Ureaplasma diversum: JM47_00660
Help
Entry
JM47_00660 CDS
T09765
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
KO
K03043
DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:
2.7.7.6
]
Organism
ude
Ureaplasma diversum
Pathway
ude03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ude00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
JM47_00660
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ude03021
]
JM47_00660
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ude03400
]
JM47_00660
Enzymes [BR:
ude01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
JM47_00660
Transcription machinery [BR:
ude03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
JM47_00660
DNA repair and recombination proteins [BR:
ude03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
JM47_00660
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_45
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_2
TNV_CP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJQ45162
UniProt:
A0A0C5RL51
LinkDB
All DBs
Position
complement(159026..163306)
Genome browser
AA seq
1426 aa
AA seq
DB search
MQNSNNFRIKQITKKVTRRDYSKIKTEFEGPNLLEVQVESFKRFIDRDLKEAVGGIFPLK
SPQGKYSLHFKGLRIKEPAKTEELCRDEAKTYETPVYIDLELVDNFTGEVKRAQKNSKTG
EDGIYLGAVPKMTEKGTFIINGIEKFVVSQIVRSPGIYVLSKSNIKLNGSRKRLFEGKIC
EIYPSKGTLMLGYIPKDKEVIQVVARDSSGDNAQTLSITTLLKAFGLSEGEILRVFANEY
EVVESLRSENYDRESILLNTEQNEIIIKILSEIHEINEKADRKDINKIREEYIIGNSPLL
STLKKLLFSYVEKSEQLDLLLHENGDVYNDEFIAKNQDLINEINQILDEIISEKAARDVV
DLLGINIKNVDALKHYGFVSFQLALQQHFFNKRSYDISSAGRYKFEKKLLLTERLLQRVL
AEDIVLKNKEVLLPEGTLITKEDLELIKKHSEADNIDWNDTIRLNSNAINDELEQHLEIE
AISVYKDNDIRTETTRIIGTKPGCKLETLTVADLVATTSYIYNLIHDIGDFDDIDHIGNK
RLKLIHELLRARVSTSMARIEKFINEKLAISDGSNNNITNINDKNIDPELDKELEESDLS
EEEKRKAISVKSIVNTKQFQMLIKDFFNSHQLIQFIDQQNPLAELTNKRRISAMGPGGIS
REDPNLDIRDVHHSHYSRICPIETPEGMNIGLIMSLATLAKVDDNGFITAPYFVVKDGVI
TDEYHYLTAHEDDNFIISESSVTVDENKKILNDQVVARYRGSTGIFSPQELDYIDIDPKQ
IVSIAASAIPFIENDDGARALMGSNMQRQATPLIKPYAPIVGTGTEYKIAHDSGMAVVSK
NDGVVSYVDSEKIEVTTDDGKKDQYKLIKYRKSNQDTCNNQTPIVKLNEQVKANQTLADG
PAMNNGELALGRNILAAYTTWRGYNFEDAIIISERLVHQDVFTSIHIDEHTVQCMKTKNG
DEEITRDMPNVSDNAKRFLDADGIVLVGAEVREGDVLVGKTTPRGNVDAIPEDKLLQTIF
GDKAKTVKDSSLKVRHGQEGIVAAVKRITSADKSGNELPDDVLEIIKVYIVQKRKIQVGD
KMAGRHGNKGIVSKVVPIQDMPFLKDGTPIDIMLNPLGVPSRMNIGQILELHLGYAASEI
GKKQLIQIVLDNKDASEYVSLYGLDLNVAEQLYKYVQDLIKEKNITSNDQVDLIDISIIL
NRLGLSFDDISIKVSTPVFDGVNHNDLVSIMDEAGIDTQTLKGKQVLYDGRTGEPFDGLI
SVGKSYMLKLDHMVDDKIHSRSVGPYSKITQQPLGGKSQNGGQRFGEMEVWALEAYGAAY
NLLEILTIKSDDVQGRNQAYNAIIKNKEIITSGMPESFKLLTKQIQGLGLCITVETTDGE
EVDINDYTINDYKMKEQLEKDQEDVDQPTITQTFTSQYYDEDEENF
NT seq
4281 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaatagcaacaactttcgaataaaacaaattactaaaaaagttacaagacgagat
tactctaaaattaaaacagaatttgaaggaccaaacttattagaagtacaagttgagtca
ttcaaacgttttattgatcgtgacttaaaagaagctgttggtggtatttttccgcttaaa
tctccacaaggtaaatactcacttcactttaaagggttaagaattaaagaacctgctaaa
actgaagaattatgtcgagatgaagctaagacatatgaaacaccagtttatatcgactta
gaacttgttgataacttcacaggagaagttaaacgagctcaaaagaactctaaaactggt
gaagatggtatttatttaggtgcagttcctaaaatgactgaaaaagggactttcatcatt
aatgggattgaaaaatttgttgtatcacaaattgttcgatcacctgggatttatgtttta
agtaaatcaaacattaaattaaacggttcacgtaaacgtttatttgaaggaaaaatttgt
gaaatctatccttcaaaaggtactttaatgcttggatacattcctaaggataaagaagtt
attcaagttgttgctcgtgattcatctggtgataatgctcaaactttatctattacaaca
ttactaaaagcttttggtttaagtgaaggtgaaattttaagagtctttgctaatgaatac
gaagttgttgaatcattaagaagtgaaaattatgatcgtgaaagtattttattaaatact
gaacaaaacgaaatcattattaagatcttatctgaaattcatgaaattaatgaaaaagca
gatcgaaaagatattaataaaattagagaagaatacattattggaaactcaccattatta
tcaacactaaagaaactattatttagttatgttgaaaagagtgaacaattagatttattg
ttgcacgaaaatggcgatgtttataatgatgaatttattgctaaaaaccaagacttaatt
aatgaaattaaccaaattttagatgaaattatttctgaaaaagcagcaagagatgttgtt
gacttattaggaattaacatcaagaatgttgatgcattaaaacactatggttttgtgtca
ttccaattagctttacaacaacacttctttaataaacgttcatatgatattagtagtgct
ggacgttataagttcgaaaagaaattattattaactgaacgtttattacaacgtgtatta
gctgaagatattgttcttaaaaacaaagaagttttacttcctgaaggtactttaattact
aaagaagacttagaattaattaagaaacattcagaagctgataacattgattgaaatgat
acaatcagattaaattcaaatgcaattaatgatgaattagaacaacatttagaaattgaa
gcaatttcagtttataaagataatgatattagaactgaaacaactcgtattattggtact
aaacctggatgtaagcttgaaactttaacagttgctgatttagttgcaacaactagttat
atctataacttaattcatgatattggagactttgatgatattgatcatatcggtaacaag
cgtcttaaattaattcatgaattgttacgtgctcgtgtaagtacaagtatggcacgaatc
gaaaaattcattaatgaaaaattagcgatttctgatggttcaaacaataacatcacaaat
ataaatgataaaaacatcgaccctgaattagataaagaattagaagaatctgatttaagt
gaagaagaaaaaagaaaagcaattagtgttaagtcaattgttaatacaaaacaattccaa
atgctaattaaagatttcttcaactcacaccaattaattcaattcattgaccaacaaaac
ccacttgctgaattaacaaacaaacgtcgtatttcagcgatgggacctggcgggattagt
cgtgaagaccctaacttagatatccgggacgttcaccactctcactactctcgtatttgt
ccaattgaaacaccagaaggtatgaacattgggttaattatgtctttagctacacttgct
aaagttgatgataatggatttattacagccccatattttgttgttaaagatggtgtgatt
acagatgaataccattacttaacagctcatgaagatgacaactttattatttctgaatca
agtgtaactgttgatgaaaataaaaagattttaaatgatcaagtagtagcacgttatcgt
ggttcaacagggatctttagtccacaagaacttgattacattgatattgatccaaaacaa
attgtatcgattgcagcatcagcaatcccattcattgaaaacgatgatggggcgcgtgct
ttaatgggatcaaacatgcaacgtcaagcaacaccattaatcaaaccttacgcaccaatt
gttggtacaggaactgaatataaaattgctcatgactctggaatggcagtagtttctaaa
aatgatggggttgtaagttatgttgactctgaaaaaatcgaagttacaacagatgatggt
aaaaaagatcaatataaattaatcaaatatcgtaaatcaaaccaagatacatgtaataac
caaacaccaattgttaaattaaatgaacaagttaaagctaatcaaacattagctgatggt
cctgcgatgaacaatggtgagttagctttaggtagaaacattttagctgcttatacaaca
tgacgtggatacaactttgaagacgccatcattatttcagagcgtcttgttcaccaagat
gtatttacttctattcatattgatgaacatactgttcaatgtatgaaaactaaaaatgga
gacgaagaaattactcgtgatatgccaaacgtatcagataatgctaaacgattcttagat
gcagatggaattgttttagtaggagctgaagttcgtgaaggtgatgtattagttggtaaa
acaactccacgtggtaatgttgatgcgattcctgaagataaattacttcaaacaattttt
ggagataaagcaaaaactgttaaagattcttcacttaaagttcgtcatggacaagaaggg
attgttgctgcagttaaaagaattacatcagctgataagagcggaaacgaattaccagat
gatgtattagaaatcattaaagtatatattgttcaaaaacgtaaaatccaagtcggtgat
aagatggctggacgtcacggaaacaaaggtattgtttctaaagttgttccaattcaagat
atgccattcttaaaagatggaacaccaattgatattatgttaaacccacttggtgtacct
agccgtatgaacattggacaaattcttgaacttcacttaggatatgcagcttctgaaatt
ggtaagaaacaattaattcaaattgtacttgataataaagatgcttctgaatatgtaagc
ctttatggtttagatcttaatgtagctgaacaattatataaatatgttcaagacttaatt
aaagaaaagaatattacaagcaatgatcaagttgatttaattgatatttcaattattctt
aaccgattaggtttaagttttgatgatattagtattaaggtttcaacacctgtgttcgat
ggggttaaccataacgatttagtatcaattatggatgaagctggtattgatactcaaaca
cttaaaggaaaacaagttttatatgatggaagaactggcgaaccatttgatggtttaatt
tctgttggtaaatcatatatgttaaaacttgaccacatggttgatgataagatccacagc
cgttcagttggtccatactctaagattactcaacaaccattaggtggtaagtcacaaaat
gggggtcaacgttttggggaaatggaagtttgagcacttgaagcttatggtgctgcttat
aacttattagaaattttaacgattaaatctgatgatgttcaagggcgtaaccaagcttat
aatgcaattatcaaaaacaaagaaattattacaagcggaatgcctgaatcattcaagtta
ttaacaaaacaaattcaaggtttaggtttatgtatcactgtagaaacaactgatggtgaa
gaagttgatatcaacgactacacaattaatgactacaagatgaaagaacaacttgaaaaa
gatcaagaagatgttgatcaaccaactattactcaaacattcactagtcaatactatgat
gaagatgaagagaatttctag
DBGET
integrated database retrieval system
