacagagttccaattgaagaaaaattcttatca
atgtataatgctcttgatgtgggaagtggtgttatttatgaacgtttacaaatgagtgag
aacggggttgtaagtattagttttatctttgataaacaatgtcaaaaactacttaatagt
gttcaatttaaatactatggggtagttaacaatggacctttttcactttcaaaagtagaa
gaaattgaagctacttttaaagaacgaatgggtgaatgtttattctatgataaaaacaaa
aagttagatatcaaagaaacaaaagcagctctaaaacgattattagcacgtttgtttgaa
aagaaattcaacaaacgtccattagttttatcaaacttcattgattacactacaattaaa
taa

DBGET integrated database retrieval system